Heatmap: Cluster_64 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_13081.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_0_7701.1 (EXT18)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.19	0.12	0.0	0.12	0.4	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.63	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_121821.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_24541.1	0.07	0.06	0.0	0.13	0.3	0.21	0.33	0.0	0.05	0.26	0.0	0.0	0.46	1.0	0.3	0.06	0.14	0.78	0.19	0.34	0.05	0.25	0.18	0.1	0.3	0.34	0.06	0.29	0.39	0.4	0.43
Lsat_1_v5_gn_1_2680.1 (SPD1)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_11361.1 (KOR)	0.05	0.04	0.08	0.0	0.36	0.3	0.2	0.22	0.34	0.61	0.2	0.09	0.24	1.0	0.32	0.04	0.18	0.42	0.35	0.2	0.41	0.44	0.0	0.12	0.4	0.08	0.54	0.27	0.32	0.52	0.04
Lsat_1_v5_gn_2_126340.1 (RR17)	0.02	0.02	0.56	0.93	0.08	0.0	0.02	0.06	0.04	0.1	0.08	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.08	0.18	0.0	0.14	0.03	0.0	0.18	0.15	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.53
Lsat_1_v5_gn_2_132121.1 (RLP14)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.33	0.0	0.6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.64	0.28	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_15621.1 (PSAA)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_20321.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_70541.1 (RBCL)	0.0	0.0	0.25	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_90381.1 (CIK1)	0.0	0.58	0.0	0.0	0.48	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_110761.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_17841.1 (ALA8)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.45	0.95	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2
Lsat_1_v5_gn_3_63520.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_74061.1 (MIK2)	0.0	0.0	0.71	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.14	0.41	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_107581.1 (PK1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_107701.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_109741.1 (THAD)	0.0	0.0	0.53	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_110061.1	0.0	0.0	0.0	0.9	0.5	0.0	0.25	0.12	0.0	0.37	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	1.0	0.13	0.23	0.33	0.0	0.0	0.0	0.54	0.62	0.75	0.0	0.37	0.0	0.74	0.12	0.25
Lsat_1_v5_gn_4_114760.1 (PDI10)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.28
Lsat_1_v5_gn_4_126501.1 (NUP62)	0.0	0.0	0.0	0.72	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.36	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.14	0.0	0.14	0.16	0.13	0.0	0.0	0.0	0.13
Lsat_1_v5_gn_4_35841.1 (RTL1)	0.0	0.0	0.0	0.67	1.0	0.29	0.66	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.29	0.0	0.36	0.25	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_60000.1 (FH8)	0.47	0.0	0.0	0.0	0.5	0.5	0.32	0.0	0.0	0.0	0.31	1.0	0.35	0.0	0.34	0.0	0.81	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.33
Lsat_1_v5_gn_4_63061.1	0.07	0.0	0.25	1.0	0.15	0.05	0.46	0.23	0.42	0.18	0.29	0.43	0.75	0.0	0.12	0.5	0.22	0.65	0.15	0.42	0.18	0.25	0.26	0.74	0.89	0.39	0.47	0.87	0.05	0.24	0.5
Lsat_1_v5_gn_4_66900.1 (TEB)	0.8	0.0	0.26	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	1.0	0.57	0.72	0.23	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_118461.1 (SGT)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	1.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_156900.1 (TPP)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_157960.1 (PIP5K4)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_189960.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.13	0.0	0.11	0.27	0.13	0.23	0.0	1.0	0.44	0.46	0.15	0.79	0.0	0.12	0.0	0.31	0.0	0.12	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.12	0.12
Lsat_1_v5_gn_5_63041.1 (DMI1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_75081.1 (MDN1)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_83800.1	0.2	0.2	0.61	1.0	0.11	0.04	0.1	0.16	0.19	0.36	0.26	0.24	0.96	0.07	0.15	0.1	0.13	0.31	0.14	0.18	0.09	0.09	0.0	0.16	0.11	0.14	0.16	0.16	0.09	0.39	0.96
Lsat_1_v5_gn_5_84460.1 (HGL1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_107681.1 (IMPA-2)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_110601.1 (MBD13)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_12481.1 (ATL96)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.45	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_23561.1 (PDH-E1 ALPHA)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_65121.1	0.0	0.0	0.71	1.0	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_83700.1 (SUN5)	0.06	0.06	0.4	0.92	0.0	0.04	0.26	0.3	0.23	0.0	0.25	0.15	0.1	0.16	0.21	0.16	0.18	0.24	0.63	0.09	0.04	0.36	1.0	0.57	0.31	0.23	0.4	0.21	0.33	0.64	0.36
Lsat_1_v5_gn_7_103200.1	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.3	0.0	1.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.32
Lsat_1_v5_gn_7_11541.1 (PLDZ1)	0.0	0.0	0.0	0.8	0.85	1.0	0.19	0.11	0.08	0.28	0.0	0.62	0.0	0.0	0.1	0.26	0.11	0.25	0.0	0.25	0.08	0.21	0.13	0.0	0.09	0.0	0.21	0.46	0.0	0.27	0.72
Lsat_1_v5_gn_7_32760.1 (VIL3)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_48580.1 (SMU2)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_61541.1 (HUA1)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.94	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77	0.0	0.93	0.83	0.0	0.0	0.27
Lsat_1_v5_gn_7_93000.1	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.35	0.0	0.0	0.33	0.0	0.18	1.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_98301.1 (ACCD)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_101061.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_108960.1 (DPE2)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.25
Lsat_1_v5_gn_8_117881.1 (MAP70-4)	0.0	0.0	0.0	0.63	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_122401.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_137301.1 (NDHH)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_141940.1 (CYP71B4)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.22	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.22	0.0	0.0	0.69	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.23
Lsat_1_v5_gn_8_149921.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4
Lsat_1_v5_gn_8_27841.1 (CYP96A2)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.18	0.16	0.11	0.0	0.06	0.34	0.17	0.14	0.26	1.0	0.29	0.07	0.28	0.32	0.21	0.16	0.12	0.56	0.03	0.2	0.42	0.17	0.0	0.34	0.11	0.7	0.3
Lsat_1_v5_gn_8_61580.1 (SDN3)	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54
Lsat_1_v5_gn_8_69280.1 (PICALM2a)	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.32	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_94201.1 (CAD2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_98160.1 (MAN)	0.0	0.78	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_98760.1 (FHIT)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_17261.1 (PAP7)	0.12	0.09	0.63	1.0	0.05	0.14	0.08	0.0	0.0	0.07	0.06	0.47	0.31	0.24	0.0	0.27	0.05	0.12	0.17	0.33	0.0	0.43	0.0	0.0	0.24	0.11	0.58	0.24	0.3	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_2460.1 (HAK5)	0.06	0.3	0.0	0.0	0.41	0.67	0.11	0.11	0.41	0.42	0.3	1.0	0.05	0.27	0.42	0.22	0.25	0.22	0.1	0.46	0.37	0.77	0.78	0.09	0.96	0.27	0.45	0.19	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_55061.1 (MYB45)	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.71	1.0	0.0	0.0	0.6	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.36	0.38	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_57841.1 (PP2-B12)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)