1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_64 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.03 0.0 0.03 0.1 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.15 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.03 0.0 0.06 0.14 0.09 0.15 0.0 0.02 0.12 0.0 0.0 0.21 0.45 0.14 0.03 0.06 0.35 0.08 0.15 0.02 0.11 0.08 0.04 0.14 0.15 0.03 0.13 0.18 0.18 0.19
0.0 0.0 0.0 1.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.02 0.0 0.09 0.07 0.05 0.06 0.08 0.15 0.05 0.02 0.06 0.25 0.08 0.01 0.04 0.1 0.09 0.05 0.1 0.11 0.0 0.03 0.1 0.02 0.13 0.07 0.08 0.13 0.01
0.03 0.03 0.75 1.25 0.1 0.0 0.03 0.09 0.05 0.14 0.11 0.0 1.35 0.0 0.0 0.06 0.11 0.25 0.0 0.19 0.04 0.0 0.25 0.2 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.12 0.24 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.11 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.25 0.14 0.0 0.07 0.03 0.0 0.1 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.28 0.04 0.06 0.09 0.0 0.0 0.0 0.15 0.17 0.21 0.0 0.1 0.0 0.2 0.03 0.07
0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08
0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.41 1.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.16 0.0 0.15 0.17 0.14 0.0 0.0 0.0 0.14
0.0 0.0 0.0 0.32 0.48 0.14 0.32 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.14 0.0 0.18 0.12 0.0 0.0 0.0
0.59 0.0 0.0 0.0 0.64 0.64 0.41 0.0 0.0 0.0 0.4 1.27 0.44 0.0 0.43 0.0 1.03 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.42
0.03 0.0 0.11 0.44 0.07 0.02 0.2 0.1 0.19 0.08 0.13 0.19 0.33 0.0 0.05 0.22 0.1 0.28 0.06 0.18 0.08 0.11 0.11 0.32 0.39 0.17 0.2 0.38 0.02 0.11 0.22
0.06 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.04 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.06 0.0 0.05 0.13 0.06 0.11 0.0 0.47 0.21 0.22 0.07 0.37 0.0 0.06 0.0 0.15 0.0 0.06 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.06 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.73 7.45 23.37 38.19 4.15 1.69 4.0 5.99 7.32 13.74 10.09 9.02 36.54 2.82 5.61 3.73 5.15 11.74 5.23 6.96 3.29 3.36 0.0 6.24 4.28 5.25 6.19 6.25 3.55 14.89 36.78
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Lsat_1_v5_gn_6_23561.1 (PDH-E1 ALPHA)
 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.07 0.09 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.07 0.16 0.0 0.01 0.04 0.05 0.04 0.0 0.04 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.11 0.01 0.01 0.06 0.17 0.1 0.05 0.04 0.07 0.04 0.06 0.11 0.06
0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.28 0.0 0.95 0.0 0.28 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.3
0.0 0.0 0.0 0.21 0.22 0.26 0.05 0.03 0.02 0.07 0.0 0.16 0.0 0.0 0.03 0.07 0.03 0.06 0.0 0.07 0.02 0.05 0.03 0.0 0.02 0.0 0.05 0.12 0.0 0.07 0.19
0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.11 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.3 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.22 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.36 0.08 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.0 0.25 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.08
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.03 0.0 0.02 0.1 0.05 0.04 0.08 0.29 0.09 0.02 0.08 0.09 0.06 0.05 0.04 0.16 0.01 0.06 0.12 0.05 0.0 0.1 0.03 0.21 0.09
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.87 0.65 4.43 7.02 0.39 0.95 0.58 0.0 0.0 0.46 0.41 3.27 2.17 1.7 0.0 1.91 0.34 0.83 1.19 2.35 0.0 3.01 0.0 0.0 1.67 0.77 4.07 1.68 2.12 0.0 0.0
0.01 0.03 0.0 0.0 0.04 0.06 0.01 0.01 0.04 0.04 0.03 0.1 0.01 0.03 0.04 0.02 0.02 0.02 0.01 0.04 0.04 0.07 0.07 0.01 0.09 0.03 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)