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Heatmap: Cluster_102 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.17 0.42 0.44 0.18 0.88 0.16 -0.53 -0.85 -0.3 -0.28 -0.24 -0.32 -0.24 0.27 0.38 -0.34 -0.41 0.92 -0.13 -0.42 -0.45 -0.41 0.11 -0.33 -0.34 -0.54 -0.34 -0.45 0.28 0.25 0.42
0.29 0.38 0.21 -0.4 0.47 0.34 -0.01 -0.03 -0.67 -0.5 -0.47 -0.73 -0.41 1.0 0.84 0.01 -0.46 0.57 -0.16 -0.56 -0.22 -0.37 0.44 -0.34 -0.36 -0.36 -0.29 -0.42 0.09 -0.21 0.15
0.23 0.22 0.04 -0.02 0.78 0.12 -0.66 -0.97 -0.11 -0.15 0.1 -0.01 0.17 0.25 0.23 -0.13 -0.29 0.29 -0.22 -0.41 -0.41 -0.29 0.57 -0.42 -0.28 -0.21 -0.26 -0.39 0.21 0.16 0.47
0.09 -0.25 0.11 0.3 0.52 0.31 -0.17 -0.4 -0.17 -0.1 -0.0 -0.3 0.01 0.52 0.31 -0.18 -0.35 0.39 -0.19 -0.42 -0.35 -0.06 0.25 -0.46 -0.25 -0.24 -0.14 -0.2 0.17 0.06 0.32
0.75 0.88 -0.15 -0.64 1.55 0.29 -1.55 -1.22 -0.71 -0.72 -0.41 -0.68 -0.15 0.75 0.41 -0.35 -0.83 1.13 -0.64 -1.18 -1.02 -0.83 1.4 -1.21 -1.19 -0.76 -0.86 -1.3 0.07 0.18 0.67
0.66 0.83 -0.23 -0.98 1.2 0.33 -1.17 -1.06 -0.65 -0.73 -0.45 -0.7 -0.03 0.93 0.41 -0.14 -0.57 0.75 -0.39 -1.0 -0.88 -0.66 1.25 -0.9 -0.77 -0.65 -0.62 -1.21 0.17 0.27 0.8
0.57 0.51 0.47 0.18 1.27 0.51 -0.95 -0.93 -0.65 -0.71 -0.35 -0.95 -0.74 0.92 0.59 -0.1 -0.83 0.64 -0.37 -1.04 -0.87 -0.84 0.65 -0.94 -0.73 -0.52 -0.42 -1.34 0.43 0.3 0.69
0.62 0.42 0.47 -0.02 1.22 0.28 -1.11 -1.06 -0.89 -0.83 -0.55 -0.84 -0.47 0.83 0.69 -0.25 -0.68 1.34 -0.35 -0.81 -0.75 -0.65 0.66 -1.04 -0.91 -0.46 -0.62 -1.25 0.29 -0.08 0.72
0.33 0.13 0.44 0.18 0.38 0.26 -0.18 -0.29 -0.52 -0.49 -0.38 -0.61 -0.21 1.04 0.78 0.04 -0.1 0.26 -0.08 -0.49 -0.26 -0.22 0.07 -0.33 -0.37 -0.19 -0.21 -0.2 0.04 -0.24 -0.15
0.95 0.76 0.6 0.7 1.21 0.35 -1.56 -2.23 -0.89 -0.86 -0.79 -0.81 -0.64 0.79 0.39 -0.51 -0.91 1.25 -0.26 -0.95 -1.08 -1.29 0.97 -0.77 -1.31 -0.95 -0.85 -1.31 -0.08 0.11 0.91
0.17 0.4 0.57 0.08 1.08 0.7 -0.59 -0.85 -0.81 -0.66 -0.73 -1.07 -0.68 1.4 1.38 0.08 -0.38 -0.02 0.12 -0.55 -0.39 -0.46 -0.03 -0.63 -0.82 -0.49 -0.39 -0.7 -0.01 -0.45 -0.3
0.77 0.76 0.41 -0.16 0.33 0.65 -0.33 -0.27 -0.49 -0.68 -0.39 -0.78 -0.17 1.12 0.64 0.11 -0.2 -0.39 0.02 -0.52 -0.28 -0.22 0.08 -0.49 -0.51 -0.25 -0.17 -0.4 -0.03 -0.27 -0.41
0.23 0.44 -0.0 -0.14 0.63 0.43 -0.5 -0.88 -0.44 -0.45 -0.24 -0.66 0.22 0.67 0.43 -0.06 -0.39 0.65 -0.24 -0.52 -0.32 -0.32 0.51 -0.51 -0.33 -0.18 -0.21 -0.62 0.24 0.0 0.51
0.69 0.25 0.41 -0.27 0.51 0.37 -0.05 -0.58 -0.34 -0.37 -0.33 -0.45 -0.08 0.68 0.58 0.03 -0.2 -0.1 -0.26 -0.45 -0.27 -0.3 0.48 -0.48 -0.36 -0.21 -0.18 -0.22 0.13 -0.03 -0.08
0.83 0.56 0.2 -0.45 0.45 0.36 -0.49 -0.81 -0.27 -0.31 -0.25 -0.68 -0.07 0.92 0.68 0.03 -0.42 0.15 -0.21 -0.61 -0.56 -0.28 0.97 -0.6 -0.55 -0.27 -0.31 -0.46 -0.02 -0.28 0.02
0.52 0.38 0.47 0.15 0.62 0.5 -0.17 -0.28 -0.58 -0.56 -0.47 -0.54 -0.17 0.74 0.55 -0.12 -0.37 0.11 -0.14 -0.35 -0.28 -0.2 0.09 -0.35 -0.19 -0.2 -0.18 -0.28 -0.06 -0.24 0.12
0.23 0.01 0.22 0.33 0.89 0.24 -0.78 -1.15 -0.28 -0.29 -0.43 -0.36 -0.31 0.73 0.4 -0.26 -0.63 0.54 -0.33 -0.75 -0.8 -0.66 1.16 -0.62 -0.73 -0.45 -0.51 -0.69 0.43 0.34 0.76
1.07 0.98 0.87 0.57 0.88 0.03 -1.22 -1.18 -0.75 -0.74 -0.88 -0.88 -0.49 0.26 0.2 -0.52 -1.17 1.4 -0.21 -0.62 -0.19 -0.27 0.36 -0.46 -0.67 -0.8 -0.32 -0.82 -0.0 0.01 -0.05
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0.17 0.24 0.19 0.32 0.87 0.85 -0.94 -1.19 -0.53 -0.5 -0.42 -0.6 -0.35 0.89 0.57 0.27 0.08 0.04 0.03 -0.4 -0.24 -0.09 0.42 -0.65 -0.36 -0.06 0.01 -0.14 -0.27 -0.47 -0.38
0.62 0.85 0.53 0.07 0.92 0.26 -1.54 -0.63 -0.48 -0.52 -0.54 -0.18 -0.03 0.67 0.21 -0.37 -0.71 0.45 -0.66 -0.69 -0.89 -0.57 0.61 -0.35 -0.35 -0.8 -0.52 -0.82 0.29 0.3 0.82
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Lsat_1_v5_gn_6_109140.1 (AUXILIN-LIKE3)
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0.08 0.15 0.15 -0.25 0.08 0.17 -0.08 0.18 -0.55 -0.44 -0.4 -0.19 0.55 0.33 0.05 0.05 0.09 0.06 -0.3 -0.31 -0.23 -0.1 0.29 -0.14 -0.11 -0.08 -0.15 -0.08 -0.07 -0.05 0.58
0.22 1.49 0.27 -1.61 1.64 0.69 -1.33 -1.19 -1.52 -1.49 -0.84 -0.89 -0.72 1.38 1.03 -0.06 -0.61 2.23 -0.66 -1.01 -1.11 -1.25 -0.86 -1.84 -1.04 -0.84 -0.82 -1.71 -0.88 -0.74 -0.63
-0.05 1.4 0.13 -0.96 1.99 1.3 -1.93 -2.07 -1.35 -0.95 -1.17 -1.41 -1.02 0.83 0.9 -0.16 -1.17 2.51 -0.25 -1.51 -0.95 -3.01 -0.25 -3.41 -2.35 -0.76 -0.8 -1.25 -1.4 -1.52 -0.6
0.23 0.05 0.02 -0.43 0.48 -0.11 -0.37 -0.43 -0.51 -0.23 -0.42 -0.45 0.32 0.79 0.57 0.08 0.07 0.66 0.38 -0.09 -0.44 -0.68 -0.25 -0.5 -0.46 -0.05 -0.25 -0.25 -0.43 0.25 0.64
0.89 1.36 0.95 0.17 -0.36 -0.03 0.41 -0.78 0.27 -0.86 -0.09 -1.08 0.08 1.91 -0.59 -0.8 -0.74 -5.46 -0.15 -0.72 -0.71 -1.53 -1.99 -0.78 -0.38 -0.25 -0.08 -0.8 0.24 0.4 0.08
0.87 0.98 0.28 -0.26 1.43 0.3 -1.13 -1.32 -0.81 -0.76 -0.34 -0.56 -0.65 0.74 0.85 -0.24 -0.72 0.92 -0.31 -1.06 -0.82 -0.69 -0.06 -0.95 -0.82 -0.74 -0.64 -1.01 0.31 0.17 0.74
0.39 0.81 0.38 -0.49 1.24 0.63 -1.8 -1.27 -0.83 -0.65 -0.34 -0.31 0.39 0.65 0.13 -0.01 -0.47 0.57 -0.38 -0.8 -0.87 -0.65 0.66 -0.49 -0.44 -0.53 -0.36 -0.27 0.19 0.2 0.24
0.34 0.42 0.57 0.48 0.56 0.37 -0.19 -0.53 -0.43 -0.33 -0.24 -0.37 -0.95 0.94 0.92 -0.06 -0.3 0.56 0.21 -0.34 -0.25 -0.34 0.14 -0.71 -0.57 -0.43 -0.21 -0.23 -0.25 -0.44 -1.21
0.48 0.31 0.65 0.11 0.21 0.58 -0.48 -0.41 -0.79 -0.86 -0.58 -0.74 -0.5 1.0 0.48 0.2 -0.14 -0.27 0.12 -0.46 -0.31 -0.17 0.52 -0.33 -0.29 -0.1 -0.12 -0.33 -0.03 -0.06 0.1
1.18 0.42 0.21 -0.74 0.44 0.87 -0.6 -0.14 -2.19 -2.39 -1.03 -2.27 -0.38 2.02 1.63 0.07 -0.39 0.06 -0.65 -1.03 -1.21 -1.14 0.63 -1.0 -0.7 -1.16 -1.26 -0.75 0.09 -0.52 0.16
1.28 1.11 0.88 0.82 1.03 0.19 -0.52 0.13 -1.03 -1.08 -0.93 -0.86 -1.32 2.3 1.48 -1.1 -1.35 -2.06 -0.07 -1.5 -1.28 -1.17 -1.87 -1.06 -1.41 -1.47 -1.3 -0.94 -0.22 -0.96 -0.73
0.17 0.21 0.42 0.33 0.39 0.38 -0.17 -0.17 -0.43 -0.36 -0.26 -0.43 0.19 0.49 0.28 0.04 -0.08 0.27 -0.18 -0.4 -0.13 -0.19 0.02 -0.41 -0.2 -0.06 -0.07 -0.09 0.15 -0.22 -0.32
0.02 0.46 -0.05 -0.78 0.61 0.0 -0.21 0.1 -0.45 -0.82 -0.33 -0.52 0.56 0.47 0.43 0.23 0.28 0.95 0.0 -0.16 -0.41 -0.31 -0.17 -0.3 -0.19 -0.11 -0.11 -0.35 -0.37 -0.3 0.05
0.92 1.42 1.39 0.46 0.69 0.39 -1.28 -1.5 -1.13 -0.3 -0.69 -1.59 -0.85 0.79 0.49 0.16 -0.77 1.45 -1.22 -1.36 -0.88 -0.69 0.17 -1.34 -1.39 -0.68 -0.2 -0.97 -0.11 -0.18 -0.53
-0.06 0.25 -0.22 -0.06 0.45 0.31 -0.41 -0.7 -0.3 -0.16 -0.16 -0.28 -0.0 0.55 0.33 -0.12 -0.16 0.76 -0.01 -0.22 -0.28 -0.29 0.22 -0.37 -0.32 -0.0 -0.18 -0.31 0.21 0.2 0.24
0.05 0.07 0.52 0.68 0.77 0.86 -0.25 -0.22 -0.54 -0.36 -0.3 -0.37 -0.2 0.43 0.24 0.23 -0.07 0.24 -0.32 -0.55 -0.23 -0.2 0.42 -0.71 -0.37 -0.27 -0.31 0.06 0.08 -0.38 -1.09
1.64 1.69 1.16 0.15 0.62 0.91 -0.6 -0.49 -2.64 -1.57 -1.07 -2.62 -0.57 0.62 -0.14 -0.4 -2.04 1.87 -0.26 -0.87 -1.24 -1.35 1.23 -1.61 -1.42 -2.24 -0.4 -2.0 -1.75 -1.1 -1.35
0.36 0.14 0.48 -0.11 0.58 0.52 -0.34 -0.34 -0.19 -0.09 -0.36 -0.42 -0.68 0.87 0.46 0.15 -0.26 -0.59 -0.05 -0.37 -0.37 -0.22 0.37 -0.33 -0.21 -0.1 -0.12 -0.5 0.22 0.02 -0.08
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0.7 0.05 0.04 -1.46 0.43 0.48 -1.0 -2.07 -1.3 -1.32 -1.49 -1.2 0.96 1.54 0.79 0.45 0.15 0.76 -0.38 -0.87 -0.94 -1.19 0.38 -0.36 -0.27 -0.25 -0.62 -0.4 -0.66 -0.49 1.23
0.18 1.05 -0.0 -0.25 0.84 0.37 -1.0 -0.77 -1.25 -0.18 -0.38 -0.72 -0.15 1.09 0.51 -0.65 -0.84 0.8 -0.22 -1.05 -0.43 -0.51 0.82 -0.58 -0.56 -0.47 -0.23 -1.08 0.23 -0.15 0.75

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.