1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_102 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.6 0.71 0.72 0.6 0.97 0.59 0.37 0.29 0.43 0.44 0.45 0.43 0.45 0.64 0.69 0.42 0.4 1.0 0.49 0.4 0.39 0.4 0.57 0.42 0.42 0.36 0.42 0.39 0.64 0.63 0.71
0.61 0.65 0.58 0.38 0.69 0.63 0.5 0.49 0.31 0.35 0.36 0.3 0.38 1.0 0.89 0.5 0.36 0.74 0.45 0.34 0.43 0.39 0.68 0.4 0.39 0.39 0.41 0.37 0.53 0.43 0.55
0.68 0.68 0.6 0.58 1.0 0.63 0.37 0.3 0.54 0.53 0.62 0.58 0.66 0.69 0.68 0.53 0.48 0.71 0.5 0.44 0.44 0.48 0.87 0.43 0.48 0.5 0.49 0.44 0.68 0.65 0.81
0.74 0.59 0.75 0.86 1.0 0.87 0.62 0.53 0.62 0.65 0.7 0.57 0.71 1.0 0.86 0.62 0.55 0.92 0.61 0.52 0.55 0.67 0.83 0.51 0.59 0.59 0.64 0.61 0.79 0.73 0.87
0.57 0.63 0.31 0.22 1.0 0.42 0.12 0.15 0.21 0.21 0.26 0.21 0.31 0.58 0.45 0.27 0.19 0.75 0.22 0.15 0.17 0.19 0.9 0.15 0.15 0.2 0.19 0.14 0.36 0.39 0.54
0.66 0.75 0.36 0.21 0.96 0.53 0.19 0.2 0.27 0.25 0.31 0.26 0.41 0.8 0.56 0.38 0.28 0.71 0.32 0.21 0.23 0.27 1.0 0.22 0.25 0.27 0.27 0.18 0.47 0.51 0.73
0.61 0.59 0.57 0.47 1.0 0.59 0.21 0.22 0.26 0.25 0.32 0.21 0.25 0.78 0.62 0.39 0.23 0.64 0.32 0.2 0.23 0.23 0.65 0.22 0.25 0.29 0.31 0.16 0.56 0.51 0.67
0.61 0.53 0.55 0.39 0.92 0.48 0.18 0.19 0.21 0.22 0.27 0.22 0.29 0.7 0.64 0.33 0.25 1.0 0.31 0.23 0.23 0.25 0.62 0.19 0.21 0.29 0.26 0.17 0.48 0.37 0.65
0.61 0.53 0.66 0.55 0.63 0.58 0.43 0.4 0.34 0.35 0.37 0.32 0.42 1.0 0.83 0.5 0.46 0.58 0.46 0.35 0.41 0.42 0.51 0.39 0.38 0.43 0.42 0.42 0.5 0.41 0.44
0.81 0.71 0.64 0.68 0.97 0.54 0.14 0.09 0.23 0.23 0.24 0.24 0.27 0.73 0.55 0.29 0.22 1.0 0.35 0.22 0.2 0.17 0.82 0.25 0.17 0.22 0.23 0.17 0.4 0.45 0.79
0.43 0.5 0.56 0.4 0.8 0.62 0.25 0.21 0.22 0.24 0.23 0.18 0.24 1.0 0.98 0.4 0.29 0.37 0.41 0.26 0.29 0.28 0.37 0.24 0.21 0.27 0.29 0.23 0.38 0.28 0.31
0.78 0.78 0.61 0.41 0.58 0.72 0.37 0.38 0.33 0.29 0.35 0.27 0.41 1.0 0.71 0.49 0.4 0.35 0.46 0.32 0.38 0.39 0.49 0.33 0.32 0.39 0.41 0.35 0.45 0.38 0.35
0.74 0.85 0.63 0.57 0.98 0.85 0.45 0.34 0.46 0.46 0.53 0.4 0.73 1.0 0.85 0.6 0.48 0.98 0.53 0.44 0.5 0.5 0.9 0.44 0.5 0.56 0.54 0.41 0.74 0.63 0.89
1.0 0.74 0.82 0.51 0.88 0.8 0.6 0.42 0.49 0.48 0.49 0.45 0.58 0.99 0.93 0.63 0.54 0.58 0.52 0.46 0.51 0.5 0.87 0.44 0.48 0.54 0.55 0.53 0.68 0.61 0.59
0.91 0.75 0.59 0.37 0.7 0.66 0.36 0.29 0.42 0.41 0.43 0.32 0.49 0.96 0.82 0.52 0.38 0.57 0.44 0.34 0.35 0.42 1.0 0.34 0.35 0.42 0.41 0.37 0.51 0.42 0.52
0.86 0.78 0.83 0.66 0.92 0.85 0.53 0.49 0.4 0.41 0.43 0.41 0.53 1.0 0.88 0.55 0.46 0.65 0.54 0.47 0.49 0.52 0.64 0.47 0.53 0.52 0.53 0.49 0.57 0.51 0.65
0.52 0.45 0.52 0.56 0.83 0.53 0.26 0.2 0.37 0.37 0.33 0.35 0.36 0.74 0.59 0.37 0.29 0.65 0.36 0.27 0.26 0.28 1.0 0.29 0.27 0.33 0.31 0.28 0.6 0.57 0.76
0.8 0.75 0.69 0.57 0.7 0.39 0.16 0.17 0.23 0.23 0.21 0.21 0.27 0.46 0.44 0.26 0.17 1.0 0.33 0.25 0.33 0.32 0.49 0.28 0.24 0.22 0.3 0.22 0.38 0.38 0.37
0.77 0.93 0.77 0.52 1.0 0.81 0.53 0.58 0.53 0.55 0.55 0.59 0.63 0.64 0.81 0.58 0.59 0.96 0.63 0.54 0.52 0.53 0.76 0.5 0.58 0.47 0.54 0.54 0.7 0.75 0.86
0.77 0.7 0.74 0.45 0.61 0.59 0.45 0.48 0.37 0.4 0.39 0.44 0.71 1.0 0.67 0.57 0.57 0.68 0.48 0.4 0.42 0.45 0.95 0.44 0.43 0.51 0.44 0.49 0.59 0.57 0.86
1.0 0.69 0.62 0.35 0.59 0.65 0.45 0.45 0.34 0.3 0.42 0.37 0.49 0.81 0.71 0.44 0.39 0.97 0.63 0.38 0.4 0.42 0.82 0.37 0.41 0.43 0.44 0.36 0.47 0.43 0.62
0.71 0.64 0.64 0.52 0.75 0.57 0.38 0.32 0.44 0.47 0.52 0.43 0.51 0.9 0.71 0.53 0.45 0.82 0.49 0.42 0.43 0.43 1.0 0.41 0.46 0.47 0.5 0.38 0.63 0.64 0.84
0.61 0.64 0.62 0.67 0.99 0.98 0.28 0.24 0.37 0.38 0.4 0.36 0.42 1.0 0.8 0.65 0.57 0.56 0.55 0.41 0.46 0.51 0.72 0.35 0.42 0.52 0.55 0.49 0.45 0.39 0.42
0.82 0.95 0.77 0.55 1.0 0.63 0.18 0.34 0.38 0.37 0.36 0.47 0.52 0.84 0.61 0.41 0.32 0.72 0.33 0.33 0.29 0.36 0.81 0.41 0.42 0.3 0.37 0.3 0.65 0.65 0.93
0.43 0.76 0.26 0.25 0.78 0.56 0.15 0.1 0.15 0.17 0.17 0.13 0.13 0.38 0.41 0.22 0.16 1.0 0.34 0.2 0.17 0.13 0.24 0.14 0.1 0.15 0.15 0.09 0.29 0.22 0.26
0.47 0.66 0.45 0.2 0.73 0.52 0.26 0.22 0.31 0.26 0.29 0.18 0.32 0.77 0.68 0.31 0.32 1.0 0.46 0.28 0.26 0.28 0.52 0.3 0.24 0.25 0.26 0.19 0.56 0.52 0.58
0.6 0.65 0.52 0.65 0.79 0.67 0.36 0.35 0.39 0.41 0.47 0.38 0.39 1.0 0.82 0.65 0.51 0.6 0.27 0.38 0.4 0.4 0.86 0.35 0.39 0.41 0.53 0.36 0.55 0.49 0.46
0.15 0.8 0.12 0.0 1.0 0.31 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.09 0.17 0.2 0.0 0.03 0.86 0.18 0.01 0.01 0.09 0.0 0.05 0.08 0.02 0.0 0.07 0.01 0.13 0.05
0.53 0.52 0.42 0.23 0.35 0.37 0.14 0.13 0.08 0.05 0.11 0.07 0.09 1.0 0.41 0.08 0.04 0.11 0.15 0.06 0.15 0.12 0.07 0.09 0.12 0.08 0.14 0.19 0.24 0.13 0.17
0.92 1.0 0.34 0.3 0.9 0.42 0.29 0.15 0.11 0.1 0.14 0.13 0.4 0.76 0.76 0.49 0.26 0.71 0.26 0.13 0.04 0.21 0.17 0.17 0.3 0.29 0.15 0.16 0.3 0.33 0.4
0.73 0.74 0.9 0.86 0.66 0.65 0.35 0.3 0.33 0.32 0.33 0.34 0.56 1.0 0.62 0.58 0.52 0.74 0.46 0.34 0.45 0.45 0.79 0.34 0.44 0.51 0.51 0.48 0.67 0.56 0.42
0.72 0.56 0.81 0.51 0.96 0.72 0.37 0.28 0.45 0.41 0.52 0.4 0.3 1.0 0.87 0.59 0.51 0.63 0.43 0.4 0.41 0.51 0.71 0.32 0.35 0.46 0.46 0.38 0.53 0.57 0.53
0.84 0.69 0.63 0.53 0.54 0.54 0.46 0.52 0.38 0.41 0.43 0.44 0.77 1.0 0.72 0.56 0.5 0.64 0.54 0.45 0.41 0.46 0.91 0.45 0.52 0.45 0.46 0.44 0.5 0.55 0.79
0.63 0.71 0.57 0.51 0.78 0.58 0.36 0.23 0.46 0.42 0.46 0.4 0.47 0.84 0.64 0.45 0.48 0.79 0.46 0.38 0.4 0.41 1.0 0.38 0.41 0.38 0.44 0.36 0.57 0.54 0.68
0.83 0.86 0.87 0.76 0.98 0.89 0.6 0.53 0.48 0.5 0.52 0.53 0.76 0.82 0.75 0.59 0.62 1.0 0.55 0.56 0.59 0.55 0.84 0.6 0.61 0.54 0.58 0.7 0.74 0.71 0.73
0.68 0.58 0.76 0.73 0.88 0.76 0.58 0.49 0.53 0.56 0.56 0.47 0.56 1.0 0.9 0.81 0.7 0.77 0.58 0.48 0.55 0.54 0.69 0.45 0.48 0.53 0.57 0.7 0.63 0.58 0.51
0.44 0.39 0.49 0.41 0.61 0.51 0.3 0.27 0.22 0.22 0.23 0.19 0.28 1.0 0.66 0.33 0.3 0.21 0.31 0.26 0.27 0.28 0.45 0.21 0.24 0.27 0.28 0.38 0.23 0.16 0.14
0.69 0.65 0.86 0.77 0.85 0.78 0.56 0.57 0.47 0.55 0.63 0.53 0.61 1.0 0.88 0.72 0.57 0.73 0.66 0.53 0.52 0.56 0.66 0.47 0.52 0.57 0.58 0.55 0.69 0.64 0.67
0.76 0.67 0.87 0.84 0.94 0.76 0.49 0.42 0.53 0.53 0.58 0.54 0.64 1.0 0.85 0.62 0.56 0.85 0.69 0.51 0.51 0.6 0.62 0.52 0.58 0.59 0.64 0.57 0.71 0.65 0.83
Lsat_1_v5_gn_6_109140.1 (AUXILIN-LIKE3)
 0.83 0.7 0.9 0.84 0.69 0.57 0.37 0.27 0.39 0.43 0.43 0.41 0.5 0.9 0.64 0.5 0.48 1.0 0.49 0.38 0.42 0.43 0.58 0.34 0.39 0.43 0.47 0.46 0.5 0.47 0.48
0.54 0.59 0.46 0.42 0.52 0.53 0.53 0.47 0.34 0.29 0.32 0.29 0.37 1.0 0.75 0.46 0.42 0.5 0.57 0.4 0.42 0.41 0.53 0.36 0.38 0.41 0.44 0.38 0.43 0.38 0.38
0.82 0.71 0.62 0.51 1.0 0.73 0.54 0.54 0.46 0.43 0.54 0.46 0.58 0.98 0.84 0.58 0.54 0.72 0.6 0.49 0.52 0.48 0.57 0.5 0.49 0.5 0.5 0.52 0.58 0.59 0.62
0.78 0.64 0.61 0.31 1.0 0.65 0.28 0.23 0.25 0.27 0.28 0.26 0.31 0.63 0.48 0.42 0.32 0.91 0.2 0.15 0.23 0.25 0.41 0.21 0.27 0.28 0.28 0.21 0.29 0.42 0.66
0.68 0.7 0.9 0.83 0.96 0.78 0.38 0.31 0.29 0.31 0.37 0.31 0.39 1.0 0.74 0.46 0.36 0.91 0.42 0.32 0.37 0.35 0.54 0.33 0.41 0.36 0.5 0.36 0.51 0.34 0.34
0.65 0.64 0.59 0.54 0.74 0.59 0.42 0.38 0.41 0.4 0.41 0.43 0.64 0.65 0.62 0.39 0.41 1.0 0.43 0.39 0.38 0.39 0.46 0.39 0.4 0.38 0.43 0.49 0.49 0.47 0.47
0.38 0.54 0.3 0.27 0.72 0.7 0.16 0.06 0.2 0.24 0.22 0.17 0.25 0.58 0.53 0.23 0.2 1.0 0.53 0.27 0.16 0.2 0.48 0.18 0.15 0.22 0.15 0.15 0.46 0.32 0.37
0.78 0.56 0.86 0.66 0.51 0.43 0.29 0.27 0.26 0.26 0.29 0.26 0.41 1.0 0.52 0.4 0.4 0.94 0.38 0.31 0.31 0.36 0.63 0.3 0.32 0.38 0.36 0.35 0.39 0.37 0.44
0.72 0.65 0.54 0.46 0.74 0.63 0.44 0.4 0.37 0.34 0.35 0.32 0.34 0.61 0.58 0.46 0.35 1.0 0.88 0.45 0.37 0.4 0.61 0.35 0.35 0.36 0.37 0.38 0.57 0.47 0.46
0.71 0.74 0.74 0.56 0.71 0.76 0.63 0.76 0.46 0.49 0.51 0.59 0.98 0.84 0.69 0.69 0.71 0.7 0.54 0.54 0.57 0.62 0.82 0.61 0.62 0.63 0.6 0.64 0.64 0.65 1.0
0.25 0.6 0.26 0.07 0.67 0.34 0.08 0.09 0.07 0.08 0.12 0.12 0.13 0.56 0.43 0.2 0.14 1.0 0.14 0.11 0.1 0.09 0.12 0.06 0.1 0.12 0.12 0.06 0.12 0.13 0.14
0.17 0.46 0.19 0.09 0.69 0.43 0.05 0.04 0.07 0.09 0.08 0.07 0.09 0.31 0.33 0.16 0.08 1.0 0.15 0.06 0.09 0.02 0.15 0.02 0.03 0.1 0.1 0.07 0.07 0.06 0.12
0.68 0.6 0.58 0.43 0.81 0.53 0.45 0.43 0.4 0.49 0.43 0.42 0.72 1.0 0.86 0.61 0.6 0.91 0.75 0.54 0.43 0.36 0.48 0.41 0.42 0.56 0.49 0.49 0.43 0.69 0.9
0.49 0.68 0.51 0.3 0.21 0.26 0.35 0.15 0.32 0.15 0.25 0.13 0.28 1.0 0.18 0.15 0.16 0.01 0.24 0.16 0.16 0.09 0.07 0.15 0.2 0.22 0.25 0.15 0.31 0.35 0.28
0.68 0.73 0.45 0.31 1.0 0.46 0.17 0.15 0.21 0.22 0.29 0.25 0.24 0.62 0.67 0.31 0.22 0.7 0.3 0.18 0.21 0.23 0.36 0.19 0.21 0.22 0.24 0.19 0.46 0.42 0.62
0.55 0.74 0.55 0.3 1.0 0.65 0.12 0.18 0.24 0.27 0.33 0.34 0.55 0.66 0.46 0.42 0.3 0.63 0.33 0.24 0.23 0.27 0.67 0.3 0.31 0.29 0.33 0.35 0.48 0.48 0.5
0.66 0.7 0.78 0.73 0.77 0.67 0.46 0.36 0.39 0.42 0.44 0.4 0.27 1.0 0.99 0.5 0.43 0.77 0.61 0.41 0.44 0.41 0.58 0.32 0.35 0.39 0.45 0.45 0.44 0.39 0.23
0.7 0.62 0.79 0.54 0.58 0.75 0.36 0.38 0.29 0.28 0.34 0.3 0.35 1.0 0.7 0.58 0.45 0.42 0.54 0.36 0.41 0.44 0.72 0.4 0.41 0.47 0.46 0.4 0.49 0.48 0.54
0.56 0.33 0.29 0.15 0.33 0.45 0.16 0.22 0.05 0.05 0.12 0.05 0.19 1.0 0.77 0.26 0.19 0.26 0.16 0.12 0.11 0.11 0.38 0.12 0.15 0.11 0.1 0.15 0.26 0.17 0.28
0.49 0.44 0.37 0.36 0.41 0.23 0.14 0.22 0.1 0.1 0.11 0.11 0.08 1.0 0.56 0.09 0.08 0.05 0.19 0.07 0.08 0.09 0.06 0.1 0.08 0.07 0.08 0.11 0.17 0.1 0.12
0.8 0.82 0.95 0.9 0.94 0.93 0.63 0.63 0.53 0.55 0.6 0.53 0.81 1.0 0.86 0.73 0.68 0.86 0.63 0.54 0.65 0.62 0.72 0.53 0.62 0.68 0.68 0.67 0.79 0.61 0.57
0.53 0.71 0.5 0.3 0.79 0.52 0.45 0.56 0.38 0.29 0.41 0.36 0.77 0.72 0.7 0.61 0.63 1.0 0.52 0.46 0.39 0.42 0.46 0.42 0.45 0.48 0.48 0.41 0.4 0.42 0.54
0.7 0.98 0.96 0.51 0.59 0.48 0.15 0.13 0.17 0.3 0.23 0.12 0.2 0.63 0.51 0.41 0.21 1.0 0.16 0.14 0.2 0.23 0.41 0.14 0.14 0.23 0.32 0.19 0.34 0.32 0.25
0.57 0.71 0.51 0.57 0.81 0.73 0.45 0.36 0.48 0.53 0.53 0.49 0.59 0.87 0.74 0.54 0.53 1.0 0.59 0.51 0.49 0.48 0.69 0.46 0.48 0.59 0.52 0.48 0.68 0.68 0.7
0.57 0.58 0.79 0.89 0.95 1.0 0.46 0.48 0.38 0.43 0.45 0.43 0.48 0.75 0.65 0.65 0.52 0.65 0.44 0.38 0.47 0.48 0.74 0.34 0.43 0.46 0.45 0.58 0.58 0.43 0.26
0.85 0.88 0.61 0.3 0.42 0.51 0.18 0.19 0.04 0.09 0.13 0.04 0.18 0.42 0.25 0.21 0.07 1.0 0.23 0.15 0.12 0.11 0.64 0.09 0.1 0.06 0.21 0.07 0.08 0.13 0.11
0.7 0.6 0.76 0.5 0.82 0.78 0.43 0.43 0.48 0.51 0.42 0.41 0.34 1.0 0.75 0.61 0.45 0.36 0.53 0.42 0.42 0.47 0.71 0.43 0.47 0.51 0.5 0.39 0.64 0.55 0.52
0.78 0.93 0.7 0.58 0.83 0.68 0.41 0.37 0.48 0.47 0.55 0.47 0.66 0.92 0.75 0.61 0.52 0.74 0.57 0.45 0.5 0.57 1.0 0.49 0.52 0.62 0.57 0.48 0.69 0.74 0.96
0.56 0.36 0.35 0.12 0.46 0.48 0.17 0.08 0.14 0.14 0.12 0.15 0.67 1.0 0.59 0.47 0.38 0.58 0.26 0.19 0.18 0.15 0.45 0.27 0.29 0.29 0.22 0.26 0.22 0.25 0.81
0.53 0.97 0.47 0.39 0.84 0.61 0.23 0.28 0.2 0.41 0.36 0.28 0.42 1.0 0.67 0.3 0.26 0.82 0.4 0.23 0.35 0.33 0.83 0.31 0.32 0.34 0.4 0.22 0.55 0.42 0.79

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)