Heatmap: Cluster_84 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_32900.1	-0.87	-1.41	-1.11	-0.5	0.37	-0.06	-0.49	-1.02	-0.45	-0.07	-0.35	-0.21	0.23	0.96	0.77	-0.13	-0.35	1.15	-0.07	-0.27	-0.59	-0.96	0.79	-0.64	-0.35	-0.06	-0.35	-0.48	0.43	0.52	1.01
Lsat_1_v5_gn_1_102000.1	-0.83	-0.34	-0.76	0.26	1.21	0.28	-1.22	-1.16	-0.28	-0.33	-0.17	-0.38	-1.22	1.14	0.87	-0.04	-0.51	1.07	-0.21	-0.79	-0.69	-0.66	0.71	-1.19	-0.79	-0.73	-0.43	-1.01	0.59	0.5	0.87
Lsat_1_v5_gn_1_10941.1	-0.07	-0.14	-0.03	0.06	0.43	0.09	-0.45	-0.64	-0.14	-0.1	0.08	-0.09	-0.24	0.55	0.6	0.03	-0.25	0.12	-0.03	-0.29	-0.31	-0.19	0.3	-0.45	-0.3	-0.09	-0.14	-0.48	0.24	0.28	0.61
Lsat_1_v5_gn_1_2340.1 (AtFDB13)	-0.1	-0.12	-0.52	-0.06	0.45	0.23	-0.6	-0.25	-0.53	-0.45	-0.35	-0.26	-0.36	1.18	0.46	-0.48	-0.85	0.92	-0.41	-0.86	-0.73	-0.47	0.71	-0.42	-0.53	-0.19	-0.2	-1.26	0.25	0.44	1.27
Lsat_1_v5_gn_1_36841.1 (PAPS2)	-0.43	-0.26	-0.01	0.37	0.49	0.05	-0.35	-0.5	-0.08	-0.02	0.09	0.01	-0.22	0.78	0.59	-0.11	-0.25	0.32	-0.11	-0.3	-0.32	-0.41	0.14	-0.56	-0.53	-0.28	-0.22	-0.59	0.27	0.31	0.63
Lsat_1_v5_gn_1_42641.1 (RPK2)	0.09	-0.42	-0.15	-0.37	0.78	0.54	-1.05	-0.98	-0.9	-1.01	-0.55	-0.86	-0.23	0.93	0.46	-0.38	-0.74	0.63	-0.47	-0.75	-0.63	-0.86	1.02	-0.89	-0.56	-0.52	-0.41	-1.01	0.31	0.43	1.9
Lsat_1_v5_gn_1_73301.1 (IRR)	-0.36	-0.17	-0.19	0.19	0.35	0.07	-0.08	0.07	-0.13	-0.03	0.11	-0.03	0.03	0.59	0.4	-0.06	-0.28	-0.15	-0.07	-0.32	-0.37	-0.3	0.26	-0.3	-0.2	-0.13	-0.17	-0.56	0.24	0.29	0.49
Lsat_1_v5_gn_1_98921.1	-0.61	-0.51	-0.07	0.15	1.0	0.44	-0.47	-0.42	-0.27	-0.26	-0.3	-0.33	-0.85	1.01	0.62	-0.05	-0.35	0.17	-0.18	-0.47	-0.69	-0.62	0.55	-0.84	-0.69	-0.15	-0.29	-0.65	0.59	0.41	0.86
Lsat_1_v5_gn_2_108761.1	-1.46	-0.55	-1.04	-0.62	0.1	-0.23	-0.56	-0.84	0.08	0.0	0.17	-0.38	-0.0	0.67	0.88	0.06	-0.42	1.11	0.35	-0.25	-0.53	-0.05	-0.48	-0.52	-0.31	-0.13	-0.51	-1.4	0.43	0.89	1.11
Lsat_1_v5_gn_2_1100.1	-0.74	-0.4	-0.27	0.24	0.86	0.4	-0.72	-1.1	-0.28	-0.16	-0.28	-0.33	-0.16	0.7	0.43	-0.21	-0.36	0.74	-0.41	-0.52	-0.44	-0.41	0.59	-0.63	-0.43	-0.38	-0.55	-0.81	0.34	0.39	1.31
Lsat_1_v5_gn_2_117840.1 (CASPL5B2)	-0.58	-0.58	-0.63	-0.29	-0.03	0.09	-0.34	-0.44	0.11	0.01	0.35	-0.12	-0.21	0.53	0.42	0.14	0.07	0.91	0.56	-0.25	-0.39	-0.29	-0.27	-0.27	-0.21	0.01	-0.23	-0.41	-0.06	0.14	0.64
Lsat_1_v5_gn_2_1980.1 (FAC1)	-1.08	-0.54	-0.08	0.13	-0.4	-0.51	-0.6	-0.76	0.04	0.34	0.17	0.03	-0.58	0.59	0.46	-0.12	-0.42	0.08	0.09	-0.26	-0.29	-0.01	0.44	-0.36	-0.33	0.03	-0.17	-0.68	0.48	0.53	1.23
Lsat_1_v5_gn_2_241.1	-0.48	-0.01	-0.69	-0.28	0.72	0.54	-0.18	-0.34	-0.32	-0.51	-0.26	-0.52	0.04	0.78	0.49	0.07	-0.11	0.03	-0.33	-0.41	-0.45	-0.4	0.55	-0.47	-0.26	-0.25	-0.15	-0.51	0.35	0.49	0.75
Lsat_1_v5_gn_2_261.1	-0.23	0.07	-0.54	-0.33	0.86	0.65	-0.1	-0.35	-0.33	-0.51	-0.37	-0.5	0.02	0.86	0.5	0.1	-0.18	0.04	-0.44	-0.62	-0.34	-0.34	0.48	-0.6	-0.53	-0.3	-0.19	-0.46	0.33	0.42	0.66
Lsat_1_v5_gn_2_281.1 (CAR1)	-0.36	0.12	-0.26	-0.18	0.66	0.41	-0.14	-0.37	-0.33	-0.39	-0.25	-0.33	0.12	0.74	0.58	0.12	-0.11	0.04	-0.29	-0.59	-0.46	-0.44	0.36	-0.54	-0.44	-0.14	-0.04	-0.49	0.33	0.29	0.69
Lsat_1_v5_gn_2_340.1	-0.14	0.42	-0.35	-0.2	0.93	0.44	-0.15	-0.56	-0.41	-0.49	-0.47	-0.62	-0.1	0.76	0.54	0.19	-0.1	-0.06	-0.41	-0.55	-0.42	-0.32	0.64	-0.71	-0.39	-0.17	-0.36	-0.45	0.35	0.45	0.44
Lsat_1_v5_gn_2_50401.1 (PBL16)	-0.42	0.06	-0.72	-0.35	0.7	0.26	-0.35	-0.33	-0.24	-0.33	-0.15	-0.27	-0.06	0.69	0.56	0.01	-0.22	0.23	-0.17	-0.38	-0.24	-0.27	0.44	-0.28	-0.16	-0.18	-0.09	-0.54	0.27	0.33	0.65
Lsat_1_v5_gn_2_60401.1	-0.3	-0.34	-0.25	-0.07	1.01	0.12	-0.58	-0.56	-0.18	-0.36	-0.11	-0.31	-0.31	0.95	0.67	-0.11	-0.34	0.8	-0.44	-0.39	-0.42	-0.46	0.37	-0.77	-0.58	-0.43	-0.39	-0.77	0.49	0.36	0.76
Lsat_1_v5_gn_2_70720.1	-1.02	-1.13	-0.09	0.09	0.5	0.26	-0.92	-1.45	-0.09	0.06	0.09	-0.33	-0.16	0.99	0.62	0.03	-0.18	0.63	0.14	-0.65	-0.27	-0.38	0.09	-0.6	-0.38	-0.19	-0.41	-0.72	0.39	0.57	0.98
Lsat_1_v5_gn_2_75001.1 (PAT10)	-0.1	-0.11	0.09	-0.04	0.5	0.26	-0.71	-0.61	-0.24	-0.07	-0.03	-0.37	-0.05	0.47	0.24	-0.07	-0.29	0.54	-0.0	-0.3	-0.42	-0.22	0.53	-0.3	-0.37	-0.13	-0.08	-0.44	0.24	0.2	0.65
Lsat_1_v5_gn_2_83960.1	-0.95	-0.52	-0.45	-0.26	0.66	0.28	-0.59	-0.39	0.04	0.17	0.18	-0.1	-0.74	1.16	0.96	0.07	-0.39	0.45	-0.12	-0.34	-0.25	-0.36	0.58	-0.65	-0.71	-0.67	-0.34	-0.67	0.3	0.31	0.3
Lsat_1_v5_gn_2_880.1 (sks18)	-0.44	0.02	0.17	0.17	0.63	0.41	-0.2	-0.44	-0.61	-0.64	-0.31	-0.38	-0.18	0.87	0.65	-0.02	-0.43	-0.71	-0.25	-0.75	-0.72	-0.98	1.01	-0.81	-0.53	-0.37	-0.19	-0.68	0.55	0.58	0.99
Lsat_1_v5_gn_2_88460.1 (VIH2)	-1.58	-1.38	-1.95	-1.81	1.5	0.69	-1.22	-1.43	-0.8	-1.06	-0.5	-0.77	0.08	0.88	1.22	0.33	-0.29	0.71	0.28	-0.64	-0.65	-0.49	0.37	-0.21	-0.28	-0.45	-0.26	-0.65	0.35	0.54	1.04
Lsat_1_v5_gn_3_32580.1	0.07	-0.09	0.32	0.03	0.51	0.26	-0.76	-1.23	-0.38	-0.53	-0.31	-0.41	-0.29	0.73	0.65	0.08	-0.33	0.48	-0.12	-0.28	-0.21	-0.5	0.61	-0.45	-0.49	-0.21	-0.4	-0.21	-0.06	0.19	0.94
Lsat_1_v5_gn_3_53521.1 (EDA26)	-0.54	-0.24	-0.28	0.24	0.22	0.29	-0.17	-0.1	-0.18	-0.3	0.13	-0.0	0.09	0.83	0.55	-0.15	-0.22	-0.19	-0.35	-0.25	-0.43	-0.2	0.55	-0.49	-0.31	0.02	-0.1	-0.68	0.12	0.12	0.64
Lsat_1_v5_gn_3_8160.1	-1.17	-1.05	-0.42	0.3	0.03	-0.37	-1.03	-0.73	0.01	0.18	0.44	0.03	-0.39	1.1	0.56	-0.4	-0.9	0.12	-0.29	-0.69	-0.64	-0.51	0.5	-0.24	-0.32	-0.21	-0.15	-1.08	0.61	0.8	1.36
Lsat_1_v5_gn_4_144921.1 (BAR1)	-0.25	-0.23	-0.52	-0.32	0.56	0.56	-0.18	-0.44	-0.21	-0.32	0.01	-0.36	0.21	0.83	0.44	0.12	-0.26	0.23	-0.25	-0.57	-0.57	-0.5	0.72	-0.49	-0.62	-0.29	-0.39	-0.73	0.41	0.38	0.76
Lsat_1_v5_gn_4_152560.1	-0.36	0.03	-0.11	-0.24	0.92	0.25	-0.65	-0.56	-0.4	-0.45	0.01	-0.12	-0.17	1.0	0.67	-0.3	-0.47	0.62	-0.07	-0.63	-0.65	-0.56	0.55	-0.64	-0.66	-0.44	-0.62	-0.73	0.23	0.34	0.97
Lsat_1_v5_gn_4_16880.1	-0.29	-0.44	-0.06	0.25	0.26	0.28	-0.13	0.25	-0.06	-0.11	0.12	0.07	-0.31	0.43	0.46	-0.09	-0.26	-0.39	-0.08	-0.3	-0.31	-0.17	0.47	-0.21	-0.52	-0.21	-0.12	-0.51	0.1	0.27	0.62
Lsat_1_v5_gn_4_16900.1 (IQD31)	-0.47	-0.62	-0.24	0.3	0.66	0.3	-0.19	0.09	-0.23	-0.08	-0.01	-0.27	-0.47	0.7	0.44	-0.04	-0.45	0.14	-0.12	-0.44	-0.41	-0.3	0.61	-0.41	-0.68	-0.3	-0.32	-0.61	0.32	0.46	0.73
Lsat_1_v5_gn_4_24960.1	-1.16	-1.58	-1.56	-1.4	1.42	0.59	-0.76	-1.12	-0.57	-0.52	-0.45	-0.42	-0.13	0.92	1.1	0.14	-0.11	0.98	-0.68	-0.43	-0.54	-0.34	0.9	-0.27	-0.27	-0.35	-0.14	-0.51	0.01	0.07	0.74
Lsat_1_v5_gn_4_95521.1	-0.83	-0.54	-0.14	0.02	0.39	0.29	-0.41	-0.95	-0.03	0.2	0.18	-0.16	-1.05	1.17	1.01	-0.05	-0.42	0.61	0.17	-0.42	-0.49	-0.35	0.26	-0.74	-0.67	-0.29	-0.26	-0.84	0.16	0.43	0.5
Lsat_1_v5_gn_5_106661.1 (LAX2)	-1.58	-0.84	-0.07	0.2	0.24	-0.05	-1.1	-0.67	0.15	0.15	0.36	0.17	-0.74	1.02	0.7	-0.36	-0.95	0.55	-0.04	-0.68	-0.45	-0.44	0.32	-0.59	-0.97	-0.2	-0.43	-0.73	0.5	0.75	1.22
Lsat_1_v5_gn_5_133581.1 (PLDALPHA4)	-1.11	-0.65	-0.61	-0.04	-0.15	-0.1	-0.39	-0.1	-0.13	-0.05	0.09	0.15	-0.33	0.75	0.84	0.16	-0.02	0.87	0.37	-0.1	-0.19	-0.51	-0.88	-0.32	-0.18	-0.05	-0.1	-0.83	0.03	0.31	0.79
Lsat_1_v5_gn_5_175841.1 (LACS6)	-1.2	-0.29	-0.34	-0.17	0.25	-0.35	-0.54	-0.14	0.09	0.18	0.35	-0.28	-0.53	1.04	1.04	-0.17	-0.32	-0.51	-0.34	-0.23	-0.88	-0.87	0.53	-1.18	-0.58	-0.86	-0.75	-1.45	0.28	0.88	1.65
Lsat_1_v5_gn_5_32021.1	-1.21	-1.08	-1.47	-0.46	0.26	0.25	-0.64	-0.65	-0.06	0.05	0.18	-0.18	-1.45	0.82	0.47	-0.07	-0.27	0.92	-0.02	-0.27	-0.24	-0.04	-0.03	-0.55	-0.37	-0.38	-0.26	-0.85	0.83	0.87	1.2
Lsat_1_v5_gn_5_78281.1 (RMG1)	-0.71	-0.34	-0.82	0.27	1.0	0.46	-0.85	-1.1	-0.1	-0.28	0.04	-0.01	0.01	0.83	0.71	-0.06	-0.34	0.31	-0.6	-0.55	-0.53	-0.33	0.83	-0.54	-0.48	-0.53	-0.32	-0.42	0.31	0.38	0.53
Lsat_1_v5_gn_5_90280.1 (HIR4)	-0.23	-0.69	-0.56	-0.06	0.79	0.43	-0.42	-0.87	-0.22	-0.27	-0.19	-0.1	-0.66	0.9	0.88	-0.18	-0.59	1.07	-0.61	-0.5	-0.65	-0.29	0.6	-0.7	-0.5	-0.38	0.0	-1.08	0.3	0.31	0.74
Lsat_1_v5_gn_6_115600.1 (MICU)	-0.42	-0.42	-0.5	-0.33	0.62	0.38	-0.11	-0.15	-0.25	-0.14	-0.15	-0.25	-0.26	0.52	0.66	0.08	-0.34	0.52	0.03	-0.11	-0.17	-0.18	0.01	-0.23	-0.34	-0.15	-0.19	-0.08	0.22	0.26	0.33
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.