Heatmap: Cluster_84 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.25 0.17 0.21 0.32 0.58 0.43 0.32 0.22 0.33 0.43 0.35 0.39 0.53 0.87 0.77 0.41 0.35 1.0 0.43 0.37 0.3 0.23 0.78 0.29 0.35 0.43 0.35 0.32 0.61 0.64 0.9
0.24 0.34 0.25 0.51 1.0 0.52 0.18 0.19 0.36 0.34 0.38 0.33 0.19 0.95 0.79 0.42 0.3 0.9 0.37 0.25 0.27 0.27 0.71 0.19 0.25 0.26 0.32 0.21 0.65 0.61 0.79
0.63 0.6 0.64 0.69 0.88 0.7 0.48 0.42 0.6 0.61 0.69 0.62 0.56 0.96 0.99 0.67 0.55 0.71 0.64 0.54 0.53 0.58 0.81 0.48 0.53 0.62 0.6 0.47 0.77 0.8 1.0
0.39 0.38 0.29 0.4 0.57 0.49 0.27 0.35 0.29 0.3 0.32 0.35 0.32 0.94 0.57 0.3 0.23 0.78 0.31 0.23 0.25 0.3 0.68 0.31 0.29 0.36 0.36 0.17 0.49 0.56 1.0
0.43 0.49 0.58 0.75 0.82 0.6 0.46 0.41 0.55 0.57 0.62 0.58 0.5 1.0 0.87 0.54 0.49 0.73 0.54 0.47 0.47 0.44 0.64 0.39 0.4 0.48 0.5 0.39 0.7 0.72 0.9
0.28 0.2 0.24 0.21 0.46 0.39 0.13 0.14 0.14 0.13 0.18 0.15 0.23 0.51 0.37 0.21 0.16 0.41 0.19 0.16 0.17 0.15 0.54 0.14 0.18 0.19 0.2 0.13 0.33 0.36 1.0
0.52 0.59 0.58 0.76 0.85 0.7 0.63 0.69 0.6 0.65 0.72 0.65 0.68 1.0 0.87 0.64 0.55 0.6 0.63 0.53 0.51 0.54 0.8 0.54 0.58 0.61 0.59 0.45 0.78 0.81 0.93
0.33 0.35 0.47 0.55 1.0 0.67 0.36 0.37 0.41 0.42 0.4 0.4 0.28 1.0 0.77 0.48 0.39 0.56 0.44 0.36 0.31 0.32 0.73 0.28 0.31 0.45 0.41 0.32 0.75 0.66 0.9
0.17 0.32 0.23 0.3 0.5 0.4 0.31 0.26 0.49 0.46 0.52 0.36 0.46 0.74 0.85 0.49 0.35 1.0 0.59 0.39 0.32 0.45 0.33 0.32 0.37 0.42 0.33 0.18 0.62 0.86 1.0
0.24 0.31 0.33 0.48 0.73 0.53 0.25 0.19 0.33 0.36 0.33 0.32 0.36 0.65 0.54 0.35 0.31 0.67 0.3 0.28 0.3 0.3 0.61 0.26 0.3 0.31 0.28 0.23 0.51 0.53 1.0
0.35 0.36 0.34 0.44 0.52 0.56 0.42 0.39 0.57 0.53 0.67 0.49 0.46 0.77 0.71 0.58 0.56 1.0 0.78 0.45 0.41 0.43 0.44 0.44 0.46 0.53 0.45 0.4 0.51 0.59 0.83
0.2 0.29 0.4 0.46 0.32 0.3 0.28 0.25 0.44 0.54 0.48 0.43 0.29 0.64 0.58 0.39 0.32 0.45 0.45 0.36 0.35 0.42 0.58 0.33 0.34 0.44 0.38 0.27 0.59 0.62 1.0
0.42 0.58 0.36 0.48 0.96 0.85 0.51 0.46 0.47 0.41 0.49 0.41 0.6 1.0 0.82 0.61 0.54 0.6 0.46 0.44 0.43 0.44 0.85 0.42 0.49 0.49 0.53 0.41 0.74 0.82 0.98
0.47 0.58 0.38 0.44 1.0 0.86 0.51 0.43 0.44 0.39 0.43 0.39 0.56 1.0 0.78 0.59 0.49 0.57 0.41 0.36 0.43 0.43 0.77 0.36 0.38 0.45 0.48 0.4 0.69 0.74 0.87
0.47 0.65 0.5 0.53 0.95 0.8 0.54 0.46 0.47 0.46 0.5 0.47 0.65 1.0 0.89 0.65 0.55 0.61 0.49 0.4 0.43 0.44 0.77 0.41 0.44 0.54 0.58 0.42 0.75 0.73 0.96
0.48 0.71 0.41 0.46 1.0 0.71 0.47 0.36 0.4 0.37 0.38 0.34 0.49 0.89 0.77 0.6 0.49 0.51 0.4 0.36 0.39 0.42 0.82 0.32 0.4 0.47 0.41 0.39 0.67 0.72 0.72
0.46 0.64 0.37 0.48 1.0 0.74 0.48 0.49 0.52 0.49 0.55 0.51 0.59 0.99 0.91 0.62 0.53 0.72 0.55 0.47 0.52 0.51 0.83 0.51 0.55 0.54 0.58 0.42 0.74 0.77 0.97
0.4 0.39 0.42 0.47 1.0 0.54 0.33 0.34 0.44 0.39 0.46 0.4 0.4 0.96 0.79 0.46 0.39 0.86 0.37 0.38 0.37 0.36 0.64 0.29 0.33 0.37 0.38 0.29 0.7 0.64 0.84
0.25 0.23 0.47 0.53 0.71 0.6 0.27 0.18 0.47 0.52 0.54 0.4 0.45 1.0 0.77 0.51 0.44 0.78 0.55 0.32 0.42 0.39 0.53 0.33 0.39 0.44 0.38 0.3 0.66 0.74 0.99
0.59 0.59 0.68 0.62 0.9 0.76 0.39 0.42 0.54 0.61 0.62 0.49 0.62 0.88 0.75 0.61 0.52 0.92 0.64 0.52 0.48 0.55 0.92 0.52 0.49 0.58 0.6 0.47 0.75 0.73 1.0
0.23 0.31 0.33 0.37 0.71 0.54 0.3 0.34 0.46 0.5 0.51 0.42 0.27 1.0 0.87 0.47 0.34 0.61 0.41 0.35 0.38 0.35 0.67 0.29 0.27 0.28 0.35 0.28 0.55 0.56 0.55
0.37 0.5 0.56 0.56 0.77 0.66 0.43 0.37 0.32 0.32 0.4 0.38 0.44 0.91 0.78 0.49 0.37 0.3 0.42 0.3 0.3 0.25 1.0 0.28 0.35 0.38 0.44 0.31 0.73 0.74 0.99
0.12 0.14 0.09 0.1 1.0 0.57 0.15 0.13 0.2 0.17 0.25 0.21 0.37 0.65 0.82 0.44 0.29 0.58 0.43 0.23 0.22 0.25 0.46 0.3 0.29 0.26 0.29 0.22 0.45 0.51 0.73
0.55 0.49 0.65 0.53 0.74 0.63 0.31 0.22 0.4 0.36 0.42 0.39 0.43 0.87 0.82 0.55 0.42 0.73 0.48 0.43 0.45 0.37 0.8 0.38 0.37 0.45 0.4 0.45 0.5 0.6 1.0
0.39 0.48 0.47 0.66 0.66 0.69 0.5 0.53 0.5 0.46 0.62 0.56 0.6 1.0 0.83 0.51 0.48 0.49 0.44 0.47 0.42 0.49 0.83 0.4 0.45 0.57 0.53 0.35 0.61 0.61 0.88
0.17 0.19 0.29 0.48 0.4 0.3 0.19 0.23 0.39 0.44 0.53 0.4 0.3 0.83 0.58 0.3 0.21 0.42 0.32 0.24 0.25 0.27 0.55 0.33 0.31 0.34 0.35 0.18 0.59 0.68 1.0
0.47 0.48 0.39 0.45 0.83 0.83 0.5 0.42 0.49 0.45 0.57 0.44 0.65 1.0 0.77 0.61 0.47 0.66 0.47 0.38 0.38 0.4 0.93 0.4 0.37 0.46 0.43 0.34 0.75 0.73 0.95
0.39 0.51 0.47 0.43 0.95 0.6 0.32 0.34 0.38 0.37 0.5 0.46 0.45 1.0 0.8 0.41 0.36 0.77 0.48 0.32 0.32 0.34 0.73 0.32 0.32 0.37 0.33 0.3 0.59 0.64 0.99
0.53 0.48 0.62 0.77 0.78 0.79 0.59 0.77 0.63 0.6 0.71 0.69 0.53 0.88 0.9 0.61 0.54 0.5 0.62 0.53 0.53 0.58 0.9 0.56 0.46 0.57 0.6 0.46 0.7 0.79 1.0
0.43 0.39 0.51 0.74 0.95 0.74 0.53 0.64 0.51 0.57 0.6 0.5 0.43 0.98 0.82 0.59 0.44 0.66 0.55 0.44 0.45 0.49 0.92 0.45 0.37 0.49 0.48 0.39 0.75 0.83 1.0
0.17 0.12 0.13 0.14 1.0 0.56 0.22 0.17 0.25 0.26 0.27 0.28 0.34 0.71 0.8 0.41 0.35 0.74 0.23 0.28 0.26 0.29 0.7 0.31 0.31 0.29 0.34 0.26 0.38 0.39 0.62
0.25 0.31 0.4 0.45 0.59 0.54 0.33 0.23 0.43 0.51 0.51 0.4 0.21 1.0 0.89 0.43 0.33 0.68 0.5 0.33 0.32 0.35 0.53 0.27 0.28 0.36 0.37 0.25 0.5 0.6 0.63
0.14 0.24 0.41 0.49 0.51 0.41 0.2 0.27 0.48 0.47 0.55 0.48 0.26 0.87 0.7 0.33 0.22 0.63 0.42 0.27 0.31 0.32 0.54 0.28 0.22 0.37 0.32 0.26 0.6 0.72 1.0
0.25 0.35 0.36 0.53 0.49 0.51 0.42 0.51 0.5 0.53 0.59 0.61 0.44 0.93 0.99 0.61 0.54 1.0 0.71 0.51 0.48 0.38 0.3 0.44 0.48 0.53 0.51 0.31 0.56 0.68 0.95
0.14 0.26 0.25 0.28 0.38 0.25 0.22 0.29 0.34 0.36 0.41 0.26 0.22 0.66 0.66 0.28 0.26 0.22 0.25 0.27 0.17 0.17 0.46 0.14 0.21 0.18 0.19 0.12 0.39 0.59 1.0
0.19 0.21 0.16 0.32 0.52 0.52 0.28 0.28 0.42 0.45 0.49 0.39 0.16 0.77 0.6 0.42 0.36 0.82 0.43 0.36 0.37 0.42 0.43 0.3 0.34 0.34 0.36 0.24 0.77 0.8 1.0
0.31 0.4 0.28 0.6 1.0 0.69 0.28 0.23 0.47 0.41 0.52 0.5 0.5 0.89 0.82 0.48 0.4 0.62 0.33 0.34 0.35 0.4 0.89 0.34 0.36 0.35 0.4 0.37 0.62 0.65 0.72
0.4 0.29 0.32 0.46 0.82 0.64 0.36 0.26 0.41 0.4 0.42 0.44 0.3 0.89 0.87 0.42 0.31 1.0 0.31 0.34 0.3 0.39 0.72 0.29 0.34 0.37 0.48 0.22 0.58 0.59 0.8
0.47 0.47 0.45 0.5 0.97 0.82 0.59 0.57 0.53 0.57 0.57 0.53 0.53 0.91 1.0 0.67 0.5 0.91 0.64 0.59 0.56 0.56 0.63 0.54 0.5 0.57 0.55 0.6 0.73 0.76 0.79
0.3 0.27 0.49 0.52 0.75 0.7 0.32 0.25 0.44 0.42 0.47 0.37 0.26 0.89 0.69 0.47 0.37 0.83 0.57 0.41 0.42 0.43 0.55 0.46 0.46 0.48 0.5 0.3 0.65 0.7 1.0
0.22 0.2 0.27 0.35 0.63 0.54 0.38 0.25 0.45 0.47 0.5 0.48 0.4 0.67 0.65 0.52 0.4 0.95 0.48 0.4 0.38 0.42 0.37 0.26 0.27 0.34 0.32 0.25 1.0 0.76 0.67
0.34 0.36 0.46 0.64 0.52 0.49 0.42 0.44 0.73 0.77 0.66 0.69 0.57 0.86 0.68 0.53 0.51 0.82 0.6 0.49 0.43 0.4 0.73 0.49 0.43 0.43 0.46 0.42 0.64 0.84 1.0
0.19 0.18 0.12 0.27 0.5 0.41 0.14 0.17 0.25 0.24 0.3 0.2 0.27 0.64 0.57 0.33 0.27 0.79 0.22 0.22 0.18 0.21 0.51 0.18 0.2 0.23 0.17 0.12 0.41 0.49 1.0
0.23 0.25 0.21 0.22 0.38 0.43 0.32 0.25 0.46 0.46 0.5 0.41 0.28 0.84 0.78 0.4 0.4 0.9 0.53 0.4 0.37 0.37 0.18 0.37 0.33 0.29 0.37 0.33 0.57 0.55 1.0
0.16 0.08 0.11 0.11 1.0 0.48 0.24 0.13 0.33 0.42 0.42 0.34 0.26 0.96 0.86 0.42 0.34 1.0 0.31 0.24 0.29 0.35 0.7 0.28 0.33 0.31 0.25 0.23 0.55 0.64 1.0
0.25 0.21 0.33 0.47 0.6 0.41 0.33 0.36 0.47 0.41 0.56 0.33 0.36 1.0 0.84 0.36 0.4 0.76 0.77 0.44 0.45 0.45 0.65 0.39 0.5 0.46 0.49 0.33 0.74 0.69 0.88
0.42 0.58 0.43 0.54 0.99 0.74 0.45 0.38 0.55 0.58 0.62 0.55 0.63 1.0 0.9 0.62 0.6 0.69 0.56 0.51 0.5 0.54 0.96 0.45 0.51 0.59 0.58 0.52 0.68 0.68 0.74
0.26 0.3 0.38 0.39 0.58 0.22 0.18 0.3 0.36 0.36 0.41 0.43 0.18 0.61 0.44 0.22 0.2 0.57 0.33 0.27 0.22 0.22 0.42 0.25 0.21 0.22 0.24 0.14 0.61 0.69 1.0
0.23 0.22 0.36 0.51 0.86 0.65 0.32 0.35 0.37 0.32 0.5 0.32 0.37 0.86 0.76 0.51 0.34 0.65 0.45 0.33 0.38 0.36 1.0 0.32 0.33 0.39 0.33 0.32 0.65 0.66 0.84
0.43 0.43 0.57 0.77 0.89 0.84 0.59 0.67 0.52 0.55 0.57 0.45 0.51 1.0 0.73 0.55 0.5 0.71 0.53 0.46 0.53 0.52 0.81 0.52 0.5 0.56 0.65 0.46 0.73 0.74 0.71
0.33 0.31 0.5 0.63 0.55 0.46 0.35 0.43 0.57 0.59 0.64 0.56 0.32 0.87 0.73 0.46 0.4 0.79 0.84 0.45 0.45 0.43 0.52 0.42 0.45 0.48 0.47 0.32 0.66 0.8 1.0
0.48 0.61 0.44 0.54 0.9 0.77 0.51 0.46 0.51 0.51 0.58 0.5 0.53 1.0 0.94 0.61 0.54 0.6 0.61 0.49 0.49 0.51 0.82 0.49 0.5 0.53 0.6 0.45 0.69 0.69 0.71
0.41 0.44 0.47 0.73 0.74 0.71 0.5 0.39 0.61 0.63 0.66 0.47 0.44 1.0 0.97 0.6 0.48 0.67 0.55 0.48 0.49 0.51 0.72 0.44 0.41 0.53 0.53 0.44 0.85 0.81 0.69
0.24 0.25 0.4 0.52 0.69 0.51 0.24 0.21 0.44 0.49 0.38 0.34 0.27 1.0 0.87 0.43 0.24 0.63 0.36 0.25 0.25 0.31 0.68 0.22 0.27 0.28 0.33 0.18 0.53 0.5 0.76
0.06 0.1 0.09 0.16 0.26 0.16 0.14 0.06 0.38 0.3 0.24 0.27 0.32 1.0 0.6 0.25 0.22 0.95 0.3 0.16 0.22 0.12 0.0 0.32 0.3 0.23 0.32 0.09 0.31 0.51 0.84
0.25 0.24 0.51 0.52 0.63 0.6 0.39 0.38 0.55 0.56 0.55 0.48 0.35 0.78 0.62 0.46 0.38 0.69 0.49 0.36 0.34 0.44 0.78 0.44 0.4 0.45 0.45 0.29 0.69 0.71 1.0
0.3 0.28 0.35 0.36 0.65 0.53 0.26 0.2 0.4 0.36 0.39 0.36 0.4 0.81 0.57 0.42 0.31 0.77 0.34 0.29 0.32 0.28 0.67 0.31 0.29 0.26 0.32 0.19 0.51 0.63 1.0
0.33 0.49 0.37 0.3 0.81 0.45 0.2 0.17 0.3 0.26 0.27 0.28 0.4 0.71 0.58 0.39 0.3 0.86 0.29 0.17 0.23 0.25 0.78 0.2 0.24 0.36 0.23 0.18 0.42 0.55 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)