Heatmap: Cluster_188 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_107340.1	-0.46	-0.84	-1.66	-1.11	0.37	0.66	0.32	0.68	-0.56	-0.45	-0.29	-0.44	0.81	1.09	0.57	0.12	-0.38	-0.38	-0.16	-0.53	-0.31	0.01	0.44	-0.16	-0.09	-0.15	-0.24	-0.21	0.0	-0.23	0.24
Lsat_1_v5_gn_1_111401.1	-0.0	-0.33	-0.06	0.17	0.4	0.57	-0.21	-0.24	-0.12	-0.22	-0.1	-0.53	-0.36	0.78	0.7	0.22	-0.23	-0.5	0.18	-0.23	-0.1	-0.14	0.16	-0.19	-0.22	-0.01	0.04	-0.14	0.1	-0.04	-0.47
Lsat_1_v5_gn_1_2081.1 (PUP1)	-0.07	-0.2	0.11	0.15	0.81	0.97	-0.43	-0.46	-0.73	-0.88	-0.49	-1.13	-0.45	1.01	0.76	0.07	-0.51	0.25	-0.12	-0.73	-0.14	-0.03	1.18	-0.51	-0.38	0.01	0.08	-0.1	-0.07	-0.66	-1.41
Lsat_1_v5_gn_1_26120.1 (CBP60c)	-0.54	-0.61	-1.6	-2.13	0.59	0.85	0.25	0.16	-0.27	-0.15	-0.16	-0.0	0.18	1.33	1.01	0.14	-0.18	-1.23	0.17	-0.24	-0.17	-0.26	0.54	-0.32	-0.35	-0.13	-0.02	0.14	-0.26	-0.69	-0.72
Lsat_1_v5_gn_1_26361.1	-1.66	-1.71	-0.38	0.49	0.53	0.43	0.2	-0.46	0.08	0.19	0.11	0.01	-0.53	0.55	1.1	0.49	0.08	-0.22	0.18	0.07	0.08	-0.08	-0.21	-0.61	-0.52	-0.27	-0.11	-0.07	-0.03	-0.29	-0.47
Lsat_1_v5_gn_1_36320.1 (B ALPHA)	-0.48	-0.27	-0.39	-0.21	0.33	0.35	0.08	0.12	-0.13	-0.09	0.02	-0.01	0.01	0.18	0.15	0.24	0.02	-0.45	-0.05	-0.21	-0.18	-0.07	0.3	-0.19	-0.06	-0.0	0.02	-0.17	0.15	0.25	0.24
Lsat_1_v5_gn_1_56821.1 (RHF2A)	0.03	-0.09	-0.14	-0.31	0.44	0.37	0.02	0.07	-0.25	-0.26	-0.09	-0.28	-0.14	0.65	0.53	-0.01	-0.28	0.02	-0.2	-0.37	-0.25	-0.14	0.44	-0.2	-0.31	-0.13	-0.11	-0.24	0.26	0.1	0.03
Lsat_1_v5_gn_1_99041.1 (FH11)	-0.51	-0.62	-0.67	-0.49	-0.12	0.35	-0.08	0.43	-0.01	0.06	0.07	-0.15	-0.24	0.28	0.36	0.19	-0.13	-1.23	0.09	-0.05	-0.13	-0.07	1.11	-0.05	0.03	0.06	0.18	-0.18	-0.06	0.04	-0.14
Lsat_1_v5_gn_2_101000.1 (FBH4)	-0.54	-0.6	-0.08	-0.08	0.05	0.34	0.02	-0.28	-0.04	-0.07	0.1	-0.12	-0.7	1.09	0.87	0.34	0.06	-1.8	0.12	-0.12	0.06	0.07	0.2	-0.46	-0.38	-0.09	-0.06	-0.33	0.27	0.02	-0.15
Lsat_1_v5_gn_2_15441.1 (AMT1;2)	-0.03	0.27	-0.48	-1.06	0.74	0.66	0.13	0.48	-0.48	-0.6	-0.54	-0.95	-0.35	0.72	0.82	0.25	-0.22	-0.27	0.01	-0.64	-0.4	-0.44	1.34	-0.41	-0.49	-0.62	-0.43	-0.67	0.11	0.22	-0.29
Lsat_1_v5_gn_2_62380.1 (KUP10)	-0.27	-0.01	-0.3	-0.31	0.34	0.62	0.19	0.33	-0.43	-0.44	-0.42	-0.61	-0.2	0.81	0.51	0.08	-0.06	-0.31	0.24	-0.44	-0.25	-0.22	0.37	-0.4	-0.25	-0.12	-0.08	-0.04	0.35	0.09	-0.15
Lsat_1_v5_gn_2_62960.1 (WAKL2)	-0.52	-0.06	-0.51	0.07	0.54	0.56	0.26	0.41	0.02	-0.2	0.1	-0.37	-0.69	0.5	0.57	0.18	-0.27	-0.95	0.11	-0.4	-0.23	-0.18	0.9	-0.48	-0.33	-0.16	-0.06	-0.34	0.17	-0.0	-0.49
Lsat_1_v5_gn_2_69740.1 (ADL2)	-0.29	-0.26	-0.39	-0.66	0.29	0.37	0.3	0.19	-0.11	-0.14	-0.05	-0.11	0.06	0.58	0.38	0.03	0.02	-0.46	-0.01	-0.22	-0.1	0.0	0.22	-0.28	-0.12	0.02	0.05	0.18	0.06	-0.14	-0.13
Lsat_1_v5_gn_3_110040.1	-0.45	-0.52	-0.5	-0.05	0.33	0.44	0.09	0.58	-0.69	-0.51	-0.57	-0.51	0.15	0.7	0.47	-0.11	-0.22	-0.37	-0.48	-0.31	-0.01	0.11	0.44	-0.13	-0.1	0.08	-0.2	0.06	0.29	0.01	0.42
Lsat_1_v5_gn_3_129161.1 (VAP)	-0.39	-0.22	-0.36	-0.19	0.23	0.55	0.33	0.43	-0.21	-0.3	-0.23	-0.39	0.0	0.7	0.46	0.1	-0.07	-0.2	-0.06	-0.31	-0.16	-0.18	0.06	-0.29	-0.15	-0.03	-0.09	-0.2	0.1	0.06	0.13
Lsat_1_v5_gn_3_135541.1 (CYP704A2)	-0.32	-0.55	-0.15	0.1	0.2	0.65	0.58	0.3	0.02	-0.04	0.04	-0.05	-0.35	-0.19	-0.22	-0.14	-0.33	-0.52	-0.1	-0.15	-0.03	0.05	1.31	-0.35	-0.29	-0.32	-0.4	-0.29	0.19	-0.05	-0.29
Lsat_1_v5_gn_3_32861.1	-0.56	-0.59	-0.37	-0.55	0.07	0.45	0.15	0.06	-0.09	-0.04	-0.2	0.1	-0.03	0.79	0.57	0.16	-0.05	-0.61	0.08	-0.24	-0.22	0.02	0.51	-0.18	-0.08	-0.15	0.09	-0.07	-0.02	-0.03	-0.11
Lsat_1_v5_gn_3_43201.1 (RR14)	-1.2	-1.03	-0.6	-1.04	0.64	0.68	0.09	-0.19	0.51	0.46	0.01	-0.14	-1.08	0.34	1.49	1.02	0.75	-3.19	0.25	0.28	-0.2	-0.68	-2.65	-0.33	-0.84	0.14	0.24	-0.8	-0.24	0.15	-0.94
Lsat_1_v5_gn_3_52761.1	-0.57	-0.94	-0.26	0.31	0.36	0.57	-0.08	-0.54	0.06	-0.0	0.14	-0.1	-0.48	0.84	0.71	0.03	-0.18	-1.57	-0.16	-0.16	-0.09	-0.05	0.21	-0.24	-0.18	0.04	0.07	-0.26	0.19	0.1	0.21
Lsat_1_v5_gn_3_55521.1 (GAI)	-0.84	-0.45	-0.41	0.04	0.36	0.67	0.51	0.53	0.09	0.06	0.12	-0.21	-0.75	0.42	0.07	-0.14	-0.25	-2.47	-0.43	-0.48	0.01	-0.24	1.26	-0.29	-0.11	0.09	-0.16	-0.4	0.08	0.24	-0.31
Lsat_1_v5_gn_3_7661.1 (ROL5)	-0.27	-0.3	-0.37	-0.1	0.21	0.45	0.17	0.22	-0.43	-0.2	-0.13	-0.23	-0.0	0.54	0.29	0.1	0.03	-0.26	-0.04	-0.19	-0.11	0.02	0.28	-0.23	-0.04	0.13	-0.08	-0.13	-0.03	-0.07	0.2
Lsat_1_v5_gn_3_89921.1 (DEAR4)	-0.96	-1.62	-0.73	-0.32	0.51	0.68	0.45	0.31	-0.44	-0.5	-0.31	-0.88	-0.69	0.96	0.85	0.01	-0.27	-0.49	0.21	-0.31	-0.17	-0.13	0.05	-0.22	-0.04	-0.05	0.06	-0.3	0.5	0.33	0.34
Lsat_1_v5_gn_4_103741.1	-0.57	-0.48	-0.58	-0.51	0.39	0.65	0.39	0.38	-0.48	-0.4	-0.21	-0.41	-0.11	0.79	0.61	-0.04	-0.31	-0.24	0.15	-0.28	-0.19	-0.12	0.35	-0.02	-0.13	-0.15	-0.14	-0.24	0.11	0.0	0.28
Lsat_1_v5_gn_4_113580.1	-0.11	-0.22	-0.46	-0.8	0.48	0.42	0.28	0.35	-0.48	-0.57	-0.26	-0.29	-0.32	0.74	0.66	0.01	-0.15	0.06	-0.01	-0.55	-0.33	-0.26	0.98	-0.5	-0.44	-0.35	-0.32	-0.63	0.11	0.33	0.42
Lsat_1_v5_gn_4_12941.1	0.25	-0.32	0.03	0.08	0.88	1.11	-0.8	-0.76	-0.96	-1.05	-0.76	-1.23	0.15	1.27	0.98	0.18	-0.39	-0.52	0.02	-0.52	-0.11	0.07	0.71	-0.39	-0.31	-0.09	0.02	-0.09	-0.04	-0.63	-1.88
Lsat_1_v5_gn_4_36960.1 (IRP3)	-0.35	0.03	-0.36	-0.33	0.17	0.57	0.06	0.4	-0.01	-0.57	0.06	-0.09	-0.2	0.93	0.73	0.31	-0.09	-0.84	0.01	-0.47	-0.15	-0.33	0.21	-0.37	-0.08	-0.04	0.02	-0.32	0.04	-0.21	-0.24
Lsat_1_v5_gn_4_66820.1 (FLY1)	-0.04	-0.36	-0.36	-0.33	0.59	0.35	-0.1	0.06	-0.21	-0.18	-0.04	-0.3	-0.2	0.68	0.56	0.05	-0.18	-0.26	-0.1	-0.25	-0.22	-0.23	0.65	-0.25	-0.23	-0.17	-0.07	-0.12	0.18	0.05	0.03
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Lsat_1_v5_gn_4_71761.1 (AtSYF2)	0.04	0.17	0.01	-0.05	0.37	0.38	0.06	0.4	-0.56	-0.36	-0.26	-0.27	0.01	0.46	0.37	-0.1	-0.31	0.2	-0.04	-0.36	-0.26	-0.18	0.61	-0.21	-0.27	-0.26	-0.23	-0.24	0.01	-0.08	0.07
Lsat_1_v5_gn_4_97140.1	0.5	-0.15	-0.48	-0.56	1.02	0.43	-0.01	-0.14	-0.3	-0.51	-0.4	-0.91	-0.93	1.17	1.04	0.06	-0.19	-0.36	0.02	-0.28	0.02	0.04	0.64	-0.62	-0.3	0.0	0.14	0.36	-0.31	-0.98	-3.52
Lsat_1_v5_gn_5_118620.1	-0.68	-0.54	-0.06	0.1	0.48	0.4	-0.14	-0.58	0.13	0.18	0.16	0.13	-0.08	0.37	0.52	0.21	0.16	0.11	-0.18	-0.15	-0.14	-0.12	0.22	-0.33	-0.17	-0.19	-0.05	-0.29	-0.14	0.02	-0.22
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Lsat_1_v5_gn_5_1420.1	0.2	-0.26	-0.44	-0.5	0.21	0.3	0.18	0.47	-0.67	-0.69	-0.61	-0.48	0.04	0.83	0.58	-0.08	-0.24	0.11	-0.18	-0.25	-0.17	-0.12	0.74	-0.21	-0.08	-0.27	-0.35	-0.12	0.27	0.16	0.02
Lsat_1_v5_gn_5_164641.1 (NOT4A)	-0.48	-0.15	-0.67	-0.68	0.44	0.48	0.25	0.2	-0.11	-0.2	-0.09	-0.26	-0.11	0.61	0.58	0.13	-0.2	-0.47	0.08	-0.24	-0.16	-0.06	0.35	-0.31	-0.23	-0.0	0.08	0.08	0.21	-0.07	-0.11
Lsat_1_v5_gn_5_176100.1 (MLO1)	-0.0	0.11	-0.37	-1.15	0.61	0.7	0.12	0.44	-0.69	-0.71	-0.46	-0.63	-0.33	0.83	0.54	-0.06	-0.22	-0.34	-0.11	-0.44	-0.28	-0.1	0.87	-0.24	-0.22	-0.16	-0.1	-0.37	0.26	0.05	0.1
Lsat_1_v5_gn_5_2721.1 (HCR1)	-0.05	-0.07	-0.58	-0.72	0.48	0.48	0.31	0.52	-0.36	-0.36	-0.55	-0.57	0.09	0.57	0.34	0.05	-0.15	0.08	-0.1	-0.35	-0.12	-0.15	0.65	-0.24	-0.13	-0.29	-0.22	-0.25	0.13	0.03	0.14
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.