Heatmap: Cluster_188 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.34 0.26 0.15 0.22 0.61 0.74 0.58 0.75 0.32 0.34 0.38 0.34 0.82 1.0 0.7 0.51 0.36 0.36 0.42 0.32 0.38 0.47 0.64 0.42 0.44 0.42 0.4 0.4 0.47 0.4 0.55
0.58 0.46 0.56 0.66 0.77 0.86 0.5 0.49 0.54 0.5 0.54 0.4 0.45 1.0 0.94 0.68 0.5 0.41 0.66 0.5 0.54 0.53 0.65 0.51 0.5 0.58 0.6 0.53 0.63 0.57 0.42
0.42 0.39 0.48 0.49 0.78 0.87 0.33 0.32 0.27 0.24 0.31 0.2 0.32 0.89 0.75 0.46 0.31 0.52 0.41 0.27 0.4 0.43 1.0 0.31 0.34 0.44 0.47 0.41 0.42 0.28 0.17
0.27 0.26 0.13 0.09 0.6 0.72 0.47 0.44 0.33 0.36 0.36 0.4 0.45 1.0 0.8 0.44 0.35 0.17 0.45 0.34 0.35 0.33 0.58 0.32 0.31 0.36 0.39 0.44 0.33 0.25 0.24
0.15 0.14 0.36 0.66 0.67 0.63 0.54 0.34 0.49 0.53 0.5 0.47 0.32 0.68 1.0 0.65 0.49 0.4 0.53 0.49 0.49 0.44 0.4 0.3 0.32 0.39 0.43 0.44 0.46 0.38 0.34
0.56 0.65 0.6 0.68 0.98 1.0 0.83 0.85 0.72 0.73 0.8 0.77 0.79 0.89 0.87 0.93 0.79 0.57 0.76 0.68 0.69 0.75 0.96 0.69 0.75 0.78 0.79 0.7 0.87 0.93 0.92
0.65 0.6 0.58 0.51 0.86 0.82 0.64 0.67 0.54 0.53 0.6 0.53 0.58 1.0 0.92 0.63 0.52 0.65 0.56 0.49 0.54 0.58 0.87 0.56 0.52 0.58 0.59 0.54 0.77 0.69 0.65
0.33 0.3 0.29 0.33 0.43 0.59 0.44 0.62 0.46 0.48 0.49 0.42 0.39 0.56 0.6 0.53 0.42 0.2 0.49 0.45 0.42 0.44 1.0 0.45 0.47 0.48 0.52 0.41 0.45 0.47 0.42
0.32 0.31 0.44 0.44 0.49 0.59 0.48 0.39 0.46 0.45 0.5 0.43 0.29 1.0 0.86 0.59 0.49 0.13 0.51 0.43 0.49 0.49 0.54 0.34 0.36 0.44 0.45 0.37 0.57 0.47 0.42
0.39 0.48 0.28 0.19 0.66 0.62 0.43 0.55 0.28 0.26 0.27 0.2 0.31 0.65 0.7 0.47 0.34 0.33 0.4 0.25 0.3 0.29 1.0 0.3 0.28 0.26 0.29 0.25 0.43 0.46 0.32
0.47 0.57 0.46 0.46 0.72 0.88 0.65 0.72 0.42 0.42 0.43 0.37 0.5 1.0 0.81 0.6 0.55 0.46 0.67 0.42 0.48 0.49 0.74 0.43 0.48 0.52 0.54 0.55 0.72 0.61 0.51
0.37 0.51 0.38 0.56 0.78 0.79 0.64 0.71 0.54 0.47 0.58 0.41 0.33 0.76 0.79 0.61 0.44 0.28 0.58 0.41 0.46 0.47 1.0 0.38 0.43 0.48 0.51 0.42 0.6 0.53 0.38
0.55 0.56 0.51 0.42 0.81 0.86 0.82 0.76 0.62 0.6 0.64 0.62 0.7 1.0 0.87 0.68 0.68 0.48 0.66 0.57 0.62 0.67 0.78 0.55 0.62 0.68 0.69 0.76 0.7 0.6 0.61
0.45 0.43 0.44 0.6 0.77 0.84 0.65 0.92 0.38 0.43 0.41 0.43 0.68 1.0 0.85 0.57 0.53 0.48 0.44 0.5 0.61 0.66 0.83 0.56 0.58 0.65 0.53 0.64 0.75 0.62 0.82
0.47 0.53 0.48 0.54 0.72 0.9 0.77 0.83 0.53 0.5 0.53 0.47 0.62 1.0 0.85 0.66 0.59 0.53 0.59 0.5 0.55 0.54 0.64 0.5 0.55 0.6 0.58 0.53 0.66 0.64 0.68
0.32 0.28 0.36 0.43 0.46 0.63 0.6 0.5 0.41 0.39 0.41 0.39 0.32 0.35 0.35 0.37 0.32 0.28 0.38 0.37 0.4 0.42 1.0 0.32 0.33 0.32 0.31 0.33 0.46 0.39 0.33
0.39 0.38 0.45 0.4 0.61 0.79 0.64 0.6 0.54 0.56 0.5 0.62 0.57 1.0 0.86 0.64 0.56 0.38 0.61 0.49 0.5 0.59 0.82 0.51 0.55 0.52 0.62 0.55 0.57 0.56 0.53
0.15 0.18 0.24 0.17 0.56 0.57 0.38 0.31 0.51 0.49 0.36 0.32 0.17 0.45 1.0 0.72 0.6 0.04 0.42 0.43 0.31 0.22 0.06 0.28 0.2 0.39 0.42 0.2 0.3 0.4 0.19
0.38 0.29 0.47 0.69 0.72 0.83 0.53 0.38 0.58 0.56 0.62 0.52 0.4 1.0 0.92 0.57 0.49 0.19 0.5 0.5 0.52 0.54 0.64 0.47 0.49 0.57 0.59 0.47 0.64 0.6 0.65
0.23 0.31 0.31 0.43 0.54 0.66 0.6 0.6 0.44 0.44 0.45 0.36 0.25 0.56 0.44 0.38 0.35 0.08 0.31 0.3 0.42 0.35 1.0 0.34 0.39 0.44 0.37 0.32 0.44 0.49 0.34
0.57 0.56 0.53 0.64 0.8 0.94 0.77 0.8 0.51 0.6 0.63 0.59 0.69 1.0 0.84 0.74 0.7 0.58 0.67 0.6 0.64 0.7 0.84 0.59 0.67 0.75 0.65 0.63 0.68 0.66 0.79
0.26 0.17 0.31 0.41 0.73 0.82 0.7 0.64 0.38 0.36 0.41 0.28 0.32 1.0 0.93 0.52 0.43 0.37 0.59 0.42 0.46 0.47 0.53 0.44 0.5 0.5 0.54 0.42 0.73 0.64 0.65
0.39 0.41 0.39 0.41 0.76 0.91 0.76 0.76 0.42 0.44 0.5 0.44 0.54 1.0 0.88 0.56 0.47 0.49 0.64 0.48 0.51 0.53 0.74 0.57 0.53 0.52 0.53 0.49 0.62 0.58 0.71
0.47 0.43 0.37 0.29 0.71 0.68 0.62 0.65 0.36 0.34 0.42 0.41 0.41 0.85 0.8 0.51 0.46 0.53 0.5 0.35 0.4 0.42 1.0 0.36 0.37 0.4 0.41 0.33 0.55 0.64 0.68
0.49 0.33 0.42 0.44 0.76 0.89 0.24 0.24 0.21 0.2 0.24 0.18 0.46 1.0 0.81 0.47 0.31 0.29 0.42 0.29 0.38 0.43 0.68 0.32 0.33 0.39 0.42 0.39 0.4 0.27 0.11
0.41 0.54 0.41 0.42 0.59 0.77 0.55 0.69 0.52 0.35 0.55 0.49 0.45 1.0 0.87 0.65 0.49 0.29 0.53 0.38 0.47 0.42 0.61 0.41 0.5 0.51 0.53 0.42 0.54 0.45 0.44
0.61 0.48 0.49 0.5 0.94 0.79 0.58 0.65 0.54 0.55 0.61 0.51 0.54 1.0 0.92 0.65 0.55 0.52 0.58 0.53 0.53 0.53 0.98 0.53 0.53 0.55 0.59 0.57 0.7 0.65 0.64
0.48 0.52 0.31 0.3 0.86 0.84 0.7 0.6 0.5 0.5 0.55 0.5 0.4 1.0 0.99 0.71 0.58 0.38 0.68 0.56 0.59 0.59 0.85 0.59 0.6 0.58 0.68 0.53 0.67 0.61 0.52
0.67 0.73 0.66 0.63 0.84 0.85 0.68 0.86 0.44 0.51 0.55 0.54 0.66 0.9 0.85 0.61 0.53 0.75 0.63 0.51 0.55 0.58 1.0 0.56 0.54 0.55 0.56 0.55 0.66 0.62 0.69
0.63 0.4 0.32 0.3 0.9 0.6 0.44 0.4 0.36 0.31 0.34 0.24 0.23 1.0 0.91 0.46 0.39 0.35 0.45 0.37 0.45 0.46 0.69 0.29 0.36 0.44 0.49 0.57 0.36 0.22 0.04
0.43 0.48 0.67 0.74 0.97 0.92 0.63 0.47 0.76 0.79 0.78 0.76 0.66 0.9 1.0 0.8 0.78 0.75 0.62 0.63 0.63 0.64 0.81 0.55 0.62 0.61 0.67 0.57 0.63 0.71 0.6
0.56 0.56 0.58 0.59 0.95 1.0 0.75 0.8 0.71 0.69 0.75 0.7 0.81 0.94 0.89 0.81 0.73 0.38 0.66 0.67 0.67 0.75 0.89 0.72 0.74 0.68 0.69 0.66 0.78 0.77 0.91
0.56 0.55 0.4 0.34 0.69 0.71 0.62 0.79 0.44 0.44 0.49 0.49 0.51 1.0 0.88 0.61 0.52 0.61 0.55 0.47 0.5 0.51 0.97 0.45 0.49 0.52 0.51 0.5 0.67 0.61 0.65
0.4 0.36 0.34 0.4 0.8 0.84 0.48 0.35 0.39 0.4 0.41 0.37 0.33 0.9 0.97 0.66 0.58 0.47 0.57 0.47 0.48 0.49 1.0 0.34 0.39 0.47 0.47 0.55 0.35 0.3 0.22
0.65 0.47 0.41 0.4 0.65 0.69 0.64 0.78 0.35 0.35 0.37 0.4 0.58 1.0 0.84 0.53 0.48 0.61 0.5 0.48 0.5 0.52 0.94 0.49 0.53 0.47 0.44 0.52 0.68 0.63 0.57
0.47 0.59 0.41 0.41 0.89 0.91 0.78 0.75 0.61 0.57 0.61 0.55 0.61 1.0 0.98 0.72 0.57 0.47 0.69 0.55 0.59 0.63 0.84 0.53 0.56 0.65 0.69 0.69 0.75 0.62 0.61
0.55 0.59 0.42 0.25 0.83 0.89 0.59 0.74 0.34 0.33 0.4 0.35 0.44 0.97 0.8 0.53 0.47 0.43 0.51 0.4 0.45 0.51 1.0 0.46 0.47 0.49 0.51 0.42 0.65 0.57 0.58
0.62 0.61 0.43 0.39 0.89 0.89 0.79 0.92 0.5 0.5 0.43 0.43 0.68 0.95 0.81 0.66 0.57 0.68 0.59 0.5 0.59 0.57 1.0 0.54 0.58 0.52 0.55 0.53 0.7 0.65 0.7
0.58 0.54 0.56 0.52 0.8 0.76 0.62 0.68 0.46 0.5 0.51 0.45 0.61 0.71 0.71 0.54 0.49 0.52 0.45 0.42 0.47 0.5 1.0 0.44 0.48 0.47 0.5 0.45 0.54 0.53 0.56
0.72 0.75 0.69 0.71 0.88 0.8 0.59 0.48 0.52 0.57 0.62 0.52 0.52 1.0 0.85 0.79 0.61 0.39 0.55 0.5 0.58 0.55 0.64 0.48 0.53 0.59 0.56 0.54 0.72 0.69 0.62
0.87 0.51 0.67 0.66 0.74 0.87 0.71 0.51 0.65 0.64 0.62 0.49 0.57 0.94 1.0 0.69 0.62 0.3 0.66 0.64 0.65 0.64 0.57 0.55 0.6 0.69 0.69 0.72 0.57 0.46 0.4
0.33 0.46 0.39 0.4 0.61 0.79 0.57 0.71 0.37 0.42 0.44 0.47 0.55 1.0 0.7 0.56 0.51 0.23 0.64 0.4 0.43 0.46 0.51 0.39 0.43 0.42 0.43 0.57 0.65 0.56 0.42
0.5 0.73 0.29 0.16 0.92 0.97 0.46 0.35 0.33 0.26 0.37 0.21 0.43 0.87 0.81 0.5 0.33 0.27 0.48 0.29 0.41 0.42 1.0 0.3 0.34 0.45 0.37 0.36 0.49 0.44 0.28
0.4 0.68 0.21 0.11 1.0 0.91 0.34 0.25 0.21 0.2 0.25 0.17 0.3 0.65 0.57 0.41 0.24 0.18 0.49 0.22 0.41 0.38 0.56 0.33 0.34 0.47 0.43 0.25 0.45 0.32 0.31
0.19 0.43 0.06 0.05 0.78 1.0 0.28 0.19 0.16 0.09 0.23 0.07 0.23 0.64 0.54 0.41 0.2 0.03 0.47 0.15 0.28 0.41 0.48 0.39 0.41 0.38 0.46 0.17 0.43 0.33 0.28
0.27 0.18 0.36 0.44 0.76 0.88 0.63 0.44 0.45 0.41 0.46 0.32 0.22 0.57 0.7 0.53 0.42 0.27 0.39 0.34 0.39 0.4 1.0 0.34 0.36 0.41 0.44 0.32 0.47 0.41 0.45
0.54 0.53 0.55 0.52 0.72 0.86 0.71 0.75 0.47 0.51 0.48 0.46 0.71 1.0 0.82 0.65 0.6 0.51 0.62 0.55 0.57 0.63 0.72 0.54 0.6 0.62 0.62 0.66 0.62 0.57 0.6
0.62 0.55 0.64 0.61 0.95 0.98 0.79 0.68 0.62 0.64 0.66 0.56 0.64 0.79 0.87 0.85 0.73 0.62 0.64 0.6 0.64 0.68 1.0 0.59 0.66 0.72 0.72 0.66 0.8 0.75 0.82
0.59 0.52 0.4 0.45 0.95 0.85 0.59 0.8 0.43 0.46 0.5 0.43 0.68 0.8 0.75 0.57 0.48 0.62 0.42 0.48 0.52 0.52 1.0 0.48 0.49 0.52 0.48 0.52 0.59 0.56 0.76
0.69 0.63 0.62 0.54 0.94 0.89 0.49 0.43 0.45 0.48 0.51 0.47 0.41 1.0 0.94 0.7 0.64 0.3 0.7 0.49 0.54 0.61 0.81 0.45 0.51 0.52 0.64 0.58 0.71 0.64 0.42
0.44 0.78 0.21 0.2 0.94 1.0 0.33 0.41 0.2 0.19 0.23 0.14 0.15 0.44 0.65 0.38 0.25 0.3 0.33 0.24 0.4 0.4 0.27 0.29 0.33 0.27 0.39 0.53 0.37 0.29 0.15
0.38 0.43 0.28 0.22 0.61 0.6 0.26 0.22 0.24 0.23 0.34 0.23 0.29 0.92 0.73 0.39 0.32 0.49 0.42 0.26 0.3 0.32 1.0 0.24 0.28 0.31 0.27 0.29 0.38 0.38 0.34
0.17 0.32 0.21 0.27 0.54 0.57 0.38 0.42 0.21 0.21 0.25 0.17 0.2 1.0 0.54 0.24 0.18 0.43 0.37 0.21 0.23 0.27 0.69 0.22 0.2 0.22 0.26 0.22 0.45 0.32 0.48
0.11 0.2 0.01 0.1 0.55 0.53 0.29 0.26 0.41 0.44 0.54 0.28 0.15 0.5 1.0 0.72 0.34 0.0 0.49 0.31 0.22 0.16 0.0 0.32 0.23 0.55 0.32 0.39 0.24 0.42 0.31
0.41 0.54 0.41 0.42 0.59 0.77 0.55 0.69 0.52 0.35 0.55 0.49 0.45 1.0 0.87 0.65 0.49 0.29 0.53 0.38 0.47 0.42 0.61 0.41 0.5 0.51 0.53 0.42 0.54 0.45 0.44
0.55 0.56 0.54 0.58 0.83 0.93 0.56 0.61 0.51 0.48 0.51 0.47 0.58 1.0 0.79 0.62 0.57 0.29 0.54 0.45 0.49 0.48 0.68 0.48 0.57 0.52 0.54 0.47 0.66 0.61 0.61
0.54 0.45 0.54 0.49 0.76 0.88 0.68 0.77 0.5 0.46 0.51 0.46 0.76 1.0 0.84 0.66 0.56 0.48 0.51 0.51 0.54 0.61 0.8 0.47 0.53 0.61 0.57 0.62 0.68 0.61 0.65
0.68 0.71 0.57 0.5 0.92 0.98 0.76 0.76 0.57 0.53 0.61 0.49 0.49 1.0 0.92 0.8 0.67 0.37 0.66 0.53 0.62 0.63 0.9 0.54 0.58 0.64 0.64 0.65 0.66 0.62 0.56
0.51 0.46 0.47 0.41 0.88 0.86 0.58 0.67 0.39 0.42 0.4 0.39 0.42 1.0 0.89 0.58 0.51 0.34 0.56 0.42 0.47 0.51 0.96 0.44 0.45 0.49 0.54 0.5 0.56 0.49 0.47
0.54 0.49 0.37 0.36 0.97 0.84 0.47 0.58 0.39 0.4 0.42 0.4 0.51 1.0 0.89 0.53 0.47 0.45 0.54 0.39 0.43 0.45 0.95 0.43 0.4 0.42 0.41 0.49 0.63 0.59 0.57
0.45 0.5 0.31 0.29 0.82 0.67 0.54 0.59 0.41 0.38 0.4 0.35 0.46 0.82 0.75 0.49 0.44 0.57 0.53 0.42 0.45 0.46 1.0 0.38 0.41 0.4 0.41 0.45 0.51 0.44 0.4
0.51 0.55 0.49 0.46 0.82 0.77 0.52 0.46 0.45 0.45 0.49 0.42 0.4 0.98 0.9 0.59 0.46 0.55 0.59 0.43 0.53 0.52 1.0 0.41 0.47 0.49 0.48 0.47 0.63 0.56 0.52
0.61 0.54 0.54 0.61 0.72 0.8 0.68 0.62 0.7 0.7 0.66 0.63 0.52 1.0 0.92 0.72 0.67 0.25 0.67 0.63 0.66 0.65 0.72 0.57 0.63 0.67 0.65 0.67 0.71 0.59 0.55
0.52 0.51 0.5 0.56 0.76 0.82 0.65 0.7 0.46 0.5 0.53 0.47 0.51 0.83 0.75 0.6 0.51 0.46 0.6 0.48 0.53 0.55 1.0 0.49 0.5 0.53 0.54 0.53 0.65 0.64 0.57
0.44 0.36 0.22 0.32 0.55 0.79 0.52 0.65 0.29 0.27 0.34 0.25 0.37 1.0 0.66 0.44 0.29 0.11 0.29 0.24 0.4 0.39 0.56 0.36 0.37 0.38 0.4 0.42 0.57 0.39 0.27
0.52 0.54 0.42 0.42 0.9 0.93 0.71 0.72 0.47 0.44 0.48 0.39 0.41 0.95 0.88 0.54 0.42 0.55 0.52 0.42 0.47 0.5 1.0 0.47 0.45 0.48 0.5 0.41 0.69 0.59 0.63
0.58 0.56 0.54 0.61 0.78 0.81 0.68 0.6 0.6 0.58 0.64 0.54 0.5 1.0 0.88 0.74 0.6 0.44 0.58 0.54 0.59 0.59 0.74 0.52 0.56 0.58 0.6 0.52 0.73 0.69 0.51
0.49 0.53 0.41 0.5 0.94 1.0 0.77 0.75 0.68 0.65 0.69 0.69 0.8 0.93 0.84 0.75 0.77 0.52 0.63 0.62 0.6 0.67 0.86 0.67 0.6 0.67 0.68 0.75 0.7 0.77 0.81
0.46 0.41 0.58 0.82 0.76 0.96 0.7 0.54 0.62 0.63 0.63 0.54 0.41 0.87 1.0 0.72 0.61 0.26 0.67 0.65 0.66 0.67 0.78 0.57 0.59 0.65 0.67 0.63 0.72 0.6 0.52
0.67 0.47 0.54 0.61 0.85 0.86 0.71 0.74 0.53 0.49 0.51 0.52 0.5 0.87 0.86 0.66 0.56 0.41 0.6 0.5 0.59 0.57 1.0 0.54 0.58 0.58 0.64 0.63 0.58 0.61 0.58
0.44 0.43 0.32 0.39 0.84 0.79 0.42 0.45 0.38 0.35 0.38 0.31 0.32 0.89 0.87 0.53 0.38 0.39 0.55 0.35 0.48 0.38 1.0 0.33 0.37 0.38 0.37 0.37 0.48 0.45 0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)