1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_42 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra001609 (FADB)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.38 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0
Bra003780 (ORA47)
 0.18 0.19 0.17 0.05 0.14 0.05 0.01 0.03 0.14 0.04 0.07 0.11 0.06 0.12 0.14 0.05 0.03 0.05 0.03 0.05 0.02 0.05 0.37 0.08 0.1 0.15 0.15 0.08 1.0 0.5 0.37
0.03 0.36 0.27 0.16 0.06 0.03 0.13 0.16 0.14 0.13 0.24 0.23 0.81 0.05 0.02 0.14 0.25 0.21 0.06 0.14 0.03 0.12 1.0 0.27 0.22 0.23 0.21 0.28 0.34 0.61 0.34
Bra005129 (APD1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.44 0.0 0.48 0.12 0.31 0.43 0.0 0.11 0.0 0.12 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.12 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
Bra006041 (PROPEP4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0
Bra006356 (SEIPIN1)
 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.57 0.58 0.0 0.0 0.0 1.0 0.59 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra007486 (SK9)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.88 0.0
Bra007586 (PLIM2c)
 0.0 0.0 0.0 0.85 0.73 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.49 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.48 0.0 0.0 0.24 1.0 0.0 0.24
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.32 0.1 0.18 0.17 0.0 0.33 0.0 0.17 0.0 0.2 0.0 0.17 0.16 0.59 0.59 0.61 0.32 0.29 0.05 0.3 1.0 0.38 0.45
Bra009737 (SQP2)
 0.04 0.1 0.03 0.04 0.33 0.03 0.13 0.32 0.29 0.58 0.12 0.19 0.83 0.11 0.09 0.13 0.12 0.47 0.01 0.16 0.06 0.19 0.79 0.04 0.29 0.1 0.1 0.13 0.07 0.35 1.0
Bra010488 (REN1)
 0.47 0.47 0.42 0.12 0.32 1.0 0.22 0.46 0.0 0.26 0.24 0.12 0.17 0.08 0.12 0.04 0.33 0.09 0.26 0.35 0.31 0.03 0.46 0.25 0.2 0.22 0.0 0.15 0.99 0.3 0.21
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.25 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.26 0.0 0.92 0.3 0.0
Bra010947 (RIC2)
 0.09 0.18 0.18 0.21 0.33 0.26 0.23 0.02 0.16 0.23 0.26 0.37 0.51 0.66 1.0 0.25 0.03 0.0 0.41 0.18 0.17 0.53 0.06 0.53 0.71 0.22 0.35 0.47 0.6 0.39 0.41
0.07 0.07 0.27 0.14 0.12 0.08 0.11 0.09 0.07 0.1 0.11 0.12 0.14 0.14 0.13 0.19 0.14 0.19 0.15 0.22 0.14 0.11 0.67 0.08 0.08 0.35 0.08 0.12 1.0 0.81 0.15
Bra011529 (RRTF1)
 0.0 0.01 0.09 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.03 0.04 0.02 0.0 0.14 0.01 0.0 0.13 0.0 0.0 1.0 0.25 0.01
Bra011732 (PLP4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.67 0.33 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.36
Bra013128 (NAI1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.4 0.21 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97
Bra015492 (ACX6)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.88 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.23 0.61 0.72 0.21 0.12 0.0 0.07 0.04
Bra015882 (ORA47)
 0.03 0.0 0.08 0.0 0.17 0.03 0.01 0.02 0.08 0.0 0.01 0.04 0.0 0.02 0.03 0.03 0.01 0.07 0.01 0.05 0.01 0.13 0.57 0.04 0.0 0.0 0.02 0.04 1.0 0.07 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.99 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.27 0.24 0.0 1.0 0.46 0.0
Bra016638 (OCT3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra017656 (RRTF1)
 0.0 0.0 0.2 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 1.0 0.55 0.0
Bra019162 (CBF1)
 0.0 0.02 0.11 0.17 0.22 0.02 0.02 0.11 0.01 0.0 0.02 0.03 0.02 0.0 0.07 0.13 0.04 0.14 0.02 0.05 0.02 0.0 0.45 0.05 0.08 0.1 0.03 0.26 1.0 0.81 0.06
Bra019404 (TH1)
 0.0 0.0 0.23 0.04 0.04 0.09 0.0 0.06 0.1 0.12 0.06 0.06 0.8 0.0 0.16 0.0 0.06 0.26 0.12 0.0 0.04 0.0 0.15 0.39 0.27 1.0 0.22 0.35 0.17 0.48 0.25
Bra020802 (LHT7)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0
Bra021479 (MUB1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra022319 (NAC058)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra023044 (PUB23)
 0.09 0.11 0.55 0.44 0.31 0.63 0.22 0.48 0.06 0.36 0.37 0.19 0.34 0.27 0.4 0.57 0.28 0.17 0.53 0.31 0.39 0.59 0.72 0.11 0.27 0.34 0.22 0.14 1.0 0.77 0.21
Bra023149 (PER7)
 0.0 0.09 0.0 0.0 0.08 0.35 0.32 0.08 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.14 0.07 0.21 0.07 0.0 0.0 0.49 0.0 1.0 0.77 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra024890 (At17.1)
 0.31 0.44 0.48 0.44 0.33 0.19 0.13 0.33 0.17 0.23 0.13 0.14 0.19 0.26 0.17 0.21 0.29 0.2 0.23 0.31 0.22 0.14 1.0 0.13 0.06 0.35 0.23 0.22 0.47 0.29 0.23
Bra025829 (RANGAP2)
 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.06 0.12 0.0 0.0 0.0 0.2 0.08 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.34 1.0 0.07 0.08 0.14 0.32 0.93 0.33 0.08
Bra028201 (ALC)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra029045 (UGT79B6)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.34 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.35 0.0 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.57 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.62
Bra032154 (sks16)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.17 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.36 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra032468 (PICL)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.16 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.17
Bra032610 (RSF1)
 0.21 0.18 0.33 0.17 0.14 0.14 0.02 0.29 0.24 0.37 0.18 0.2 0.29 0.03 0.0 0.43 0.17 0.44 0.18 0.27 0.17 0.18 0.76 0.13 0.23 0.42 0.24 0.08 0.41 0.38 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra033307 (RSL4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra033791 (ADR2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra034624 (RRTF1)
 0.0 0.0 0.23 0.11 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 1.0 0.68 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra034743 (AGC1.5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.29 0.63 0.19 0.18 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 1.0 0.14 0.15 0.22 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.21 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra036868 (CIPK4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra037759 (AGL57)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.05 0.22 0.04 0.0 0.0 0.0 0.99 0.1 0.0 0.0 0.0 0.46 0.27 0.4 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra038741 (FLA14)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.32 0.23 0.0 0.22 0.0 1.0 0.12 0.25
0.22 0.52 0.67 0.44 0.47 0.3 0.15 0.22 0.18 0.17 0.12 0.29 0.66 1.0 0.42 0.13 0.22 0.32 0.1 0.22 0.21 0.29 0.72 0.39 0.2 0.38 0.35 0.66 0.69 0.42 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Bra041162 (SUP32)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)