1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_246 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.13 0.22 0.24 0.05 0.29 0.73 0.23 0.24 0.32 0.54 0.38 0.43 0.16 0.69 1.0 0.47 0.46 0.68 0.42 0.51 0.39 0.46 0.03 0.1 0.16 0.15 0.12 0.07 0.09 0.09 0.05
Bra001531 (mtE2-2)
 0.69 0.59 0.38 0.49 0.89 0.89 0.62 0.59 0.71 0.82 0.69 0.82 0.71 0.91 1.0 0.83 0.64 0.53 0.6 0.6 0.69 0.68 0.66 0.47 0.42 0.39 0.38 0.43 0.39 0.43 0.33
0.29 0.21 0.19 0.25 0.55 0.87 0.46 0.34 0.64 0.48 0.57 0.52 0.35 0.93 1.0 0.68 0.62 0.54 0.7 0.66 0.55 0.5 0.22 0.45 0.42 0.32 0.36 0.49 0.59 0.35 0.34
0.3 0.59 0.25 0.34 0.7 1.0 0.73 0.62 0.59 0.45 0.55 0.46 0.79 0.83 0.81 0.68 0.66 0.64 0.6 0.59 0.56 0.54 0.26 0.37 0.34 0.25 0.31 0.4 0.46 0.24 0.33
Bra003066 (UBC10)
 0.52 0.49 0.5 0.54 0.81 0.8 0.53 0.5 0.64 0.57 0.55 0.56 0.54 0.84 1.0 0.65 0.56 0.68 0.57 0.6 0.53 0.7 0.57 0.48 0.51 0.44 0.5 0.48 0.59 0.47 0.45
Bra003246 (CYP94D2)
 0.26 0.22 0.21 0.24 0.47 0.81 0.3 0.25 0.48 0.29 0.34 0.39 0.26 1.0 0.47 0.44 0.31 0.37 0.45 0.61 0.47 0.46 0.35 0.24 0.24 0.19 0.22 0.31 0.31 0.18 0.26
Bra003569 (TPR1)
 0.23 0.25 0.38 0.27 0.82 0.71 0.35 0.34 0.49 0.47 0.47 0.44 0.39 0.82 1.0 0.52 0.36 0.39 0.36 0.5 0.31 0.51 0.21 0.33 0.32 0.3 0.31 0.31 0.4 0.23 0.21
0.36 0.23 0.26 0.31 0.6 1.0 0.45 0.34 0.58 0.42 0.49 0.43 0.28 0.81 0.89 0.43 0.41 0.29 0.63 0.56 0.49 0.52 0.16 0.28 0.27 0.17 0.23 0.3 0.36 0.19 0.24
Bra004282 (EAP1)
 0.09 0.06 0.1 0.04 0.83 0.66 0.15 0.13 0.59 0.36 0.41 0.46 0.17 1.0 0.92 0.31 0.28 0.11 0.34 0.5 0.37 0.5 0.01 0.24 0.21 0.05 0.1 0.06 0.37 0.18 0.14
Bra004408 (HVA22C)
 0.41 0.32 0.27 0.27 0.78 0.64 0.35 0.32 0.49 0.35 0.52 0.4 0.72 0.84 1.0 0.61 0.48 0.8 0.71 0.52 0.58 0.53 0.33 0.39 0.32 0.33 0.34 0.36 0.36 0.3 0.41
Bra005673 (MDL2)
 0.48 0.45 0.41 0.42 0.78 0.78 0.53 0.45 0.83 0.7 0.75 0.78 0.71 0.99 1.0 0.73 0.68 0.59 0.71 0.7 0.69 0.74 0.42 0.55 0.51 0.46 0.51 0.45 0.47 0.36 0.4
Bra006693 (MBD7)
 0.3 0.41 0.33 0.38 0.65 0.84 0.49 0.44 0.59 0.57 0.51 0.6 0.54 1.0 0.95 0.72 0.75 0.63 0.66 0.57 0.72 0.65 0.33 0.46 0.53 0.33 0.42 0.45 0.46 0.46 0.39
Bra007729 (CYCP1;1)
 0.56 0.49 0.5 0.47 0.83 0.87 0.75 0.77 0.65 0.74 0.78 0.72 0.89 1.0 0.98 0.89 0.83 0.8 0.59 0.84 0.72 0.78 0.37 0.5 0.54 0.36 0.48 0.38 0.44 0.38 0.52
0.28 0.12 0.19 0.23 0.79 0.63 0.49 0.46 0.58 0.42 0.49 0.4 0.44 1.0 0.7 0.67 0.46 0.37 0.63 0.72 0.47 0.44 0.2 0.29 0.34 0.21 0.3 0.41 0.5 0.23 0.19
Bra008403 (ST1)
 0.33 0.23 0.29 0.33 0.72 0.72 0.41 0.28 0.64 0.44 0.58 0.51 0.36 0.96 1.0 0.64 0.56 0.52 0.58 0.65 0.54 0.6 0.19 0.36 0.46 0.31 0.36 0.31 0.46 0.32 0.33
Bra008551 (PPa5)
 0.3 0.27 0.28 0.22 0.7 0.71 0.53 0.46 0.42 0.6 0.62 0.6 0.82 1.0 0.92 0.69 0.54 0.9 0.57 0.48 0.54 0.54 0.38 0.17 0.17 0.31 0.27 0.21 0.19 0.23 0.18
Bra008839 (CRN)
 0.2 0.08 0.16 0.15 0.68 0.87 0.59 0.43 0.39 0.24 0.39 0.31 0.55 0.55 1.0 0.62 0.54 0.35 0.55 0.38 0.46 0.34 0.36 0.29 0.3 0.16 0.21 0.23 0.33 0.19 0.27
0.5 0.44 0.4 0.4 0.69 0.96 0.39 0.52 0.46 0.42 0.35 0.37 0.36 0.87 1.0 0.46 0.56 0.35 0.49 0.41 0.55 0.4 0.31 0.36 0.35 0.3 0.32 0.4 0.51 0.36 0.43
Bra010783 (LKS1)
 0.48 0.42 0.44 0.25 0.5 0.75 0.28 0.38 0.6 0.54 0.63 0.62 0.28 0.86 1.0 0.5 0.39 0.61 0.68 0.47 0.48 0.64 0.07 0.05 0.05 0.03 0.06 0.08 0.05 0.04 0.05
0.35 0.22 0.26 0.15 0.78 0.58 0.44 0.46 0.52 0.45 0.52 0.49 0.93 1.0 0.93 0.6 0.5 0.9 0.59 0.59 0.48 0.55 0.28 0.19 0.17 0.14 0.18 0.15 0.14 0.16 0.19
0.33 0.43 0.4 0.29 0.76 0.65 0.4 0.28 0.77 0.69 0.61 0.79 0.53 0.94 1.0 0.51 0.51 0.58 0.73 0.58 0.6 0.69 0.36 0.37 0.36 0.18 0.31 0.27 0.38 0.31 0.23
Bra012110 (MAPKKK5)
 0.28 0.33 0.36 0.24 0.63 0.68 0.44 0.34 0.49 0.42 0.4 0.43 0.41 0.72 1.0 0.57 0.48 0.44 0.48 0.48 0.42 0.49 0.39 0.37 0.33 0.27 0.35 0.36 0.4 0.32 0.25
0.52 0.41 0.38 0.46 0.57 1.0 0.64 0.49 0.66 0.51 0.62 0.6 0.44 0.79 0.86 0.75 0.66 0.48 0.74 0.76 0.75 0.66 0.38 0.41 0.45 0.29 0.41 0.47 0.5 0.3 0.37
Bra013076 (BLH7)
 0.46 0.29 0.35 0.34 0.72 0.86 0.54 0.52 0.74 0.53 0.7 0.59 0.47 0.82 1.0 0.56 0.52 0.48 0.66 0.78 0.52 0.62 0.32 0.51 0.52 0.37 0.48 0.52 0.6 0.5 0.5
Bra017473 (NF-YB2)
 0.24 0.19 0.2 0.21 0.54 0.73 0.38 0.25 0.49 0.4 0.5 0.35 0.28 0.96 1.0 0.64 0.59 0.24 0.6 0.68 0.51 0.52 0.07 0.35 0.32 0.43 0.31 0.31 0.37 0.23 0.26
0.42 0.43 0.4 0.39 0.76 1.0 0.56 0.39 0.71 0.59 0.49 0.67 0.55 0.99 0.98 0.71 0.6 0.45 0.78 0.57 0.59 0.65 0.32 0.4 0.43 0.37 0.39 0.46 0.44 0.36 0.57
Bra020137 (TSL)
 0.4 0.44 0.47 0.41 0.81 0.94 0.57 0.55 0.67 0.64 0.62 0.57 0.59 0.96 1.0 0.74 0.68 0.75 0.62 0.73 0.66 0.71 0.62 0.47 0.52 0.48 0.5 0.52 0.59 0.44 0.48
Bra020342 (UCP2)
 0.45 0.44 0.39 0.45 0.89 0.8 0.58 0.59 0.78 0.58 0.62 0.62 0.7 0.82 1.0 0.77 0.66 0.67 0.68 0.67 0.67 0.78 0.51 0.43 0.42 0.37 0.38 0.39 0.49 0.41 0.44
Bra021122 (UVR3)
 0.07 0.05 0.05 0.11 0.28 0.48 0.35 0.41 0.3 0.31 0.2 0.27 0.39 1.0 0.72 0.36 0.26 0.42 0.35 0.77 0.4 0.43 0.12 0.1 0.06 0.05 0.07 0.16 0.09 0.03 0.05
Bra022186 (AAE7)
 0.28 0.26 0.36 0.31 0.49 0.86 0.49 0.39 0.47 0.45 0.5 0.39 0.43 0.94 1.0 0.67 0.54 0.24 0.47 0.53 0.51 0.48 0.23 0.31 0.32 0.28 0.33 0.24 0.31 0.22 0.28
Bra022235 (CNBT1)
 0.21 0.23 0.23 0.21 0.44 0.69 0.37 0.31 0.46 0.37 0.37 0.39 0.22 0.86 1.0 0.48 0.38 0.35 0.56 0.47 0.32 0.48 0.26 0.22 0.21 0.15 0.22 0.24 0.31 0.31 0.2
Bra022903 (PAP13)
 0.17 0.11 0.19 0.13 0.68 0.76 0.58 0.37 0.57 0.42 0.58 0.38 0.79 0.73 0.88 0.93 0.55 1.0 0.81 0.73 0.47 0.5 0.27 0.16 0.13 0.13 0.1 0.13 0.12 0.08 0.16
Bra023205 (SAE1A)
 0.04 0.03 0.1 0.13 0.23 0.78 0.4 0.31 0.36 0.35 0.38 0.44 0.49 0.98 1.0 0.61 0.62 0.44 0.66 0.29 0.43 0.55 0.04 0.03 0.07 0.01 0.06 0.04 0.02 0.03 0.06
Bra025294 (LBD25)
 0.37 0.24 0.2 0.18 0.68 0.99 0.43 0.3 0.88 0.61 0.68 0.79 0.44 0.8 1.0 0.65 0.49 0.44 0.75 0.77 0.68 0.73 0.2 0.5 0.43 0.36 0.4 0.47 0.56 0.31 0.39
Bra025733 (BES1)
 0.24 0.26 0.3 0.3 0.56 0.64 0.31 0.24 0.64 0.47 0.61 0.52 0.4 1.0 0.86 0.49 0.35 0.55 0.88 0.85 0.85 0.67 0.25 0.34 0.37 0.33 0.3 0.41 0.43 0.22 0.29
0.15 0.1 0.16 0.1 0.43 0.58 0.45 0.37 0.34 0.59 0.59 0.51 0.47 1.0 0.79 0.53 0.5 0.39 0.32 0.68 0.5 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra026250 (PAWH1)
 0.25 0.34 0.19 0.34 0.54 0.76 0.5 0.34 0.68 0.5 0.54 0.48 0.34 1.0 0.94 0.5 0.38 0.26 0.53 0.38 0.41 0.32 0.16 0.24 0.2 0.19 0.21 0.26 0.32 0.18 0.23
Bra026367 (HTA2)
 0.46 0.49 0.41 0.42 0.77 0.73 0.47 0.35 0.65 0.52 0.58 0.6 0.86 0.96 1.0 0.65 0.62 0.72 0.77 0.72 0.72 0.72 0.53 0.59 0.5 0.47 0.46 0.44 0.48 0.35 0.43
Bra027721 (GTB1)
 0.31 0.25 0.26 0.28 0.67 0.65 0.41 0.38 0.47 0.31 0.36 0.31 0.38 0.79 1.0 0.5 0.41 0.54 0.51 0.46 0.37 0.32 0.16 0.16 0.16 0.12 0.19 0.14 0.2 0.12 0.13
0.03 0.1 0.02 0.09 0.35 0.8 0.09 0.03 0.6 0.28 0.27 0.19 0.21 1.0 0.8 0.47 0.1 0.16 0.52 0.6 0.79 0.53 0.0 0.0 0.04 0.03 0.02 0.05 0.01 0.0 0.03
Bra030872 (SAGL1)
 0.18 0.19 0.2 0.24 0.41 0.7 0.41 0.22 0.38 0.34 0.23 0.31 0.27 0.88 1.0 0.4 0.33 0.31 0.43 0.54 0.37 0.35 0.29 0.25 0.21 0.19 0.22 0.24 0.32 0.19 0.17
0.58 0.6 0.66 0.54 0.93 0.79 0.46 0.5 0.63 0.57 0.59 0.67 0.66 0.92 1.0 0.61 0.58 0.7 0.57 0.6 0.56 0.63 0.52 0.51 0.53 0.51 0.52 0.54 0.57 0.49 0.51
Bra033140 (GPX6)
 0.62 0.53 0.42 0.37 0.89 0.87 0.47 0.34 0.67 0.54 0.52 0.61 0.34 0.84 1.0 0.46 0.45 0.84 0.71 0.47 0.48 0.47 0.31 0.36 0.32 0.28 0.32 0.47 0.47 0.46 0.39
Bra033276 (ORM1)
 0.51 0.56 0.57 0.48 0.84 0.93 0.48 0.48 0.73 0.64 0.59 0.73 0.44 0.98 1.0 0.53 0.61 0.78 0.69 0.67 0.56 0.66 0.57 0.48 0.46 0.43 0.43 0.49 0.54 0.47 0.46
Bra033474 (RK1)
 0.27 0.18 0.18 0.25 0.59 0.85 0.49 0.45 0.9 0.64 0.7 0.7 0.37 0.98 1.0 0.74 0.68 0.35 0.72 0.75 0.67 0.75 0.05 0.09 0.1 0.06 0.09 0.11 0.14 0.11 0.12
0.16 0.2 0.24 0.18 0.73 0.7 0.21 0.41 0.39 0.34 0.54 0.47 0.42 0.95 1.0 0.6 0.43 0.44 0.48 0.48 0.47 0.51 0.16 0.27 0.28 0.22 0.23 0.23 0.31 0.22 0.19
Bra033881 (WDL3)
 0.4 0.26 0.21 0.35 0.7 0.67 0.72 0.68 0.7 0.62 0.59 0.57 0.64 1.0 0.91 0.73 0.52 0.65 0.84 0.77 0.6 0.54 0.24 0.38 0.43 0.34 0.33 0.42 0.37 0.19 0.18
Bra034821 (DGD1)
 0.3 0.26 0.27 0.23 0.61 1.0 0.52 0.55 0.44 0.4 0.41 0.33 0.36 0.9 0.89 0.55 0.58 0.46 0.65 0.44 0.51 0.45 0.16 0.36 0.36 0.23 0.33 0.36 0.49 0.27 0.32
Bra034997 (GTB1)
 0.31 0.25 0.26 0.28 0.67 0.65 0.41 0.38 0.47 0.31 0.36 0.31 0.38 0.79 1.0 0.5 0.41 0.54 0.51 0.46 0.37 0.32 0.16 0.16 0.16 0.12 0.19 0.14 0.2 0.12 0.13
0.4 0.3 0.31 0.22 0.56 0.79 0.32 0.33 0.55 0.43 0.48 0.44 0.27 0.97 1.0 0.59 0.5 0.55 0.52 0.58 0.51 0.45 0.33 0.39 0.39 0.36 0.38 0.44 0.49 0.45 0.45
Bra036255 (MLO1)
 0.56 0.58 0.4 0.45 0.73 0.84 0.54 0.52 0.73 0.68 0.76 0.66 0.55 1.0 0.97 0.78 0.65 0.58 0.68 0.77 0.77 0.79 0.4 0.51 0.5 0.47 0.51 0.6 0.58 0.4 0.41
Bra037257 (PP2C49)
 0.14 0.12 0.16 0.15 0.61 0.66 0.35 0.29 0.38 0.4 0.27 0.32 0.4 1.0 0.67 0.39 0.28 0.4 0.7 0.46 0.54 0.41 0.24 0.28 0.3 0.16 0.25 0.18 0.21 0.22 0.29
Bra037405 (SAUR31)
 0.23 0.28 0.18 0.14 0.78 1.0 0.42 0.42 0.32 0.28 0.36 0.31 0.57 0.91 0.64 0.53 0.37 0.6 0.51 0.41 0.51 0.52 0.11 0.3 0.29 0.22 0.29 0.27 0.26 0.16 0.21
Bra037461 (CB5-D)
 0.51 0.53 0.51 0.48 0.8 0.9 0.54 0.57 0.75 0.65 0.67 0.75 0.69 0.97 1.0 0.75 0.67 0.62 0.7 0.71 0.69 0.79 0.46 0.51 0.48 0.45 0.5 0.43 0.5 0.48 0.52
Bra038964 (SBP1)
 0.44 0.49 0.37 0.41 0.66 0.86 0.5 0.42 0.64 0.56 0.53 0.55 0.39 0.91 1.0 0.61 0.52 0.52 0.73 0.55 0.6 0.66 0.36 0.47 0.46 0.43 0.51 0.58 0.57 0.5 0.58
Bra039504 (SK18)
 0.29 0.42 0.31 0.16 0.77 0.81 0.51 0.54 0.59 0.51 0.59 0.62 0.72 0.85 1.0 0.71 0.64 0.84 0.57 0.69 0.63 0.68 0.14 0.3 0.2 0.05 0.09 0.14 0.21 0.13 0.2
Bra040449 (CCD1)
 0.6 0.54 0.41 0.56 0.68 1.0 0.75 0.66 0.73 0.66 0.69 0.67 0.65 1.0 0.97 0.79 0.71 0.64 0.8 0.75 0.7 0.72 0.41 0.55 0.57 0.51 0.53 0.61 0.59 0.43 0.53
0.52 0.5 0.45 0.51 0.85 0.97 0.85 0.81 0.9 0.83 0.67 0.77 0.82 0.96 0.96 1.0 0.69 0.63 0.74 0.86 0.71 0.7 0.55 0.52 0.55 0.43 0.49 0.51 0.46 0.38 0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)