1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_146 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra001199 (ELO1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.03 0.04 0.03 0.06 0.04 0.06 0.07 0.07 0.08 0.07 0.07 0.4 0.06 0.04 0.12 0.1 1.0 0.09 0.09 0.06 0.08 0.15 0.1 0.11 0.11 0.08 0.08 0.07 0.05 0.09
Bra001637 (TCTP1)
 0.17 0.22 0.23 0.21 0.19 0.16 0.16 0.24 0.17 0.19 0.17 0.19 0.35 0.32 0.33 0.26 0.28 1.0 0.3 0.21 0.21 0.22 0.35 0.12 0.13 0.17 0.13 0.1 0.11 0.13 0.24
Bra002041 (GPAT5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Bra003309 (AFO)
 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.94 0.0 0.0 0.06 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.3 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1
Bra004162 (PAP2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.09 0.07 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.33 0.02 0.04 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02
Bra004204 (TRM22)
 0.04 0.01 0.02 0.05 0.11 0.08 0.05 0.07 0.02 0.04 0.06 0.04 0.46 0.16 0.11 0.08 0.06 1.0 0.11 0.04 0.01 0.0 0.22 0.07 0.03 0.05 0.05 0.08 0.02 0.04 0.12
Bra004617 (BOP2)
 0.05 0.11 0.03 0.02 0.05 0.12 0.0 0.09 0.0 0.09 0.04 0.06 0.92 0.01 0.13 0.02 0.03 1.0 0.02 0.04 0.01 0.0 0.35 0.04 0.01 0.05 0.05 0.02 0.05 0.08 0.09
Bra004719 (RLP29)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.02 0.04 0.02 0.06 0.07 0.01 0.03 0.71 0.07 0.08 0.07 0.02 1.0 0.06 0.07 0.01 0.06 0.29 0.13 0.09 0.04 0.06 0.07 0.04 0.07 0.09
Bra005137 (GPAT6)
 0.01 0.01 0.0 0.0 0.07 0.03 0.07 0.04 0.1 0.14 0.07 0.09 0.49 0.13 0.08 0.17 0.33 1.0 0.11 0.07 0.05 0.07 0.23 0.06 0.05 0.04 0.04 0.07 0.07 0.08 0.09
Bra005917 (PGIP2)
 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.11 0.01 0.01 0.03 0.03 1.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.09 0.02 0.04 0.04 0.04 0.01 0.01 0.04 0.08
0.11 0.04 0.06 0.08 0.18 0.09 0.07 0.06 0.11 0.11 0.11 0.1 0.41 0.22 0.14 0.17 0.16 1.0 0.12 0.07 0.08 0.07 0.28 0.14 0.1 0.21 0.1 0.13 0.13 0.13 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.06 0.03 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.06 0.03 0.03 0.07 0.02 0.02 0.03 0.02 1.0 0.03 0.02 0.01 0.03 0.34 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
Bra007961 (RSW10)
 0.12 0.18 0.29 0.09 0.06 0.08 0.08 0.14 0.09 0.09 0.1 0.08 0.12 0.08 0.09 0.07 0.11 1.0 0.24 0.08 0.07 0.06 0.31 0.14 0.08 0.13 0.06 0.09 0.1 0.13 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.08 0.06 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.01 0.02 0.04 0.02 0.07 0.07 0.06 0.07 0.08 0.06 0.34 0.07 0.06 0.09 0.06 1.0 0.1 0.07 0.04 0.03 0.14 0.04 0.05 0.04 0.04 0.05 0.04 0.04 0.07
Bra010306 (CDEF1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.02 0.01 0.11 0.04 0.09 0.05 0.06 0.09 0.1 0.09 0.49 0.21 0.1 0.18 0.15 1.0 0.08 0.08 0.08 0.07 0.23 0.15 0.14 0.17 0.12 0.19 0.11 0.14 0.16
Bra011506 (EDA9)
 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.03 0.03 0.09 0.04 0.1 0.05 0.04 0.21 0.07 0.06 0.1 0.07 1.0 0.1 0.05 0.05 0.06 0.27 0.1 0.09 0.08 0.06 0.05 0.03 0.03 0.04
Bra012067 (GMD1)
 0.0 0.02 0.02 0.01 0.1 0.02 0.01 0.0 0.04 0.0 0.02 0.01 0.75 0.05 0.05 0.01 0.01 1.0 0.02 0.03 0.03 0.0 0.2 0.05 0.01 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.05
Bra012131 (MKK19)
 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 1.0 0.13 0.02 0.0 0.01 0.24 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01
Bra012274 (RSH)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra012901 (OBP1)
 0.13 0.17 0.2 0.12 0.15 0.14 0.07 0.06 0.05 0.17 0.03 0.11 0.91 0.15 0.1 0.23 0.2 1.0 0.13 0.16 0.05 0.21 0.45 0.05 0.05 0.23 0.06 0.0 0.09 0.04 0.14
Bra013422 (IRT1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra014794 (PT)
 0.08 0.02 0.02 0.04 0.08 0.16 0.11 0.14 0.09 0.09 0.12 0.1 0.28 0.15 0.14 0.13 0.15 1.0 0.23 0.08 0.09 0.06 0.17 0.09 0.09 0.07 0.1 0.08 0.06 0.08 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.05 0.01 0.0 0.52 0.0 0.0 0.02 0.01 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.12 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0
Bra017988 (iqd15)
 0.01 0.03 0.09 0.02 0.14 0.09 0.04 0.05 0.07 0.03 0.16 0.04 0.75 0.13 0.17 0.1 0.08 1.0 0.18 0.08 0.05 0.03 0.32 0.06 0.16 0.02 0.06 0.02 0.1 0.03 0.13
Bra019257 (UGE2)
 0.04 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.13 0.01 0.03 0.0 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.04 0.03
Bra019619 (LFY)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra019823 (MKD1)
 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.01 0.0 0.17 0.02 0.02 0.01 0.02 1.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.15 0.02 0.02 0.04 0.02 0.02 0.02 0.03 0.04
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra021934 (MEE24)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra022381 (POK2)
 0.17 0.09 0.19 0.12 0.25 0.15 0.16 0.1 0.13 0.14 0.14 0.12 0.65 0.16 0.15 0.23 0.2 1.0 0.2 0.15 0.14 0.15 0.31 0.15 0.14 0.17 0.1 0.16 0.14 0.18 0.26
Bra023112 (TTG2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.16 0.29 0.08 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 1.0 0.05 0.01 0.0 0.01 0.3 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.04
0.15 0.15 0.14 0.19 0.26 0.1 0.15 0.17 0.18 0.21 0.16 0.17 0.33 0.22 0.19 0.17 0.19 1.0 0.25 0.16 0.14 0.16 0.44 0.14 0.14 0.18 0.17 0.15 0.13 0.14 0.21
Bra026570 (RNS1)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 1.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.21 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0
Bra027549 (AtBBE25)
 0.01 0.05 0.06 0.01 0.1 0.07 0.09 0.07 0.02 0.03 0.03 0.06 0.63 0.01 0.02 0.04 0.06 1.0 0.02 0.04 0.04 0.03 0.38 0.04 0.04 0.05 0.05 0.05 0.05 0.04 0.04
Bra028786 (KCS19)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
Bra029305 (LFY)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra030763 (CRT2)
 0.04 0.04 0.04 0.06 0.09 0.15 0.14 0.14 0.15 0.17 0.11 0.1 0.38 0.08 0.13 0.14 0.16 1.0 0.33 0.17 0.11 0.24 0.24 0.21 0.19 0.18 0.18 0.18 0.16 0.14 0.17
Bra031793 (GAL2)
 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
Bra032889 (AGP31)
 0.02 0.01 0.03 0.02 0.04 0.04 0.02 0.02 0.06 0.05 0.05 0.04 0.29 0.07 0.12 0.1 0.07 1.0 0.13 0.1 0.05 0.04 0.3 0.04 0.05 0.04 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03
Bra033366 (GRXS1)
 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.04 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra034774 (FLR1)
 0.08 0.03 0.04 0.04 0.11 0.03 0.11 0.1 0.05 0.14 0.08 0.07 0.49 0.09 0.06 0.09 0.2 1.0 0.11 0.1 0.07 0.06 0.22 0.12 0.1 0.17 0.1 0.08 0.09 0.14 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.42 0.16 0.12 0.01 0.03 1.0 0.07 0.0 0.01 0.02 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.01 0.0 0.01
Bra037302 (PUP1)
 0.04 0.08 0.12 0.09 0.07 0.07 0.05 0.11 0.04 0.08 0.05 0.07 0.05 0.04 0.04 0.07 0.12 1.0 0.13 0.07 0.06 0.05 0.39 0.05 0.06 0.12 0.06 0.04 0.05 0.05 0.03
Bra038700 (FLR1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.33 0.02 0.02 0.05 0.06 1.0 0.02 0.03 0.03 0.02 0.15 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.04
Bra040525 (DEG28)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)