1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_126 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.37 0.01 0.14 0.26 0.62 0.67 0.57 0.36 0.53 0.45 0.41 0.43 0.91 0.5 0.2 0.83 0.61 0.48 0.45 0.89 0.77 0.37 1.0 0.56 0.46 0.45 0.42 0.25 0.66 0.64 1.0
Bra002384 (UBP8)
 0.72 0.56 0.61 0.63 1.0 0.98 0.77 0.65 0.53 0.55 0.58 0.58 0.63 0.76 0.79 0.78 0.71 0.82 0.67 0.64 0.56 0.64 0.81 0.84 0.85 0.77 0.84 0.87 0.84 0.77 0.94
0.39 0.47 0.65 0.71 0.92 0.7 0.71 0.9 0.6 0.67 0.66 0.59 0.9 0.77 0.73 0.86 0.76 0.98 0.67 0.65 0.62 0.58 0.82 0.68 0.78 0.81 0.83 0.89 0.83 1.0 0.97
Bra003683 (RFC5)
 0.74 0.82 0.74 0.8 0.72 0.77 0.58 0.57 0.54 0.47 0.51 0.49 0.82 0.62 1.0 0.6 0.56 0.66 0.49 0.57 0.43 0.46 0.77 0.49 0.69 0.57 0.61 0.76 0.72 0.69 0.73
0.35 0.15 0.22 0.25 1.0 0.51 0.5 0.76 0.67 0.53 0.77 0.56 0.54 0.44 0.23 0.57 0.43 0.75 0.67 0.6 0.5 0.61 0.32 0.75 0.71 0.6 0.76 0.85 0.83 0.72 0.63
0.43 0.2 0.2 0.24 1.0 0.7 0.65 0.53 0.56 0.54 0.59 0.7 0.49 0.69 0.55 0.76 0.53 0.51 0.5 0.54 0.53 0.61 0.41 0.61 0.63 0.57 0.65 0.73 0.77 0.73 0.63
0.49 0.36 0.43 0.37 0.92 0.8 0.62 0.53 0.59 0.49 0.58 0.57 0.59 0.72 0.8 0.74 0.65 0.81 0.64 0.61 0.54 0.47 0.58 0.66 0.72 0.45 0.66 0.7 0.86 0.89 1.0
Bra005988 (AGAL2)
 0.43 0.34 0.5 0.31 1.0 0.71 0.54 0.42 0.63 0.62 0.66 0.65 0.45 0.59 0.55 0.56 0.52 0.64 0.56 0.52 0.55 0.47 0.34 0.61 0.57 0.45 0.55 0.68 0.75 0.56 0.64
Bra006017 (E1A2)
 0.11 0.11 0.09 0.06 0.68 0.52 0.67 0.68 0.54 0.53 0.56 0.48 0.64 0.84 0.47 0.66 0.52 0.45 0.54 0.35 0.56 0.52 0.38 0.65 0.51 0.49 0.54 1.0 0.94 0.43 0.4
Bra006413 (BolA4)
 0.46 0.43 0.49 0.42 0.84 0.63 0.7 0.7 0.7 0.53 0.51 0.59 0.91 0.6 0.66 0.65 0.64 0.6 0.57 0.61 0.71 0.56 1.0 0.73 0.63 0.68 0.75 0.9 0.84 0.71 0.79
0.48 0.51 0.54 0.39 0.9 0.62 0.62 0.47 0.59 0.59 0.58 0.59 1.0 0.9 0.72 0.74 0.44 0.72 0.67 0.54 0.62 0.72 0.77 0.77 0.66 0.65 0.64 0.72 0.62 0.57 0.63
Bra007153 (HHP1)
 0.56 0.51 0.39 0.43 0.97 0.63 0.83 0.68 0.59 0.59 0.54 0.67 0.59 0.69 0.64 0.64 0.58 0.68 0.55 0.49 0.47 0.49 0.43 0.7 0.54 0.41 0.56 1.0 0.86 0.88 0.57
Bra007248 (SCAB3)
 0.22 0.22 0.28 0.15 0.95 0.69 0.59 0.45 0.47 0.62 0.66 0.57 0.96 0.59 0.52 1.0 0.83 0.31 0.39 0.71 0.77 0.72 0.7 0.85 0.85 0.59 0.78 0.71 0.75 0.53 0.57
0.81 1.0 0.78 0.87 0.93 0.67 0.62 0.79 0.6 0.61 0.52 0.57 0.93 0.89 0.82 0.67 0.56 0.97 0.52 0.52 0.47 0.47 0.8 0.69 0.76 0.75 0.67 0.88 0.91 0.88 0.86
0.15 0.23 0.32 0.09 0.79 0.42 0.31 0.24 0.73 0.75 0.72 0.37 0.37 0.72 0.59 0.74 0.58 0.63 0.88 0.45 0.63 0.53 1.0 0.73 0.82 0.48 0.75 0.56 0.49 0.51 0.46
Bra009121 (AL1)
 0.49 0.3 0.59 0.48 0.82 0.6 0.6 0.76 0.48 0.56 0.57 0.57 0.74 0.93 0.78 0.67 0.75 0.53 0.58 0.67 0.65 0.55 0.83 0.86 0.73 0.63 0.8 0.69 0.62 0.64 1.0
Bra009208 (d-LDH)
 0.93 0.75 0.8 0.63 1.0 0.9 0.7 0.67 0.66 0.63 0.64 0.67 0.84 0.85 0.87 0.7 0.62 0.87 0.79 0.67 0.59 0.67 0.72 0.75 0.8 0.76 0.8 0.93 0.97 0.86 0.98
Bra009385 (SACL1)
 0.2 0.17 0.19 0.2 1.0 0.4 0.31 0.33 0.37 0.37 0.37 0.35 0.67 0.81 0.63 0.5 0.45 0.66 0.42 0.43 0.4 0.38 0.3 0.37 0.41 0.26 0.36 0.29 0.37 0.38 0.53
0.29 0.17 0.2 0.22 1.0 0.38 0.31 0.32 0.29 0.35 0.37 0.36 0.49 0.79 0.66 0.44 0.36 0.67 0.34 0.4 0.36 0.33 0.24 0.33 0.43 0.21 0.35 0.32 0.38 0.38 0.62
Bra010847 (SCAR3)
 0.4 0.36 0.39 0.24 0.88 0.72 0.63 0.78 0.72 0.64 0.65 0.68 0.67 1.0 0.93 0.64 0.53 0.79 0.6 0.6 0.5 0.55 0.5 0.69 0.82 0.62 0.8 0.91 0.97 0.75 0.67
0.08 0.07 0.25 0.08 1.0 0.45 0.49 0.33 0.43 0.67 0.74 0.52 0.95 0.9 0.69 0.79 0.6 0.58 0.47 0.44 0.7 0.39 0.98 0.77 0.85 0.57 0.8 0.81 0.6 0.54 0.57
Bra011219 (AUG8)
 0.32 0.23 0.26 0.36 1.0 0.5 0.26 0.4 0.35 0.35 0.31 0.34 0.41 0.64 0.63 0.49 0.43 0.64 0.43 0.39 0.39 0.29 0.35 0.37 0.36 0.35 0.31 0.49 0.46 0.76 0.89
Bra011335 (KIX9)
 0.59 0.23 0.37 0.2 1.0 0.45 0.26 0.6 0.55 0.3 0.51 0.47 0.46 0.4 0.58 0.27 0.19 0.74 0.5 0.21 0.29 0.33 0.61 0.3 0.29 0.12 0.3 0.51 0.41 0.83 0.92
Bra012800 (SMXL3)
 0.63 0.38 0.42 0.34 1.0 0.57 0.25 0.18 0.41 0.45 0.24 0.34 0.58 0.7 0.57 0.64 0.51 0.52 0.67 0.37 0.52 0.41 0.57 0.53 0.54 0.54 0.5 0.43 0.48 0.75 0.99
Bra013852 (TPD1)
 0.22 0.08 0.13 0.06 1.0 0.73 0.71 0.56 0.61 0.42 0.54 0.5 0.5 0.57 0.69 0.52 0.52 0.41 0.67 0.68 0.5 0.51 0.41 0.65 0.65 0.19 0.57 0.63 0.55 0.66 0.47
Bra014419 (ARF18)
 0.24 0.1 0.17 0.12 1.0 0.56 0.41 0.54 0.63 0.36 0.44 0.39 0.49 0.53 0.5 0.45 0.27 0.79 0.66 0.39 0.33 0.27 0.23 0.63 0.57 0.38 0.43 0.93 0.73 0.58 0.44
0.32 0.15 0.32 0.23 0.63 0.27 0.53 0.91 0.44 0.36 0.51 0.56 1.0 0.29 0.55 0.28 0.59 0.95 0.42 0.43 0.32 0.21 0.45 0.5 0.47 0.62 0.46 0.78 0.6 0.68 0.81
0.42 0.29 0.37 0.51 1.0 0.61 0.51 0.57 0.78 0.6 0.61 0.49 0.54 0.86 0.93 0.74 0.59 0.71 0.98 0.8 0.62 0.59 0.34 0.65 0.64 0.87 0.61 0.72 0.76 0.66 0.56
0.29 0.18 0.22 0.3 1.0 0.74 0.62 0.63 0.47 0.47 0.53 0.43 0.4 0.69 0.73 0.6 0.65 0.53 0.72 0.54 0.41 0.46 0.59 0.7 0.71 0.42 0.71 0.84 0.71 0.68 0.74
0.58 0.45 0.46 0.31 0.73 0.58 0.67 0.69 0.61 0.63 0.57 0.75 0.84 0.77 0.74 0.81 0.68 0.83 0.77 0.7 0.47 0.52 0.82 0.83 0.84 0.64 0.82 0.89 0.84 1.0 0.81
0.52 0.53 0.68 0.32 1.0 0.68 0.41 0.4 0.64 0.55 0.49 0.63 0.65 0.98 0.89 0.64 0.61 0.9 0.59 0.5 0.49 0.69 0.7 0.55 0.65 0.4 0.59 0.63 0.66 0.73 0.84
Bra018665 (GATA11)
 0.1 0.17 0.29 0.19 0.72 0.23 0.29 0.22 0.49 0.58 0.53 0.56 0.51 0.51 0.55 0.64 0.47 0.73 0.49 0.6 0.5 0.43 1.0 0.71 0.52 0.35 0.44 0.56 0.39 0.63 0.75
Bra018937 (LYK3)
 0.48 0.46 0.36 0.41 1.0 0.6 0.22 0.62 0.42 0.5 0.41 0.38 0.38 0.54 0.49 0.3 0.48 0.8 0.58 0.26 0.3 0.46 0.5 0.26 0.31 0.36 0.39 0.44 0.37 0.51 0.72
Bra021248 (NPSN13)
 0.84 0.82 0.85 0.84 0.96 0.65 0.67 0.54 0.49 0.46 0.47 0.45 0.82 0.85 1.0 0.39 0.34 0.92 0.51 0.66 0.54 0.48 0.99 0.71 0.71 0.79 0.63 0.64 0.6 0.59 0.73
Bra021277 (RLK902)
 0.39 0.29 0.42 0.48 0.99 0.43 0.67 0.84 0.19 0.34 0.31 0.57 0.91 0.59 0.51 0.54 0.65 0.86 0.41 0.26 0.23 0.34 1.0 0.59 0.57 0.9 0.64 0.86 0.86 0.98 0.89
Bra021392 (CER8)
 0.42 0.25 0.33 0.1 1.0 0.33 0.26 0.52 0.88 0.63 0.51 0.58 0.57 0.73 0.55 0.43 0.33 0.77 0.49 0.26 0.25 0.25 0.45 0.32 0.35 0.25 0.28 0.58 0.69 0.7 0.83
0.04 0.01 0.1 0.06 1.0 0.8 0.39 0.48 0.69 0.58 0.47 0.32 0.49 0.83 0.66 0.35 0.41 0.55 0.8 0.71 0.54 0.5 0.74 0.59 0.4 0.47 0.5 0.84 0.9 0.38 0.63
0.34 0.34 0.37 0.25 1.0 0.7 0.41 0.4 0.44 0.52 0.39 0.44 0.56 0.8 0.68 0.56 0.46 0.81 0.55 0.52 0.5 0.46 0.31 0.63 0.56 0.43 0.51 0.56 0.55 0.52 0.76
Bra022547 (EYE)
 0.56 0.62 0.91 0.8 0.83 0.39 0.43 0.69 0.49 0.56 0.42 0.53 0.92 0.7 0.68 0.54 0.6 0.88 0.56 0.38 0.41 0.46 0.77 0.67 0.56 0.72 0.57 0.77 0.71 1.0 0.86
Bra022766 (SPL13)
 0.21 0.07 0.11 0.13 1.0 0.51 0.34 0.41 0.3 0.37 0.35 0.32 0.6 0.51 0.51 0.56 0.5 0.43 0.51 0.53 0.5 0.43 0.44 0.56 0.49 0.44 0.51 0.59 0.45 0.47 0.49
Bra024383 (CYCD4;1)
 0.38 0.35 0.34 0.18 0.9 0.67 0.4 0.29 0.43 0.64 0.5 0.57 1.0 0.75 0.67 0.6 0.31 0.77 0.78 0.36 0.76 0.58 0.85 0.76 0.64 0.72 0.73 0.61 0.67 0.65 0.68
Bra025152 (ABCG21)
 0.31 0.15 0.19 0.15 1.0 0.47 0.17 0.16 0.31 0.15 0.14 0.19 0.36 0.44 0.36 0.35 0.22 0.59 0.46 0.23 0.2 0.12 0.25 0.3 0.3 0.39 0.33 0.4 0.46 0.37 0.44
Bra026184 (MAP70-4)
 0.35 0.37 0.32 0.36 0.91 0.67 0.6 0.89 0.61 0.49 0.54 0.53 0.62 1.0 0.94 0.58 0.52 0.49 0.59 0.54 0.56 0.52 0.6 0.68 0.62 0.51 0.62 0.71 0.75 0.58 0.63
0.32 0.14 0.18 0.17 1.0 0.65 0.45 0.6 0.82 0.54 0.8 0.8 0.52 0.72 0.44 0.45 0.41 0.38 0.58 0.56 0.62 0.56 0.3 0.55 0.63 0.55 0.58 0.77 0.91 0.68 0.51
0.46 0.25 0.3 0.19 0.86 0.44 0.43 0.6 0.46 0.33 0.29 0.38 0.34 0.32 0.4 0.29 0.31 0.72 0.35 0.35 0.27 0.27 0.32 0.63 0.57 0.42 0.53 0.74 1.0 0.64 0.34
Bra026958 (RFL2)
 0.47 0.37 0.44 0.31 0.94 0.69 0.37 0.51 0.34 0.28 0.44 0.34 0.53 1.0 0.58 0.52 0.47 0.7 0.54 0.33 0.4 0.33 0.33 0.46 0.41 0.29 0.47 0.35 0.56 0.45 0.62
Bra027014 (LDL1)
 0.51 0.57 0.55 0.52 0.82 0.82 0.72 0.7 0.57 0.63 0.58 0.54 0.77 0.85 0.85 0.84 0.67 0.63 0.65 0.63 0.59 0.58 0.82 0.68 0.74 0.44 0.74 0.69 0.82 0.76 1.0
Bra027523 (UMAMIT42)
 0.13 0.19 0.08 0.14 1.0 0.41 0.27 0.33 0.5 0.42 0.67 0.41 0.61 0.85 0.41 0.67 0.39 0.83 0.58 0.45 0.36 0.51 0.98 0.54 0.67 0.65 0.54 0.61 0.47 0.82 0.61
0.44 0.39 0.55 0.35 1.0 0.68 0.45 0.49 0.49 0.51 0.45 0.47 0.67 0.85 0.78 0.58 0.59 0.67 0.54 0.51 0.45 0.49 0.45 0.57 0.61 0.61 0.59 0.62 0.76 0.55 0.83
Bra029810 (ACIP1)
 0.75 0.49 0.48 0.54 1.0 0.71 0.55 0.54 0.54 0.48 0.49 0.47 0.86 0.68 0.67 0.68 0.61 0.78 0.42 0.44 0.46 0.44 0.66 0.68 0.7 0.87 0.61 0.79 0.93 0.77 0.94
Bra029924 (SEND1)
 0.49 0.18 0.34 0.14 0.88 0.58 0.52 0.48 0.43 0.65 0.69 0.47 0.75 0.47 0.48 0.61 1.0 0.45 0.61 0.89 0.63 0.53 0.66 0.68 0.59 0.53 0.66 0.7 0.57 0.65 0.79
0.29 0.06 0.16 0.18 0.73 0.51 0.47 0.32 0.5 0.78 0.79 0.75 0.67 0.6 0.87 1.0 0.64 0.49 0.59 0.87 0.68 0.62 0.4 0.53 0.9 0.48 0.77 0.37 0.29 0.38 0.57
Bra030803 (SK41)
 0.51 0.48 0.56 0.39 0.91 0.65 0.56 0.56 0.49 0.57 0.54 0.6 0.74 0.69 0.79 0.66 0.72 0.62 0.69 0.63 0.68 0.51 0.7 0.73 0.7 0.53 0.8 0.63 0.61 0.75 1.0
0.21 0.09 0.16 0.16 0.4 0.41 1.0 0.48 0.4 0.46 0.2 0.29 0.9 0.18 0.36 0.78 0.74 0.48 0.18 0.5 0.56 0.4 0.51 0.69 0.57 0.49 0.55 0.38 0.49 0.34 0.6
0.25 0.26 0.36 0.22 0.89 0.57 0.42 0.6 0.56 0.66 0.68 0.6 0.81 0.58 0.84 0.69 0.69 0.99 0.64 0.86 0.58 0.68 0.79 1.0 0.84 0.41 0.67 0.64 0.48 0.61 0.8
Bra031741 (ATSGS1)
 0.47 0.38 0.49 0.44 1.0 0.75 0.48 0.68 0.63 0.61 0.52 0.52 0.93 0.77 0.7 0.92 0.63 0.74 0.67 0.62 0.61 0.68 0.95 0.96 0.85 0.5 0.82 0.98 0.84 0.63 0.87
Bra033063 (PRE5)
 0.07 0.12 0.2 0.2 0.63 0.37 0.44 0.4 0.65 0.58 0.78 0.69 0.74 0.37 0.67 1.0 0.42 0.5 0.5 0.65 0.68 0.42 0.61 0.83 0.53 0.3 0.3 0.11 0.27 0.37 0.82
Bra033427 (SMXL3)
 0.51 0.4 0.47 0.43 0.96 0.76 0.35 0.32 0.54 0.42 0.36 0.34 0.52 0.96 0.62 0.63 0.47 0.76 0.44 0.51 0.43 0.45 1.0 0.6 0.75 0.44 0.46 0.62 0.61 0.89 0.96
0.6 0.44 0.58 0.55 1.0 0.69 0.63 0.8 0.63 0.65 0.71 0.67 0.85 0.9 0.78 0.76 0.65 0.83 0.66 0.61 0.62 0.65 0.72 0.82 0.9 0.81 0.84 0.85 0.87 0.96 0.86
Bra035381 (HK2)
 0.38 0.23 0.36 0.23 1.0 0.67 0.2 0.15 0.36 0.31 0.29 0.35 0.45 0.73 0.78 0.42 0.45 0.44 0.38 0.4 0.3 0.26 0.42 0.44 0.44 0.4 0.42 0.46 0.6 0.42 0.59
Bra035821 (HKL2)
 1.0 0.98 0.76 0.77 0.92 0.58 0.44 0.52 0.48 0.62 0.59 0.58 0.7 0.69 0.66 0.66 0.65 0.77 0.48 0.49 0.48 0.54 0.73 0.66 0.79 0.75 0.72 0.9 0.83 0.84 0.96
Bra035849 (HEMN1)
 0.42 0.4 0.49 0.43 0.94 1.0 0.7 0.73 0.51 0.56 0.45 0.45 0.52 0.73 0.77 0.71 0.74 0.57 0.53 0.58 0.7 0.55 0.63 0.79 0.72 0.62 0.72 0.84 0.89 0.66 0.85
0.56 0.27 0.23 0.34 0.51 0.35 0.59 0.61 0.49 0.69 0.37 0.68 0.66 0.54 0.72 0.69 0.59 0.68 0.61 0.44 0.43 0.52 0.52 0.52 0.74 0.67 0.51 0.74 0.79 1.0 0.87
Bra038125 (PLA2-ALPHA)
 0.57 0.36 0.55 0.4 0.93 0.76 0.6 0.57 0.78 0.76 0.76 0.74 0.86 1.0 0.85 0.85 0.68 0.87 0.74 0.78 0.76 0.83 0.84 0.78 0.76 0.71 0.77 0.74 0.71 0.66 0.84
Bra038233 (DIM)
 0.24 0.14 0.2 0.14 1.0 0.61 0.6 0.78 0.71 0.68 0.6 0.65 0.86 0.78 0.64 0.83 0.74 0.47 0.55 0.63 0.61 0.6 0.93 0.68 0.75 0.64 0.63 0.78 0.82 0.74 0.51
0.37 0.34 0.37 0.5 0.63 0.8 0.78 0.7 0.47 0.72 0.49 0.49 0.97 0.62 0.67 0.85 1.0 0.42 0.44 0.68 0.65 0.78 0.62 0.71 0.7 0.5 0.6 0.63 0.68 0.48 0.58
0.18 0.17 0.3 0.12 0.48 0.38 0.13 0.19 0.21 0.2 0.19 0.16 0.44 0.48 0.43 0.3 0.18 0.35 0.23 0.29 0.34 0.18 1.0 0.25 0.3 0.3 0.34 0.43 0.34 0.69 0.61

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)