1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_262 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000639 (ORP1C)
 0.31 0.4 0.45 0.27 0.41 0.41 0.25 0.23 0.26 0.25 0.24 0.29 0.21 0.4 0.42 0.3 0.26 0.43 0.29 0.28 0.24 0.26 1.0 0.3 0.28 0.37 0.29 0.31 0.36 0.3 0.28
Bra000659 (ARGAH1)
 0.09 0.15 0.18 0.17 0.53 0.42 0.09 0.04 0.04 0.08 0.03 0.06 0.12 0.31 0.1 0.07 0.05 0.18 0.13 0.11 0.07 0.16 1.0 0.04 0.03 0.03 0.03 0.04 0.05 0.04 0.06
0.24 0.32 0.25 0.16 0.51 0.37 0.15 0.19 0.32 0.31 0.31 0.26 0.26 0.4 0.42 0.21 0.23 0.28 0.25 0.27 0.23 0.27 1.0 0.22 0.24 0.18 0.21 0.21 0.28 0.29 0.23
0.43 0.43 0.37 0.3 0.55 0.63 0.34 0.37 0.34 0.27 0.29 0.29 0.33 0.49 0.48 0.39 0.34 0.34 0.34 0.33 0.31 0.39 1.0 0.35 0.35 0.25 0.31 0.33 0.38 0.35 0.33
Bra001499 (CAX2)
 0.31 0.29 0.39 0.23 0.41 0.41 0.16 0.16 0.22 0.19 0.21 0.22 0.2 0.5 0.46 0.26 0.22 0.44 0.22 0.2 0.2 0.25 1.0 0.26 0.18 0.26 0.18 0.25 0.28 0.22 0.18
Bra002068 (PILS5)
 0.07 0.03 0.03 0.02 0.49 0.64 0.11 0.05 0.17 0.08 0.11 0.12 0.07 0.72 0.39 0.12 0.04 0.03 0.06 0.11 0.12 0.08 1.0 0.17 0.15 0.11 0.18 0.19 0.37 0.14 0.08
Bra002481 (SIZ1)
 0.5 0.54 0.57 0.41 0.67 0.68 0.4 0.4 0.45 0.42 0.41 0.4 0.38 0.64 0.66 0.44 0.4 0.45 0.42 0.46 0.39 0.45 1.0 0.38 0.41 0.44 0.43 0.44 0.56 0.49 0.54
Bra002917 (TOP1)
 0.4 0.43 0.42 0.31 0.55 0.49 0.25 0.22 0.34 0.33 0.35 0.34 0.31 0.51 0.55 0.35 0.33 0.39 0.36 0.33 0.29 0.37 1.0 0.33 0.33 0.3 0.31 0.33 0.4 0.36 0.41
Bra003082 (SPMS)
 0.44 0.51 0.49 0.4 0.93 0.8 0.24 0.25 0.29 0.3 0.28 0.24 0.3 0.6 0.65 0.32 0.3 0.33 0.24 0.17 0.21 0.31 1.0 0.32 0.32 0.27 0.36 0.41 0.37 0.37 0.44
Bra005281 (CASPL4A3)
 0.27 0.34 0.35 0.21 0.45 0.43 0.16 0.14 0.27 0.26 0.21 0.18 0.17 0.35 0.42 0.29 0.28 0.5 0.33 0.17 0.18 0.25 1.0 0.23 0.21 0.23 0.21 0.22 0.27 0.29 0.18
0.15 0.22 0.33 0.18 0.36 0.33 0.15 0.14 0.17 0.16 0.2 0.18 0.2 0.37 0.36 0.22 0.16 0.42 0.22 0.17 0.19 0.19 1.0 0.23 0.21 0.24 0.18 0.22 0.25 0.26 0.13
Bra006645 (VPS24.1)
 0.56 0.59 0.43 0.46 0.72 0.7 0.42 0.39 0.5 0.5 0.46 0.49 0.45 0.57 0.68 0.53 0.45 0.53 0.44 0.44 0.47 0.48 1.0 0.47 0.5 0.4 0.45 0.5 0.43 0.44 0.41
0.53 0.45 0.4 0.39 0.61 0.65 0.33 0.34 0.41 0.34 0.4 0.37 0.41 0.64 0.68 0.47 0.4 0.5 0.42 0.4 0.39 0.41 1.0 0.45 0.47 0.39 0.38 0.48 0.48 0.42 0.53
0.19 0.24 0.21 0.13 0.55 0.62 0.12 0.08 0.17 0.09 0.07 0.1 0.07 0.48 0.45 0.18 0.11 0.22 0.16 0.11 0.05 0.15 1.0 0.12 0.1 0.08 0.1 0.17 0.18 0.19 0.08
Bra007804 (HPGT3)
 0.7 0.44 0.65 0.42 1.0 0.83 0.25 0.23 0.37 0.3 0.31 0.29 0.29 0.53 0.68 0.35 0.36 0.44 0.38 0.35 0.27 0.39 0.92 0.4 0.37 0.34 0.36 0.44 0.5 0.38 0.36
Bra008585 (TOL1)
 0.47 0.58 0.55 0.41 0.62 0.62 0.29 0.23 0.37 0.33 0.29 0.37 0.35 0.59 0.62 0.41 0.32 0.4 0.32 0.3 0.32 0.32 1.0 0.38 0.39 0.35 0.4 0.46 0.47 0.47 0.39
Bra010347 (AIM1)
 0.35 0.38 0.32 0.22 0.65 0.48 0.18 0.17 0.3 0.28 0.25 0.28 0.22 0.41 0.5 0.22 0.22 0.29 0.26 0.2 0.21 0.29 1.0 0.27 0.28 0.24 0.28 0.37 0.42 0.4 0.41
0.1 0.35 0.06 0.12 0.82 0.72 0.18 0.03 0.19 0.1 0.04 0.11 0.21 0.21 0.32 0.11 0.06 0.33 0.11 0.08 0.07 0.16 1.0 0.07 0.06 0.05 0.06 0.12 0.21 0.09 0.08
0.16 0.15 0.24 0.25 0.84 0.87 0.19 0.11 0.21 0.2 0.2 0.16 0.26 0.53 0.45 0.21 0.16 0.38 0.2 0.19 0.2 0.27 1.0 0.14 0.16 0.12 0.14 0.18 0.18 0.08 0.08
Bra020821 (RLK6)
 0.11 0.04 0.04 0.05 0.37 0.67 0.02 0.03 0.08 0.06 0.02 0.03 0.02 0.15 0.43 0.06 0.09 0.1 0.04 0.02 0.03 0.08 1.0 0.06 0.04 0.0 0.05 0.01 0.03 0.12 0.0
0.27 0.31 0.52 0.18 0.45 0.53 0.21 0.2 0.42 0.37 0.31 0.28 0.25 0.56 0.58 0.31 0.29 0.47 0.37 0.29 0.28 0.36 1.0 0.23 0.2 0.17 0.21 0.19 0.21 0.19 0.16
Bra024864 (NUDT17)
 0.23 0.31 0.38 0.18 0.43 0.55 0.35 0.26 0.33 0.26 0.3 0.28 0.26 0.19 0.35 0.29 0.25 0.16 0.3 0.31 0.28 0.4 1.0 0.34 0.36 0.12 0.34 0.19 0.27 0.23 0.23
Bra025366 (AIG2)
 0.12 0.17 0.16 0.12 0.41 0.4 0.08 0.05 0.2 0.17 0.13 0.13 0.11 0.51 0.48 0.17 0.13 0.31 0.21 0.18 0.12 0.21 1.0 0.2 0.15 0.12 0.16 0.14 0.25 0.26 0.16
Bra025547 (LHT1)
 0.03 0.06 0.12 0.02 0.5 0.54 0.02 0.02 0.04 0.07 0.01 0.03 0.02 0.07 0.18 0.08 0.06 0.09 0.05 0.05 0.03 0.07 1.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.05 0.04 0.09 0.02
Bra026041 (LOS5)
 0.48 0.49 0.4 0.34 0.67 0.63 0.3 0.33 0.38 0.27 0.33 0.36 0.23 0.6 0.69 0.41 0.33 0.46 0.47 0.34 0.36 0.38 1.0 0.38 0.37 0.29 0.32 0.49 0.47 0.41 0.47
Bra026116 (KMD2)
 0.01 0.17 0.22 0.04 0.27 0.23 0.01 0.01 0.01 0.08 0.05 0.06 0.1 0.17 0.32 0.09 0.06 0.09 0.08 0.11 0.04 0.1 1.0 0.04 0.03 0.01 0.04 0.01 0.05 0.08 0.01
Bra026642 (NUDT17)
 0.4 0.32 0.37 0.15 0.42 0.36 0.29 0.26 0.31 0.39 0.33 0.29 0.25 0.15 0.13 0.3 0.24 0.09 0.13 0.3 0.27 0.32 1.0 0.3 0.24 0.09 0.27 0.27 0.3 0.3 0.28
Bra026834 (PBL2)
 0.08 0.13 0.22 0.05 0.26 0.36 0.04 0.03 0.07 0.05 0.06 0.05 0.06 0.3 0.32 0.08 0.11 0.46 0.11 0.08 0.07 0.1 1.0 0.07 0.05 0.05 0.02 0.06 0.09 0.13 0.09
Bra027436 (BTL07)
 0.48 0.4 0.45 0.39 0.71 0.69 0.36 0.34 0.37 0.32 0.34 0.38 0.31 0.66 0.62 0.37 0.36 0.42 0.32 0.4 0.33 0.39 1.0 0.39 0.32 0.3 0.43 0.4 0.45 0.43 0.5
0.1 0.16 0.14 0.06 0.26 0.37 0.07 0.02 0.14 0.13 0.12 0.11 0.08 0.27 0.35 0.15 0.12 0.45 0.16 0.1 0.12 0.17 1.0 0.1 0.1 0.12 0.09 0.06 0.15 0.14 0.07
Bra028746 (DFB)
 0.08 0.12 0.08 0.06 0.68 0.76 0.13 0.07 0.26 0.11 0.1 0.12 0.13 0.64 0.48 0.13 0.12 0.4 0.14 0.15 0.13 0.12 1.0 0.14 0.12 0.1 0.1 0.26 0.28 0.07 0.09
Bra029939 (WSD6)
 0.17 0.16 0.17 0.18 0.58 0.95 0.35 0.22 0.34 0.32 0.32 0.24 0.23 0.49 0.65 0.4 0.33 0.2 0.26 0.31 0.3 0.34 1.0 0.43 0.38 0.27 0.35 0.38 0.43 0.28 0.24
0.33 0.36 0.42 0.24 0.65 0.74 0.23 0.19 0.38 0.28 0.33 0.32 0.24 0.76 0.79 0.34 0.31 0.59 0.41 0.29 0.28 0.39 1.0 0.28 0.25 0.23 0.22 0.35 0.39 0.25 0.21
Bra033467 (CAM9)
 0.15 0.26 0.27 0.15 0.42 0.56 0.18 0.14 0.27 0.24 0.22 0.23 0.15 0.53 0.55 0.28 0.26 0.41 0.29 0.21 0.23 0.28 1.0 0.24 0.22 0.22 0.2 0.17 0.23 0.25 0.16
Bra034264 (CV)
 0.1 0.07 0.09 0.04 0.81 1.0 0.11 0.04 0.51 0.2 0.07 0.12 0.02 0.72 0.48 0.03 0.05 0.2 0.22 0.18 0.05 0.22 0.95 0.06 0.06 0.05 0.03 0.12 0.14 0.07 0.08
0.34 0.42 0.38 0.23 0.48 0.51 0.37 0.31 0.35 0.34 0.36 0.36 0.31 0.58 0.57 0.42 0.34 0.4 0.38 0.37 0.34 0.4 1.0 0.35 0.35 0.29 0.35 0.33 0.42 0.34 0.36
Bra035211 (GPX6)
 0.29 0.28 0.31 0.24 0.57 0.49 0.27 0.24 0.34 0.25 0.28 0.29 0.24 0.38 0.42 0.21 0.21 0.23 0.22 0.21 0.21 0.26 1.0 0.23 0.2 0.16 0.2 0.32 0.29 0.23 0.19
0.52 0.44 0.35 0.37 0.76 0.62 0.41 0.35 0.4 0.41 0.35 0.42 0.43 0.47 0.54 0.39 0.4 0.32 0.35 0.34 0.38 0.42 1.0 0.43 0.38 0.34 0.4 0.45 0.4 0.38 0.31
Bra036321 (AtcathB3)
 0.38 0.37 0.31 0.26 0.54 0.53 0.33 0.24 0.47 0.36 0.33 0.42 0.3 0.58 0.61 0.28 0.26 0.47 0.44 0.3 0.28 0.41 1.0 0.33 0.32 0.24 0.32 0.36 0.44 0.42 0.54
0.38 0.33 0.37 0.25 0.73 0.62 0.18 0.13 0.24 0.21 0.22 0.23 0.2 0.44 0.51 0.3 0.24 0.35 0.32 0.26 0.24 0.21 1.0 0.35 0.34 0.24 0.27 0.39 0.38 0.31 0.33
Bra036745 (ISTL1)
 0.45 0.45 0.43 0.35 0.56 0.6 0.39 0.4 0.52 0.48 0.44 0.5 0.39 0.73 0.8 0.51 0.44 0.64 0.53 0.4 0.44 0.5 1.0 0.47 0.47 0.42 0.46 0.5 0.46 0.41 0.36
0.68 0.67 0.63 0.66 0.9 0.82 0.51 0.57 0.64 0.55 0.56 0.57 0.64 0.81 0.85 0.58 0.54 0.53 0.53 0.54 0.52 0.51 1.0 0.53 0.53 0.47 0.51 0.61 0.58 0.52 0.57
Bra037981 (FLL3)
 0.48 0.41 0.48 0.35 1.0 0.9 0.32 0.31 0.67 0.46 0.46 0.5 0.41 0.96 0.71 0.44 0.36 0.62 0.51 0.41 0.43 0.44 0.99 0.63 0.51 0.48 0.55 0.67 0.73 0.43 0.51
Bra038785 (CAT1)
 0.03 0.06 0.14 0.02 0.75 0.53 0.02 0.03 0.05 0.04 0.03 0.03 0.04 0.09 0.34 0.11 0.06 0.06 0.04 0.05 0.02 0.06 1.0 0.08 0.08 0.15 0.07 0.24 0.27 0.16 0.03
Bra039545 (UGT84A3)
 0.05 0.08 0.21 0.11 1.0 0.63 0.29 0.09 0.2 0.08 0.05 0.06 0.08 0.87 0.54 0.07 0.06 0.47 0.12 0.07 0.07 0.09 0.83 0.14 0.12 0.08 0.13 0.23 0.52 0.16 0.31
Bra039979 (MTP4)
 0.32 0.17 0.19 0.14 0.69 0.99 0.28 0.2 0.24 0.31 0.17 0.19 0.14 0.71 0.47 0.36 0.22 0.27 0.52 0.39 0.27 0.29 1.0 0.45 0.34 0.26 0.27 0.49 0.36 0.27 0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)