1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_107 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000558 (MAX1)
 0.07 0.04 0.04 0.04 0.39 0.52 0.09 0.09 0.12 0.1 0.08 0.07 0.17 1.0 0.64 0.16 0.12 0.2 0.25 0.12 0.08 0.12 0.14 0.17 0.12 0.16 0.11 0.15 0.17 0.09 0.14
0.1 0.15 0.11 0.12 0.55 0.52 0.2 0.19 0.3 0.23 0.3 0.22 0.23 1.0 0.9 0.25 0.3 0.57 0.46 0.24 0.27 0.25 0.22 0.23 0.23 0.18 0.28 0.27 0.33 0.19 0.16
Bra002048 (MPT1)
 0.04 0.05 0.03 0.04 0.32 0.48 0.16 0.1 0.1 0.11 0.16 0.16 0.04 1.0 0.46 0.15 0.06 0.24 0.17 0.08 0.13 0.19 0.25 0.29 0.31 0.31 0.33 0.4 0.48 0.1 0.23
0.22 0.23 0.22 0.24 0.8 0.74 0.3 0.23 0.41 0.38 0.3 0.29 0.3 1.0 0.99 0.54 0.33 0.41 0.47 0.41 0.43 0.37 0.35 0.38 0.37 0.44 0.26 0.36 0.42 0.3 0.36
0.03 0.06 0.03 0.05 0.52 0.23 0.09 0.28 0.14 0.08 0.15 0.12 0.2 1.0 0.42 0.22 0.19 0.08 0.16 0.21 0.21 0.21 0.05 0.1 0.06 0.09 0.09 0.11 0.07 0.03 0.04
Bra005005 (PROT1)
 0.34 0.21 0.19 0.27 0.65 0.8 0.4 0.32 0.49 0.38 0.42 0.39 0.39 1.0 0.85 0.61 0.44 0.26 0.38 0.44 0.43 0.43 0.36 0.32 0.3 0.16 0.28 0.37 0.39 0.27 0.3
0.19 0.2 0.3 0.23 0.49 0.64 0.38 0.32 0.37 0.38 0.46 0.31 0.3 1.0 0.99 0.42 0.4 0.34 0.46 0.5 0.44 0.41 0.38 0.46 0.4 0.3 0.34 0.35 0.42 0.27 0.22
Bra005762 (AtHMP43)
 0.06 0.12 0.22 0.54 0.11 0.15 0.09 0.06 0.06 0.05 0.05 0.06 0.09 1.0 0.61 0.12 0.05 0.15 0.07 0.06 0.03 0.06 0.33 0.05 0.08 0.12 0.05 0.06 0.05 0.05 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.34 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 1.0 0.7 0.03 0.04 0.23 0.05 0.03 0.01 0.02 0.2 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0
0.22 0.28 0.23 0.14 0.39 0.62 0.25 0.28 0.49 0.47 0.34 0.37 0.39 0.95 1.0 0.44 0.28 0.49 0.38 0.41 0.32 0.43 0.46 0.29 0.28 0.22 0.24 0.29 0.41 0.27 0.28
0.01 0.0 0.0 0.0 0.19 0.31 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.43 0.04 0.03 0.12 0.08 0.02 0.04 0.01 0.04 0.07 0.05 0.02 0.03 0.12 0.1 0.01 0.02
Bra009001 (CAF1i)
 0.37 0.43 0.42 0.33 0.7 0.67 0.37 0.37 0.51 0.42 0.46 0.39 0.42 1.0 0.81 0.47 0.43 0.46 0.53 0.53 0.42 0.46 0.44 0.46 0.44 0.32 0.42 0.4 0.47 0.33 0.37
Bra009200 (NF-YA10)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.42 0.44 0.04 0.03 0.13 0.06 0.04 0.02 0.03 1.0 0.62 0.12 0.09 0.07 0.17 0.09 0.08 0.05 0.02 0.04 0.04 0.04 0.02 0.08 0.09 0.01 0.01
0.23 0.22 0.3 0.21 0.55 0.74 0.49 0.36 0.51 0.44 0.46 0.4 0.34 1.0 0.95 0.52 0.43 0.36 0.48 0.63 0.64 0.56 0.3 0.53 0.55 0.29 0.46 0.44 0.45 0.31 0.29
Bra011408 (ROXY21)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.56 0.66 0.08 0.02 0.21 0.07 0.13 0.06 0.07 1.0 0.82 0.2 0.09 0.24 0.17 0.13 0.17 0.09 0.31 0.22 0.17 0.04 0.12 0.3 0.37 0.06 0.05
Bra011567 (A/N-InvB)
 0.03 0.01 0.01 0.01 0.16 0.16 0.02 0.01 0.07 0.03 0.04 0.06 0.12 1.0 0.37 0.09 0.02 0.14 0.08 0.07 0.04 0.04 0.15 0.04 0.06 0.04 0.06 0.04 0.06 0.03 0.09
Bra012725 (KINbeta2)
 0.33 0.38 0.38 0.33 0.82 0.84 0.43 0.37 0.55 0.57 0.59 0.57 0.61 0.98 1.0 0.61 0.56 0.54 0.6 0.55 0.52 0.57 0.44 0.6 0.61 0.36 0.56 0.48 0.52 0.5 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 1.0 0.33 0.04 0.03 0.1 0.11 0.04 0.04 0.01 0.1 0.03 0.11 0.05 0.01 0.09 0.0 0.01 0.09
0.15 0.08 0.12 0.2 0.62 0.49 0.26 0.3 0.44 0.25 0.36 0.26 0.48 1.0 0.76 0.31 0.32 0.19 0.31 0.21 0.26 0.24 0.1 0.27 0.27 0.29 0.28 0.38 0.43 0.19 0.2
0.18 0.17 0.22 0.12 0.54 0.51 0.11 0.06 0.3 0.29 0.43 0.2 0.12 1.0 0.8 0.38 0.24 0.27 0.38 0.43 0.39 0.21 0.2 0.22 0.16 0.14 0.2 0.25 0.2 0.15 0.13
0.36 0.38 0.29 0.23 0.77 0.81 0.4 0.37 0.49 0.42 0.42 0.41 0.38 1.0 0.94 0.55 0.46 0.37 0.47 0.51 0.51 0.48 0.41 0.33 0.33 0.2 0.33 0.37 0.41 0.31 0.28
Bra020568 (NRG1A)
 0.05 0.02 0.04 0.02 0.47 0.49 0.14 0.13 0.24 0.21 0.18 0.2 0.15 1.0 0.9 0.28 0.17 0.45 0.29 0.21 0.22 0.21 0.46 0.35 0.29 0.19 0.22 0.28 0.39 0.2 0.24
0.26 0.01 0.04 0.1 0.42 0.56 0.09 0.12 0.1 0.05 0.17 0.21 0.23 1.0 0.44 0.2 0.07 0.27 0.1 0.26 0.08 0.19 0.14 0.13 0.12 0.06 0.04 0.07 0.16 0.04 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.38 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.03 1.0 0.57 0.02 0.05 0.27 0.07 0.02 0.0 0.03 0.22 0.02 0.01 0.01 0.0 0.05 0.02 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.12 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.4 0.01 0.04 0.12 0.06 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0
Bra022654 (EAL)
 0.12 0.11 0.05 0.07 0.62 0.56 0.23 0.15 0.35 0.36 0.22 0.2 0.25 0.99 1.0 0.39 0.42 0.24 0.36 0.31 0.32 0.28 0.17 0.29 0.28 0.22 0.25 0.24 0.29 0.19 0.28
Bra023030 (PAM18-1)
 0.39 0.41 0.46 0.37 0.79 0.8 0.39 0.33 0.57 0.5 0.5 0.51 0.53 1.0 1.0 0.57 0.55 0.57 0.59 0.61 0.55 0.61 0.43 0.59 0.47 0.33 0.54 0.39 0.49 0.42 0.48
Bra025018 (SSP4)
 0.2 0.2 0.18 0.15 0.38 0.6 0.24 0.18 0.33 0.28 0.32 0.29 0.2 1.0 0.84 0.33 0.3 0.32 0.34 0.3 0.26 0.32 0.41 0.22 0.2 0.21 0.2 0.22 0.29 0.22 0.22
Bra025910 (BEE1)
 0.1 0.13 0.05 0.04 0.39 0.66 0.2 0.09 0.18 0.09 0.13 0.12 0.18 1.0 0.83 0.27 0.21 0.44 0.34 0.24 0.23 0.15 0.34 0.26 0.24 0.14 0.15 0.44 0.31 0.13 0.12
0.0 0.0 0.0 0.08 0.2 0.29 0.03 0.06 0.07 0.04 0.03 0.04 0.11 1.0 0.55 0.21 0.18 0.26 0.07 0.03 0.18 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
Bra026749 (NRB4)
 0.48 0.44 0.51 0.5 0.82 0.89 0.57 0.5 0.69 0.57 0.68 0.62 0.53 0.91 1.0 0.7 0.59 0.54 0.51 0.62 0.61 0.62 0.56 0.52 0.57 0.56 0.53 0.56 0.62 0.46 0.52
Bra028369 (MYB305)
 0.01 0.12 0.0 0.0 0.39 0.33 0.01 0.05 0.05 0.08 0.01 0.0 0.04 1.0 0.8 0.05 0.08 0.09 0.02 0.0 0.01 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.39 0.41 0.36 0.37 0.55 0.51 0.3 0.33 0.41 0.43 0.51 0.35 0.52 1.0 0.8 0.37 0.43 0.52 0.44 0.46 0.43 0.47 0.43 0.45 0.4 0.49 0.39 0.39 0.4 0.4 0.36
Bra031056 (BTSL2)
 0.08 0.16 0.15 0.06 0.27 0.41 0.1 0.09 0.25 0.15 0.13 0.18 0.18 1.0 0.6 0.15 0.18 0.22 0.2 0.22 0.19 0.21 0.22 0.2 0.17 0.17 0.24 0.17 0.27 0.19 0.27
Bra031473 (GEM1)
 0.36 0.35 0.53 0.31 0.89 0.71 0.28 0.36 0.58 0.48 0.56 0.53 0.43 1.0 0.96 0.55 0.53 0.59 0.63 0.63 0.54 0.53 0.32 0.54 0.46 0.4 0.43 0.46 0.56 0.47 0.43
0.06 0.03 0.02 0.01 0.24 0.22 0.06 0.02 0.06 0.08 0.09 0.07 0.05 1.0 0.4 0.08 0.1 0.17 0.13 0.1 0.06 0.08 0.28 0.11 0.08 0.05 0.04 0.16 0.12 0.14 0.08
0.43 0.37 0.48 0.35 0.93 0.71 0.24 0.2 0.49 0.38 0.49 0.37 0.32 1.0 0.85 0.46 0.39 0.55 0.43 0.45 0.38 0.38 0.3 0.35 0.36 0.26 0.34 0.37 0.45 0.35 0.36
Bra031663 (GolS3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.09 0.02 0.02 0.05 0.02 0.02 0.02 0.03 1.0 0.28 0.03 0.02 0.28 0.06 0.03 0.03 0.03 0.28 0.03 0.02 0.01 0.01 0.06 0.06 0.02 0.02
Bra032147 (SAW1)
 0.29 0.21 0.28 0.29 0.59 0.62 0.32 0.33 0.39 0.34 0.31 0.31 0.27 1.0 0.91 0.43 0.41 0.31 0.34 0.38 0.37 0.33 0.15 0.27 0.25 0.27 0.25 0.34 0.37 0.19 0.21
Bra032315 (COR413IM2)
 0.19 0.15 0.15 0.11 0.34 0.55 0.22 0.16 0.42 0.28 0.25 0.18 0.19 1.0 0.79 0.21 0.27 0.15 0.32 0.19 0.21 0.21 0.06 0.23 0.2 0.16 0.19 0.26 0.31 0.2 0.22
Bra034628 (ELK4)
 0.15 0.14 0.22 0.18 0.5 0.56 0.24 0.22 0.38 0.28 0.26 0.28 0.24 1.0 0.83 0.37 0.33 0.23 0.35 0.38 0.3 0.25 0.21 0.25 0.23 0.22 0.2 0.3 0.29 0.16 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.18 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.44 0.01 0.0 0.1 0.04 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01
0.42 0.43 0.53 0.4 0.63 0.7 0.4 0.46 0.58 0.48 0.57 0.5 0.42 1.0 0.85 0.6 0.57 0.45 0.51 0.57 0.48 0.57 0.46 0.45 0.55 0.48 0.52 0.48 0.51 0.42 0.44
Bra036650 (AEP2)
 0.02 0.06 0.05 0.04 0.2 0.16 0.07 0.03 0.1 0.1 0.09 0.09 0.1 1.0 0.4 0.11 0.12 0.56 0.05 0.11 0.05 0.11 0.81 0.12 0.14 0.1 0.06 0.11 0.14 0.1 0.09
Bra037028 (ROXY21)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.3 0.35 0.03 0.01 0.06 0.04 0.06 0.04 0.07 1.0 0.55 0.07 0.05 0.13 0.11 0.07 0.06 0.03 0.1 0.1 0.09 0.06 0.05 0.14 0.18 0.04 0.05
Bra037037 (GATA9)
 0.02 0.0 0.03 0.04 0.25 0.16 0.03 0.05 0.09 0.02 0.07 0.05 0.14 1.0 0.57 0.08 0.03 0.18 0.08 0.02 0.06 0.03 0.43 0.06 0.14 0.05 0.04 0.08 0.26 0.07 0.15
Bra037352 (ADF8)
 0.23 0.12 0.09 0.09 0.62 0.47 0.19 0.16 0.2 0.22 0.3 0.26 0.17 1.0 0.55 0.21 0.31 0.18 0.22 0.29 0.4 0.23 0.03 0.25 0.16 0.16 0.15 0.31 0.19 0.34 0.15
0.17 0.02 0.1 0.06 0.33 0.56 0.08 0.15 0.33 0.11 0.18 0.17 0.2 1.0 0.89 0.15 0.25 0.49 0.36 0.2 0.22 0.37 0.56 0.07 0.18 0.13 0.1 0.24 0.27 0.15 0.17
0.15 0.12 0.16 0.07 0.38 0.57 0.15 0.24 0.37 0.3 0.3 0.22 0.2 1.0 0.86 0.2 0.24 0.3 0.42 0.26 0.26 0.24 0.5 0.27 0.29 0.19 0.27 0.27 0.39 0.28 0.31
Bra039212 (BLH4)
 0.32 0.26 0.33 0.25 0.75 0.8 0.4 0.42 0.45 0.42 0.38 0.39 0.28 1.0 0.97 0.46 0.58 0.44 0.47 0.49 0.39 0.44 0.2 0.42 0.39 0.35 0.39 0.47 0.49 0.3 0.3
0.32 0.3 0.42 0.25 0.64 0.78 0.26 0.16 0.52 0.37 0.46 0.37 0.3 1.0 0.92 0.36 0.32 0.44 0.41 0.36 0.31 0.41 0.37 0.36 0.31 0.24 0.28 0.38 0.49 0.32 0.36
Bra040529 (UNE8)
 0.02 0.01 0.01 0.01 0.3 0.41 0.09 0.04 0.28 0.17 0.21 0.1 0.09 1.0 0.69 0.25 0.21 0.21 0.3 0.25 0.23 0.13 0.11 0.16 0.15 0.12 0.12 0.2 0.28 0.1 0.13
0.0 0.0 0.03 0.0 0.21 0.25 0.0 0.0 0.06 0.05 0.14 0.14 0.14 1.0 0.49 0.1 0.04 0.01 0.13 0.05 0.22 0.06 0.05 0.05 0.04 0.0 0.02 0.03 0.04 0.03 0.06
Bra040594 (DJ1D)
 0.52 0.44 0.38 0.39 0.53 0.7 0.48 0.46 0.52 0.46 0.45 0.41 0.44 0.94 1.0 0.57 0.52 0.43 0.55 0.44 0.48 0.46 0.3 0.52 0.49 0.51 0.49 0.47 0.56 0.41 0.55

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)