1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_215 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000119 (CCR2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.06 0.33 0.43 0.23 0.28 0.47 0.05 0.13 0.53 0.27 0.73 0.09 0.34 0.09 0.07 1.0 0.0 0.11 0.48 0.09 0.06 0.0 0.05 0.14
0.34 0.28 0.36 0.34 0.65 0.7 0.46 0.65 0.46 0.49 0.49 0.51 1.0 0.72 0.6 0.7 0.52 0.87 0.6 0.5 0.52 0.43 0.73 0.63 0.66 0.64 0.6 0.47 0.5 0.57 0.78
Bra003135 (LOG4)
 0.05 0.06 0.06 0.05 0.31 0.19 0.1 0.06 0.07 0.1 0.04 0.08 0.46 0.47 0.72 0.14 0.04 1.0 0.1 0.04 0.02 0.01 0.16 0.08 0.07 0.05 0.05 0.13 0.05 0.02 0.04
Bra003606 (GAPCP-1)
 0.18 0.12 0.13 0.06 0.26 0.32 0.14 0.13 0.35 0.38 0.42 0.22 1.0 0.32 0.58 0.49 0.35 0.85 0.51 0.21 0.43 0.25 0.74 0.37 0.27 0.3 0.2 0.34 0.17 0.24 0.32
0.04 0.01 0.07 0.01 0.32 0.09 0.17 0.13 0.23 0.35 0.31 0.25 0.61 0.41 0.32 0.61 0.31 1.0 0.34 0.49 0.32 0.19 0.33 0.19 0.19 0.09 0.15 0.16 0.1 0.07 0.09
0.03 0.05 0.07 0.04 0.15 0.13 0.07 0.14 0.44 0.29 0.34 0.41 0.94 0.39 0.48 0.28 0.17 1.0 0.55 0.3 0.3 0.22 0.59 0.33 0.23 0.23 0.16 0.14 0.14 0.18 0.1
Bra004623 (ATS3A)
 0.16 0.16 0.22 0.14 0.38 0.26 0.42 0.44 0.43 0.39 0.45 0.35 0.59 0.44 0.4 0.66 0.61 1.0 0.44 0.42 0.39 0.42 0.39 0.37 0.37 0.36 0.36 0.26 0.26 0.19 0.3
Bra004857 (ROP8)
 0.09 0.22 0.35 0.25 0.44 0.33 0.35 0.35 0.51 0.6 0.52 0.43 1.0 0.39 0.44 0.57 0.59 1.0 0.29 0.42 0.29 0.4 1.0 0.44 0.47 0.35 0.34 0.44 0.38 0.3 0.42
0.13 0.1 0.11 0.09 0.43 0.23 0.17 0.18 0.2 0.25 0.19 0.18 0.42 0.55 0.54 0.33 0.25 1.0 0.26 0.18 0.18 0.15 0.44 0.33 0.34 0.34 0.31 0.42 0.43 0.34 0.31
0.1 0.14 0.12 0.04 0.37 0.35 0.22 0.23 0.35 0.46 0.38 0.26 0.71 0.68 0.57 0.66 0.2 1.0 0.44 0.3 0.44 0.35 0.51 0.43 0.63 0.43 0.38 0.42 0.39 0.63 0.75
Bra007448 (CR4)
 0.3 0.26 0.39 0.46 0.68 0.62 0.47 0.54 0.66 0.59 0.52 0.51 0.6 0.88 0.9 0.76 0.64 1.0 0.64 0.57 0.5 0.53 0.33 0.63 0.56 0.59 0.59 0.62 0.7 0.6 0.66
0.08 0.0 0.02 0.0 0.15 0.07 0.33 0.06 0.28 0.24 0.36 0.17 1.0 0.24 0.26 0.53 0.23 0.77 0.27 0.37 0.23 0.25 0.39 0.12 0.12 0.14 0.13 0.07 0.07 0.11 0.12
Bra008105 (PIN1)
 0.24 0.2 0.33 0.17 0.43 0.25 0.22 0.26 0.31 0.19 0.23 0.24 1.0 0.4 0.51 0.38 0.21 0.81 0.3 0.23 0.23 0.22 0.51 0.33 0.31 0.28 0.26 0.3 0.29 0.18 0.21
0.05 0.03 0.05 0.07 0.33 0.25 0.31 0.31 0.26 0.33 0.34 0.31 0.95 0.63 0.7 0.66 0.54 1.0 0.54 0.44 0.28 0.26 0.5 0.65 0.61 0.67 0.49 0.28 0.23 0.26 0.63
Bra009091 (RUL1)
 0.22 0.1 0.26 0.11 0.5 0.43 0.27 0.27 0.42 0.34 0.32 0.21 0.7 0.61 0.58 0.48 0.33 1.0 0.4 0.32 0.3 0.26 0.56 0.47 0.49 0.36 0.36 0.38 0.42 0.37 0.46
0.39 0.37 0.62 0.41 0.68 0.53 0.38 0.41 0.46 0.4 0.4 0.35 0.89 0.91 0.94 0.62 0.49 1.0 0.66 0.47 0.45 0.31 0.84 0.51 0.57 0.53 0.48 0.56 0.49 0.51 0.66
Bra009994 (GT2L)
 0.14 0.09 0.15 0.13 0.29 0.11 0.11 0.16 0.21 0.22 0.2 0.22 0.3 0.35 0.33 0.21 0.19 1.0 0.2 0.22 0.14 0.17 0.43 0.16 0.17 0.36 0.18 0.27 0.24 0.32 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.16 0.12 0.31 0.03 0.02 0.11 0.11 0.3 0.48 0.6 0.28 0.12 0.25 1.0 0.09 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03
Bra012143 (IRX15-L)
 0.09 0.04 0.08 0.07 0.45 0.24 0.3 0.1 0.31 0.27 0.18 0.25 0.62 0.45 0.43 0.4 0.41 1.0 0.31 0.26 0.18 0.12 0.39 0.19 0.19 0.18 0.14 0.23 0.18 0.07 0.08
Bra012952 (TDR)
 0.25 0.15 0.2 0.26 0.44 0.29 0.44 0.51 0.4 0.5 0.44 0.39 1.0 0.62 0.6 0.68 0.56 0.99 0.47 0.44 0.32 0.35 0.31 0.41 0.51 0.48 0.41 0.38 0.41 0.42 0.65
Bra015983 (PIN1)
 0.14 0.09 0.12 0.13 0.38 0.31 0.15 0.22 0.28 0.15 0.2 0.13 0.67 0.45 0.61 0.24 0.23 1.0 0.3 0.2 0.16 0.13 0.46 0.3 0.31 0.19 0.22 0.36 0.28 0.19 0.22
0.15 0.06 0.16 0.14 0.48 0.49 0.16 0.15 0.23 0.16 0.2 0.15 0.49 0.61 0.43 0.31 0.16 1.0 0.4 0.23 0.12 0.23 0.48 0.25 0.24 0.18 0.21 0.19 0.27 0.22 0.34
Bra016492 (MP)
 0.2 0.06 0.15 0.09 0.38 0.24 0.25 0.23 0.35 0.32 0.28 0.3 0.82 0.47 0.69 0.53 0.4 1.0 0.46 0.42 0.34 0.33 0.54 0.38 0.38 0.34 0.31 0.38 0.4 0.36 0.57
Bra017220 (XTH32)
 0.01 0.01 0.03 0.0 0.32 0.13 0.1 0.11 0.16 0.24 0.14 0.13 0.7 0.32 0.26 0.29 0.35 1.0 0.17 0.11 0.15 0.05 0.36 0.15 0.19 0.07 0.09 0.15 0.05 0.04 0.07
Bra018259 (PARP1)
 0.3 0.32 0.33 0.24 0.44 0.4 0.29 0.4 0.26 0.33 0.32 0.29 0.59 0.36 0.49 0.38 0.35 1.0 0.41 0.34 0.25 0.32 0.57 0.23 0.23 0.23 0.18 0.26 0.26 0.22 0.29
Bra018920 (MSR2)
 0.14 0.22 0.18 0.29 0.43 0.23 0.38 0.53 0.38 0.44 0.4 0.32 0.73 0.4 0.35 0.65 0.56 1.0 0.37 0.51 0.42 0.39 0.4 0.31 0.35 0.3 0.29 0.33 0.24 0.25 0.4
Bra019395 (EBS)
 0.36 0.48 0.48 0.37 0.6 0.56 0.5 0.5 0.35 0.51 0.42 0.44 0.91 0.73 0.63 0.65 0.48 1.0 0.54 0.52 0.55 0.55 0.93 0.67 0.65 0.55 0.64 0.51 0.55 0.61 0.73
0.06 0.04 0.08 0.05 0.38 0.11 0.29 0.32 0.35 0.47 0.39 0.32 1.0 0.39 0.35 0.58 0.5 0.74 0.42 0.45 0.27 0.22 0.43 0.27 0.35 0.34 0.14 0.17 0.17 0.2 0.22
Bra020212 (CSLA2)
 0.17 0.13 0.23 0.13 0.42 0.26 0.38 0.43 0.38 0.41 0.44 0.33 0.8 0.53 0.63 0.63 0.45 1.0 0.42 0.43 0.43 0.39 0.48 0.32 0.49 0.42 0.34 0.39 0.3 0.38 0.6
0.09 0.06 0.13 0.13 0.33 0.09 0.45 0.55 0.39 0.49 0.64 0.42 0.9 0.51 0.45 0.64 0.6 1.0 0.6 0.53 0.56 0.26 0.32 0.34 0.57 0.25 0.26 0.53 0.38 0.21 0.16
0.1 0.02 0.08 0.16 0.15 0.14 0.59 0.32 0.09 0.15 0.13 0.09 0.83 0.41 0.34 0.38 0.28 1.0 0.28 0.28 0.21 0.17 0.31 0.18 0.17 0.06 0.08 0.15 0.06 0.07 0.06
Bra020581 (HTA7)
 0.16 0.13 0.2 0.09 0.48 0.35 0.18 0.21 0.37 0.29 0.27 0.36 0.7 0.47 0.5 0.24 0.3 1.0 0.41 0.29 0.29 0.32 0.48 0.24 0.2 0.16 0.18 0.28 0.27 0.29 0.22
0.01 0.04 0.08 0.0 0.32 0.05 0.04 0.09 0.11 0.13 0.08 0.15 0.46 0.33 0.22 0.17 0.16 1.0 0.15 0.04 0.01 0.06 0.4 0.08 0.14 0.05 0.09 0.09 0.08 0.19 0.27
0.07 0.04 0.11 0.02 0.14 0.1 0.22 0.16 0.53 0.71 0.91 0.57 0.85 0.41 0.12 0.64 0.47 0.93 0.38 0.32 0.46 0.25 1.0 0.3 0.37 0.47 0.34 0.32 0.22 0.28 0.21
0.08 0.11 0.09 0.08 0.34 0.24 0.3 0.23 0.34 0.52 0.4 0.43 1.0 0.76 0.54 0.62 0.48 0.95 0.46 0.35 0.31 0.34 0.47 0.33 0.45 0.5 0.31 0.24 0.22 0.25 0.32
Bra021433 (LBD41)
 0.12 0.15 0.1 0.15 0.05 0.12 0.13 0.11 0.21 0.46 0.25 0.21 0.43 0.21 0.31 0.23 0.47 0.76 0.33 0.39 0.23 0.24 1.0 0.14 0.21 0.38 0.18 0.07 0.07 0.2 0.11
Bra021473 (RGP1)
 0.22 0.18 0.16 0.26 0.38 0.29 0.37 0.62 0.24 0.39 0.33 0.28 1.0 0.35 0.28 0.46 0.58 1.0 0.29 0.42 0.38 0.38 0.7 0.23 0.27 0.23 0.25 0.18 0.16 0.13 0.23
Bra022803 (C4H)
 0.03 0.06 0.05 0.06 0.09 0.25 0.48 0.39 0.2 0.27 0.22 0.23 0.67 0.56 0.47 0.56 0.53 1.0 0.32 0.21 0.25 0.2 0.47 0.38 0.35 0.26 0.29 0.39 0.27 0.15 0.26
Bra023348 (EMB3135)
 0.42 0.34 0.63 0.45 0.59 0.36 0.45 0.51 0.53 0.59 0.61 0.49 0.97 0.91 0.89 0.67 0.57 1.0 0.54 0.69 0.6 0.45 0.66 0.66 0.69 0.5 0.58 0.58 0.57 0.58 0.51
Bra023402 (CRN)
 0.27 0.19 0.23 0.11 0.25 0.21 0.15 0.12 0.15 0.14 0.1 0.13 0.57 0.44 0.5 0.19 0.26 1.0 0.19 0.13 0.11 0.11 0.35 0.12 0.1 0.15 0.13 0.11 0.19 0.18 0.16
Bra024204 (RSA1)
 0.01 0.0 0.01 0.0 0.49 0.14 0.08 0.04 0.1 0.09 0.11 0.05 0.42 0.37 0.23 0.17 0.14 1.0 0.19 0.12 0.06 0.06 0.36 0.18 0.18 0.12 0.12 0.26 0.29 0.12 0.3
Bra024897 (ZAR1)
 0.12 0.1 0.15 0.07 0.41 0.2 0.15 0.14 0.2 0.13 0.14 0.14 0.74 0.49 0.37 0.31 0.27 1.0 0.26 0.18 0.16 0.17 0.34 0.16 0.16 0.19 0.15 0.13 0.17 0.17 0.29
Bra025145 (NIK2)
 0.14 0.06 0.09 0.13 0.33 0.22 0.16 0.16 0.27 0.18 0.25 0.22 0.7 0.47 0.43 0.29 0.24 1.0 0.33 0.24 0.19 0.18 0.62 0.24 0.34 0.24 0.18 0.21 0.26 0.24 0.26
0.13 0.13 0.17 0.19 0.29 0.12 0.22 0.31 0.29 0.41 0.36 0.37 0.77 0.67 0.59 0.57 0.48 1.0 0.39 0.42 0.38 0.34 0.4 0.58 0.65 0.67 0.62 0.46 0.59 0.51 0.68
Bra025775 (MP)
 0.12 0.02 0.12 0.05 0.27 0.38 0.12 0.14 0.22 0.26 0.2 0.08 0.71 0.54 0.54 0.28 0.12 1.0 0.3 0.17 0.14 0.15 0.78 0.39 0.35 0.33 0.33 0.25 0.32 0.38 0.74
0.12 0.18 0.25 0.22 0.35 0.3 0.41 0.51 0.29 0.24 0.23 0.28 1.0 0.41 0.41 0.55 0.43 0.69 0.31 0.32 0.4 0.5 0.4 0.14 0.22 0.16 0.19 0.08 0.16 0.13 0.16
0.46 0.51 0.54 0.46 0.58 0.54 0.49 0.63 0.61 0.74 0.67 0.62 0.83 0.85 0.79 0.75 0.72 1.0 0.66 0.53 0.59 0.62 0.59 0.71 0.75 0.75 0.8 0.73 0.66 0.66 0.88
Bra027460 (CC2)
 0.01 0.0 0.01 0.01 0.09 0.06 0.04 0.03 0.3 0.45 0.4 0.36 0.81 0.39 0.4 0.44 0.41 1.0 0.46 0.24 0.41 0.23 0.63 0.19 0.26 0.27 0.19 0.11 0.07 0.05 0.03
Bra028002 (NPF4.4)
 0.17 0.04 0.1 0.04 0.25 0.2 0.21 0.31 0.18 0.1 0.17 0.17 0.85 0.3 0.28 0.31 0.17 1.0 0.22 0.09 0.31 0.12 0.3 0.24 0.18 0.16 0.12 0.11 0.07 0.09 0.16
Bra028916 (PXC2)
 0.21 0.21 0.28 0.2 0.47 0.3 0.4 0.52 0.42 0.42 0.39 0.28 1.0 0.59 0.69 0.69 0.69 0.8 0.54 0.55 0.35 0.37 0.31 0.53 0.52 0.49 0.44 0.38 0.37 0.39 0.55
Bra031068 (NPF5.1)
 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.02 0.05 0.0 0.11 0.33 0.45 0.1 0.53 0.56 0.29 0.6 0.26 0.64 0.17 0.15 0.19 0.26 1.0 0.05 0.12 0.24 0.14 0.0 0.03 0.1 0.03
0.04 0.04 0.09 0.09 0.13 0.13 0.23 0.2 0.07 0.14 0.09 0.05 0.68 0.4 0.21 0.43 0.27 1.0 0.13 0.16 0.14 0.14 0.46 0.09 0.06 0.13 0.07 0.13 0.08 0.05 0.14
0.26 0.24 0.32 0.15 0.3 0.3 0.33 0.39 0.3 0.36 0.39 0.43 0.69 0.41 0.46 0.45 0.41 1.0 0.41 0.43 0.39 0.34 0.51 0.27 0.25 0.26 0.22 0.23 0.19 0.22 0.33
0.02 0.03 0.03 0.03 0.19 0.06 0.13 0.25 0.41 0.52 0.29 0.32 0.71 0.24 0.11 0.54 0.4 1.0 0.37 0.39 0.3 0.24 0.51 0.24 0.29 0.29 0.18 0.29 0.16 0.16 0.22
0.19 0.16 0.2 0.14 0.26 0.25 0.25 0.25 0.36 0.3 0.36 0.31 0.58 0.4 0.4 0.6 0.45 1.0 0.41 0.25 0.28 0.27 0.4 0.37 0.37 0.4 0.3 0.33 0.31 0.33 0.36
Bra034170 (GGL17)
 0.09 0.06 0.07 0.08 0.28 0.19 0.41 0.24 0.23 0.22 0.37 0.19 0.57 0.49 0.29 0.43 0.4 1.0 0.23 0.28 0.22 0.18 0.29 0.3 0.26 0.24 0.2 0.2 0.3 0.15 0.23
0.4 0.32 0.32 0.23 0.46 0.34 0.49 0.42 0.53 0.65 0.61 0.5 1.0 0.6 0.87 0.75 0.47 0.96 0.48 0.44 0.49 0.53 0.6 0.64 0.66 0.54 0.66 0.59 0.55 0.57 0.69
0.22 0.11 0.17 0.15 0.6 0.38 0.37 0.47 0.48 0.56 0.58 0.44 0.8 0.83 0.83 0.61 0.54 1.0 0.57 0.47 0.47 0.46 0.5 0.59 0.64 0.63 0.65 0.51 0.5 0.54 0.88
Bra036191 (ODB2)
 0.13 0.2 0.22 0.28 0.24 0.15 0.57 0.8 0.29 0.39 0.32 0.27 1.0 0.46 0.34 0.55 0.51 0.93 0.32 0.4 0.3 0.51 0.25 0.23 0.21 0.24 0.22 0.19 0.1 0.17 0.14
Bra036493 (MAN2)
 0.28 0.21 0.22 0.22 0.46 0.35 0.31 0.26 0.29 0.32 0.24 0.28 0.4 0.43 0.57 0.56 0.35 1.0 0.47 0.39 0.28 0.31 0.57 0.44 0.5 0.43 0.41 0.45 0.42 0.41 0.51
Bra036562 (LOG8)
 0.02 0.02 0.04 0.06 0.08 0.09 0.09 0.17 0.36 0.45 0.46 0.33 1.0 0.15 0.3 0.38 0.21 0.62 0.29 0.39 0.4 0.19 0.55 0.24 0.38 0.31 0.28 0.16 0.12 0.1 0.07
Bra036728 (SLP3)
 0.18 0.08 0.13 0.09 0.47 0.22 0.19 0.27 0.35 0.32 0.33 0.35 0.56 0.4 0.46 0.45 0.36 1.0 0.49 0.35 0.3 0.31 0.39 0.38 0.4 0.33 0.37 0.45 0.41 0.31 0.36
Bra037938 (LOTR1)
 0.29 0.11 0.15 0.12 0.62 0.44 0.31 0.4 0.47 0.45 0.44 0.4 0.59 0.75 0.82 0.62 0.49 1.0 0.65 0.49 0.42 0.4 0.24 0.55 0.58 0.47 0.46 0.5 0.57 0.47 0.59
0.08 0.07 0.16 0.08 0.24 0.1 0.15 0.33 0.46 0.43 0.38 0.34 0.97 0.51 0.35 0.44 0.28 1.0 0.34 0.32 0.36 0.19 0.93 0.3 0.37 0.32 0.25 0.23 0.09 0.21 0.19
Bra038405 (GLCNA.UT1)
 0.15 0.1 0.15 0.07 0.37 0.27 0.44 0.36 0.41 0.53 0.71 0.46 0.77 0.58 0.42 0.77 0.7 1.0 0.57 0.33 0.34 0.24 0.44 0.39 0.55 0.47 0.39 0.33 0.28 0.13 0.31
0.09 0.02 0.13 0.04 0.07 0.1 0.16 0.07 0.2 0.2 0.23 0.2 1.0 0.45 0.51 0.29 0.29 0.85 0.24 0.15 0.21 0.3 0.42 0.33 0.38 0.2 0.16 0.17 0.19 0.17 0.25
0.12 0.14 0.14 0.1 0.46 0.31 0.5 0.5 0.5 0.72 0.47 0.48 1.0 0.6 0.63 0.73 0.65 0.83 0.5 0.47 0.41 0.4 0.33 0.55 0.55 0.52 0.44 0.47 0.36 0.39 0.58

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)