1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_56 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.87 0.96 0.53 0.12 1.0 0.13 0.0 0.09 0.0 0.11 0.0 0.06 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09 0.04 0.0 0.03 0.11 0.04 0.04 0.07 0.32 0.04 0.28 0.04 0.12
Bra001568 (LIK1)
 0.3 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.24
Bra003156 (ACT3)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 1.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.31 0.0 0.26 0.24 0.0 0.14 0.49 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.12 0.0 0.0 0.13 0.16 0.0 0.14 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68
0.0 0.33 1.0 0.36 0.16 0.44 0.34 0.42 0.22 0.39 0.44 0.08 0.33 0.39 0.17 0.15 0.26 0.48 0.0 0.08 0.11 0.0 0.54 0.16 0.04 0.04 0.28 0.34 0.04 0.22 0.0
0.0 0.3 0.93 0.0 0.36 0.06 0.05 0.16 0.0 0.23 0.0 0.19 0.3 1.0 0.0 0.07 0.29 0.0 0.12 0.14 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra006910 (LTA3)
 0.07 0.86 0.84 0.73 0.08 1.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.03 0.01 0.09 0.03 0.01 0.0 0.06 0.06 0.04 0.02 0.01 0.08 0.07 0.08 0.3 0.09 0.14 0.1 0.1 0.06
Bra006936 (SYT3)
 0.0 0.88 0.82 0.21 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra006971 (UGT73D1)
 0.09 0.84 1.0 0.24 0.96 0.14 0.0 0.0 0.01 0.38 0.08 0.13 0.07 0.09 0.12 0.01 0.07 0.01 0.01 0.06 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.06 0.07 0.03
0.18 0.35 0.63 0.86 0.17 0.08 0.11 0.21 0.15 0.12 0.14 0.25 1.0 0.37 0.18 0.07 0.21 0.1 0.01 0.11 0.07 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.08 0.07
Bra008173 (FAB1)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.22 0.73 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.22 0.24 0.0 0.0 0.23 0.0
Bra010650 (AtDOB4)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.17 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra010872 (PG45)
 0.68 0.14 1.0 0.22 0.77 0.26 0.22 0.62 0.23 0.0 0.32 0.0 0.33 0.61 0.71 0.7 0.15 0.31 0.24 0.0 0.41 0.06 0.0 0.83 0.13 0.07 0.33 0.48 0.38 0.12 0.34
Bra010962 (KR)
 0.73 0.53 0.99 1.0 0.45 0.3 0.23 0.27 0.14 0.21 0.05 0.22 0.17 0.0 0.06 0.18 0.11 0.16 0.14 0.05 0.3 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra011065 (TIE1)
 0.0 0.41 1.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.2 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra014444 (AHL11)
 0.47 0.78 1.0 0.51 0.61 0.27 0.07 0.23 0.22 0.31 0.34 0.19 0.46 0.77 0.27 0.26 0.33 0.51 0.09 0.16 0.19 0.2 0.36 0.41 0.44 0.72 0.45 0.52 0.72 0.43 0.31
0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.41 0.85 0.39 0.27 0.52 0.41 0.16 0.61 0.7 0.37 0.15 0.47 0.28 0.3 0.57 0.38 0.46 0.21 0.05 0.11 0.19 0.74 0.14 0.19 0.2 0.23 0.27 0.63 1.0 0.28
Bra015751 (ATL8)
 0.5 0.39 0.72 0.59 0.37 0.06 0.3 0.29 0.36 0.38 0.34 0.35 1.0 0.13 0.17 0.37 0.44 0.67 0.17 0.23 0.13 0.19 0.33 0.02 0.13 0.23 0.33 0.09 0.15 0.41 0.56
Bra016000 (scpl5)
 0.15 0.04 1.0 0.12 0.45 0.06 0.0 0.06 0.09 0.06 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.03 0.7 0.14 0.03 0.09 0.24 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.07 0.03 0.07
0.33 0.46 1.0 0.53 0.3 0.21 0.16 0.16 0.41 0.35 0.36 0.3 0.14 0.04 0.06 0.19 0.19 0.01 0.32 0.29 0.13 0.27 0.16 0.04 0.14 0.22 0.12 0.12 0.19 0.1 0.08
Bra016403 (GONST5)
 0.0 0.0 0.99 0.2 0.63 0.69 0.0 0.09 0.0 0.0 0.09 0.64 0.0 0.11 0.24 0.36 0.43 0.24 0.28 0.74 0.1 0.0 1.0 0.55 0.0 0.0 0.1 0.12 0.34 0.32 0.33
Bra016428 (WAK1)
 0.2 0.04 1.0 0.04 0.2 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.02 0.0
Bra017260 (CASP1)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra017969 (DIN11)
 0.07 0.19 1.0 0.38 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.01 0.01 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.06 0.09
Bra019056 (NZZ)
 0.39 0.28 1.0 0.8 0.37 0.14 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17
0.0 0.72 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.41
Bra019443 (TEK)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra019871 (FBS1)
 0.55 0.22 0.76 0.34 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.19 0.2 1.0 0.0 0.11 0.11 0.1 0.2 0.0 0.2 0.0 0.0 0.28 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.19 0.2
Bra020376 (MES18)
 0.7 0.34 1.0 0.7 0.4 0.15 0.5 0.14 0.06 0.29 0.21 0.25 0.17 0.07 0.08 0.13 0.13 0.8 0.19 0.1 0.11 0.14 0.05 0.27 0.24 0.27 0.33 0.39 0.6 0.99 0.91
Bra020432 (XTR6)
 0.51 0.53 0.93 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 1.0 0.79 0.56 0.27 0.99 0.01 0.01 0.07 0.14 0.11 0.01 0.0 0.05 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.08 0.04 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
0.4 0.0 0.59 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.21 0.25 0.18 0.2 0.14 0.13 0.29 0.32
Bra024083 (CNGC17)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.54 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra024464 (OFP7)
 0.32 0.11 0.72 0.08 0.48 0.09 0.37 0.0 0.47 0.0 0.43 0.82 1.0 0.0 0.12 0.34 0.56 0.74 0.2 0.65 0.0 0.19 0.72 0.39 0.11 0.0 0.0 0.5 0.49 0.48 0.47
0.53 0.51 1.0 0.42 0.05 0.18 0.12 0.27 0.18 0.1 0.13 0.21 0.6 0.17 0.11 0.07 0.08 0.06 0.0 0.04 0.04 0.09 0.54 0.05 0.01 0.02 0.07 0.03 0.12 0.06 0.09
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0
0.57 0.05 1.0 0.13 0.57 0.19 0.31 0.13 0.0 0.0 0.16 0.2 0.1 0.43 0.05 0.05 0.13 0.25 0.0 0.14 0.05 0.0 0.0 0.04 0.04 0.2 0.0 0.04 0.0 0.0 0.08
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra028242 (RECQSIM)
 0.0 0.32 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra028620 (HEC3)
 0.0 0.41 0.92 1.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.15 0.17 0.0 0.21 0.19 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra029874 (CEV1)
 0.01 0.45 1.0 0.11 0.34 0.07 0.01 0.0 0.08 0.0 0.01 0.04 0.01 0.1 0.04 0.02 0.02 0.06 0.03 0.02 0.04 0.0 0.75 0.34 0.34 0.03 0.09 0.42 0.18 0.13 0.12
Bra030078 (PUP3)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.38 0.0 0.41 0.0 0.0 0.22 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra030979 (MINI3)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra031052 (IQD30)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra031110 (TIE2)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 1.0 0.56 0.9 0.32 0.89 0.18 0.05 0.07 0.3 0.29 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra032767 (AGL84)
 0.08 0.24 1.0 0.0 0.75 0.0 0.03 0.03 0.1 0.12 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.07 0.04 0.12 0.27 0.0 0.42 0.03 0.54 0.09 0.69 0.2 0.34 0.41 0.58 0.69 0.25
Bra034655 (DEG4)
 0.0 0.29 1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.15 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44
0.34 0.34 1.0 0.27 0.37 0.24 0.0 0.0 0.66 0.39 0.0 0.13 0.32 0.0 0.0 0.14 0.13 0.36 0.17 0.0 0.13 0.12 0.74 0.0 0.12 0.0 0.28 0.13 0.79 0.88 0.5
Bra036400 (WRKY12)
 0.0 0.0 0.99 0.0 0.31 0.48 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.19
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra038954 (CDR1)
 0.0 0.0 1.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.18 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 1.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)