1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_267 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.24 0.2 0.28 0.22 0.49 0.55 0.24 0.26 0.34 0.35 0.28 0.23 0.3 0.83 0.66 0.48 0.39 1.0 0.27 0.36 0.29 0.32 0.33 0.17 0.15 0.18 0.17 0.18 0.19 0.43 0.63
Bra001781 (PUM5)
 0.03 0.02 0.03 0.01 0.27 0.25 0.06 0.02 0.16 0.04 0.06 0.05 0.09 1.0 0.87 0.13 0.05 0.53 0.21 0.1 0.05 0.06 0.58 0.26 0.24 0.1 0.16 0.29 0.51 0.27 0.21
Bra001886 (ELIP)
 0.02 0.01 0.0 0.02 0.18 0.5 0.44 0.23 0.07 0.03 0.05 0.04 0.18 1.0 0.91 0.22 0.15 0.91 0.18 0.18 0.07 0.09 0.37 0.13 0.09 0.06 0.06 0.14 0.08 0.03 0.03
Bra001972 (CCR2)
 0.02 0.02 0.04 0.02 0.3 0.45 0.27 0.19 0.39 0.19 0.18 0.21 0.23 0.87 1.0 0.26 0.23 0.88 0.44 0.28 0.17 0.29 0.16 0.12 0.13 0.05 0.11 0.18 0.25 0.14 0.17
0.47 0.43 0.43 0.41 0.74 0.63 0.43 0.55 0.45 0.44 0.41 0.44 0.6 0.89 0.83 0.6 0.57 1.0 0.48 0.55 0.47 0.5 0.55 0.51 0.48 0.48 0.45 0.45 0.55 0.48 0.55
Bra003318 (PDCB5)
 0.21 0.15 0.09 0.12 0.37 0.37 0.19 0.32 0.44 0.33 0.33 0.31 0.51 0.84 1.0 0.42 0.32 0.64 0.37 0.39 0.32 0.33 0.48 0.25 0.26 0.15 0.28 0.21 0.26 0.19 0.24
Bra003450 (BRH1)
 0.16 0.3 0.12 0.08 0.38 0.31 0.05 0.03 0.13 0.09 0.09 0.06 0.22 1.0 0.96 0.17 0.18 0.54 0.29 0.15 0.19 0.11 0.23 0.13 0.15 0.1 0.18 0.14 0.11 0.09 0.11
Bra004993 (CLC2)
 0.32 0.37 0.28 0.16 0.54 0.58 0.27 0.23 0.44 0.31 0.42 0.27 0.26 0.92 1.0 0.41 0.36 0.66 0.61 0.38 0.42 0.38 0.52 0.46 0.46 0.4 0.4 0.53 0.69 0.42 0.45
Bra005603 (ELMO1)
 0.36 0.4 0.39 0.44 0.78 0.63 0.46 0.52 0.55 0.56 0.56 0.48 0.56 0.97 0.92 0.63 0.54 1.0 0.64 0.56 0.61 0.61 0.59 0.46 0.51 0.46 0.45 0.4 0.38 0.34 0.32
Bra005775 (MDAR2)
 0.13 0.09 0.1 0.08 0.5 0.44 0.15 0.12 0.36 0.2 0.22 0.24 0.22 1.0 0.79 0.24 0.19 0.64 0.34 0.23 0.26 0.19 0.49 0.21 0.22 0.18 0.2 0.28 0.36 0.25 0.2
Bra006905 (SEX4)
 0.07 0.13 0.06 0.06 0.59 0.44 0.17 0.26 0.21 0.28 0.24 0.22 0.22 0.67 1.0 0.25 0.21 0.8 0.47 0.14 0.21 0.16 0.08 0.2 0.15 0.12 0.14 0.3 0.31 0.32 0.24
Bra007000 (LOG4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.17 0.07 0.03 0.03 0.0 0.02 0.0 0.09 1.0 0.69 0.01 0.0 0.56 0.07 0.05 0.02 0.0 0.31 0.02 0.0 0.04 0.0 0.01 0.05 0.0 0.05
Bra007054 (NHL39)
 0.22 0.19 0.4 0.2 0.47 0.47 0.34 0.27 0.52 0.4 0.42 0.33 0.43 1.0 0.94 0.68 0.46 0.9 0.51 0.35 0.24 0.43 0.47 0.11 0.19 0.16 0.13 0.19 0.21 0.16 0.11
Bra007542 (GATA4)
 0.09 0.18 0.24 0.08 0.36 0.33 0.2 0.24 0.37 0.25 0.33 0.25 0.49 0.9 0.7 0.36 0.32 1.0 0.4 0.53 0.34 0.29 0.56 0.3 0.38 0.3 0.42 0.28 0.43 0.41 0.76
Bra008052 (HAP2C)
 0.18 0.16 0.1 0.05 0.59 0.63 0.13 0.09 0.33 0.26 0.24 0.3 0.17 1.0 0.9 0.29 0.22 0.79 0.43 0.36 0.29 0.35 0.47 0.45 0.49 0.32 0.48 0.59 0.53 0.38 0.43
0.08 0.06 0.07 0.05 0.32 0.52 0.07 0.11 0.16 0.18 0.15 0.15 0.48 0.86 1.0 0.32 0.33 0.89 0.3 0.28 0.17 0.2 0.27 0.13 0.12 0.12 0.06 0.1 0.12 0.1 0.16
0.04 0.04 0.05 0.05 0.37 0.42 0.24 0.24 0.41 0.35 0.39 0.36 0.72 0.87 0.97 0.64 0.47 1.0 0.57 0.47 0.38 0.39 0.33 0.23 0.19 0.13 0.2 0.14 0.23 0.18 0.28
Bra010694 (PCBER1)
 0.12 0.05 0.05 0.04 0.64 0.63 0.19 0.13 0.28 0.22 0.24 0.13 0.24 1.0 0.95 0.32 0.23 0.94 0.5 0.22 0.19 0.21 0.35 0.26 0.25 0.15 0.2 0.37 0.33 0.12 0.13
Bra011704 (APP1)
 0.07 0.05 0.03 0.05 0.3 0.57 0.12 0.18 0.22 0.19 0.18 0.15 0.3 0.79 1.0 0.22 0.22 0.41 0.23 0.23 0.34 0.22 0.65 0.12 0.11 0.09 0.08 0.08 0.13 0.09 0.14
0.13 0.07 0.12 0.03 0.52 0.55 0.24 0.16 0.38 0.47 0.35 0.3 0.31 0.73 1.0 0.65 0.35 0.98 0.62 0.41 0.4 0.33 0.24 0.25 0.11 0.13 0.09 0.16 0.25 0.11 0.1
Bra013606 (MRB1)
 0.17 0.11 0.12 0.05 0.46 0.46 0.33 0.28 0.33 0.25 0.2 0.23 0.13 0.73 1.0 0.28 0.19 0.98 0.48 0.26 0.19 0.25 0.22 0.35 0.35 0.2 0.3 0.48 0.51 0.48 0.42
0.04 0.05 0.03 0.04 0.26 0.54 0.17 0.14 0.28 0.26 0.23 0.25 0.33 1.0 0.77 0.2 0.36 0.88 0.49 0.3 0.28 0.23 0.39 0.22 0.16 0.15 0.29 0.14 0.26 0.24 0.72
Bra014003 (RALFL31)
 0.24 0.22 0.18 0.29 0.61 0.67 0.33 0.36 0.35 0.38 0.41 0.36 0.6 1.0 1.0 0.56 0.46 0.95 0.69 0.58 0.55 0.45 0.79 0.62 0.49 0.46 0.4 0.27 0.36 0.32 0.37
0.37 0.32 0.32 0.3 0.57 0.51 0.33 0.35 0.51 0.47 0.47 0.43 0.53 0.98 0.93 0.61 0.47 1.0 0.62 0.49 0.4 0.46 0.43 0.38 0.35 0.29 0.34 0.37 0.42 0.33 0.33
0.11 0.09 0.1 0.1 0.64 0.61 0.26 0.22 0.33 0.26 0.27 0.22 0.36 1.0 0.99 0.43 0.33 0.92 0.46 0.31 0.3 0.33 0.29 0.3 0.25 0.17 0.23 0.29 0.28 0.15 0.18
Bra016031 (HAP2C)
 0.11 0.1 0.09 0.05 0.56 0.7 0.16 0.08 0.31 0.22 0.25 0.3 0.2 1.0 0.91 0.33 0.28 0.72 0.4 0.26 0.25 0.26 0.56 0.45 0.48 0.3 0.37 0.52 0.52 0.35 0.47
Bra016382 (UGT85A5)
 0.03 0.01 0.01 0.01 0.19 0.57 0.15 0.14 0.22 0.18 0.12 0.14 0.48 1.0 0.73 0.2 0.28 0.76 0.61 0.16 0.19 0.2 0.31 0.12 0.09 0.06 0.07 0.17 0.25 0.11 0.14
0.42 0.57 0.43 0.42 0.91 0.72 0.44 0.61 0.49 0.51 0.49 0.52 0.8 1.0 0.84 0.61 0.62 0.83 0.46 0.47 0.52 0.51 0.89 0.48 0.6 0.57 0.57 0.56 0.61 0.59 0.61
Bra016795 (BAG5)
 0.12 0.27 0.26 0.24 0.73 0.67 0.35 0.36 0.35 0.4 0.42 0.45 0.51 0.94 1.0 0.62 0.59 0.74 0.61 0.4 0.35 0.33 0.42 0.56 0.62 0.32 0.48 0.52 0.44 0.39 0.68
0.1 0.04 0.14 0.01 0.4 0.44 0.17 0.02 0.37 0.29 0.18 0.2 0.06 0.59 1.0 0.34 0.22 0.91 0.25 0.2 0.18 0.18 0.07 0.05 0.18 0.03 0.15 0.41 0.46 0.21 0.25
0.41 0.41 0.51 0.27 0.79 0.75 0.54 0.54 0.52 0.46 0.48 0.5 0.56 1.0 0.99 0.7 0.59 0.89 0.69 0.56 0.5 0.49 0.66 0.64 0.65 0.52 0.61 0.72 0.63 0.64 0.63
0.17 0.13 0.2 0.18 0.23 0.47 0.22 0.15 0.37 0.23 0.29 0.23 0.24 0.83 1.0 0.31 0.33 0.73 0.55 0.3 0.23 0.32 0.39 0.26 0.3 0.17 0.29 0.2 0.31 0.22 0.33
Bra021527 (NF-YA6)
 0.09 0.04 0.04 0.03 0.56 0.61 0.07 0.07 0.27 0.14 0.16 0.16 0.18 1.0 0.84 0.3 0.14 0.61 0.34 0.27 0.21 0.24 0.3 0.24 0.22 0.13 0.17 0.3 0.31 0.11 0.21
Bra021865 (AHL10)
 0.4 0.31 0.47 0.36 0.73 0.65 0.27 0.36 0.42 0.38 0.35 0.37 0.59 0.81 1.0 0.45 0.36 0.7 0.48 0.35 0.36 0.42 0.74 0.32 0.41 0.32 0.28 0.41 0.4 0.3 0.41
Bra022545 (DYAD)
 0.41 0.3 0.32 0.26 0.65 0.64 0.28 0.31 0.49 0.39 0.37 0.35 0.28 0.92 1.0 0.47 0.39 0.62 0.48 0.39 0.36 0.37 0.5 0.5 0.5 0.33 0.41 0.52 0.62 0.42 0.51
Bra023153 (SUF4)
 0.47 0.46 0.55 0.32 0.57 0.71 0.38 0.4 0.53 0.48 0.48 0.45 0.54 0.84 1.0 0.6 0.47 0.8 0.56 0.48 0.44 0.47 0.71 0.49 0.47 0.38 0.5 0.47 0.53 0.48 0.51
Bra023407 (NEF1)
 0.54 0.61 0.57 0.45 0.76 0.76 0.37 0.51 0.48 0.61 0.55 0.52 0.66 1.0 0.97 0.69 0.6 0.77 0.57 0.52 0.5 0.51 0.71 0.57 0.59 0.64 0.62 0.51 0.6 0.67 0.77
0.33 0.29 0.32 0.24 0.48 0.6 0.26 0.24 0.52 0.41 0.44 0.35 0.44 0.96 1.0 0.48 0.44 0.73 0.47 0.46 0.39 0.44 0.52 0.35 0.32 0.25 0.35 0.31 0.37 0.3 0.32
Bra026154 (CCMH)
 0.16 0.19 0.18 0.14 0.48 0.69 0.27 0.09 0.36 0.27 0.28 0.34 0.24 0.85 1.0 0.58 0.32 0.91 0.65 0.44 0.33 0.44 0.54 0.26 0.23 0.17 0.23 0.24 0.26 0.28 0.36
Bra026631 (TMK3)
 0.3 0.29 0.35 0.32 0.66 0.54 0.35 0.48 0.37 0.37 0.32 0.37 0.61 1.0 0.83 0.48 0.49 0.83 0.46 0.35 0.36 0.35 0.73 0.42 0.45 0.64 0.46 0.52 0.59 0.53 0.59
0.15 0.18 0.25 0.13 0.29 0.38 0.17 0.23 0.27 0.21 0.21 0.22 0.26 0.86 1.0 0.26 0.26 0.58 0.37 0.22 0.31 0.38 0.51 0.21 0.21 0.19 0.21 0.15 0.19 0.16 0.2
Bra029801 (ATB' BETA)
 0.56 0.46 0.46 0.55 0.83 0.78 0.48 0.6 0.48 0.54 0.43 0.44 0.57 0.88 0.86 0.63 0.68 1.0 0.45 0.57 0.57 0.5 0.52 0.51 0.45 0.44 0.52 0.37 0.53 0.51 0.58
Bra029804 (RABC2b)
 0.11 0.06 0.05 0.07 0.49 0.5 0.27 0.17 0.31 0.27 0.29 0.2 0.18 0.97 1.0 0.4 0.26 0.89 0.31 0.29 0.23 0.28 0.46 0.24 0.22 0.21 0.21 0.25 0.28 0.14 0.16
Bra031269 (DOF2)
 0.25 0.18 0.13 0.13 0.81 0.77 0.32 0.21 0.47 0.25 0.35 0.29 0.15 0.98 1.0 0.31 0.18 0.62 0.65 0.37 0.3 0.3 0.3 0.66 0.43 0.31 0.39 0.46 0.66 0.46 0.3
Bra031430 (GLP8)
 0.17 0.18 0.25 0.13 0.35 0.61 0.13 0.12 0.45 0.4 0.34 0.36 0.29 0.87 1.0 0.41 0.4 0.64 0.45 0.43 0.28 0.28 0.31 0.19 0.16 0.14 0.18 0.2 0.22 0.23 0.29
Bra031772 (GPT2)
 0.08 0.08 0.03 0.07 0.08 0.23 0.05 0.08 0.1 0.09 0.15 0.08 0.46 0.88 1.0 0.15 0.07 0.36 0.06 0.12 0.18 0.07 0.26 0.05 0.07 0.11 0.07 0.06 0.03 0.02 0.01
Bra033911 (ELIP)
 0.01 0.0 0.0 0.01 0.19 0.44 0.28 0.15 0.02 0.02 0.02 0.01 0.19 1.0 0.93 0.12 0.09 0.64 0.11 0.09 0.06 0.04 0.35 0.08 0.06 0.04 0.03 0.12 0.05 0.02 0.02
Bra035416 (IAR4L)
 0.43 0.42 0.37 0.34 0.65 0.64 0.49 0.5 0.62 0.69 0.63 0.69 0.63 0.83 0.84 0.71 0.62 1.0 0.79 0.62 0.66 0.71 0.58 0.48 0.46 0.47 0.51 0.5 0.42 0.5 0.53
Bra035605 (UBC30)
 0.21 0.26 0.19 0.18 0.45 0.59 0.32 0.45 0.53 0.43 0.38 0.45 0.62 0.95 1.0 0.4 0.4 0.91 0.61 0.51 0.57 0.35 0.69 0.33 0.29 0.24 0.27 0.23 0.22 0.19 0.26
0.4 0.39 0.33 0.21 0.58 0.61 0.42 0.47 0.45 0.55 0.4 0.5 0.74 0.94 0.88 0.64 0.47 1.0 0.78 0.69 0.54 0.57 0.69 0.38 0.41 0.38 0.35 0.33 0.33 0.32 0.37
0.02 0.14 0.03 0.09 0.42 0.19 0.09 0.05 0.3 0.04 0.05 0.02 0.53 0.69 0.53 0.12 0.23 1.0 0.4 0.15 0.04 0.1 0.21 0.02 0.07 0.01 0.2 0.2 0.09 0.2 0.43
Bra037968 (NFYA5)
 0.07 0.03 0.04 0.01 0.57 0.51 0.08 0.06 0.25 0.15 0.18 0.12 0.1 1.0 0.79 0.21 0.19 0.43 0.38 0.22 0.23 0.23 0.13 0.43 0.33 0.25 0.29 0.35 0.36 0.23 0.39
0.32 0.26 0.15 0.2 0.33 0.32 0.28 0.24 0.37 0.33 0.32 0.39 0.32 1.0 0.83 0.25 0.18 0.46 0.52 0.37 0.3 0.27 0.41 0.31 0.33 0.39 0.31 0.25 0.24 0.38 0.4
Bra040092 (ERF39)
 0.02 0.01 0.02 0.01 0.16 0.27 0.14 0.14 0.2 0.13 0.14 0.11 0.08 0.85 1.0 0.22 0.11 0.86 0.48 0.19 0.13 0.14 0.16 0.17 0.12 0.02 0.14 0.08 0.15 0.07 0.12
0.43 0.53 0.57 0.42 0.69 0.69 0.49 0.51 0.57 0.5 0.54 0.5 0.53 1.0 0.95 0.67 0.59 0.99 0.73 0.6 0.56 0.53 0.85 0.63 0.65 0.6 0.62 0.52 0.71 0.75 0.71
Bra040720 (KLU)
 0.1 0.04 0.01 0.02 0.16 0.43 0.19 0.24 0.17 0.1 0.19 0.18 0.28 1.0 0.53 0.19 0.15 0.59 0.71 0.29 0.26 0.21 0.09 0.19 0.23 0.3 0.24 0.09 0.38 0.28 0.63

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)