1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_191 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000941 (ETC3)
 0.05 0.04 0.02 0.01 0.1 0.09 0.04 0.02 0.06 0.01 0.03 0.03 0.13 0.25 0.15 0.03 0.02 1.0 0.38 0.04 0.02 0.04 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Bra001454 (PR3)
 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.08 0.05 0.06 0.09 0.01 0.05 0.04 0.0 0.02 0.05 0.08 1.0 0.08 0.04 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.05
0.01 0.01 0.07 0.03 0.04 0.02 0.1 0.14 0.04 0.05 0.04 0.05 0.21 0.02 0.02 0.11 0.1 1.0 0.04 0.03 0.04 0.04 0.11 0.09 0.09 0.07 0.08 0.04 0.09 0.07 0.46
Bra002062 (ALMT6)
 0.01 0.05 0.05 0.05 0.15 0.1 0.02 0.04 0.04 0.09 0.08 0.05 0.1 0.33 0.23 0.08 0.09 1.0 0.1 0.09 0.05 0.07 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.03 0.04
Bra003719 (PHT1;9)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01
Bra004724 (AGAP1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra005070 (ATPT2)
 0.01 0.02 0.02 0.0 0.02 0.04 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.07 0.05 0.04 1.0 0.11 0.02 0.02 0.04 0.07 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
0.01 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra005390 (AtBBE16)
 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04 0.1 0.08 0.08 0.1 0.05 0.09 0.19 0.05 0.06 0.08 0.09 1.0 0.08 0.03 0.05 0.07 0.12 0.06 0.06 0.05 0.06 0.04 0.07 0.11 0.28
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.04 0.02 0.16 0.05 0.03 1.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra009033 (AtDTX28)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra009746 (MEB2)
 0.03 0.01 0.03 0.09 0.08 0.05 0.05 0.04 0.04 0.15 0.02 0.07 0.06 0.03 0.02 0.07 0.04 1.0 0.08 0.04 0.03 0.1 0.12 0.05 0.06 0.11 0.05 0.05 0.09 0.06 0.08
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.09 0.27 0.04 0.1 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.06 0.04 0.03 0.06 0.04 0.03 0.22 0.14
Bra010423 (MAPKKK16)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 1.0 0.26 0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Bra010543 (CHX17)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra011191 (UMAMIT34)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra011817 (TRM4A)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
Bra012416 (CSLA10)
 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.04 0.05 0.04 0.03 0.06 0.03 0.3 0.05 0.07 0.06 0.05 1.0 0.03 0.04 0.04 0.04 0.1 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Bra014890 (AtBBE-like 13)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.02 0.01 0.01 1.0 0.35 0.02 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Bra015929 (RLP14)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.05
Bra015937 (RSH)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra015981 (ZW9)
 0.08 0.11 0.16 0.19 0.01 0.01 0.08 0.06 0.11 0.02 0.03 0.12 0.19 0.0 0.01 0.02 0.02 1.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.18 0.03 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02 0.09 0.23
Bra018785 (USPL1)
 0.02 0.09 0.12 0.04 0.02 0.01 0.02 0.04 0.02 0.03 0.01 0.02 0.09 0.01 0.0 0.02 0.03 1.0 0.02 0.01 0.03 0.02 0.1 0.03 0.04 0.02 0.02 0.02 0.01 0.06 0.08
0.08 0.04 0.05 0.06 0.17 0.07 0.15 0.14 0.11 0.08 0.08 0.06 0.21 0.09 0.11 0.1 0.05 1.0 0.1 0.04 0.03 0.06 0.03 0.04 0.03 0.02 0.03 0.04 0.12 0.1 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra022275 (PP7L)
 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.3 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.03 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.29 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra026303 (MEB1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.01 0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.08 0.06 0.08 0.04 0.01 1.0 0.03 0.01 0.01 0.03 0.02 0.04 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.04
Bra027987 (GGL25)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.19 0.0 0.0 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0
Bra028829 (EXO70A1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0 0.01 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01
0.02 0.02 0.03 0.01 0.06 0.14 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.08 0.15 0.02 0.03 1.0 0.06 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.02 0.01 0.04 0.04 0.02 0.02 0.04
0.15 0.11 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.09 0.0 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Bra030385 (TSA1)
 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.08 0.02 0.01 0.03 0.01 1.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.09 0.05 0.05 0.03 0.05 0.03 0.04 0.05 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.08 0.58 0.2 0.0 0.0 1.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06
Bra032563 (GRXS1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra035004 (UF3GT)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.06 0.51 0.19 0.0 0.0 1.0 0.07 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 1.0 0.09 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
Bra035920 (PUB52)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Bra035924 (PUB52)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Bra037625 (NRT2.6)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Bra037887 (TT8)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.03 0.05 0.05 0.02 0.04 0.01 0.06 0.33 0.1 0.06 0.04 1.0 0.15 0.03 0.02 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.06 0.04 0.04 0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.07 0.28 0.15 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Bra038999 (PUB34)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.12 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.06 0.06 0.04 0.1 0.14 0.05 0.03 0.07 0.04 0.04 0.06 0.04 0.12 0.12 0.04 0.05 1.0 0.27 0.06 0.05 0.06 0.13 0.09 0.06 0.04 0.06 0.07 0.13 0.07 0.08
Bra040055 (TH9)
 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.05 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 0.0 0.03 0.02 0.02 0.02 1.0 0.44 0.02 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
Bra040186 (PPCK2)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 1.0 0.1 0.04 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
Bra040489 (RPG2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.01 0.04 0.0 0.02 0.23 0.05 0.02 0.02 0.01 1.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.14 0.03 0.07 0.0 0.09 0.05 0.01 0.02 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)