1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_223 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.63 0.66 0.69 0.45 1.0 0.85 0.35 0.36 0.55 0.55 0.48 0.49 0.43 0.91 1.0 0.61 0.48 0.79 0.55 0.52 0.44 0.58 0.86 0.53 0.54 0.48 0.55 0.63 0.65 0.69 0.61
0.49 0.54 0.57 0.45 0.91 0.99 0.42 0.37 0.57 0.53 0.5 0.5 0.43 0.97 1.0 0.67 0.54 0.67 0.56 0.54 0.45 0.59 0.61 0.52 0.49 0.68 0.48 0.53 0.66 0.63 0.56
Bra003467 (ATX3)
 0.64 0.71 0.69 0.53 0.88 1.0 0.47 0.42 0.59 0.47 0.55 0.47 0.53 0.99 0.97 0.61 0.47 0.53 0.59 0.55 0.47 0.44 0.56 0.47 0.55 0.56 0.49 0.64 0.75 0.58 0.61
Bra003867 (HAP2C)
 0.63 0.62 0.71 0.49 0.9 0.95 0.26 0.16 0.49 0.36 0.46 0.35 0.27 1.0 0.96 0.34 0.36 0.54 0.43 0.45 0.44 0.43 0.35 0.37 0.45 0.38 0.44 0.45 0.58 0.39 0.34
0.45 0.62 0.6 0.32 0.96 1.0 0.12 0.08 0.22 0.22 0.14 0.18 0.03 0.6 0.89 0.23 0.22 0.38 0.5 0.24 0.24 0.25 0.09 0.12 0.12 0.19 0.13 0.39 0.28 0.29 0.04
0.62 0.69 0.7 0.52 1.0 0.89 0.44 0.4 0.57 0.51 0.55 0.52 0.51 0.97 0.9 0.58 0.51 0.6 0.54 0.6 0.51 0.61 0.7 0.59 0.55 0.65 0.54 0.63 0.71 0.66 0.56
Bra005900 (UBP12)
 0.65 0.68 0.63 0.43 1.0 0.8 0.41 0.46 0.55 0.57 0.49 0.53 0.45 0.85 0.97 0.66 0.51 0.66 0.59 0.48 0.44 0.51 0.89 0.49 0.5 0.44 0.49 0.61 0.61 0.65 0.58
0.64 0.56 0.55 0.58 0.94 1.0 0.48 0.38 0.5 0.36 0.49 0.43 0.4 0.87 0.91 0.51 0.43 0.58 0.46 0.4 0.44 0.49 0.62 0.43 0.51 0.29 0.47 0.49 0.61 0.5 0.56
Bra006083 (CAF1i)
 0.52 0.57 0.62 0.44 1.0 0.87 0.31 0.25 0.52 0.41 0.39 0.4 0.4 0.8 0.86 0.47 0.45 0.53 0.47 0.42 0.38 0.42 0.63 0.39 0.34 0.31 0.36 0.42 0.48 0.42 0.38
0.48 0.64 0.56 0.38 1.0 0.94 0.38 0.36 0.51 0.39 0.45 0.39 0.31 0.86 0.9 0.53 0.44 0.58 0.48 0.47 0.37 0.45 0.77 0.41 0.36 0.33 0.41 0.41 0.43 0.34 0.39
0.5 0.66 0.66 0.31 1.0 0.68 0.3 0.25 0.5 0.39 0.41 0.43 0.27 0.9 0.99 0.41 0.37 0.54 0.54 0.4 0.35 0.43 0.78 0.51 0.43 0.35 0.44 0.53 0.59 0.61 0.64
0.74 0.8 0.85 0.66 0.89 0.93 0.54 0.55 0.64 0.54 0.56 0.58 0.49 0.93 1.0 0.64 0.56 0.68 0.66 0.58 0.52 0.59 0.73 0.62 0.62 0.6 0.58 0.75 0.74 0.63 0.7
Bra009770 (TTG)
 0.36 0.58 0.68 0.47 0.77 0.94 0.26 0.15 0.42 0.32 0.31 0.29 0.26 0.83 1.0 0.43 0.32 0.6 0.53 0.36 0.34 0.36 0.45 0.35 0.36 0.29 0.39 0.44 0.5 0.51 0.47
0.87 0.81 0.77 0.64 1.0 0.95 0.51 0.49 0.68 0.57 0.59 0.58 0.51 0.95 1.0 0.57 0.56 0.78 0.61 0.64 0.53 0.63 0.76 0.56 0.67 0.65 0.69 0.69 0.74 0.69 0.68
Bra010152 (NHL8)
 0.77 0.71 0.7 0.52 0.86 0.72 0.3 0.22 0.61 0.45 0.5 0.36 0.24 1.0 1.0 0.52 0.38 0.56 0.59 0.5 0.41 0.42 0.73 0.59 0.55 0.54 0.48 0.69 0.8 0.53 0.45
Bra010916 (BPP5)
 0.67 0.74 0.88 0.64 0.98 0.91 0.41 0.4 0.51 0.51 0.59 0.52 0.43 0.99 1.0 0.64 0.67 0.74 0.55 0.59 0.56 0.55 0.55 0.57 0.6 0.65 0.61 0.65 0.72 0.59 0.65
Bra011524 (ARI1)
 0.79 0.72 0.73 0.51 0.99 1.0 0.39 0.31 0.54 0.39 0.44 0.43 0.36 0.81 0.9 0.53 0.44 0.65 0.53 0.51 0.4 0.5 0.56 0.47 0.44 0.41 0.47 0.5 0.64 0.46 0.46
Bra013015 (TGH)
 0.82 0.81 0.83 0.54 0.97 0.95 0.52 0.55 0.71 0.55 0.6 0.56 0.6 0.97 1.0 0.63 0.55 0.74 0.65 0.57 0.52 0.64 0.57 0.52 0.55 0.44 0.49 0.61 0.66 0.61 0.68
Bra013665 (ESP)
 0.48 0.61 0.66 0.51 1.0 0.97 0.35 0.27 0.33 0.33 0.45 0.31 0.35 0.85 0.83 0.5 0.38 0.71 0.53 0.51 0.37 0.32 0.39 0.27 0.31 0.28 0.34 0.4 0.5 0.4 0.48
Bra014351 (RDM2)
 0.59 0.62 0.62 0.36 0.95 1.0 0.44 0.43 0.61 0.51 0.54 0.47 0.48 0.92 0.86 0.49 0.46 0.53 0.53 0.5 0.47 0.54 0.49 0.5 0.45 0.44 0.47 0.57 0.66 0.42 0.44
Bra015289 (IAA10)
 0.68 0.9 0.77 0.48 1.0 0.93 0.37 0.23 0.45 0.37 0.43 0.38 0.24 0.73 0.81 0.31 0.32 0.37 0.48 0.36 0.35 0.34 0.32 0.46 0.4 0.35 0.37 0.47 0.57 0.36 0.34
0.56 0.52 0.47 0.46 0.89 0.83 0.4 0.33 0.34 0.28 0.37 0.36 0.35 0.78 1.0 0.4 0.38 0.52 0.36 0.37 0.39 0.33 0.51 0.31 0.3 0.26 0.3 0.31 0.36 0.32 0.36
Bra017087 (TAC14)
 0.52 0.54 0.61 0.55 1.0 0.9 0.39 0.4 0.53 0.48 0.47 0.36 0.43 0.91 0.95 0.57 0.41 0.39 0.48 0.54 0.37 0.55 0.48 0.46 0.57 0.3 0.52 0.47 0.61 0.55 0.65
Bra017929 (SOP1)
 0.68 0.68 0.71 0.57 0.86 0.85 0.41 0.47 0.53 0.48 0.47 0.48 0.41 0.89 1.0 0.55 0.6 0.65 0.51 0.54 0.45 0.54 0.57 0.58 0.6 0.55 0.57 0.58 0.69 0.63 0.65
Bra018674 (RNL)
 0.43 0.52 0.54 0.38 0.89 0.68 0.33 0.31 0.43 0.36 0.43 0.34 0.32 0.85 0.92 0.46 0.31 0.48 0.54 0.47 0.32 0.4 1.0 0.44 0.37 0.45 0.44 0.5 0.54 0.44 0.49
Bra019456 (DCL3)
 0.86 0.67 0.62 0.47 0.84 0.92 0.37 0.37 0.52 0.38 0.47 0.43 0.34 0.87 1.0 0.47 0.46 0.53 0.5 0.46 0.46 0.43 0.58 0.53 0.53 0.54 0.53 0.65 0.7 0.57 0.63
Bra019564 (SPT1)
 0.81 0.69 0.83 0.54 0.83 0.89 0.37 0.42 0.63 0.46 0.57 0.54 0.44 0.93 1.0 0.49 0.41 0.75 0.52 0.5 0.41 0.5 0.58 0.52 0.52 0.44 0.51 0.72 0.74 0.65 0.54
0.57 0.63 0.58 0.39 1.0 0.85 0.31 0.36 0.5 0.46 0.39 0.5 0.38 1.0 0.99 0.48 0.44 0.57 0.53 0.47 0.36 0.46 0.58 0.5 0.53 0.44 0.55 0.71 0.77 0.67 0.56
Bra020402 (CNGC5)
 0.71 0.69 0.8 0.48 0.92 0.92 0.22 0.19 0.42 0.39 0.4 0.35 0.29 0.87 1.0 0.46 0.44 0.63 0.43 0.42 0.37 0.45 0.4 0.35 0.32 0.38 0.36 0.42 0.48 0.37 0.41
0.73 0.72 0.85 0.65 0.87 0.79 0.42 0.47 0.58 0.6 0.46 0.48 0.39 0.82 1.0 0.52 0.59 0.7 0.51 0.52 0.48 0.42 0.67 0.51 0.56 0.42 0.49 0.61 0.64 0.6 0.64
0.53 0.44 0.46 0.19 1.0 0.73 0.21 0.17 0.39 0.4 0.36 0.33 0.21 0.94 0.98 0.42 0.33 0.52 0.39 0.32 0.31 0.4 0.69 0.4 0.42 0.39 0.42 0.5 0.64 0.63 0.56
Bra022151 (PDS5)
 0.75 0.73 0.71 0.46 0.94 1.0 0.53 0.48 0.56 0.49 0.51 0.48 0.49 0.87 0.96 0.63 0.52 0.6 0.57 0.58 0.49 0.53 0.54 0.52 0.54 0.51 0.52 0.58 0.64 0.49 0.62
Bra022624 (SHI1)
 0.53 0.59 0.72 0.56 0.99 0.9 0.35 0.34 0.46 0.49 0.48 0.44 0.38 0.94 1.0 0.48 0.5 0.46 0.44 0.47 0.42 0.43 0.48 0.53 0.61 0.55 0.58 0.64 0.76 0.62 0.69
Bra024543 (VPS3)
 0.78 0.86 0.9 0.64 0.97 0.92 0.45 0.4 0.64 0.54 0.5 0.47 0.43 0.98 1.0 0.58 0.61 0.76 0.52 0.45 0.38 0.54 0.64 0.55 0.51 0.46 0.51 0.64 0.67 0.6 0.63
Bra026231 (RAB2A)
 0.53 0.56 0.63 0.47 1.0 0.91 0.32 0.27 0.5 0.4 0.43 0.36 0.35 0.97 0.97 0.44 0.38 0.45 0.47 0.43 0.44 0.48 0.79 0.4 0.36 0.35 0.36 0.47 0.54 0.39 0.27
Bra026751 (TPL)
 0.5 0.48 0.43 0.36 1.0 0.83 0.25 0.23 0.28 0.27 0.26 0.21 0.42 0.85 0.98 0.37 0.3 0.39 0.3 0.33 0.36 0.33 0.22 0.25 0.26 0.27 0.29 0.34 0.37 0.25 0.29
0.7 0.78 0.76 0.62 0.85 0.85 0.4 0.4 0.62 0.55 0.57 0.54 0.45 0.88 1.0 0.59 0.6 0.74 0.52 0.49 0.5 0.55 0.75 0.49 0.49 0.47 0.45 0.55 0.64 0.56 0.55
0.6 0.61 0.61 0.37 1.0 0.83 0.25 0.2 0.55 0.41 0.38 0.39 0.27 0.84 0.89 0.44 0.37 0.43 0.48 0.41 0.33 0.45 0.62 0.33 0.31 0.28 0.33 0.42 0.5 0.37 0.34
Bra029653 (ATG10)
 0.37 0.55 0.51 0.27 1.0 0.89 0.14 0.13 0.32 0.41 0.31 0.25 0.12 0.91 0.88 0.36 0.24 0.5 0.41 0.29 0.27 0.38 0.55 0.25 0.21 0.19 0.25 0.34 0.45 0.32 0.24
Bra029827 (RTNLB8)
 0.43 0.55 0.52 0.36 1.0 0.81 0.19 0.15 0.28 0.3 0.29 0.17 0.27 0.67 0.8 0.35 0.24 0.2 0.22 0.27 0.28 0.23 0.18 0.2 0.2 0.2 0.21 0.25 0.33 0.22 0.17
0.69 0.71 0.66 0.6 1.0 0.86 0.33 0.35 0.59 0.5 0.49 0.46 0.46 0.9 0.93 0.47 0.48 0.49 0.6 0.48 0.47 0.49 0.7 0.39 0.4 0.38 0.4 0.47 0.54 0.48 0.36
Bra032565 (PEX6)
 0.92 0.89 0.82 0.61 0.99 0.93 0.54 0.53 0.69 0.6 0.62 0.61 0.53 0.91 1.0 0.63 0.63 0.8 0.69 0.66 0.59 0.63 0.61 0.6 0.63 0.55 0.62 0.7 0.78 0.63 0.77
0.66 0.64 0.75 0.56 0.63 0.77 0.43 0.35 0.68 0.53 0.53 0.44 0.4 0.87 1.0 0.53 0.51 0.6 0.52 0.55 0.46 0.47 0.79 0.57 0.57 0.54 0.5 0.62 0.69 0.56 0.55
Bra034331 (LSG1-1)
 0.67 0.63 0.78 0.45 0.95 1.0 0.44 0.45 0.52 0.48 0.42 0.47 0.47 0.95 1.0 0.54 0.45 0.58 0.55 0.42 0.48 0.49 0.62 0.39 0.31 0.34 0.35 0.52 0.53 0.44 0.43
Bra034332 (BSL3)
 0.81 0.79 0.92 0.57 0.94 0.87 0.46 0.46 0.57 0.53 0.55 0.48 0.54 0.98 1.0 0.65 0.57 0.64 0.54 0.54 0.54 0.48 0.54 0.44 0.49 0.5 0.53 0.53 0.64 0.61 0.74
0.64 0.71 0.69 0.58 1.0 0.9 0.38 0.42 0.65 0.46 0.52 0.49 0.4 1.0 0.95 0.54 0.45 0.49 0.54 0.49 0.48 0.51 0.57 0.44 0.34 0.32 0.37 0.45 0.58 0.47 0.5
Bra038259 (EHD1)
 0.66 0.71 0.76 0.58 0.99 0.86 0.43 0.42 0.62 0.58 0.53 0.57 0.42 1.0 0.99 0.55 0.49 0.59 0.56 0.51 0.48 0.62 0.68 0.52 0.49 0.43 0.43 0.53 0.59 0.56 0.55
Bra039380 (RBGD3)
 0.75 0.62 0.6 0.56 0.99 1.0 0.37 0.4 0.54 0.45 0.38 0.41 0.42 0.85 0.93 0.54 0.43 0.76 0.54 0.46 0.44 0.51 0.56 0.42 0.41 0.27 0.42 0.49 0.61 0.51 0.52

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)