1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_43 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000491 (LBD11)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.16 0.04 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra001475 (ASML2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.24 0.05 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra001947 (BKN3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra002242 (MSL9)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra002560 (DVL18)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.14 0.0 0.07 0.0 0.16 0.0 0.0 0.11 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra004042 (AE7)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.06 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra006417 (TFL2)
 0.0 0.0 0.16 0.0 0.07 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.26 0.03 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.08 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.08 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.08 0.08
Bra010276 (HTT1)
 0.0 0.01 0.06 0.05 0.01 0.05 0.01 0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.1 0.05 0.13 0.04 0.04 0.17 0.02 0.05 0.03 0.02 1.0 0.04 0.11 0.0 0.05 0.03 0.06 0.02 0.04
Bra011464 (AtCAPE3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
Bra015479 (TCH2)
 0.0 0.06 0.02 0.0 0.08 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.1 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.11 0.03 0.01 0.08
0.0 0.06 0.05 0.0 0.16 0.18 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.07 0.02 1.0 0.07 0.17 0.0 0.07 0.11 0.02 0.02 0.05
Bra015898 (MIF1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra017849 (VQ29)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 1.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.06 0.03 0.03 0.06
Bra020228 (RAX1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.02 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Bra020937 (GTB1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra021179 (JAL34)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra021775 (AthCYSTM6)
 0.0 0.04 0.0 0.12 0.02 0.04 0.04 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.19 0.02 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.05
Bra021824 (RLP23)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.12 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.08 0.13 0.11 0.07 0.1 0.14 1.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0
Bra022705 (AtDOB11)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05
Bra023505 (WRKY72)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra023586 (NDB4)
 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.11 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra023748 (TDR1)
 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.15 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra025795 (SK3)
 0.06 0.0 0.01 0.03 0.23 0.02 0.03 0.02 0.04 0.08 0.04 0.03 0.1 0.05 0.08 0.03 0.02 0.31 0.05 0.01 0.03 0.02 1.0 0.07 0.06 0.04 0.05 0.04 0.08 0.09 0.14
Bra025962 (TN2)
 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.03 0.31 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.11 0.09 0.09 0.06 0.13 0.14 0.06 0.04 0.07 0.04 0.05 0.06 0.04 0.11 0.11 0.05 0.04 0.2 0.09 0.05 0.05 0.05 1.0 0.09 0.08 0.07 0.08 0.09 0.11 0.09 0.13
Bra026805 (KNATM)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.33 0.13 0.04 0.02 0.0 0.24 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.03 0.01 0.0
0.0 0.04 0.03 0.01 0.05 0.02 0.0 0.01 0.03 0.03 0.03 0.04 0.12 0.04 0.02 0.03 0.03 0.18 0.0 0.06 0.02 0.04 1.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.02 0.01 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.0 0.0
Bra031715 (ZFP5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.07 0.03 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.08 0.04 0.03 0.07 0.06 0.04 0.04 0.01
0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.03 0.03 0.09 0.01 0.0 0.02 0.0 0.22 0.02 0.01 0.05 0.04 0.16 0.01 0.0 0.07 0.0 1.0 0.08 0.11 0.04 0.08 0.06 0.0 0.09 0.17
0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.06 0.02 0.0 0.07 0.08 0.05 0.05 0.28 0.08 0.1 0.04 0.03 0.29 0.1 0.04 0.06 0.04 1.0 0.06 0.06 0.03 0.05 0.04 0.05 0.01 0.02
Bra035948 (COBL5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra036939 (AAP5)
 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.19 0.0 0.03 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.0
Bra037568 (PUB29)
 0.01 0.02 0.01 0.01 0.08 0.08 0.1 0.07 0.03 0.05 0.05 0.09 0.19 0.05 0.15 0.12 0.07 0.08 0.12 0.07 0.05 0.09 1.0 0.09 0.05 0.06 0.07 0.08 0.1 0.03 0.06
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1
Bra038474 (CYS4)
 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 0.0 0.01 0.01 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra040831 (PBD1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra040856 (bHLH94)
 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.02 0.0 0.0 0.32 0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)