1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_129 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000719 (SPT16)
 0.62 0.7 0.67 0.6 0.84 0.85 0.49 0.5 0.59 0.53 0.55 0.5 0.61 0.85 1.0 0.66 0.58 0.63 0.57 0.52 0.54 0.53 1.0 0.52 0.52 0.54 0.52 0.6 0.62 0.55 0.61
Bra001426 (UBP13)
 0.48 0.61 0.52 0.43 0.87 0.75 0.36 0.43 0.52 0.44 0.45 0.48 0.52 0.79 0.87 0.61 0.5 0.72 0.6 0.49 0.4 0.46 1.0 0.54 0.55 0.44 0.53 0.6 0.61 0.56 0.63
0.26 0.27 0.29 0.24 0.56 0.53 0.28 0.3 0.27 0.33 0.28 0.24 0.41 0.53 0.57 0.3 0.39 0.56 0.26 0.24 0.28 0.31 1.0 0.32 0.34 0.33 0.3 0.26 0.34 0.32 0.4
Bra002667 (MSI1)
 0.29 0.35 0.25 0.2 0.44 0.37 0.21 0.26 0.35 0.25 0.25 0.22 0.36 0.57 0.55 0.34 0.2 0.35 0.29 0.28 0.32 0.29 1.0 0.36 0.29 0.32 0.35 0.31 0.34 0.29 0.33
Bra002672 (IEF)
 0.51 0.49 0.46 0.38 0.78 0.75 0.37 0.37 0.51 0.51 0.47 0.48 0.46 0.76 0.81 0.53 0.45 0.6 0.51 0.46 0.4 0.49 1.0 0.5 0.52 0.45 0.5 0.52 0.55 0.51 0.52
0.29 0.3 0.25 0.25 0.55 0.54 0.21 0.25 0.36 0.2 0.28 0.26 0.4 0.5 0.63 0.29 0.25 0.67 0.32 0.33 0.29 0.2 1.0 0.42 0.26 0.28 0.33 0.32 0.32 0.2 0.28
0.32 0.36 0.37 0.3 0.76 0.63 0.29 0.32 0.39 0.38 0.39 0.31 0.43 0.65 0.76 0.43 0.39 0.58 0.38 0.4 0.35 0.38 1.0 0.4 0.44 0.35 0.38 0.35 0.37 0.4 0.48
0.66 0.65 0.53 0.53 0.99 0.92 0.56 0.63 0.57 0.57 0.57 0.69 0.65 0.92 0.97 0.61 0.61 0.79 0.61 0.6 0.52 0.57 1.0 0.62 0.63 0.59 0.66 0.68 0.71 0.65 0.81
Bra002845 (TEX1)
 0.33 0.33 0.28 0.29 0.62 0.57 0.38 0.37 0.46 0.36 0.36 0.36 0.45 0.57 0.65 0.46 0.34 0.43 0.39 0.4 0.37 0.38 1.0 0.37 0.37 0.32 0.35 0.43 0.39 0.3 0.34
Bra002928 (SUM1)
 0.56 0.47 0.39 0.4 0.86 0.71 0.47 0.49 0.46 0.48 0.44 0.47 0.59 0.74 0.76 0.55 0.54 0.48 0.5 0.48 0.5 0.59 1.0 0.59 0.54 0.54 0.53 0.52 0.52 0.5 0.57
Bra003342 (AtCCR4a)
 0.49 0.36 0.43 0.32 0.71 0.68 0.27 0.34 0.35 0.35 0.37 0.34 0.47 0.8 0.8 0.57 0.47 0.53 0.47 0.39 0.37 0.42 1.0 0.43 0.35 0.37 0.42 0.45 0.38 0.43 0.44
0.53 0.59 0.5 0.48 0.77 0.69 0.43 0.47 0.4 0.4 0.43 0.4 0.55 0.83 0.89 0.59 0.51 0.52 0.38 0.4 0.38 0.46 1.0 0.44 0.45 0.44 0.44 0.42 0.46 0.48 0.52
Bra003369 (TXR1)
 0.38 0.41 0.43 0.3 0.81 0.7 0.3 0.3 0.38 0.34 0.31 0.35 0.38 0.73 0.77 0.42 0.36 0.43 0.39 0.34 0.3 0.41 1.0 0.5 0.44 0.46 0.48 0.49 0.51 0.4 0.42
Bra003429 (ARP7)
 0.63 0.74 0.78 0.63 1.0 0.81 0.57 0.53 0.65 0.6 0.6 0.56 0.72 0.96 0.9 0.74 0.61 0.65 0.65 0.57 0.58 0.58 0.97 0.65 0.57 0.6 0.62 0.73 0.71 0.62 0.62
Bra003464 (NTP8)
 0.71 0.64 0.57 0.58 0.84 0.86 0.53 0.51 0.61 0.56 0.55 0.52 0.54 0.82 0.92 0.68 0.59 0.61 0.57 0.6 0.54 0.55 1.0 0.54 0.54 0.5 0.57 0.59 0.61 0.57 0.6
Bra004123 (UCH2)
 0.67 0.71 0.53 0.47 0.77 0.76 0.51 0.48 0.54 0.48 0.5 0.5 0.52 0.71 0.85 0.57 0.48 0.65 0.49 0.54 0.51 0.53 1.0 0.65 0.51 0.47 0.53 0.56 0.59 0.53 0.52
Bra004279 (MAP70-1)
 0.48 0.65 0.69 0.54 0.85 0.62 0.4 0.43 0.43 0.51 0.48 0.39 0.61 1.0 0.97 0.73 0.5 0.68 0.49 0.49 0.43 0.52 0.86 0.54 0.53 0.54 0.5 0.52 0.56 0.46 0.49
0.61 0.65 0.65 0.69 0.94 0.76 0.74 0.66 0.56 0.64 0.58 0.56 0.82 0.93 0.84 0.69 0.77 0.93 0.69 0.72 0.74 0.7 1.0 0.72 0.68 0.63 0.66 0.68 0.7 0.66 0.74
Bra005523 (SAR1)
 0.51 0.72 0.58 0.55 0.65 0.66 0.45 0.42 0.31 0.4 0.38 0.39 0.62 0.71 0.64 0.53 0.52 0.5 0.36 0.42 0.37 0.4 1.0 0.42 0.41 0.5 0.39 0.42 0.5 0.39 0.37
Bra005812 (EPCR2)
 0.52 0.47 0.43 0.39 0.71 0.86 0.3 0.32 0.36 0.29 0.29 0.33 0.31 0.81 1.0 0.38 0.36 0.62 0.37 0.41 0.33 0.34 0.86 0.37 0.31 0.27 0.34 0.39 0.42 0.37 0.44
Bra007478 (LSM6A)
 0.38 0.44 0.45 0.39 0.94 0.88 0.3 0.23 0.28 0.33 0.35 0.29 0.43 0.68 0.9 0.44 0.33 0.59 0.43 0.29 0.36 0.41 1.0 0.5 0.52 0.42 0.47 0.48 0.49 0.43 0.43
0.57 0.64 0.65 0.5 0.71 0.62 0.59 0.56 0.46 0.59 0.45 0.5 0.65 0.76 0.78 0.57 0.51 0.7 0.59 0.5 0.61 0.6 1.0 0.52 0.52 0.46 0.54 0.51 0.47 0.49 0.52
Bra007752 (SMU2)
 0.67 0.62 0.54 0.56 0.81 0.79 0.47 0.47 0.63 0.48 0.53 0.57 0.52 0.96 0.94 0.62 0.51 0.63 0.49 0.56 0.51 0.48 1.0 0.55 0.51 0.5 0.51 0.64 0.6 0.53 0.57
0.47 0.48 0.47 0.38 0.76 0.7 0.46 0.42 0.51 0.43 0.43 0.43 0.44 0.73 0.8 0.54 0.43 0.55 0.52 0.47 0.41 0.45 1.0 0.47 0.46 0.39 0.42 0.54 0.53 0.44 0.46
0.44 0.48 0.4 0.45 0.73 0.58 0.5 0.62 0.32 0.37 0.38 0.37 0.54 0.78 0.66 0.44 0.48 0.78 0.49 0.47 0.51 0.5 1.0 0.44 0.45 0.43 0.44 0.44 0.45 0.42 0.5
Bra010101 (MOS14)
 0.45 0.47 0.42 0.35 0.74 0.68 0.45 0.49 0.41 0.44 0.44 0.42 0.58 0.72 0.82 0.62 0.58 0.58 0.47 0.45 0.46 0.4 1.0 0.44 0.51 0.44 0.53 0.42 0.47 0.5 0.6
Bra010243 (PBA1)
 0.52 0.61 0.6 0.5 1.0 0.81 0.45 0.36 0.54 0.52 0.45 0.46 0.56 0.77 0.96 0.53 0.47 0.66 0.38 0.42 0.43 0.52 0.99 0.47 0.46 0.46 0.51 0.5 0.53 0.44 0.48
Bra011348 (MEF8S)
 0.62 0.47 0.44 0.4 0.66 0.68 0.33 0.29 0.55 0.42 0.43 0.39 0.38 1.0 0.99 0.42 0.36 0.68 0.44 0.48 0.33 0.43 0.7 0.32 0.32 0.29 0.38 0.41 0.48 0.46 0.48
Bra012260 (BRR2)
 0.67 0.73 0.65 0.55 0.79 0.81 0.49 0.5 0.5 0.52 0.51 0.48 0.61 0.88 1.0 0.7 0.62 0.74 0.57 0.55 0.54 0.51 1.0 0.42 0.47 0.45 0.5 0.57 0.57 0.56 0.7
Bra013349 (RABA1d)
 0.22 0.3 0.24 0.16 0.61 0.41 0.21 0.33 0.23 0.23 0.19 0.19 0.55 0.64 0.52 0.43 0.29 0.39 0.28 0.22 0.3 0.25 1.0 0.28 0.25 0.29 0.29 0.26 0.31 0.31 0.33
0.68 0.62 0.63 0.55 0.79 0.86 0.55 0.57 0.53 0.47 0.47 0.49 0.59 0.9 1.0 0.63 0.56 0.54 0.57 0.53 0.49 0.55 0.74 0.49 0.54 0.46 0.53 0.55 0.56 0.49 0.61
0.32 0.31 0.43 0.37 0.62 0.59 0.32 0.3 0.38 0.32 0.36 0.33 0.65 0.77 0.79 0.48 0.37 0.45 0.37 0.41 0.34 0.38 1.0 0.39 0.37 0.29 0.33 0.43 0.44 0.3 0.49
Bra013848 (SAE1A)
 0.47 0.48 0.38 0.36 0.84 0.74 0.43 0.47 0.48 0.4 0.43 0.34 0.72 0.82 0.84 0.57 0.51 0.54 0.54 0.48 0.46 0.48 1.0 0.43 0.47 0.42 0.43 0.42 0.47 0.48 0.6
Bra015039 (VIL1)
 0.36 0.39 0.4 0.35 0.59 0.51 0.29 0.37 0.31 0.3 0.32 0.26 0.57 0.63 0.54 0.41 0.43 0.55 0.29 0.28 0.27 0.28 1.0 0.33 0.3 0.39 0.29 0.35 0.35 0.41 0.46
Bra015396 (AXR1)
 0.51 0.46 0.54 0.5 0.73 0.74 0.57 0.51 0.51 0.53 0.51 0.46 0.64 0.59 0.73 0.58 0.61 0.61 0.54 0.48 0.51 0.55 1.0 0.5 0.49 0.43 0.53 0.52 0.54 0.51 0.62
Bra015485 (GTE4)
 0.66 0.58 0.53 0.5 0.72 0.75 0.37 0.41 0.51 0.42 0.41 0.45 0.43 0.88 1.0 0.55 0.46 0.7 0.48 0.51 0.43 0.44 0.82 0.42 0.44 0.44 0.45 0.5 0.56 0.51 0.5
Bra016961 (UBP5)
 0.55 0.54 0.56 0.46 0.75 0.74 0.37 0.39 0.45 0.38 0.38 0.39 0.44 0.85 1.0 0.49 0.41 0.59 0.42 0.42 0.41 0.4 0.79 0.41 0.36 0.4 0.33 0.44 0.47 0.42 0.5
Bra017400 (RSA1)
 0.58 0.65 0.59 0.54 0.84 0.78 0.49 0.52 0.53 0.59 0.53 0.5 0.61 0.89 0.86 0.65 0.62 0.62 0.54 0.59 0.52 0.52 1.0 0.54 0.59 0.57 0.52 0.66 0.6 0.61 0.65
Bra017422 (ETL1)
 0.69 0.68 0.65 0.46 0.89 0.98 0.52 0.55 0.52 0.47 0.48 0.43 0.57 0.94 1.0 0.64 0.56 0.6 0.58 0.57 0.46 0.57 0.92 0.56 0.56 0.54 0.6 0.59 0.66 0.54 0.72
0.37 0.49 0.29 0.32 0.85 0.59 0.36 0.42 0.28 0.4 0.47 0.39 0.62 0.64 0.63 0.43 0.48 0.8 0.55 0.51 0.47 0.51 1.0 0.56 0.59 0.38 0.42 0.58 0.51 0.52 0.54
Bra019137 (PUM6)
 0.32 0.31 0.38 0.22 0.69 0.67 0.16 0.18 0.31 0.24 0.23 0.23 0.23 0.65 0.76 0.36 0.28 0.37 0.31 0.27 0.25 0.28 1.0 0.19 0.21 0.16 0.22 0.31 0.31 0.31 0.3
Bra019432 (HIRA)
 0.54 0.53 0.61 0.42 0.78 0.77 0.39 0.41 0.5 0.44 0.47 0.47 0.49 0.79 0.98 0.59 0.53 0.6 0.48 0.44 0.41 0.43 1.0 0.4 0.42 0.43 0.45 0.46 0.5 0.5 0.61
Bra019452 (MAK10)
 0.67 0.58 0.57 0.47 0.79 0.82 0.45 0.52 0.51 0.47 0.5 0.46 0.57 0.97 1.0 0.6 0.55 0.6 0.56 0.52 0.54 0.44 0.94 0.51 0.5 0.51 0.52 0.53 0.52 0.46 0.62
Bra021701 (SUS2)
 0.52 0.58 0.47 0.41 0.71 0.7 0.36 0.43 0.46 0.42 0.4 0.42 0.5 0.89 1.0 0.59 0.46 0.61 0.46 0.44 0.38 0.39 0.83 0.32 0.35 0.39 0.39 0.39 0.45 0.42 0.58
Bra022762 (MORC4)
 0.59 0.54 0.51 0.36 0.98 0.87 0.39 0.4 0.53 0.4 0.41 0.51 0.5 0.96 0.98 0.52 0.46 0.63 0.48 0.55 0.44 0.5 1.0 0.46 0.42 0.41 0.45 0.51 0.56 0.49 0.64
Bra022873 (RAD50)
 0.57 0.65 0.47 0.39 0.84 0.77 0.31 0.34 0.32 0.28 0.31 0.27 0.38 0.77 1.0 0.46 0.42 0.64 0.49 0.38 0.39 0.37 0.85 0.31 0.31 0.27 0.31 0.29 0.31 0.29 0.51
0.61 0.61 0.63 0.47 0.86 0.86 0.43 0.48 0.42 0.4 0.39 0.38 0.57 0.85 1.0 0.62 0.54 0.7 0.55 0.45 0.45 0.46 0.92 0.58 0.55 0.56 0.53 0.58 0.59 0.46 0.69
Bra023851 (PAC1)
 0.58 0.66 0.58 0.58 0.93 0.79 0.53 0.56 0.59 0.59 0.53 0.59 0.71 0.92 0.85 0.59 0.53 0.74 0.57 0.53 0.59 0.59 1.0 0.58 0.58 0.56 0.58 0.66 0.62 0.56 0.54
0.61 0.65 0.6 0.5 0.79 0.73 0.42 0.44 0.55 0.39 0.42 0.48 0.48 1.0 0.97 0.57 0.49 0.66 0.56 0.51 0.41 0.48 0.81 0.46 0.48 0.45 0.46 0.54 0.57 0.43 0.54
0.48 0.43 0.39 0.36 0.77 0.74 0.37 0.29 0.35 0.37 0.35 0.33 0.4 0.65 0.85 0.46 0.36 0.58 0.49 0.41 0.36 0.39 1.0 0.5 0.5 0.41 0.45 0.49 0.45 0.45 0.44
0.59 0.79 0.61 0.54 0.73 0.74 0.49 0.47 0.4 0.4 0.49 0.36 0.48 0.97 1.0 0.53 0.47 0.69 0.5 0.44 0.46 0.38 0.86 0.46 0.46 0.46 0.5 0.49 0.5 0.34 0.6
Bra028579 (TOP2)
 0.43 0.46 0.32 0.21 0.79 0.61 0.28 0.27 0.39 0.36 0.34 0.35 0.51 0.77 0.93 0.44 0.34 0.64 0.41 0.32 0.34 0.35 1.0 0.44 0.41 0.35 0.39 0.46 0.41 0.32 0.45
0.7 0.72 0.66 0.58 0.86 0.92 0.7 0.67 0.69 0.51 0.53 0.48 0.7 0.9 1.0 0.64 0.64 0.72 0.59 0.63 0.55 0.54 0.91 0.6 0.67 0.6 0.62 0.71 0.71 0.65 0.81
0.63 0.62 0.62 0.54 0.82 0.81 0.48 0.5 0.55 0.51 0.5 0.45 0.53 0.79 0.88 0.62 0.54 0.61 0.52 0.5 0.48 0.53 1.0 0.49 0.5 0.5 0.49 0.55 0.59 0.54 0.53
Bra029530 (IEN1)
 0.48 0.45 0.44 0.37 0.79 0.8 0.37 0.37 0.49 0.42 0.41 0.4 0.44 0.82 0.99 0.55 0.46 0.58 0.5 0.46 0.41 0.45 1.0 0.41 0.39 0.41 0.42 0.47 0.5 0.45 0.52
Bra030524 (UVH6)
 0.6 0.47 0.53 0.42 0.79 0.8 0.45 0.44 0.45 0.42 0.47 0.49 0.52 0.81 1.0 0.64 0.52 0.52 0.51 0.47 0.47 0.45 0.73 0.47 0.44 0.44 0.47 0.52 0.5 0.49 0.54
Bra030662 (NRPC7)
 0.21 0.19 0.21 0.12 0.47 0.43 0.24 0.28 0.2 0.16 0.17 0.19 0.42 0.38 0.53 0.2 0.34 0.24 0.2 0.14 0.21 0.15 1.0 0.22 0.19 0.15 0.23 0.24 0.23 0.23 0.32
0.64 0.6 0.59 0.57 0.84 0.71 0.55 0.48 0.58 0.6 0.52 0.55 0.69 1.0 0.93 0.66 0.59 0.72 0.59 0.57 0.52 0.53 0.93 0.58 0.58 0.5 0.48 0.64 0.6 0.55 0.52
Bra032014 (PWO1)
 0.65 0.52 0.5 0.44 0.89 0.87 0.45 0.5 0.55 0.48 0.5 0.53 0.54 0.87 0.98 0.62 0.54 0.66 0.61 0.53 0.5 0.52 1.0 0.53 0.59 0.59 0.59 0.6 0.66 0.65 0.72
0.26 0.34 0.36 0.26 0.96 0.7 0.34 0.26 0.4 0.3 0.41 0.4 0.43 0.7 1.0 0.43 0.39 0.89 0.43 0.46 0.34 0.51 1.0 0.45 0.45 0.32 0.44 0.42 0.31 0.32 0.37
Bra032664 (NOT1)
 0.67 0.73 0.62 0.54 0.82 0.77 0.45 0.51 0.51 0.49 0.46 0.47 0.48 0.88 1.0 0.62 0.53 0.72 0.59 0.51 0.47 0.48 0.91 0.51 0.53 0.51 0.57 0.54 0.58 0.55 0.73
Bra034627 (gamma2-COP)
 0.56 0.64 0.51 0.49 1.0 0.75 0.42 0.43 0.49 0.5 0.47 0.45 0.54 0.94 0.9 0.59 0.51 0.63 0.55 0.53 0.4 0.46 0.85 0.51 0.52 0.52 0.49 0.6 0.54 0.48 0.54
0.36 0.41 0.41 0.34 0.65 0.65 0.32 0.36 0.41 0.38 0.36 0.33 0.77 0.7 0.74 0.49 0.48 0.64 0.43 0.36 0.4 0.43 1.0 0.43 0.42 0.37 0.38 0.46 0.49 0.41 0.48
Bra035938 (PIA2)
 0.42 0.39 0.46 0.28 0.8 0.6 0.34 0.27 0.42 0.45 0.36 0.33 0.53 0.82 0.77 0.52 0.47 0.46 0.43 0.44 0.33 0.4 1.0 0.46 0.45 0.31 0.42 0.43 0.46 0.4 0.42
Bra036970 (ADA1B)
 0.41 0.37 0.5 0.47 0.74 0.69 0.33 0.37 0.38 0.33 0.26 0.27 0.56 0.7 0.72 0.42 0.4 0.55 0.34 0.35 0.38 0.39 1.0 0.39 0.41 0.28 0.33 0.35 0.42 0.38 0.44
Bra037299 (NERD)
 0.59 0.61 0.58 0.49 0.86 0.8 0.47 0.52 0.56 0.51 0.51 0.53 0.55 0.91 1.0 0.59 0.54 0.7 0.55 0.55 0.49 0.49 0.96 0.48 0.51 0.45 0.54 0.52 0.6 0.59 0.69
0.55 0.67 0.64 0.5 0.81 0.82 0.49 0.55 0.49 0.55 0.5 0.47 0.62 0.84 0.86 0.69 0.59 0.63 0.58 0.59 0.52 0.51 1.0 0.55 0.61 0.6 0.63 0.53 0.64 0.63 0.67
Bra037810 (RABA4a)
 0.4 0.6 0.51 0.49 0.67 0.61 0.34 0.35 0.37 0.36 0.33 0.32 0.54 0.8 0.61 0.36 0.33 0.51 0.28 0.26 0.27 0.33 1.0 0.41 0.36 0.31 0.32 0.38 0.36 0.39 0.37
0.52 0.59 0.6 0.55 0.89 0.71 0.47 0.5 0.5 0.51 0.47 0.49 0.7 0.86 0.89 0.63 0.58 0.83 0.58 0.6 0.57 0.59 1.0 0.6 0.57 0.57 0.58 0.57 0.59 0.56 0.55
0.51 0.45 0.52 0.34 0.82 0.84 0.38 0.43 0.39 0.35 0.35 0.38 0.46 0.76 1.0 0.49 0.39 0.53 0.38 0.38 0.35 0.35 0.91 0.38 0.37 0.33 0.37 0.39 0.42 0.4 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)