1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_125 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000060 (AGT3)
 0.15 0.08 0.15 0.1 0.99 0.42 0.07 0.04 0.46 0.1 0.14 0.13 0.05 0.38 0.37 0.11 0.11 0.09 0.1 0.18 0.11 0.1 0.22 0.12 0.12 0.15 0.11 0.46 1.0 0.15 0.1
0.43 0.37 0.47 0.28 1.0 0.69 0.32 0.31 0.5 0.44 0.45 0.44 0.31 0.51 0.53 0.39 0.32 0.56 0.47 0.38 0.36 0.39 0.29 0.36 0.34 0.34 0.37 0.55 0.64 0.39 0.31
Bra000416 (ABIL1)
 0.46 0.38 0.41 0.38 0.95 0.75 0.44 0.28 0.61 0.57 0.55 0.54 0.44 1.0 0.78 0.57 0.39 0.46 0.76 0.52 0.51 0.43 0.14 0.46 0.46 0.47 0.38 0.47 0.46 0.48 0.44
Bra000456 (CHB1)
 0.63 0.55 0.64 0.57 1.0 0.78 0.43 0.4 0.61 0.52 0.55 0.61 0.62 0.76 0.67 0.57 0.56 0.69 0.48 0.6 0.52 0.48 0.5 0.52 0.53 0.45 0.48 0.61 0.67 0.54 0.54
0.67 0.56 0.43 0.36 1.0 0.49 0.35 0.4 0.55 0.42 0.42 0.46 0.41 0.64 0.55 0.44 0.31 0.91 0.57 0.38 0.34 0.35 0.32 0.31 0.29 0.16 0.24 0.45 0.35 0.33 0.25
Bra004456 (PFG1)
 0.02 0.03 0.02 0.05 1.0 0.55 0.07 0.04 0.12 0.06 0.11 0.08 0.28 0.62 0.99 0.18 0.15 0.83 0.45 0.12 0.13 0.07 0.11 0.08 0.09 0.1 0.15 0.43 0.32 0.31 0.27
Bra006085 (KNAT4)
 0.36 0.39 0.39 0.24 1.0 0.45 0.16 0.15 0.36 0.34 0.26 0.24 0.16 0.41 0.67 0.24 0.21 0.18 0.21 0.26 0.2 0.22 0.32 0.22 0.19 0.14 0.22 0.34 0.42 0.38 0.22
0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.3 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.13 0.19 0.02 0.01 0.06 0.04 0.02 0.01 0.0 0.04 0.05 0.02 0.01 0.01 0.23 0.17 0.07 0.08
0.14 0.03 0.03 0.07 1.0 0.46 0.15 0.15 0.34 0.15 0.16 0.15 0.1 0.46 0.42 0.14 0.14 0.07 0.11 0.13 0.12 0.11 0.11 0.16 0.15 0.18 0.11 0.57 0.5 0.17 0.08
Bra006908 (SEX4)
 0.18 0.14 0.09 0.08 1.0 0.44 0.09 0.1 0.12 0.14 0.12 0.1 0.06 0.45 0.45 0.13 0.08 0.41 0.34 0.17 0.1 0.09 0.12 0.18 0.15 0.12 0.14 0.39 0.35 0.48 0.27
Bra007343 (ExAD)
 0.27 0.18 0.27 0.17 1.0 0.45 0.1 0.14 0.19 0.16 0.15 0.14 0.17 0.4 0.34 0.16 0.12 0.25 0.18 0.13 0.13 0.14 0.33 0.22 0.23 0.22 0.2 0.35 0.4 0.21 0.16
Bra007646 (NGA2)
 0.39 0.24 0.22 0.24 1.0 0.84 0.38 0.42 0.59 0.39 0.36 0.4 0.3 0.79 0.68 0.3 0.39 0.51 0.32 0.34 0.38 0.34 0.31 0.32 0.36 0.3 0.33 0.73 0.66 0.45 0.41
Bra008557 (CTPS3)
 0.91 0.81 0.66 0.68 0.95 0.77 0.53 0.54 0.84 0.6 0.65 0.7 0.47 1.0 0.89 0.57 0.44 0.76 0.65 0.59 0.56 0.55 0.3 0.54 0.56 0.51 0.51 0.71 0.84 0.64 0.71
Bra008612 (GLN1;4)
 0.3 0.12 0.13 0.16 1.0 0.66 0.05 0.12 0.32 0.12 0.18 0.12 0.02 0.12 0.34 0.12 0.05 0.0 0.08 0.15 0.1 0.1 0.13 0.17 0.14 0.15 0.13 0.81 0.65 0.21 0.07
Bra008705 (MYB16)
 0.28 0.18 0.27 0.17 1.0 0.77 0.5 0.43 0.63 0.49 0.57 0.55 0.45 0.9 0.68 0.64 0.56 0.46 0.6 0.65 0.5 0.59 0.28 0.44 0.39 0.11 0.38 0.38 0.4 0.27 0.39
Bra009326 (ATAIH)
 0.29 0.26 0.25 0.3 1.0 0.54 0.14 0.17 0.35 0.33 0.26 0.29 0.08 0.41 0.49 0.19 0.12 0.06 0.13 0.14 0.17 0.21 0.16 0.29 0.27 0.22 0.26 0.61 0.75 0.58 0.24
Bra010738 (FP6)
 0.46 0.4 0.36 0.26 1.0 0.41 0.15 0.18 0.39 0.25 0.25 0.23 0.29 0.47 0.55 0.2 0.19 0.52 0.26 0.17 0.15 0.2 0.18 0.27 0.25 0.25 0.25 0.38 0.35 0.33 0.34
Bra011489 (LEJ1)
 0.17 0.12 0.01 0.02 1.0 0.35 0.04 0.05 0.06 0.06 0.05 0.07 0.03 0.33 0.49 0.06 0.02 0.1 0.12 0.04 0.04 0.05 0.03 0.04 0.02 0.02 0.03 0.32 0.17 0.09 0.11
0.29 0.23 0.17 0.09 1.0 0.49 0.14 0.07 0.3 0.14 0.07 0.25 0.04 0.36 0.34 0.09 0.11 0.05 0.26 0.09 0.1 0.06 0.16 0.29 0.17 0.03 0.1 0.33 0.3 0.25 0.17
0.19 0.09 0.01 0.02 1.0 0.39 0.03 0.02 0.11 0.03 0.05 0.08 0.05 0.22 0.22 0.02 0.02 0.34 0.17 0.11 0.02 0.1 0.14 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.04 0.04 0.09
Bra014307 (MBP2)
 0.52 0.43 0.63 0.32 1.0 0.71 0.4 0.39 0.32 0.42 0.35 0.64 0.24 0.32 0.86 0.46 0.46 0.73 0.47 0.41 0.33 0.37 0.1 0.29 0.31 0.22 0.28 0.27 0.4 0.6 0.63
Bra014309 (MBP2)
 0.48 0.29 0.6 0.25 1.0 0.65 0.27 0.21 0.2 0.28 0.23 0.41 0.06 0.2 0.57 0.35 0.33 0.35 0.29 0.17 0.24 0.21 0.01 0.07 0.11 0.08 0.09 0.08 0.12 0.14 0.18
Bra016246 (CLE26)
 0.55 0.33 0.32 0.32 1.0 0.51 0.19 0.21 0.37 0.34 0.36 0.3 0.15 0.66 0.61 0.39 0.32 0.39 0.33 0.31 0.27 0.2 0.13 0.29 0.34 0.33 0.28 0.36 0.4 0.32 0.23
Bra016747 (NRT2.5)
 0.03 0.0 0.03 0.0 1.0 0.44 0.02 0.0 0.08 0.05 0.06 0.02 0.06 0.15 0.51 0.02 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.09 0.04 0.02 0.0 0.02 0.02 0.1 0.06 0.06 0.03
Bra016871 (CuAO-zeta)
 0.49 0.38 0.31 0.23 1.0 0.39 0.15 0.14 0.39 0.29 0.27 0.21 0.21 0.62 0.66 0.23 0.23 0.36 0.23 0.22 0.16 0.19 0.27 0.18 0.19 0.21 0.24 0.35 0.47 0.4 0.3
0.43 0.16 0.16 0.07 1.0 0.59 0.17 0.17 0.35 0.29 0.28 0.21 0.16 0.43 0.72 0.3 0.21 0.12 0.34 0.29 0.19 0.22 0.28 0.13 0.15 0.16 0.19 0.2 0.44 0.22 0.21
Bra018643 (AXS2)
 0.7 0.7 0.59 0.57 0.97 0.75 0.52 0.52 0.67 0.68 0.72 0.7 0.58 0.72 0.9 0.73 0.57 1.0 0.73 0.65 0.5 0.57 0.42 0.58 0.58 0.55 0.56 0.62 0.61 0.64 0.55
0.63 0.48 0.4 0.24 1.0 0.59 0.32 0.25 0.46 0.46 0.51 0.4 0.34 0.48 0.71 0.53 0.41 0.54 0.52 0.37 0.41 0.39 0.34 0.31 0.36 0.29 0.32 0.3 0.38 0.32 0.3
Bra021829 (PKT3)
 0.27 0.22 0.23 0.16 1.0 0.49 0.12 0.07 0.22 0.07 0.03 0.16 0.11 0.51 0.33 0.06 0.07 0.16 0.07 0.08 0.08 0.06 0.24 0.26 0.15 0.12 0.19 0.25 0.18 0.11 0.12
0.51 0.44 0.61 0.39 1.0 0.9 0.24 0.35 0.37 0.35 0.32 0.31 0.3 0.86 0.73 0.32 0.29 0.57 0.45 0.29 0.43 0.33 0.81 0.48 0.51 0.44 0.56 0.52 0.53 0.45 0.42
Bra022648 (PMEPCRF)
 0.3 0.3 0.33 0.27 1.0 0.58 0.3 0.27 0.44 0.48 0.41 0.35 0.2 0.72 0.65 0.37 0.43 0.52 0.51 0.28 0.31 0.32 0.29 0.34 0.4 0.44 0.29 0.48 0.44 0.48 0.3
Bra022882 (VCC)
 0.16 0.03 0.16 0.05 1.0 0.41 0.04 0.06 0.18 0.17 0.18 0.1 0.3 0.38 0.48 0.17 0.13 0.24 0.27 0.22 0.17 0.17 0.38 0.18 0.17 0.07 0.13 0.27 0.2 0.43 0.18
0.59 0.38 0.57 0.36 1.0 0.59 0.25 0.24 0.6 0.46 0.52 0.53 0.34 0.74 0.66 0.37 0.34 0.45 0.55 0.34 0.37 0.38 0.16 0.34 0.33 0.34 0.34 0.61 0.73 0.56 0.45
0.2 0.43 0.2 0.14 0.78 0.49 0.05 0.05 0.47 0.17 0.24 0.18 0.06 1.0 0.72 0.1 0.15 0.17 0.11 0.12 0.14 0.15 0.26 0.19 0.21 0.21 0.28 0.55 0.88 0.46 0.2
Bra024716 (UPS5)
 0.38 0.14 0.12 0.1 0.89 0.51 0.07 0.09 0.39 0.19 0.28 0.19 0.04 0.57 0.62 0.09 0.07 0.01 0.06 0.15 0.18 0.19 0.1 0.24 0.23 0.13 0.17 1.0 1.0 0.26 0.1
Bra024901 (GABP)
 0.19 0.29 0.15 0.18 1.0 0.31 0.02 0.05 0.04 0.05 0.01 0.02 0.0 0.13 0.24 0.02 0.06 0.08 0.01 0.15 0.04 0.05 0.39 0.02 0.02 0.09 0.02 0.22 0.12 0.07 0.06
Bra028335 (CIL2)
 0.4 0.42 0.39 0.34 1.0 0.65 0.38 0.3 0.66 0.58 0.63 0.59 0.45 0.86 0.72 0.55 0.41 0.41 0.56 0.59 0.55 0.52 0.37 0.47 0.48 0.47 0.42 0.49 0.53 0.42 0.43
0.19 0.15 0.2 0.07 1.0 0.43 0.16 0.12 0.38 0.15 0.26 0.16 0.14 0.7 0.57 0.26 0.27 0.68 0.31 0.34 0.23 0.21 0.16 0.25 0.17 0.14 0.19 0.27 0.29 0.23 0.18
0.24 0.18 0.37 0.2 1.0 0.5 0.17 0.08 0.23 0.21 0.23 0.19 0.18 0.35 0.35 0.3 0.23 0.25 0.24 0.17 0.14 0.16 0.37 0.21 0.19 0.15 0.17 0.28 0.29 0.27 0.16
Bra031017 (MPK8)
 0.52 0.5 0.55 0.36 0.97 0.75 0.44 0.51 0.71 0.7 0.62 0.53 0.57 1.0 0.93 0.62 0.64 0.59 0.59 0.59 0.6 0.61 0.58 0.56 0.57 0.47 0.5 0.62 0.63 0.54 0.46
Bra031961 (MLK2)
 0.73 0.47 0.58 0.59 1.0 0.64 0.31 0.38 0.65 0.47 0.44 0.45 0.24 0.86 0.72 0.42 0.39 0.66 0.51 0.38 0.42 0.43 0.17 0.38 0.36 0.35 0.45 0.55 0.67 0.48 0.51
Bra032763 (ARPC4)
 0.6 0.57 0.55 0.5 1.0 0.78 0.35 0.26 0.48 0.39 0.39 0.44 0.43 0.69 0.72 0.41 0.38 0.46 0.45 0.42 0.42 0.5 0.62 0.47 0.49 0.52 0.46 0.45 0.53 0.5 0.4
Bra033088 (KIN11)
 0.24 0.14 0.13 0.08 1.0 0.55 0.24 0.17 0.31 0.21 0.3 0.27 0.18 0.48 0.66 0.18 0.1 0.55 0.42 0.18 0.14 0.14 0.3 0.25 0.26 0.15 0.17 0.29 0.37 0.3 0.3
Bra033241 (PRD3)
 0.32 0.41 0.27 0.24 1.0 0.44 0.1 0.13 0.33 0.17 0.21 0.17 0.19 0.35 0.46 0.12 0.16 0.15 0.16 0.13 0.13 0.16 0.39 0.1 0.07 0.09 0.11 0.23 0.17 0.25 0.08
Bra033567 (PLC1)
 0.6 0.28 0.23 0.22 1.0 0.56 0.34 0.21 0.55 0.41 0.47 0.39 0.1 0.96 0.77 0.54 0.45 0.41 0.69 0.5 0.47 0.39 0.07 0.41 0.42 0.41 0.38 0.36 0.4 0.38 0.24
0.46 0.41 0.43 0.39 1.0 0.86 0.41 0.42 0.5 0.37 0.52 0.41 0.39 0.63 0.87 0.52 0.46 0.44 0.43 0.41 0.41 0.39 0.42 0.49 0.52 0.4 0.48 0.6 0.58 0.45 0.45
Bra038348 (PPRT1)
 0.19 0.23 0.3 0.13 1.0 0.44 0.11 0.1 0.34 0.26 0.22 0.12 0.23 0.35 0.33 0.17 0.23 0.26 0.33 0.25 0.17 0.19 0.34 0.12 0.07 0.06 0.12 0.15 0.17 0.17 0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)