1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_224 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000591 (AtAVT3B)
 0.16 0.01 0.04 0.05 0.3 0.37 0.17 0.04 0.6 0.37 0.34 0.25 0.3 1.0 0.91 0.36 0.21 0.21 0.67 0.39 0.19 0.41 0.15 0.63 0.56 0.38 0.42 0.49 0.54 0.23 0.4
Bra000848 (AOP3)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.13 0.36 0.08 0.05 0.49 0.18 0.28 0.22 0.24 1.0 0.86 0.55 0.22 0.33 0.54 0.34 0.26 0.41 0.47 0.97 0.85 0.63 0.67 0.69 0.81 0.3 0.57
0.04 0.02 0.04 0.04 0.52 0.5 0.4 0.28 0.61 0.55 0.61 0.45 0.35 0.98 1.0 0.65 0.63 0.54 0.74 0.52 0.53 0.45 0.21 0.71 0.58 0.3 0.53 0.46 0.43 0.29 0.3
Bra003062 (PMEPCRF)
 0.08 0.05 0.06 0.08 0.79 0.66 0.29 0.23 0.58 0.66 0.49 0.58 0.29 1.0 0.93 0.67 0.58 0.58 0.67 0.56 0.44 0.51 0.36 0.5 0.5 0.44 0.5 0.34 0.36 0.29 0.23
0.29 0.26 0.33 0.19 0.83 0.73 0.46 0.5 0.6 0.51 0.44 0.45 0.52 0.83 1.0 0.63 0.53 0.62 0.59 0.62 0.5 0.47 0.48 0.6 0.68 0.38 0.57 0.61 0.85 0.63 0.48
Bra004446 (ATL64)
 0.07 0.04 0.05 0.07 0.46 0.36 0.17 0.13 0.46 0.31 0.3 0.29 0.21 1.0 0.87 0.41 0.29 0.09 0.36 0.3 0.39 0.27 0.4 0.45 0.52 0.18 0.27 0.32 0.66 0.25 0.25
Bra004519 (TAC1)
 0.33 0.16 0.28 0.27 0.73 0.62 0.59 0.61 0.57 0.49 0.63 0.55 0.44 0.89 1.0 0.77 0.57 0.79 0.67 0.75 0.57 0.54 0.25 0.8 0.85 0.68 0.64 0.59 0.72 0.45 0.39
Bra004737 (PAO2)
 0.25 0.2 0.17 0.18 0.45 0.76 0.48 0.44 0.71 0.58 0.56 0.57 0.53 0.95 1.0 0.8 0.6 0.56 0.73 0.63 0.61 0.67 0.37 0.52 0.5 0.37 0.5 0.58 0.54 0.38 0.39
Bra004878 (ERF34)
 0.06 0.02 0.05 0.05 0.38 0.43 0.34 0.4 0.52 0.35 0.39 0.37 0.26 0.76 1.0 0.49 0.35 0.39 0.56 0.42 0.29 0.34 0.21 0.58 0.55 0.09 0.51 0.38 0.56 0.38 0.62
Bra005751 (LCL1)
 0.07 0.05 0.08 0.14 0.25 0.6 0.49 0.32 0.48 0.41 0.52 0.33 0.44 1.0 0.94 0.71 0.6 0.58 0.69 0.62 0.71 0.61 0.21 0.56 0.56 0.42 0.49 0.36 0.4 0.23 0.41
Bra006782 (NPL1)
 0.23 0.11 0.12 0.17 0.62 0.8 0.37 0.29 0.63 0.48 0.5 0.45 0.33 0.84 1.0 0.61 0.55 0.41 0.69 0.52 0.44 0.49 0.19 0.6 0.63 0.47 0.48 0.65 0.7 0.41 0.46
0.36 0.21 0.24 0.23 0.9 0.88 0.67 0.53 0.64 0.62 0.68 0.57 0.7 1.0 0.9 0.74 0.66 0.7 0.83 0.72 0.63 0.64 0.47 0.93 0.87 0.51 0.79 0.63 0.72 0.54 0.67
Bra011758 (CYP81F3)
 0.18 0.11 0.09 0.05 0.67 1.0 0.36 0.18 0.53 0.36 0.39 0.38 0.18 0.91 0.92 0.77 0.65 0.51 1.0 0.66 0.52 0.49 0.25 0.76 0.76 0.39 0.51 0.55 0.71 0.39 0.26
0.11 0.06 0.06 0.13 0.65 0.52 0.48 0.29 0.44 0.37 0.53 0.41 0.33 0.96 1.0 0.78 0.48 0.61 0.48 0.43 0.3 0.33 0.33 0.49 0.47 0.37 0.34 0.58 0.59 0.37 0.52
Bra012961 (HAG1)
 0.13 0.02 0.01 0.02 0.26 0.29 0.19 0.12 0.71 0.48 0.46 0.44 0.39 0.78 1.0 0.61 0.4 0.38 0.59 0.62 0.34 0.49 0.2 0.49 0.59 0.43 0.47 0.41 0.42 0.35 0.49
Bra013049 (UBC29)
 0.2 0.14 0.1 0.06 0.5 0.74 0.44 0.22 0.47 0.39 0.47 0.45 0.32 1.0 0.89 0.74 0.45 0.4 0.79 0.55 0.67 0.51 0.29 0.58 0.5 0.48 0.42 0.48 0.39 0.25 0.18
Bra013324 (IPGA1)
 0.21 0.2 0.23 0.27 0.83 0.69 0.56 0.72 0.69 0.56 0.64 0.58 0.73 1.0 0.92 0.63 0.46 0.61 0.59 0.51 0.52 0.51 0.2 0.44 0.42 0.39 0.43 0.38 0.47 0.41 0.41
Bra014127 (DHNAT1)
 0.29 0.27 0.36 0.19 0.86 0.7 0.36 0.29 0.85 0.46 0.4 0.4 0.4 0.86 0.94 0.56 0.34 0.36 0.49 0.51 0.2 0.55 1.0 0.77 0.82 0.59 0.7 0.65 0.79 0.58 0.45
Bra016517 (IAA22)
 0.22 0.15 0.17 0.24 0.3 0.67 0.37 0.32 0.56 0.37 0.48 0.43 0.24 0.79 1.0 0.44 0.31 0.39 0.6 0.5 0.38 0.32 0.11 0.36 0.4 0.27 0.34 0.46 0.6 0.29 0.29
Bra017191 (NAKR2)
 0.21 0.09 0.11 0.18 0.41 0.77 0.32 0.34 0.37 0.27 0.34 0.33 0.4 0.79 1.0 0.45 0.31 0.38 0.59 0.43 0.39 0.41 0.13 0.48 0.49 0.28 0.41 0.46 0.56 0.3 0.44
0.16 0.14 0.07 0.16 0.54 0.74 0.48 0.46 0.59 0.42 0.4 0.48 0.59 0.87 1.0 0.56 0.5 0.73 0.64 0.44 0.37 0.52 0.22 0.54 0.52 0.36 0.45 0.39 0.41 0.35 0.55
0.39 0.48 0.6 0.47 0.62 0.79 0.53 0.49 0.61 0.6 0.61 0.57 0.6 0.99 1.0 0.69 0.58 0.69 0.67 0.65 0.56 0.66 0.38 0.71 0.69 0.62 0.71 0.65 0.75 0.61 0.68
0.26 0.28 0.31 0.28 0.83 0.85 0.51 0.46 0.55 0.56 0.58 0.51 0.53 0.92 1.0 0.79 0.73 0.8 0.8 0.64 0.6 0.51 0.43 0.74 0.74 0.36 0.84 0.69 0.75 0.61 0.71
0.15 0.13 0.13 0.17 0.79 0.73 0.48 0.47 0.82 0.57 0.63 0.57 0.37 1.0 0.86 0.56 0.52 0.65 0.57 0.57 0.5 0.48 0.27 0.61 0.62 0.47 0.59 0.69 0.83 0.52 0.52
Bra020032 (MAGL16)
 0.19 0.19 0.32 0.25 0.62 0.57 0.47 0.45 0.64 0.77 0.46 0.6 0.5 1.0 0.85 0.7 0.69 0.43 0.7 0.6 0.66 0.46 0.23 0.5 0.49 0.33 0.51 0.62 0.66 0.48 0.56
0.26 0.27 0.25 0.19 0.67 0.7 0.54 0.44 0.53 0.56 0.48 0.53 0.63 0.89 1.0 0.56 0.51 0.67 0.71 0.68 0.64 0.68 0.56 0.73 0.6 0.46 0.65 0.45 0.46 0.33 0.39
Bra022325 (ASPG1)
 0.19 0.22 0.22 0.15 0.78 0.65 0.41 0.34 0.75 0.57 0.47 0.58 0.27 1.0 0.74 0.56 0.45 0.4 0.68 0.52 0.5 0.44 0.29 0.53 0.47 0.28 0.5 0.5 0.54 0.46 0.28
0.13 0.05 0.08 0.07 0.68 0.65 0.51 0.46 0.51 0.45 0.43 0.41 0.46 0.97 1.0 0.64 0.45 0.65 0.63 0.57 0.44 0.4 0.38 0.75 0.75 0.4 0.59 0.75 0.66 0.47 0.51
Bra023087 (PGP1)
 0.33 0.3 0.3 0.25 0.99 0.76 0.47 0.51 0.71 0.57 0.67 0.71 0.6 1.0 0.98 0.71 0.52 0.76 0.73 0.73 0.68 0.64 0.43 0.57 0.64 0.5 0.65 0.57 0.6 0.58 0.66
Bra023169 (AK-HSDH)
 0.64 0.47 0.41 0.36 0.53 0.73 0.33 0.29 0.59 0.51 0.51 0.46 0.35 0.87 1.0 0.58 0.45 0.34 0.67 0.51 0.5 0.58 0.17 0.7 0.7 0.58 0.63 0.55 0.63 0.44 0.47
Bra024150 (VSP3)
 0.26 0.11 0.15 0.18 0.7 0.74 0.49 0.38 0.87 0.64 0.71 0.57 0.59 1.0 0.81 0.57 0.4 0.24 0.41 0.54 0.56 0.47 0.33 0.45 0.4 0.42 0.46 0.57 0.64 0.4 0.36
Bra024749 (KCS5)
 0.16 0.18 0.22 0.21 0.75 0.63 0.47 0.36 0.74 0.67 0.69 0.67 0.49 1.0 0.97 0.62 0.67 0.44 0.54 0.57 0.57 0.57 0.14 0.59 0.56 0.42 0.58 0.44 0.53 0.4 0.41
Bra025523 (DRB5)
 0.11 0.13 0.14 0.1 0.4 0.83 0.31 0.27 0.38 0.3 0.3 0.27 0.37 0.95 1.0 0.51 0.36 0.34 0.68 0.51 0.56 0.42 0.29 0.52 0.46 0.3 0.38 0.44 0.43 0.29 0.25
Bra025819 (LTI45)
 0.09 0.05 0.09 0.17 0.6 0.63 0.31 0.25 0.44 0.44 0.45 0.4 0.3 0.89 1.0 0.53 0.37 0.24 0.46 0.45 0.41 0.39 0.54 0.65 0.57 0.55 0.4 0.34 0.35 0.21 0.22
Bra025904 (PPRT3)
 0.26 0.15 0.22 0.13 0.6 0.73 0.32 0.29 0.69 0.47 0.43 0.48 0.42 0.93 1.0 0.45 0.32 0.7 0.59 0.47 0.34 0.55 0.31 0.42 0.44 0.37 0.49 0.5 0.62 0.48 0.5
0.28 0.27 0.3 0.26 0.54 0.67 0.64 0.6 0.72 0.62 0.65 0.62 0.48 0.82 1.0 0.75 0.69 0.73 0.88 0.83 0.64 0.65 0.43 0.71 0.78 0.59 0.74 0.71 0.63 0.44 0.47
0.32 0.27 0.32 0.33 0.69 0.8 0.54 0.4 0.53 0.53 0.54 0.5 0.47 0.81 1.0 0.77 0.57 0.55 0.68 0.71 0.53 0.65 0.65 0.6 0.61 0.51 0.59 0.67 0.75 0.55 0.52
Bra028599 (FLC)
 0.36 0.25 0.23 0.18 0.47 0.63 0.45 0.4 0.78 0.57 0.64 0.52 0.46 0.87 1.0 0.66 0.57 0.46 0.71 0.64 0.58 0.65 0.34 0.6 0.61 0.5 0.59 0.54 0.68 0.51 0.58
Bra028971 (WRKY20)
 0.19 0.09 0.24 0.1 0.67 0.57 0.46 0.38 0.48 0.48 0.43 0.47 0.4 1.0 0.97 0.66 0.49 0.56 0.52 0.51 0.47 0.58 0.39 0.42 0.55 0.28 0.37 0.59 0.59 0.4 0.37
Bra029288 (BAG2)
 0.09 0.07 0.05 0.08 0.77 0.67 0.48 0.39 0.68 0.58 0.6 0.59 0.48 1.0 0.96 0.64 0.49 0.73 0.61 0.62 0.48 0.54 0.12 0.63 0.49 0.26 0.46 0.43 0.63 0.42 0.65
Bra030028 (PUB6)
 0.21 0.2 0.17 0.18 0.53 0.79 0.5 0.31 0.57 0.49 0.44 0.41 0.36 0.9 1.0 0.72 0.58 0.61 0.59 0.64 0.46 0.52 0.43 0.55 0.5 0.31 0.49 0.52 0.71 0.41 0.47
0.15 0.08 0.22 0.07 0.81 0.73 0.54 0.37 0.52 0.46 0.69 0.49 0.4 0.98 1.0 0.73 0.64 0.4 0.62 0.62 0.52 0.5 0.4 0.72 0.82 0.61 0.6 0.45 0.54 0.33 0.38
Bra032708 (IIL1)
 0.25 0.25 0.2 0.22 0.54 0.69 0.38 0.38 0.64 0.52 0.56 0.5 0.38 1.0 1.0 0.73 0.54 0.52 0.64 0.58 0.58 0.72 0.57 0.83 0.79 0.66 0.75 0.62 0.6 0.39 0.5
0.54 0.42 0.49 0.43 0.83 0.99 0.7 0.63 0.67 0.63 0.63 0.57 0.69 0.87 1.0 0.8 0.73 0.71 0.81 0.79 0.75 0.8 0.64 0.76 0.81 0.56 0.69 0.75 0.72 0.56 0.59
0.43 0.31 0.29 0.22 0.94 0.77 0.5 0.33 0.75 0.62 0.7 0.65 0.62 0.86 1.0 0.73 0.6 0.67 0.88 0.71 0.68 0.76 0.94 0.93 0.87 0.7 0.81 0.73 0.74 0.52 0.4
0.15 0.16 0.18 0.23 0.31 0.37 0.29 0.17 0.54 0.4 0.41 0.41 0.34 0.97 1.0 0.47 0.33 0.21 0.44 0.43 0.5 0.4 0.33 0.61 0.5 0.47 0.51 0.49 0.63 0.3 0.45
0.32 0.28 0.31 0.29 0.57 0.65 0.48 0.49 0.56 0.55 0.54 0.53 0.58 0.8 1.0 0.68 0.65 0.66 0.63 0.65 0.51 0.61 0.42 0.58 0.64 0.47 0.63 0.52 0.57 0.4 0.48
Bra034718 (BRG3)
 0.36 0.38 0.25 0.25 0.39 0.8 0.43 0.17 0.53 0.46 0.47 0.43 0.3 0.88 1.0 0.64 0.47 0.28 0.63 0.49 0.43 0.53 0.11 0.6 0.56 0.24 0.52 0.31 0.41 0.26 0.38
Bra034752 (FDM3)
 0.29 0.32 0.27 0.26 0.78 0.81 0.51 0.46 0.73 0.65 0.61 0.58 0.54 1.0 1.0 0.73 0.62 0.61 0.63 0.71 0.57 0.65 0.46 0.64 0.58 0.37 0.49 0.63 0.73 0.53 0.73
Bra035446 (NAT2)
 0.15 0.11 0.14 0.19 0.66 1.0 0.49 0.44 0.67 0.51 0.57 0.56 0.44 0.89 0.94 0.59 0.44 0.69 0.62 0.54 0.59 0.53 0.47 0.68 0.63 0.51 0.6 0.86 0.84 0.55 0.65
Bra036647 (ASP4)
 0.13 0.14 0.12 0.11 0.51 0.53 0.38 0.51 0.64 0.48 0.54 0.56 0.47 1.0 0.92 0.46 0.45 0.4 0.59 0.47 0.52 0.53 0.26 0.39 0.44 0.32 0.38 0.38 0.42 0.32 0.36
0.24 0.26 0.27 0.19 0.49 0.6 0.24 0.21 0.61 0.57 0.53 0.56 0.34 0.98 1.0 0.44 0.46 0.4 0.45 0.48 0.49 0.5 0.28 0.54 0.58 0.49 0.51 0.5 0.62 0.6 0.62
Bra037972 (BG3)
 0.3 0.2 0.29 0.3 0.37 0.42 0.27 0.27 0.67 0.51 0.84 0.78 0.37 0.73 0.94 1.0 0.49 0.59 0.71 0.71 0.61 0.51 0.37 0.63 0.6 0.45 0.57 0.53 0.62 0.52 0.53
Bra038946 (PUP3)
 0.5 0.49 0.55 0.44 0.62 0.68 0.48 0.48 0.65 0.56 0.65 0.63 0.59 0.91 1.0 0.65 0.54 0.65 0.68 0.68 0.52 0.62 0.5 0.58 0.59 0.53 0.59 0.57 0.66 0.65 0.78
Bra039142 (NOK)
 0.02 0.0 0.02 0.02 0.62 0.44 0.21 0.11 0.44 0.38 0.44 0.35 0.23 0.8 1.0 0.46 0.49 0.39 0.49 0.5 0.34 0.4 0.19 0.29 0.25 0.13 0.27 0.22 0.32 0.19 0.2
Bra039237 (LAP1)
 0.31 0.23 0.28 0.23 0.87 0.7 0.41 0.39 0.64 0.71 0.61 0.6 0.51 0.97 1.0 0.64 0.55 0.72 0.76 0.54 0.5 0.66 0.54 0.53 0.5 0.38 0.48 0.56 0.55 0.61 0.67
0.1 0.13 0.16 0.22 0.43 0.9 0.32 0.32 0.51 0.36 0.44 0.5 0.39 1.0 0.94 0.38 0.37 0.48 0.57 0.39 0.41 0.39 0.26 0.45 0.5 0.41 0.42 0.57 0.63 0.26 0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)