1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_136 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000493 (BGAL8)
 0.5 0.62 0.72 0.64 0.64 0.51 0.55 0.7 0.78 0.65 0.69 0.76 0.72 0.72 0.66 0.68 0.58 0.9 0.68 0.62 0.49 0.42 0.31 0.72 0.71 0.77 0.8 0.91 0.76 1.0 0.8
0.8 0.55 0.53 0.44 0.75 0.34 0.34 0.39 0.73 0.57 0.65 0.76 0.2 0.21 0.24 0.28 0.3 0.19 0.34 0.34 0.33 0.38 0.47 0.34 0.42 0.4 0.41 0.61 0.7 1.0 0.68
Bra000821 (ATHM2)
 0.71 0.61 0.53 0.57 1.0 0.7 0.57 0.5 0.81 0.77 0.77 0.77 0.51 0.54 0.58 0.57 0.58 0.46 0.8 0.66 0.67 0.68 0.23 0.59 0.59 0.56 0.63 0.81 0.73 0.91 0.76
Bra001975 (PCH1)
 0.59 0.31 0.35 0.23 0.83 0.49 0.49 0.6 0.76 0.38 0.5 0.66 0.29 0.78 0.75 0.44 0.32 0.64 0.59 0.56 0.37 0.63 0.43 0.43 0.32 0.36 0.33 1.0 0.65 0.92 0.45
Bra002957 (TZ)
 0.62 0.52 0.53 0.47 0.81 0.48 0.54 0.85 0.6 0.54 0.5 0.69 0.22 0.31 0.34 0.23 0.22 0.29 0.47 0.35 0.36 0.38 0.17 0.37 0.35 0.33 0.44 0.92 0.69 1.0 0.54
Bra003434 (CLB1)
 0.81 0.88 0.94 0.88 0.81 0.87 0.71 0.71 0.73 0.69 0.65 0.62 0.48 0.77 0.88 0.73 0.61 0.61 0.65 0.76 0.72 0.71 0.4 0.8 0.8 0.85 0.78 1.0 0.97 0.74 0.59
Bra004064 (NPY8)
 0.86 0.74 0.69 0.72 0.86 0.88 0.59 0.75 0.84 0.63 0.72 0.7 0.57 0.63 0.55 0.49 0.51 0.59 0.64 0.5 0.53 0.51 0.2 0.58 0.58 0.83 0.6 0.99 1.0 0.86 0.63
0.54 0.34 0.43 0.16 0.87 0.28 0.36 0.54 0.65 0.39 0.52 0.48 0.52 0.23 0.15 0.19 0.09 0.27 0.27 0.18 0.3 0.22 0.18 0.65 0.57 0.46 0.71 0.99 0.99 1.0 0.74
Bra004781 (OASB)
 0.87 0.75 0.72 0.65 0.93 0.85 0.85 0.74 0.97 1.0 0.93 0.92 0.86 0.86 0.9 0.91 0.78 0.81 0.94 0.89 0.87 0.88 0.54 0.79 0.8 0.77 0.8 0.89 0.91 0.96 0.93
Bra005414 (CCP1)
 0.69 0.52 0.48 0.47 0.85 0.44 0.44 0.63 0.74 0.56 0.52 0.61 0.37 0.36 0.34 0.3 0.25 0.49 0.42 0.37 0.32 0.36 0.25 0.51 0.53 0.52 0.53 1.0 0.93 0.94 0.78
Bra005612 (GLXI-like;9)
 0.74 0.75 0.77 0.7 1.0 0.69 0.4 0.36 0.68 0.49 0.57 0.63 0.41 0.6 0.6 0.3 0.35 0.74 0.72 0.42 0.44 0.5 0.25 0.44 0.45 0.48 0.46 0.49 0.64 0.61 0.58
Bra005979 (scpl35)
 0.26 0.35 0.23 0.26 1.0 0.56 0.33 0.28 0.75 0.78 0.55 0.64 0.17 0.42 0.49 0.36 0.61 0.34 0.69 0.51 0.31 0.54 0.16 0.34 0.32 0.27 0.38 0.4 0.38 0.61 0.3
Bra006679 (NOT4A)
 1.0 0.85 0.78 0.88 0.86 0.92 0.78 0.71 0.69 0.7 0.79 0.7 0.43 0.75 0.76 0.43 0.84 0.37 0.52 0.65 0.48 0.66 0.53 0.67 0.7 0.54 0.61 0.85 0.85 0.81 0.53
Bra007430 (PIF5)
 0.94 0.84 0.8 0.84 0.7 0.86 0.69 0.66 0.88 0.56 0.76 0.73 0.45 0.85 0.83 0.5 0.48 0.45 0.68 0.59 0.6 0.58 0.19 0.78 0.78 1.0 0.73 0.84 1.0 0.88 0.69
Bra007678 (CP12)
 0.68 0.51 0.4 0.33 1.0 0.51 0.43 0.39 0.63 0.51 0.56 0.66 0.14 0.31 0.42 0.19 0.19 0.55 0.74 0.37 0.36 0.45 0.05 0.29 0.27 0.22 0.33 0.45 0.55 0.64 0.59
Bra008214 (GH9B7)
 0.39 0.63 0.6 0.57 0.53 0.38 0.6 0.74 0.7 0.77 0.72 0.67 0.56 0.62 0.57 0.72 0.62 1.0 0.61 0.59 0.59 0.53 0.36 0.7 0.73 0.79 0.77 0.73 0.65 0.58 0.55
Bra008371 (LZF1)
 0.2 0.17 0.15 0.14 0.46 0.26 0.55 1.0 0.44 0.27 0.29 0.51 0.38 0.13 0.15 0.17 0.16 0.57 0.34 0.2 0.19 0.27 0.41 0.3 0.31 0.31 0.39 0.94 0.66 0.79 0.53
Bra009302 (LNK4)
 0.97 0.81 0.63 0.87 0.39 0.61 0.64 0.7 0.55 0.38 0.57 0.51 0.46 0.79 0.54 0.27 0.39 0.45 0.36 0.4 0.38 0.38 0.21 0.58 0.62 1.0 0.55 0.66 0.77 0.42 0.46
Bra010123 (DXR)
 0.91 0.8 0.75 0.73 0.98 0.82 0.79 0.73 0.84 0.74 0.8 0.79 0.56 0.65 0.68 0.6 0.6 0.46 0.7 0.66 0.63 0.69 0.3 0.75 0.76 0.7 0.77 0.9 1.0 0.94 0.91
0.58 0.48 0.46 0.37 1.0 0.44 0.21 0.36 0.99 0.52 0.43 0.92 0.19 0.16 0.12 0.15 0.1 0.13 0.34 0.34 0.28 0.4 0.01 0.18 0.22 0.06 0.39 0.44 0.42 0.81 0.55
Bra010722 (DKML)
 0.38 0.32 0.32 0.44 0.48 0.28 0.57 1.0 0.56 0.49 0.59 0.67 0.57 0.4 0.35 0.42 0.4 0.35 0.33 0.32 0.35 0.29 0.31 0.44 0.45 0.68 0.44 0.57 0.72 0.99 0.87
Bra011014 (TTM2)
 0.69 0.43 0.33 0.4 0.73 0.48 0.59 1.0 0.62 0.57 0.38 0.45 0.81 0.35 0.32 0.35 0.32 0.53 0.43 0.38 0.3 0.46 0.67 0.64 0.49 0.43 0.42 0.86 0.54 0.71 0.77
0.45 0.39 0.5 0.38 0.58 0.17 0.6 0.85 0.91 0.65 1.0 0.93 0.51 0.24 0.26 0.44 0.35 0.82 0.45 0.46 0.41 0.51 0.22 0.48 0.46 0.53 0.5 0.58 0.49 0.74 0.78
Bra013300 (HHOA)
 0.99 0.73 0.7 0.78 0.9 0.98 0.62 0.58 0.73 0.76 0.72 0.73 0.52 0.64 0.62 0.62 0.61 0.39 0.6 0.7 0.69 0.72 0.29 0.76 0.79 0.7 0.75 1.0 1.0 0.77 0.93
0.56 0.16 0.35 0.39 0.4 0.23 0.29 0.25 0.66 0.79 0.43 0.32 0.59 0.61 0.43 0.54 0.4 0.36 0.84 0.13 0.33 0.26 0.35 1.0 0.91 0.76 0.77 0.75 0.58 0.87 0.75
0.48 0.14 0.32 0.01 0.67 0.18 0.44 0.81 0.61 0.45 0.4 0.36 0.56 0.16 0.06 0.3 0.45 0.44 0.2 0.46 0.31 0.42 0.35 0.56 0.58 0.08 0.77 1.0 0.76 0.47 0.88
Bra014765 (HEXO1)
 0.63 0.58 0.56 0.64 0.68 0.55 0.5 0.67 0.71 0.75 0.75 0.83 0.72 0.67 0.57 0.63 0.66 1.0 0.7 0.63 0.68 0.66 0.48 0.63 0.59 0.6 0.66 0.73 0.62 0.85 0.83
Bra015135 (ADG1)
 0.59 0.53 0.52 0.58 0.83 0.46 0.57 0.75 0.68 0.63 0.61 0.77 0.57 0.57 0.6 0.57 0.59 0.69 0.67 0.57 0.56 0.52 0.18 0.46 0.45 0.45 0.48 0.9 0.59 1.0 0.72
Bra016791 (ELP)
 0.4 0.26 0.28 0.31 0.71 0.14 0.36 0.98 0.63 0.59 0.5 0.8 0.62 0.13 0.14 0.22 0.32 0.68 0.35 0.28 0.27 0.25 0.15 0.48 0.49 0.62 0.62 0.92 0.7 1.0 0.77
Bra018372 (PY)
 0.71 0.53 0.43 0.51 1.0 0.87 0.43 0.41 0.76 0.68 0.64 0.61 0.3 0.64 0.69 0.55 0.49 0.52 0.95 0.57 0.57 0.62 0.19 0.41 0.4 0.35 0.43 0.6 0.53 0.64 0.54
Bra018893 (FBN10)
 0.84 0.62 0.52 0.6 0.92 0.87 0.7 0.67 0.79 0.69 0.66 0.8 0.42 0.53 0.5 0.44 0.54 0.28 0.61 0.55 0.56 0.6 0.16 0.67 0.64 0.57 0.65 0.91 1.0 0.96 0.93
Bra018941 (MBP2)
 0.2 0.12 0.23 0.17 0.95 0.04 0.23 0.61 0.31 0.15 0.2 0.15 0.09 0.02 0.02 0.02 0.02 0.89 0.06 0.04 0.08 0.1 0.18 0.11 0.08 0.08 0.12 1.0 0.55 0.9 0.83
Bra019386 (TIPSY1)
 0.59 0.64 0.64 0.51 0.66 0.54 0.57 0.46 0.86 0.76 0.65 0.77 0.73 1.0 0.77 0.73 0.68 0.56 0.7 0.52 0.57 0.55 0.5 0.79 0.84 0.78 0.78 0.87 0.79 1.0 0.82
Bra019387 (SHOU4L2)
 0.72 0.88 0.49 0.81 0.66 0.36 0.36 0.67 0.65 0.55 0.44 0.65 0.58 1.0 0.89 0.53 0.38 0.85 0.62 0.36 0.36 0.29 0.39 0.67 0.67 1.0 0.64 0.97 0.66 0.87 0.58
Bra019474 (RPT1)
 0.93 0.9 0.8 0.86 1.0 0.66 0.41 0.64 0.93 0.81 0.74 0.84 0.48 0.68 0.61 0.5 0.46 0.26 0.61 0.56 0.54 0.54 0.16 0.52 0.55 0.68 0.58 0.96 0.97 0.92 0.74
Bra020046 (DY1)
 0.75 0.47 0.38 0.37 0.91 0.74 0.51 0.53 0.8 0.49 0.59 0.72 0.33 0.42 0.58 0.36 0.4 0.33 0.62 0.52 0.4 0.48 0.26 0.6 0.54 0.45 0.63 0.78 0.9 0.86 1.0
Bra021430 (PMI1)
 0.71 0.75 0.8 0.55 1.0 0.55 0.47 0.63 0.57 0.61 0.52 0.53 0.4 0.83 0.69 0.48 0.5 0.72 0.49 0.48 0.44 0.44 0.17 0.48 0.44 0.45 0.41 0.7 0.61 0.62 0.48
0.61 0.46 0.91 0.58 0.42 0.11 0.39 0.76 0.7 0.62 0.57 0.89 0.52 0.17 0.13 0.24 0.21 0.47 0.45 0.4 0.45 0.45 0.38 0.5 0.5 0.42 0.62 0.76 0.59 1.0 0.6
0.54 0.55 0.44 0.46 0.97 0.63 0.58 0.45 0.73 1.0 0.72 0.73 0.35 0.65 0.81 0.76 0.66 0.31 0.82 0.68 0.59 0.75 0.27 0.55 0.54 0.48 0.58 0.62 0.54 0.95 0.51
Bra022742 (TZ)
 0.77 0.67 0.49 0.62 0.82 0.9 0.8 0.81 0.77 0.55 0.61 0.7 0.36 0.62 0.83 0.37 0.48 0.66 0.94 0.59 0.53 0.58 0.13 0.56 0.51 0.47 0.63 1.0 0.82 0.97 0.75
Bra024665 (HB54)
 0.41 0.47 0.56 0.36 0.47 0.39 0.5 0.63 0.73 0.62 0.94 0.87 0.62 0.14 0.22 0.45 0.13 0.61 0.39 0.55 0.51 0.28 0.18 0.61 0.54 0.33 0.59 0.33 0.4 0.86 1.0
Bra025180 (FBN3a)
 0.81 0.71 0.66 0.66 0.88 0.76 0.46 0.44 0.77 0.63 0.68 0.71 0.42 0.49 0.51 0.49 0.49 0.4 0.6 0.54 0.55 0.57 0.37 0.63 0.62 0.58 0.66 0.92 0.94 1.0 0.98
Bra025610 (FTRB)
 0.87 0.75 0.67 0.72 1.0 0.75 0.62 0.52 0.78 0.71 0.74 0.81 0.53 0.57 0.55 0.56 0.59 0.38 0.68 0.68 0.63 0.67 0.3 0.69 0.64 0.59 0.67 0.82 0.72 0.79 0.72
Bra026506 (TCP7)
 0.45 0.39 0.4 0.62 0.49 0.27 0.46 0.68 0.77 0.81 0.62 0.69 0.65 0.48 0.39 0.34 0.32 0.55 0.4 0.36 0.35 0.4 0.27 0.63 0.59 0.72 0.67 0.62 0.74 1.0 0.71
Bra027904 (MAH1)
 0.18 0.01 0.06 0.04 0.26 0.2 0.33 0.67 0.31 0.29 0.39 0.29 0.16 0.17 0.37 0.13 0.12 0.3 0.29 0.21 0.24 0.19 0.12 0.31 0.16 0.08 0.24 0.63 0.66 1.0 0.24
Bra028096 (IDS2)
 0.34 0.19 0.21 0.29 0.55 0.47 0.43 0.6 0.65 0.49 0.5 0.59 0.64 0.49 0.5 0.43 0.41 0.27 0.24 0.29 0.41 0.42 0.18 0.54 0.54 0.46 0.55 0.76 1.0 0.74 0.77
Bra029429 (TPXL2)
 0.68 0.22 0.3 0.21 0.89 0.25 0.39 1.0 0.69 0.44 0.41 0.8 0.72 0.03 0.31 0.11 0.06 0.39 0.22 0.17 0.08 0.15 0.29 0.26 0.15 0.26 0.33 0.49 0.64 0.92 0.8
0.98 0.78 0.92 0.86 0.9 0.8 0.61 0.65 0.76 0.58 0.67 0.74 0.39 0.65 0.75 0.54 0.66 0.58 0.6 0.59 0.53 0.7 0.29 0.61 0.6 0.7 0.65 1.0 0.92 0.7 0.49
0.92 0.59 0.56 0.72 0.88 0.73 0.75 0.66 0.78 0.75 0.78 0.77 0.51 0.48 0.43 0.56 0.57 0.26 0.62 0.75 0.66 0.7 0.25 0.77 0.78 0.74 0.8 0.99 1.0 0.81 0.91
Bra030635 (STO)
 0.82 0.59 0.54 0.62 0.68 0.42 0.53 0.66 0.58 0.34 0.46 0.46 0.36 0.48 0.36 0.19 0.22 0.53 0.5 0.36 0.43 0.36 0.54 0.7 0.62 0.51 0.65 0.98 1.0 0.88 0.5
Bra030653 (ACD31.2)
 0.72 0.74 0.42 0.45 1.0 0.44 0.42 0.55 0.85 0.58 0.55 0.83 0.16 0.31 0.41 0.17 0.14 0.22 0.43 0.4 0.3 0.39 0.1 0.48 0.46 0.4 0.55 0.57 0.62 0.91 0.87
Bra032941 (NUDX13)
 0.97 0.62 0.76 0.34 0.69 0.34 0.56 0.9 0.67 0.6 0.54 0.6 0.58 0.31 0.26 0.38 0.33 0.65 0.34 0.47 0.36 0.29 0.29 0.66 0.57 0.68 0.64 0.93 0.94 1.0 0.86
0.86 0.71 0.7 0.7 0.83 0.83 0.52 0.47 0.81 0.66 0.7 0.83 0.45 0.7 0.66 0.49 0.54 0.35 0.6 0.57 0.56 0.62 0.41 0.52 0.56 0.54 0.59 0.79 0.82 1.0 0.8
Bra034026 (ABA4)
 0.57 0.26 0.43 0.62 0.75 0.6 0.63 0.7 0.65 0.49 0.54 0.5 0.7 0.56 0.5 0.46 0.47 0.26 0.3 0.54 0.56 0.53 0.5 0.73 0.68 0.62 0.73 0.82 1.0 0.81 0.76
Bra034237 (CYP71B26)
 0.33 0.27 0.21 0.25 0.36 0.43 0.5 0.67 0.8 0.37 0.58 0.62 0.47 0.47 0.36 0.47 0.28 0.35 0.33 0.36 0.41 0.64 0.17 0.73 0.72 0.54 0.71 0.78 0.88 0.76 1.0
0.21 0.22 0.17 0.24 0.28 0.17 0.39 0.39 0.63 0.62 0.68 0.53 0.36 0.4 0.88 0.76 0.41 1.0 0.66 0.65 0.55 0.35 0.4 0.7 0.83 0.49 0.72 0.57 0.71 0.46 0.68
0.11 0.14 0.11 0.42 0.15 0.17 0.47 0.39 0.34 0.32 0.54 0.43 0.31 0.18 0.29 0.52 0.6 1.0 0.45 0.48 0.54 0.62 0.22 0.64 0.64 0.63 0.55 0.33 0.28 0.19 0.38
Bra036788 (LTP5)
 0.35 0.43 0.54 0.38 0.46 0.27 0.49 0.58 0.38 0.61 0.47 0.46 0.52 0.53 0.44 0.5 0.86 1.0 0.51 0.53 0.58 0.49 0.13 0.67 0.75 0.96 0.91 0.59 0.47 0.51 0.42
Bra037385 (TBL26)
 0.36 0.21 0.25 0.38 0.61 0.47 0.48 0.69 0.77 0.5 0.5 0.7 0.38 0.5 0.43 0.24 0.23 0.15 0.29 0.22 0.31 0.31 0.03 0.43 0.4 0.48 0.46 0.88 0.89 1.0 0.76
0.82 0.62 0.8 0.82 0.79 0.55 0.63 0.93 0.67 0.59 0.63 0.79 0.81 0.54 0.5 0.5 0.45 0.67 0.6 0.47 0.53 0.7 0.45 0.78 0.74 0.67 0.63 0.69 0.75 1.0 0.77
0.89 0.93 1.0 0.89 0.95 0.67 0.48 0.49 0.76 0.74 0.72 0.81 0.53 0.65 0.66 0.5 0.58 0.39 0.65 0.52 0.58 0.53 0.3 0.59 0.57 0.59 0.58 0.79 0.75 0.98 0.7
Bra039155 (scpl25)
 0.36 0.55 0.68 0.52 0.57 0.53 0.7 0.79 0.79 0.84 0.88 0.85 0.89 0.69 0.73 0.82 0.82 1.0 0.73 0.88 0.64 0.63 0.49 0.71 0.75 0.81 0.86 0.66 0.65 0.62 0.64
Bra039181 (PMI1)
 0.81 0.73 0.74 0.7 0.78 0.35 0.57 1.0 0.67 0.56 0.43 0.6 0.48 0.76 0.65 0.47 0.51 0.79 0.51 0.46 0.39 0.32 0.2 0.38 0.4 0.62 0.43 0.81 0.67 0.7 0.49
0.61 0.27 0.28 0.26 0.98 0.54 0.58 0.63 1.0 0.65 0.6 0.83 0.27 0.35 0.33 0.21 0.17 0.38 0.54 0.46 0.31 0.42 0.08 0.43 0.42 0.36 0.43 0.77 0.8 0.84 0.66
Bra040288 (GATA15)
 0.4 0.23 0.28 0.23 0.96 0.42 0.41 0.73 0.92 0.44 0.56 0.61 0.67 0.47 0.45 0.34 0.3 0.56 0.38 0.46 0.43 0.49 0.22 0.63 0.55 0.35 0.58 0.82 0.82 1.0 0.64
Bra040322 (AFO)
 0.55 0.65 0.72 0.41 0.32 0.16 0.61 0.88 0.69 0.53 0.43 0.7 1.0 0.17 0.13 0.24 0.27 0.93 0.14 0.29 0.36 0.34 0.34 0.72 0.78 0.77 0.78 0.68 0.8 0.79 0.84

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)