1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_233 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.31 0.23 0.26 0.16 1.0 0.85 0.14 0.07 0.29 0.23 0.3 0.16 0.31 0.42 0.5 0.2 0.17 0.56 0.38 0.21 0.15 0.15 0.35 0.29 0.38 0.21 0.3 0.28 0.55 0.46 0.54
0.73 0.59 0.55 0.35 0.94 0.92 0.32 0.4 0.65 0.43 0.43 0.53 0.45 0.86 1.0 0.55 0.37 0.65 0.52 0.45 0.4 0.46 0.94 0.6 0.56 0.47 0.56 0.83 0.83 0.74 0.83
Bra000592 (CARD1)
 0.35 0.38 0.28 0.18 1.0 0.47 0.24 0.31 0.46 0.38 0.36 0.36 0.13 0.34 0.38 0.33 0.25 0.26 0.37 0.29 0.24 0.27 0.17 0.29 0.28 0.24 0.3 0.41 0.48 0.64 0.39
0.3 0.17 0.12 0.06 0.86 0.62 0.15 0.16 0.51 0.37 0.33 0.43 0.18 0.33 0.68 0.29 0.22 0.19 0.44 0.29 0.3 0.4 0.22 0.47 0.41 0.21 0.45 0.46 0.56 1.0 0.62
Bra002338 (JAZ12)
 0.37 0.23 0.35 0.23 0.9 0.68 0.16 0.1 0.29 0.2 0.25 0.23 0.18 0.44 0.61 0.26 0.2 1.0 0.29 0.14 0.16 0.17 0.78 0.43 0.38 0.3 0.39 0.49 0.66 0.67 0.76
0.39 0.32 0.48 0.37 1.0 0.53 0.35 0.4 0.44 0.54 0.45 0.4 0.32 0.56 0.43 0.41 0.39 0.37 0.38 0.45 0.36 0.42 0.29 0.32 0.38 0.3 0.36 0.59 0.55 0.5 0.45
Bra003543 (BTZ1)
 0.66 0.73 0.8 0.41 1.0 0.58 0.26 0.36 0.41 0.38 0.38 0.42 0.27 0.57 0.68 0.35 0.38 0.51 0.43 0.36 0.26 0.34 0.71 0.43 0.46 0.49 0.47 0.58 0.62 0.68 0.68
Bra003611 (WDY)
 0.77 0.55 0.48 0.57 0.78 0.85 0.41 0.43 0.57 0.41 0.58 0.69 0.35 0.95 0.68 0.7 0.56 0.8 0.8 0.54 0.52 0.39 0.47 0.93 0.94 0.64 0.79 0.87 1.0 0.88 0.7
Bra003698 (PRAF1)
 0.23 0.31 0.3 0.24 0.54 0.54 0.21 0.18 0.44 0.39 0.32 0.35 0.37 0.57 0.6 0.38 0.36 1.0 0.38 0.29 0.24 0.3 0.76 0.39 0.36 0.39 0.4 0.43 0.47 0.54 0.69
Bra004166 (CAM4)
 0.49 0.47 0.44 0.36 1.0 0.66 0.15 0.2 0.37 0.25 0.29 0.34 0.19 0.43 0.63 0.26 0.25 0.64 0.36 0.22 0.23 0.26 0.96 0.39 0.37 0.28 0.35 0.72 0.54 0.71 0.49
Bra005516 (AtFDB16)
 0.5 0.41 0.46 0.37 0.8 0.88 0.46 0.39 0.62 0.51 0.52 0.48 0.25 0.68 1.0 0.57 0.53 0.55 0.45 0.56 0.49 0.51 0.43 0.63 0.62 0.51 0.67 0.6 0.76 0.74 0.89
Bra006440 (APRL7)
 0.52 0.59 0.65 0.3 1.0 0.59 0.13 0.17 0.36 0.28 0.27 0.39 0.1 0.46 0.55 0.18 0.19 0.27 0.36 0.15 0.12 0.24 0.54 0.35 0.35 0.14 0.3 0.73 0.58 0.87 0.46
Bra008337 (PRE2)
 0.75 0.65 0.59 0.54 1.0 0.88 0.43 0.49 0.61 0.46 0.52 0.53 0.35 0.65 0.82 0.49 0.44 0.74 0.58 0.54 0.44 0.49 0.48 0.51 0.51 0.45 0.49 0.7 0.73 0.71 0.63
Bra008838 (SFC)
 0.51 0.54 0.55 0.33 1.0 0.61 0.18 0.25 0.37 0.34 0.23 0.34 0.38 0.45 0.73 0.32 0.28 0.49 0.27 0.27 0.19 0.31 0.71 0.3 0.31 0.28 0.3 0.5 0.5 0.48 0.46
0.19 0.27 0.32 0.2 1.0 0.62 0.13 0.17 0.33 0.22 0.27 0.29 0.27 0.42 0.36 0.23 0.19 0.56 0.44 0.25 0.22 0.23 0.78 0.45 0.39 0.34 0.41 0.54 0.63 0.5 0.49
Bra010028 (PNG1)
 0.84 0.81 0.79 0.51 1.0 0.81 0.31 0.37 0.8 0.57 0.59 0.58 0.45 0.87 0.98 0.47 0.46 0.56 0.65 0.4 0.56 0.44 0.98 0.53 0.51 0.56 0.58 0.77 0.8 0.73 0.61
Bra010458 (SLK3)
 0.72 0.65 0.69 0.59 0.92 0.87 0.41 0.44 0.71 0.59 0.66 0.7 0.41 0.83 1.0 0.59 0.44 0.73 0.48 0.49 0.53 0.61 0.84 0.58 0.64 0.54 0.63 0.81 0.83 0.83 0.76
Bra010565 (VPS39)
 0.53 0.26 0.36 0.2 0.71 0.68 0.31 0.22 0.46 0.43 0.49 0.31 0.29 0.52 1.0 0.32 0.32 0.43 0.3 0.42 0.27 0.44 0.39 0.73 0.7 0.45 0.68 0.59 0.75 0.71 0.82
Bra010927 (CYCT1;3)
 0.68 0.73 0.62 0.32 1.0 0.64 0.07 0.2 0.55 0.31 0.28 0.4 0.14 0.37 0.61 0.2 0.21 0.43 0.4 0.24 0.22 0.28 0.81 0.3 0.2 0.17 0.36 0.64 0.5 0.83 0.61
Bra010937 (APT1)
 0.32 0.42 0.49 0.29 1.0 0.55 0.25 0.38 0.55 0.45 0.48 0.45 0.28 0.62 0.65 0.47 0.38 0.48 0.54 0.44 0.34 0.34 0.58 0.57 0.54 0.43 0.54 0.81 0.67 0.93 0.74
Bra012238 (SEN2)
 0.61 0.52 0.53 0.29 1.0 0.64 0.16 0.15 0.54 0.39 0.47 0.38 0.2 0.31 0.6 0.26 0.31 0.67 0.78 0.3 0.29 0.34 0.29 0.48 0.49 0.39 0.53 0.67 0.68 0.95 0.61
Bra014504 (BPC6)
 0.83 0.72 0.78 0.77 1.0 0.79 0.46 0.41 0.53 0.54 0.54 0.67 0.45 1.0 0.83 0.52 0.62 0.68 0.46 0.55 0.45 0.6 0.44 0.72 0.64 0.67 0.65 0.81 0.85 0.66 0.72
Bra014818 (SRS6)
 0.33 0.15 0.15 0.06 1.0 0.25 0.05 0.07 0.25 0.19 0.2 0.21 0.1 0.14 0.19 0.12 0.09 0.16 0.21 0.15 0.1 0.15 0.16 0.09 0.11 0.08 0.12 0.38 0.2 0.33 0.21
0.47 0.62 0.51 0.38 1.0 0.79 0.37 0.46 0.53 0.4 0.49 0.37 0.5 0.67 0.71 0.47 0.43 0.56 0.58 0.53 0.5 0.5 0.45 0.55 0.5 0.39 0.46 0.54 0.61 0.52 0.54
0.48 0.37 0.43 0.24 1.0 0.48 0.25 0.31 0.46 0.39 0.31 0.4 0.16 0.38 0.48 0.31 0.23 0.35 0.39 0.35 0.2 0.26 0.54 0.42 0.37 0.24 0.38 0.65 0.57 0.57 0.48
Bra018090 (ALDH2)
 0.86 0.91 0.95 0.57 1.0 0.7 0.38 0.43 0.48 0.44 0.39 0.41 0.34 0.89 0.9 0.4 0.41 0.54 0.49 0.4 0.38 0.44 0.68 0.45 0.48 0.56 0.55 0.57 0.88 0.79 0.88
0.84 0.91 0.74 0.65 1.0 0.84 0.52 0.58 0.69 0.66 0.67 0.63 0.57 0.8 0.91 0.65 0.58 0.6 0.63 0.66 0.59 0.68 0.82 0.59 0.7 0.66 0.62 0.76 0.71 0.68 0.79
0.6 0.77 0.54 0.27 1.0 0.69 0.18 0.23 0.45 0.29 0.39 0.34 0.17 0.67 0.78 0.26 0.25 0.47 0.38 0.3 0.28 0.36 0.81 0.34 0.32 0.22 0.32 0.64 0.65 0.88 0.52
0.65 0.64 0.51 0.3 0.89 0.5 0.16 0.26 0.4 0.37 0.35 0.45 0.36 0.77 0.71 0.32 0.26 0.46 0.38 0.27 0.23 0.31 1.0 0.41 0.3 0.24 0.27 0.47 0.51 0.73 0.76
0.8 0.66 0.46 0.39 1.0 0.68 0.24 0.28 0.65 0.37 0.36 0.43 0.17 0.57 0.66 0.18 0.16 0.19 0.32 0.25 0.23 0.3 0.98 0.34 0.29 0.23 0.29 0.54 0.83 0.75 0.61
0.26 0.29 0.4 0.02 1.0 0.82 0.21 0.31 0.2 0.2 0.28 0.19 0.14 0.44 0.81 0.23 0.1 0.28 0.2 0.16 0.14 0.3 0.33 0.34 0.51 0.3 0.27 0.41 0.57 0.5 0.42
Bra019776 (UER1)
 0.18 0.26 0.21 0.09 0.5 0.5 0.11 0.06 0.3 0.23 0.16 0.16 0.13 0.35 0.69 0.2 0.16 0.97 0.16 0.12 0.17 0.19 1.0 0.38 0.35 0.25 0.29 0.32 0.75 0.49 0.54
0.55 0.55 0.58 0.45 0.87 0.76 0.33 0.16 0.65 0.54 0.56 0.67 0.29 0.72 1.0 0.47 0.38 0.46 0.61 0.39 0.37 0.56 0.66 0.64 0.6 0.41 0.52 0.72 0.82 0.6 0.53
0.78 0.82 0.94 0.47 0.83 0.62 0.33 0.24 0.48 0.47 0.33 0.56 0.26 0.52 0.56 0.39 0.41 0.62 0.55 0.43 0.36 0.48 0.56 0.51 0.5 0.39 0.46 0.74 0.68 1.0 0.9
Bra024157 (TZF3)
 0.45 0.47 0.33 0.26 0.38 0.39 0.27 0.16 0.63 0.23 0.4 0.28 0.14 1.0 0.46 0.25 0.36 0.23 0.85 0.42 0.45 0.48 0.09 0.82 0.72 0.44 0.76 0.62 0.92 0.84 0.81
0.75 0.78 0.94 0.47 1.0 0.96 0.47 0.33 0.65 0.5 0.52 0.6 0.35 0.81 0.9 0.55 0.49 0.68 0.57 0.53 0.48 0.57 0.83 0.67 0.64 0.48 0.6 0.77 0.73 0.97 0.99
Bra025208 (NPY7)
 0.4 0.64 0.46 0.23 1.0 0.9 0.45 0.44 0.54 0.43 0.41 0.56 0.17 0.49 0.63 0.49 0.36 0.23 0.51 0.62 0.49 0.47 0.3 0.4 0.4 0.13 0.44 0.42 0.51 0.83 0.65
Bra025248 (NRP2)
 0.73 0.88 0.91 0.48 0.92 0.62 0.32 0.36 0.47 0.4 0.37 0.43 0.32 0.54 0.73 0.59 0.35 0.7 0.54 0.36 0.35 0.35 1.0 0.5 0.47 0.3 0.48 0.68 0.69 0.78 0.6
Bra025973 (TRFL3)
 0.29 0.13 0.29 0.11 0.48 0.3 0.12 0.24 0.18 0.22 0.2 0.23 0.28 0.45 0.6 0.17 0.19 1.0 0.42 0.13 0.19 0.24 0.66 0.24 0.24 0.17 0.25 0.39 0.44 0.49 0.66
Bra026991 (B-1)
 0.18 0.05 0.05 0.03 1.0 0.46 0.07 0.04 0.24 0.25 0.13 0.14 0.04 0.11 0.19 0.13 0.13 0.09 0.21 0.17 0.22 0.16 0.66 0.19 0.14 0.09 0.1 0.67 0.34 0.22 0.06
Bra027046 (CDS1)
 0.67 0.61 0.57 0.47 1.0 0.71 0.3 0.41 0.55 0.48 0.46 0.62 0.4 0.64 0.63 0.4 0.4 0.69 0.47 0.39 0.45 0.44 0.5 0.37 0.37 0.36 0.38 0.65 0.58 0.7 0.6
0.47 0.57 0.62 0.25 1.0 0.71 0.1 0.09 0.27 0.21 0.25 0.22 0.14 0.61 0.88 0.24 0.15 0.53 0.4 0.22 0.23 0.19 0.32 0.33 0.33 0.24 0.33 0.5 0.54 0.75 0.69
Bra027121 (PIP5K8)
 0.69 0.81 0.67 0.42 1.0 0.82 0.43 0.36 0.53 0.53 0.49 0.43 0.43 0.76 0.88 0.51 0.47 0.51 0.43 0.45 0.42 0.48 0.61 0.47 0.47 0.4 0.47 0.57 0.69 0.62 0.69
0.44 0.49 0.7 0.45 0.74 0.76 0.51 0.42 0.71 0.57 0.7 0.61 0.53 0.95 0.92 0.68 0.57 0.38 0.71 0.72 0.53 0.61 0.75 1.0 0.92 0.65 0.95 0.71 0.96 0.77 0.72
0.62 0.5 0.58 0.31 1.0 0.9 0.24 0.04 0.39 0.15 0.34 0.24 0.12 0.95 0.8 0.29 0.33 0.49 0.24 0.21 0.42 0.33 0.27 0.56 0.5 0.55 0.49 0.41 0.71 0.53 0.78
Bra029645 (ECA4)
 0.66 0.65 0.74 0.62 1.0 0.65 0.35 0.46 0.51 0.57 0.55 0.52 0.54 0.84 0.77 0.57 0.53 0.86 0.62 0.42 0.48 0.56 0.84 0.55 0.59 0.69 0.54 0.69 0.69 0.76 0.83
Bra030286 (ACS)
 0.69 0.77 0.76 0.65 0.88 0.7 0.43 0.49 0.62 0.65 0.58 0.69 0.62 0.77 0.84 0.64 0.55 1.0 0.73 0.49 0.48 0.6 0.83 0.65 0.65 0.62 0.64 0.59 0.71 0.84 0.76
0.88 0.59 0.82 0.67 1.0 0.89 0.51 0.43 0.6 0.45 0.68 0.52 0.31 0.8 0.83 0.37 0.49 0.63 0.65 0.47 0.54 0.46 0.44 0.69 0.65 0.5 0.54 0.72 0.9 0.69 0.7
Bra030568 (FHA)
 0.84 0.78 0.72 0.51 0.92 0.68 0.24 0.33 0.56 0.46 0.5 0.51 0.28 0.49 0.59 0.35 0.36 0.46 0.53 0.35 0.35 0.48 0.61 0.53 0.53 0.5 0.59 0.76 0.83 1.0 0.88
Bra031704 (NFXL1)
 0.68 0.54 0.63 0.5 0.79 0.75 0.28 0.31 0.55 0.38 0.38 0.35 0.21 0.59 1.0 0.4 0.32 0.52 0.36 0.29 0.27 0.44 0.86 0.44 0.47 0.28 0.37 0.57 0.66 0.6 0.55
Bra031749 (GWD)
 0.17 0.12 0.11 0.04 1.0 0.18 0.01 0.03 0.06 0.06 0.03 0.09 0.01 0.09 0.14 0.03 0.02 0.01 0.02 0.06 0.02 0.02 0.04 0.09 0.09 0.1 0.11 0.42 0.3 0.6 0.22
Bra032628 (ORM1)
 0.82 0.89 0.89 0.53 1.0 0.66 0.28 0.32 0.5 0.38 0.5 0.56 0.27 0.61 0.68 0.41 0.32 0.47 0.34 0.33 0.4 0.42 0.68 0.43 0.47 0.49 0.52 0.48 0.52 0.62 0.57
Bra033379 (DAAR2)
 0.53 0.66 0.51 0.36 0.9 0.83 0.23 0.19 0.41 0.43 0.42 0.38 0.26 0.74 1.0 0.38 0.44 0.64 0.63 0.36 0.32 0.4 0.54 0.49 0.47 0.37 0.49 0.6 0.66 0.67 0.64
Bra034882 (NYC1)
 0.77 0.49 0.49 0.4 1.0 0.68 0.35 0.53 0.51 0.36 0.35 0.39 0.26 0.49 0.57 0.32 0.3 0.35 0.43 0.36 0.29 0.3 0.77 0.36 0.31 0.29 0.31 0.62 0.58 0.7 0.45
0.84 0.78 0.79 0.69 1.0 0.9 0.52 0.59 0.67 0.63 0.65 0.61 0.66 0.85 0.97 0.71 0.6 0.72 0.63 0.58 0.61 0.63 0.81 0.64 0.69 0.63 0.64 0.7 0.76 0.7 0.85
0.73 0.74 0.71 0.5 1.0 0.72 0.37 0.43 0.4 0.4 0.5 0.37 0.32 0.66 0.81 0.31 0.45 0.65 0.43 0.38 0.31 0.43 0.62 0.41 0.41 0.37 0.43 0.64 0.72 0.62 0.55
Bra035982 (ARP9)
 0.69 0.57 0.64 0.32 0.85 0.61 0.29 0.42 0.47 0.45 0.4 0.47 0.43 0.51 0.57 0.37 0.33 0.58 0.44 0.37 0.35 0.38 1.0 0.41 0.37 0.38 0.42 0.61 0.57 0.71 0.62
Bra037224 (ZHD6)
 0.4 0.22 0.3 0.04 0.73 0.4 0.1 0.14 0.94 0.19 0.41 0.25 0.23 0.63 0.7 0.38 0.16 0.38 0.63 0.28 0.3 0.38 0.43 0.69 0.66 0.24 0.56 0.73 1.0 0.87 0.67
0.14 0.13 0.14 0.04 1.0 0.47 0.35 0.13 0.3 0.28 0.41 0.28 0.21 0.51 0.66 0.38 0.26 0.28 0.43 0.24 0.16 0.3 0.31 0.61 0.56 0.23 0.81 0.32 0.51 0.55 0.68
0.93 0.76 0.83 0.62 0.82 0.65 0.28 0.4 0.6 0.49 0.39 0.52 0.25 0.66 0.73 0.23 0.26 0.59 0.47 0.31 0.29 0.34 1.0 0.39 0.45 0.29 0.49 0.67 0.72 0.9 0.71
Bra038217 (PUT5)
 0.66 0.76 0.71 0.29 1.0 0.74 0.27 0.27 0.63 0.51 0.51 0.56 0.27 0.67 0.74 0.31 0.25 0.67 0.42 0.36 0.34 0.38 0.81 0.32 0.47 0.29 0.5 0.86 0.8 0.84 0.62
Bra039288 (LEA27)
 0.57 0.54 0.49 0.44 0.86 0.83 0.37 0.35 0.47 0.61 0.57 0.55 0.55 0.81 0.88 0.49 0.48 0.95 0.68 0.47 0.55 0.53 1.0 0.74 0.7 0.62 0.74 0.79 0.66 0.79 0.95
0.68 0.95 1.0 0.75 1.0 0.72 0.44 0.4 0.58 0.51 0.46 0.47 0.44 0.63 0.76 0.5 0.4 0.47 0.51 0.34 0.38 0.41 0.58 0.66 0.56 0.38 0.62 0.79 0.7 0.86 0.67
Bra039629 (MPK7)
 0.39 0.24 0.41 0.17 1.0 0.38 0.05 0.05 0.19 0.35 0.25 0.12 0.27 0.27 0.64 0.19 0.33 0.45 0.23 0.44 0.13 0.15 0.65 0.53 0.53 0.38 0.59 0.48 0.56 0.67 0.71
Bra039842 (MBR1)
 0.8 0.6 0.79 0.61 0.89 0.77 0.42 0.44 0.74 0.56 0.61 0.63 0.56 0.74 1.0 0.65 0.56 0.73 0.55 0.59 0.52 0.5 1.0 0.59 0.63 0.58 0.6 0.76 0.86 0.84 0.85

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)