1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_177 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000562 (UNE11)
 0.0 0.0 1.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra001424 (PUB24)
 0.0 0.34 0.44 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.14 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.2 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Bra001890 (DMC1)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra001998 (PUB16)
 0.2 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.42 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29
Bra002408 (NAC090)
 0.04 0.17 0.21 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02 0.03 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0
0.21 0.07 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra002905 (NHX3)
 0.0 0.0 0.62 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 0.5 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04 0.17 0.0 0.0 0.17 0.0 0.29 0.2 0.0
Bra003613 (MC7)
 0.39 0.11 1.0 0.16 0.17 0.07 0.03 0.02 0.08 0.08 0.05 0.1 0.03 0.01 0.02 0.01 0.04 0.02 0.02 0.02 0.01 0.05 0.11 0.02 0.1 0.3 0.16 0.01 0.07 0.18 0.17
Bra003635 (MBL1)
 0.19 0.28 1.0 0.19 0.02 0.0 0.05 0.08 0.03 0.13 0.15 0.05 0.1 0.0 0.01 0.05 0.1 0.18 0.03 0.07 0.04 0.06 0.09 0.05 0.04 0.33 0.05 0.02 0.04 0.16 0.11
0.26 0.34 1.0 0.14 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02
Bra005355 (GIK)
 0.0 0.0 0.36 0.0 0.04 0.07 0.03 0.04 0.26 0.07 0.14 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.0 0.25 0.03 1.0 0.0 0.08 0.16 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
Bra005429 (RLP54)
 0.02 0.13 1.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra005852 (DREB2)
 0.17 0.47 1.0 0.38 0.0 0.02 0.05 0.04 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.02 0.0
Bra006657 (HB26)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra006735 (OSCA1.8)
 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra007828 (TAT)
 0.01 0.05 0.12 0.0 0.11 0.3 0.03 0.03 0.02 0.04 0.01 0.02 0.01 0.02 0.17 0.11 0.09 0.05 0.04 0.03 0.02 0.08 1.0 0.04 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0
Bra009054 (MIPS3)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra011924 (ALB3)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.25 1.0 0.04 0.05 0.1 0.01 0.01 0.01 0.1 0.01 0.02 0.0 0.1 0.01 0.07 0.03 0.01 0.03 0.0 0.01 0.07 0.28 0.12 0.11 0.53 0.11 0.25 0.2 0.08 0.07
0.0 0.17 0.06 0.02 0.07 0.28 0.02 0.01 0.02 0.04 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.13 0.06 0.02 0.05 0.02 0.03 0.13 1.0 0.07 0.01 0.01 0.05 0.02 0.05 0.06 0.0
0.0 0.04 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0
Bra020652 (PRR4)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra020979 (RLP30)
 0.2 0.36 1.0 0.13 0.39 0.25 0.05 0.01 0.12 0.11 0.08 0.17 0.03 0.13 0.1 0.23 0.19 0.01 0.13 0.03 0.14 0.1 0.15 0.01 0.05 0.14 0.08 0.04 0.06 0.25 0.01
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra021786 (DOR)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra022379 (MES16)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra025875 (IGMT4)
 0.17 0.61 1.0 0.09 0.18 0.26 0.16 0.33 0.04 0.31 0.18 0.13 0.1 0.16 0.08 0.33 0.23 0.12 0.15 0.17 0.11 0.1 0.4 0.32 0.32 0.48 0.32 0.49 0.62 0.56 0.17
Bra029015 (ANK)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra030839 (RS1)
 0.3 0.29 1.0 0.22 0.0 0.04 0.0 0.1 0.06 0.09 0.06 0.1 0.17 0.04 0.04 0.08 0.07 0.05 0.0 0.0 0.05 0.03 0.09 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02
Bra031304 (UGT71B1)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.22 0.23 0.0 0.0 0.24 0.0 0.21 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 1.0 0.0 0.13 0.12 0.04 0.0 0.0 0.31 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.2 0.14 0.0 0.08 0.19 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra032180 (PUB4)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 0.12 1.0 0.27 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.14 0.22 0.24 0.0 0.0 0.04 0.07 0.09 0.03 0.13 0.12 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra035901 (TPXL8)
 0.36 0.0 1.0 0.37 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.24 0.0 0.0 0.13 0.17 0.0 0.14 0.0
Bra036481 (TAX2)
 0.08 0.22 0.62 0.12 0.05 0.12 0.08 0.02 0.02 0.05 0.04 0.02 0.09 0.08 0.06 0.06 0.13 0.11 0.07 0.07 0.13 0.17 1.0 0.03 0.02 0.1 0.04 0.02 0.03 0.06 0.01
Bra037158 (cMCU)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra039990 (JOSL)
 0.41 0.0 1.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.1 0.0 0.2 0.09 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.0 1.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0
0.12 0.03 0.81 0.33 0.23 0.02 0.07 0.06 0.18 0.14 0.13 0.42 0.23 0.23 0.14 0.31 0.03 0.54 0.05 0.49 0.02 0.07 1.0 0.19 0.23 0.49 0.1 0.03 0.13 0.5 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)