1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_110 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000391 (CYP704A2)
 0.27 0.47 0.4 0.27 1.0 0.71 0.16 0.11 0.27 0.3 0.2 0.23 0.11 0.61 0.65 0.37 0.25 0.32 0.3 0.25 0.25 0.38 0.41 0.18 0.18 0.13 0.19 0.25 0.25 0.32 0.09
Bra001024 (MUB1)
 0.45 0.56 0.54 0.28 1.0 0.83 0.26 0.18 0.28 0.41 0.31 0.33 0.2 0.68 0.83 0.48 0.44 0.33 0.43 0.51 0.45 0.54 0.44 0.28 0.27 0.21 0.31 0.36 0.33 0.25 0.12
Bra002307 (AL5)
 0.19 0.14 0.23 0.11 1.0 0.8 0.19 0.24 0.36 0.21 0.24 0.2 0.45 0.85 0.98 0.28 0.32 0.49 0.49 0.28 0.28 0.28 0.56 0.38 0.3 0.18 0.34 0.38 0.48 0.2 0.4
Bra003729 (RLP15)
 0.22 0.53 0.26 0.19 1.0 0.96 0.13 0.07 0.18 0.3 0.26 0.28 0.24 0.54 0.94 0.44 0.26 0.42 0.41 0.29 0.25 0.35 0.49 0.1 0.07 0.18 0.13 0.08 0.08 0.08 0.07
0.08 0.19 0.27 0.12 1.0 0.66 0.19 0.13 0.25 0.3 0.19 0.15 0.11 0.49 0.56 0.25 0.26 0.42 0.38 0.2 0.15 0.34 0.12 0.25 0.15 0.09 0.22 0.22 0.23 0.21 0.15
0.28 0.23 0.29 0.18 1.0 0.87 0.24 0.21 0.33 0.41 0.3 0.25 0.29 0.59 0.73 0.48 0.42 0.4 0.41 0.4 0.36 0.41 0.24 0.3 0.22 0.2 0.28 0.29 0.3 0.36 0.27
Bra004679 (bHLH48)
 0.18 0.19 0.15 0.24 1.0 0.79 0.26 0.3 0.44 0.52 0.5 0.35 0.42 0.86 0.95 0.5 0.45 0.52 0.69 0.41 0.47 0.46 0.33 0.41 0.5 0.35 0.45 0.39 0.61 0.36 0.27
0.42 0.2 0.11 0.03 1.0 0.75 0.2 0.04 0.33 0.3 0.28 0.31 0.12 0.97 0.83 0.52 0.46 0.24 0.46 0.14 0.34 0.23 0.01 0.11 0.08 0.01 0.0 0.0 0.15 0.01 0.03
0.27 0.18 0.22 0.13 0.86 0.45 0.12 0.09 0.33 0.27 0.27 0.31 0.2 0.73 1.0 0.19 0.23 0.62 0.41 0.2 0.16 0.15 0.32 0.19 0.2 0.18 0.17 0.31 0.4 0.45 0.39
0.67 0.87 0.79 0.62 0.99 1.0 0.54 0.42 0.59 0.51 0.59 0.51 0.27 0.85 0.83 0.62 0.56 0.4 0.64 0.62 0.53 0.64 0.49 0.59 0.52 0.43 0.56 0.57 0.74 0.63 0.49
0.3 0.3 0.46 0.38 0.86 0.97 0.49 0.38 0.37 0.39 0.4 0.33 0.42 0.99 1.0 0.7 0.68 0.53 0.51 0.52 0.54 0.49 0.63 0.51 0.54 0.49 0.47 0.47 0.53 0.33 0.43
0.43 0.36 0.3 0.29 1.0 0.77 0.41 0.35 0.54 0.41 0.45 0.43 0.65 0.95 0.89 0.7 0.44 0.55 0.67 0.48 0.52 0.57 0.58 0.3 0.28 0.3 0.25 0.31 0.31 0.31 0.52
Bra010500 (SHD)
 0.39 0.13 0.11 0.08 0.74 0.69 0.36 0.16 0.28 0.29 0.29 0.37 0.18 1.0 0.99 0.47 0.57 0.18 0.34 0.41 0.47 0.35 0.26 0.23 0.18 0.13 0.13 0.19 0.32 0.17 0.1
0.21 0.07 0.13 0.02 1.0 0.74 0.21 0.12 0.24 0.31 0.26 0.28 0.1 0.46 0.96 0.46 0.28 0.14 0.32 0.25 0.17 0.3 0.19 0.24 0.13 0.2 0.12 0.2 0.24 0.26 0.2
Bra011038 (CKL6)
 0.46 0.65 0.64 0.39 0.91 0.84 0.57 0.58 0.57 0.63 0.59 0.61 0.61 0.86 1.0 0.68 0.7 0.54 0.5 0.57 0.52 0.64 0.61 0.46 0.5 0.4 0.47 0.53 0.54 0.59 0.5
Bra012894 (KRP2)
 0.17 0.08 0.06 0.02 1.0 0.71 0.25 0.09 0.34 0.12 0.23 0.33 0.19 0.62 0.85 0.21 0.22 0.13 0.32 0.22 0.15 0.27 0.06 0.13 0.14 0.06 0.15 0.44 0.33 0.11 0.09
Bra013012 (AAE17)
 0.3 0.43 0.51 0.49 0.83 0.91 0.32 0.17 0.43 0.36 0.41 0.28 0.25 1.0 0.98 0.57 0.44 0.48 0.51 0.42 0.41 0.45 0.6 0.26 0.27 0.2 0.27 0.28 0.33 0.19 0.34
0.53 0.23 0.26 0.26 1.0 0.87 0.33 0.2 0.55 0.45 0.53 0.4 0.36 0.76 0.83 0.69 0.58 0.64 0.63 0.44 0.5 0.49 0.38 0.31 0.43 0.24 0.31 0.39 0.32 0.38 0.24
Bra013676 (RLK4)
 0.15 0.3 0.24 0.17 0.73 1.0 0.37 0.18 0.3 0.32 0.33 0.37 0.25 0.7 0.92 0.56 0.53 0.49 0.38 0.45 0.22 0.65 0.93 0.27 0.2 0.17 0.28 0.26 0.29 0.22 0.1
Bra013677 (RLK4)
 0.22 0.34 0.34 0.25 0.85 1.0 0.27 0.15 0.27 0.31 0.26 0.32 0.12 0.66 0.7 0.62 0.37 0.36 0.31 0.43 0.22 0.36 0.31 0.21 0.18 0.19 0.2 0.28 0.26 0.23 0.1
0.28 0.4 0.23 0.17 0.74 1.0 0.11 0.04 0.19 0.2 0.18 0.21 0.04 0.57 0.92 0.32 0.18 0.07 0.23 0.11 0.17 0.31 0.44 0.15 0.13 0.1 0.14 0.29 0.29 0.26 0.09
Bra014862 (RBL4)
 0.35 0.39 0.34 0.28 0.82 0.84 0.46 0.33 0.46 0.39 0.4 0.34 0.37 0.64 1.0 0.51 0.43 0.44 0.43 0.48 0.51 0.47 0.58 0.4 0.38 0.33 0.34 0.46 0.44 0.34 0.32
Bra015708 (PRAF1)
 0.62 0.7 0.8 0.53 0.89 0.92 0.54 0.41 0.5 0.61 0.5 0.55 0.49 0.91 1.0 0.79 0.77 0.77 0.59 0.61 0.59 0.61 0.59 0.59 0.52 0.62 0.58 0.75 0.68 0.61 0.59
Bra016023 (TMEM16)
 0.81 0.88 0.79 0.85 1.0 0.93 0.49 0.58 0.64 0.58 0.57 0.65 0.6 0.94 0.81 0.76 0.73 0.58 0.51 0.59 0.57 0.59 0.45 0.51 0.5 0.63 0.52 0.57 0.64 0.58 0.5
Bra016950 (CRK1)
 0.23 0.23 0.31 0.17 1.0 0.66 0.24 0.1 0.3 0.42 0.25 0.28 0.23 0.79 0.86 0.44 0.3 0.44 0.32 0.23 0.25 0.26 0.5 0.13 0.12 0.14 0.14 0.11 0.17 0.22 0.07
Bra017348 (PDF1)
 0.65 0.74 0.51 0.45 0.89 1.0 0.43 0.42 0.55 0.53 0.48 0.46 0.56 0.94 0.98 0.56 0.62 0.61 0.54 0.57 0.43 0.56 0.82 0.5 0.49 0.41 0.44 0.51 0.52 0.43 0.5
0.39 0.62 0.56 0.65 1.0 0.76 0.34 0.27 0.42 0.47 0.42 0.45 0.27 0.78 0.8 0.56 0.45 0.33 0.48 0.47 0.46 0.56 0.62 0.42 0.43 0.43 0.34 0.53 0.46 0.35 0.25
0.2 0.17 0.16 0.07 1.0 0.69 0.12 0.15 0.37 0.3 0.28 0.31 0.32 0.66 0.95 0.2 0.15 0.15 0.35 0.31 0.32 0.39 0.52 0.26 0.26 0.23 0.27 0.41 0.41 0.31 0.32
Bra017623 (MCCB)
 0.25 0.21 0.24 0.18 1.0 0.86 0.38 0.19 0.17 0.3 0.27 0.23 0.31 0.44 0.61 0.66 0.48 0.27 0.49 0.45 0.41 0.45 0.24 0.4 0.38 0.28 0.35 0.31 0.31 0.31 0.34
0.5 0.75 0.53 0.44 0.85 0.76 0.48 0.48 0.54 0.64 0.54 0.59 0.57 0.94 1.0 0.63 0.63 0.62 0.72 0.52 0.63 0.65 0.59 0.43 0.45 0.36 0.42 0.37 0.43 0.39 0.5
0.33 0.31 0.34 0.3 0.94 1.0 0.33 0.19 0.41 0.36 0.39 0.3 0.19 0.79 0.61 0.5 0.47 0.41 0.39 0.41 0.36 0.41 0.49 0.31 0.26 0.26 0.27 0.32 0.4 0.33 0.36
Bra019459 (NAC061)
 0.18 0.22 0.38 0.12 0.62 1.0 0.26 0.1 0.32 0.22 0.24 0.33 0.05 0.78 0.8 0.38 0.29 0.09 0.22 0.32 0.27 0.41 0.81 0.32 0.24 0.27 0.23 0.23 0.32 0.35 0.11
Bra019955 (MPK1)
 0.58 0.62 0.57 0.37 0.79 0.78 0.26 0.17 0.47 0.46 0.51 0.44 0.22 0.76 1.0 0.38 0.37 0.57 0.56 0.41 0.35 0.54 0.66 0.4 0.4 0.3 0.41 0.46 0.46 0.49 0.37
Bra020107 (AL5)
 0.34 0.17 0.35 0.41 1.0 0.96 0.3 0.22 0.47 0.41 0.51 0.29 0.33 0.84 0.72 0.49 0.39 0.28 0.51 0.46 0.42 0.39 0.29 0.45 0.47 0.42 0.39 0.47 0.51 0.37 0.37
Bra020430 (CBP60b)
 0.66 0.77 0.58 0.45 1.0 0.83 0.32 0.31 0.44 0.52 0.4 0.4 0.22 0.72 0.74 0.56 0.5 0.32 0.45 0.48 0.4 0.52 0.32 0.36 0.35 0.3 0.36 0.44 0.46 0.45 0.22
Bra020999 (RLP31)
 0.12 0.27 0.36 0.07 0.37 1.0 0.18 0.05 0.31 0.22 0.17 0.28 0.07 0.52 0.97 0.45 0.29 0.22 0.25 0.17 0.25 0.38 0.72 0.27 0.23 0.13 0.25 0.23 0.24 0.15 0.04
0.55 0.66 0.61 0.53 0.86 1.0 0.44 0.37 0.54 0.57 0.55 0.53 0.41 0.79 0.9 0.72 0.7 0.46 0.58 0.65 0.55 0.63 0.78 0.54 0.52 0.43 0.51 0.52 0.59 0.52 0.41
0.36 0.33 0.41 0.32 1.0 0.82 0.43 0.29 0.51 0.41 0.41 0.4 0.6 0.78 0.79 0.64 0.54 0.59 0.51 0.53 0.55 0.5 0.41 0.32 0.3 0.31 0.31 0.27 0.25 0.19 0.28
Bra023351 (LOG8)
 0.09 0.03 0.11 0.06 0.8 0.47 0.05 0.04 0.13 0.1 0.13 0.05 0.25 0.44 1.0 0.16 0.09 0.31 0.16 0.19 0.12 0.13 0.1 0.04 0.05 0.02 0.06 0.06 0.06 0.03 0.01
Bra024315 (C/VIF2)
 0.52 0.32 0.5 0.3 0.91 1.0 0.24 0.18 0.39 0.49 0.39 0.3 0.34 0.83 0.92 0.57 0.39 0.41 0.55 0.46 0.45 0.48 0.41 0.29 0.31 0.31 0.25 0.48 0.45 0.39 0.22
Bra024915 (NPY6)
 0.44 0.37 0.59 0.34 0.91 0.99 0.3 0.21 0.5 0.56 0.56 0.4 0.44 0.9 1.0 0.63 0.58 0.6 0.67 0.62 0.56 0.58 0.54 0.37 0.42 0.35 0.41 0.41 0.43 0.31 0.27
Bra024926 (NUDT2)
 0.37 0.44 0.36 0.24 1.0 0.86 0.24 0.18 0.51 0.53 0.61 0.55 0.26 0.79 0.9 0.56 0.57 0.42 0.57 0.34 0.44 0.66 0.29 0.3 0.27 0.27 0.3 0.25 0.3 0.42 0.36
Bra024961 (GATA27)
 0.26 0.22 0.25 0.2 0.69 0.89 0.42 0.36 0.6 0.48 0.44 0.42 0.29 0.72 1.0 0.61 0.4 0.45 0.47 0.49 0.41 0.62 0.74 0.25 0.27 0.23 0.25 0.27 0.27 0.22 0.23
0.51 0.57 0.52 0.41 0.69 1.0 0.31 0.23 0.32 0.33 0.31 0.27 0.26 0.81 0.9 0.61 0.4 0.35 0.5 0.4 0.4 0.49 0.55 0.27 0.23 0.3 0.24 0.36 0.38 0.24 0.22
Bra026780 (PSS1)
 0.38 0.37 0.41 0.44 0.84 0.85 0.57 0.43 0.43 0.46 0.47 0.52 0.57 0.99 1.0 0.66 0.53 0.66 0.48 0.47 0.47 0.54 0.74 0.36 0.42 0.27 0.35 0.43 0.43 0.31 0.4
Bra027195 (RFO3)
 0.29 0.28 0.42 0.22 0.79 1.0 0.31 0.24 0.45 0.41 0.31 0.48 0.26 0.83 0.7 0.47 0.51 0.56 0.33 0.32 0.35 0.5 0.56 0.24 0.27 0.24 0.29 0.27 0.3 0.34 0.4
0.06 0.07 0.09 0.06 0.63 0.66 0.1 0.14 0.14 0.14 0.12 0.12 0.25 0.55 1.0 0.15 0.16 0.23 0.31 0.21 0.25 0.21 0.36 0.27 0.18 0.11 0.17 0.24 0.19 0.08 0.2
Bra027279 (HCF243)
 0.18 0.15 0.26 0.09 0.76 0.63 0.17 0.19 0.31 0.21 0.21 0.18 0.24 0.75 1.0 0.19 0.18 0.62 0.38 0.23 0.15 0.18 0.24 0.3 0.27 0.16 0.27 0.39 0.52 0.45 0.41
Bra027306 (LIK1)
 0.16 0.2 0.29 0.1 1.0 0.74 0.15 0.14 0.16 0.26 0.15 0.2 0.08 0.77 0.64 0.32 0.21 0.12 0.34 0.3 0.29 0.33 0.05 0.05 0.05 0.04 0.06 0.06 0.05 0.08 0.01
0.1 0.07 0.15 0.1 0.63 0.69 0.25 0.17 0.27 0.23 0.18 0.12 0.2 0.72 1.0 0.22 0.25 0.28 0.28 0.27 0.24 0.24 0.25 0.17 0.18 0.08 0.09 0.17 0.12 0.13 0.12
Bra029240 (RAC10)
 0.29 0.28 0.36 0.21 0.73 1.0 0.49 0.36 0.35 0.36 0.47 0.28 0.56 0.66 0.81 0.68 0.62 0.57 0.56 0.58 0.45 0.58 0.63 0.61 0.62 0.51 0.6 0.53 0.52 0.3 0.4
0.0 0.01 0.02 0.01 1.0 0.5 0.02 0.01 0.06 0.11 0.03 0.03 0.03 0.3 0.74 0.2 0.08 0.1 0.09 0.05 0.07 0.09 0.12 0.02 0.03 0.0 0.02 0.04 0.05 0.06 0.01
Bra030549 (ABCI19)
 0.32 0.38 0.35 0.31 0.82 0.8 0.52 0.4 0.37 0.4 0.46 0.38 0.45 1.0 0.97 0.54 0.41 0.64 0.57 0.44 0.37 0.5 0.45 0.37 0.45 0.31 0.38 0.41 0.38 0.31 0.34
Bra030997 (CHS1)
 0.18 0.39 0.34 0.26 1.0 0.89 0.08 0.06 0.23 0.36 0.18 0.19 0.07 0.66 0.91 0.42 0.37 0.16 0.33 0.32 0.24 0.33 0.46 0.15 0.13 0.1 0.12 0.15 0.24 0.31 0.1
Bra031259 (ACA9)
 0.07 0.17 0.04 0.06 1.0 0.51 0.1 0.04 0.11 0.09 0.13 0.08 0.05 0.86 0.49 0.08 0.15 0.14 0.21 0.19 0.09 0.1 0.09 0.05 0.15 0.31 0.08 0.23 0.3 0.09 0.09
0.08 0.09 0.15 0.08 0.96 0.42 0.07 0.03 0.15 0.19 0.14 0.08 0.2 0.8 1.0 0.21 0.08 0.43 0.28 0.1 0.11 0.09 0.2 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02
0.31 0.37 0.41 0.27 0.74 0.73 0.4 0.34 0.57 0.41 0.46 0.41 0.41 1.0 0.96 0.42 0.34 0.64 0.48 0.39 0.33 0.38 0.45 0.52 0.49 0.39 0.43 0.53 0.62 0.56 0.56
Bra035437 (MPK2)
 0.4 0.58 0.42 0.4 0.91 0.93 0.34 0.25 0.54 0.56 0.53 0.55 0.25 0.82 1.0 0.49 0.46 0.62 0.64 0.42 0.46 0.64 0.52 0.44 0.41 0.35 0.45 0.45 0.44 0.51 0.3
Bra036194 (FRA1)
 0.34 0.31 0.38 0.34 1.0 0.8 0.51 0.43 0.42 0.57 0.49 0.39 0.57 0.59 0.74 0.57 0.52 0.37 0.51 0.5 0.38 0.47 0.32 0.35 0.36 0.34 0.33 0.33 0.37 0.36 0.37
Bra037495 (ADG1)
 0.21 0.1 0.12 0.14 1.0 0.43 0.19 0.12 0.23 0.28 0.26 0.16 0.24 0.54 0.56 0.34 0.33 0.23 0.32 0.28 0.25 0.28 0.12 0.27 0.22 0.19 0.22 0.28 0.34 0.31 0.29
Bra037992 (AAE18)
 0.27 0.35 0.33 0.27 0.86 1.0 0.53 0.35 0.28 0.34 0.3 0.3 0.42 0.87 0.9 0.63 0.53 0.55 0.48 0.5 0.42 0.38 0.54 0.31 0.31 0.26 0.32 0.39 0.36 0.29 0.33
Bra038295 (IFL)
 0.04 0.02 0.05 0.01 0.82 0.64 0.08 0.08 0.09 0.16 0.09 0.09 0.18 0.47 1.0 0.11 0.1 0.16 0.15 0.11 0.13 0.1 0.05 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02
Bra038321 (SP1L2)
 0.18 0.19 0.26 0.14 1.0 0.55 0.05 0.07 0.21 0.4 0.3 0.18 0.15 0.49 0.75 0.35 0.27 0.31 0.36 0.29 0.29 0.32 0.21 0.18 0.19 0.12 0.18 0.14 0.15 0.27 0.26
Bra038739 (SAP5)
 0.46 0.49 0.56 0.53 0.82 0.93 0.54 0.42 0.58 0.45 0.48 0.45 0.52 1.0 0.99 0.73 0.54 0.57 0.58 0.64 0.62 0.63 0.54 0.42 0.4 0.46 0.34 0.39 0.51 0.48 0.43

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)