1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_85 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000018 (AKR4C9)
 0.07 0.04 0.04 0.02 0.24 0.2 0.06 0.05 0.08 0.08 0.07 0.07 0.11 0.22 0.19 0.09 0.07 0.18 0.09 0.06 0.09 0.1 1.0 0.04 0.04 0.03 0.03 0.05 0.04 0.03 0.04
Bra001865 (HSR3)
 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.09 0.04 0.02 0.06 0.05 0.04 0.06 0.04 0.32 0.32 0.1 0.06 0.35 0.06 0.05 0.06 0.07 1.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02
0.12 0.18 0.27 0.07 0.22 0.22 0.05 0.05 0.11 0.1 0.06 0.1 0.04 0.32 0.28 0.14 0.05 0.17 0.09 0.09 0.06 0.11 1.0 0.11 0.07 0.04 0.09 0.08 0.14 0.14 0.2
Bra002594 (HAI1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.19 0.25 0.02 0.01 0.1 0.03 0.01 0.0 0.0 1.0 0.04 0.02 0.01 0.02 0.03 0.04 0.04 0.05
0.07 0.09 0.11 0.09 0.23 0.29 0.08 0.08 0.12 0.13 0.08 0.12 0.24 0.34 0.39 0.18 0.15 0.21 0.17 0.16 0.16 0.15 1.0 0.15 0.12 0.08 0.09 0.09 0.1 0.11 0.12
0.19 0.21 0.24 0.24 0.34 0.3 0.17 0.13 0.2 0.19 0.15 0.18 0.14 0.35 0.37 0.2 0.17 0.2 0.18 0.19 0.16 0.2 1.0 0.19 0.19 0.26 0.16 0.15 0.22 0.28 0.25
Bra003789 (SID2)
 0.13 0.1 0.12 0.08 0.17 0.16 0.07 0.09 0.21 0.1 0.12 0.15 0.06 0.17 0.18 0.07 0.07 0.08 0.13 0.08 0.11 0.11 1.0 0.16 0.14 0.14 0.13 0.18 0.23 0.21 0.21
0.06 0.05 0.02 0.02 0.22 0.17 0.05 0.05 0.08 0.06 0.06 0.02 0.12 0.17 0.21 0.15 0.1 0.17 0.11 0.07 0.07 0.13 1.0 0.1 0.14 0.09 0.08 0.1 0.09 0.08 0.16
0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.09 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.07 0.17 0.13 0.03 0.02 0.19 0.05 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.03 0.14
0.09 0.09 0.12 0.18 0.2 0.32 0.14 0.1 0.21 0.15 0.11 0.17 0.16 0.28 0.36 0.14 0.12 0.21 0.18 0.13 0.17 0.18 1.0 0.08 0.07 0.06 0.08 0.08 0.13 0.06 0.09
Bra005163 (AKR4C8)
 0.14 0.23 0.1 0.12 0.33 0.3 0.11 0.08 0.08 0.08 0.05 0.08 0.32 0.21 0.29 0.23 0.21 0.25 0.12 0.12 0.11 0.13 1.0 0.13 0.17 0.15 0.13 0.14 0.12 0.12 0.15
Bra005351 (EDL3)
 0.0 0.0 0.04 0.0 0.1 0.05 0.05 0.02 0.04 0.02 0.01 0.04 0.02 0.14 0.32 0.05 0.03 0.18 0.09 0.05 0.04 0.02 1.0 0.06 0.06 0.01 0.03 0.06 0.12 0.1 0.06
0.05 0.06 0.04 0.04 0.21 0.31 0.06 0.03 0.06 0.09 0.09 0.05 0.05 0.22 0.26 0.05 0.07 0.4 0.1 0.08 0.06 0.13 1.0 0.04 0.05 0.03 0.04 0.05 0.05 0.03 0.02
0.03 0.08 0.02 0.03 0.12 0.12 0.09 0.08 0.11 0.12 0.13 0.09 0.16 0.22 0.3 0.15 0.17 0.24 0.11 0.16 0.13 0.08 1.0 0.14 0.1 0.09 0.1 0.05 0.12 0.1 0.18
Bra006879 (ACX4)
 0.2 0.3 0.3 0.16 0.33 0.27 0.1 0.1 0.19 0.16 0.13 0.13 0.15 0.34 0.33 0.13 0.14 0.35 0.16 0.11 0.12 0.13 1.0 0.1 0.1 0.08 0.09 0.09 0.11 0.13 0.2
Bra008060 (TN6)
 0.04 0.05 0.01 0.02 0.12 0.13 0.02 0.03 0.1 0.07 0.06 0.04 0.05 0.18 0.18 0.04 0.07 0.09 0.07 0.02 0.05 0.06 1.0 0.15 0.11 0.11 0.13 0.12 0.19 0.1 0.14
Bra010049 (HSFB2A)
 0.02 0.02 0.06 0.01 0.11 0.21 0.02 0.01 0.05 0.03 0.04 0.04 0.1 0.18 0.21 0.13 0.09 0.12 0.05 0.08 0.07 0.06 1.0 0.06 0.05 0.05 0.04 0.03 0.04 0.04 0.1
0.04 0.05 0.06 0.02 0.1 0.19 0.04 0.03 0.11 0.04 0.03 0.04 0.05 0.26 0.27 0.04 0.03 0.35 0.06 0.06 0.03 0.03 1.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.05 0.04 0.1
Bra013628 (TPPG)
 0.01 0.01 0.02 0.03 0.13 0.11 0.14 0.11 0.11 0.13 0.1 0.1 0.12 0.18 0.16 0.19 0.13 0.13 0.1 0.11 0.11 0.14 1.0 0.09 0.09 0.14 0.08 0.07 0.08 0.06 0.05
Bra013744 (UGE2)
 0.13 0.14 0.13 0.15 0.28 0.24 0.14 0.11 0.21 0.2 0.16 0.17 0.2 0.29 0.3 0.23 0.19 0.27 0.18 0.12 0.13 0.19 1.0 0.22 0.22 0.26 0.22 0.21 0.24 0.21 0.25
Bra014189 (AIW2)
 0.03 0.0 0.03 0.02 0.27 0.24 0.03 0.02 0.11 0.06 0.07 0.05 0.15 0.19 0.43 0.34 0.17 0.12 0.13 0.17 0.08 0.09 1.0 0.07 0.09 0.03 0.05 0.05 0.11 0.08 0.07
Bra015435 (UGT1)
 0.02 0.01 0.0 0.01 0.12 0.21 0.17 0.09 0.11 0.07 0.08 0.06 0.1 0.21 0.21 0.17 0.11 0.12 0.15 0.15 0.14 0.09 1.0 0.13 0.12 0.06 0.08 0.13 0.25 0.07 0.12
Bra015579 (HON)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.02 0.0 0.04 0.02 0.02 0.03 0.02 0.22 0.32 0.05 0.03 0.21 0.06 0.03 0.02 0.03 1.0 0.04 0.04 0.01 0.03 0.01 0.04 0.05 0.06
Bra018116 (ATH1)
 0.21 0.19 0.17 0.14 0.26 0.26 0.11 0.11 0.16 0.12 0.1 0.15 0.12 0.34 0.29 0.13 0.13 0.14 0.1 0.11 0.1 0.1 1.0 0.1 0.09 0.08 0.1 0.12 0.16 0.12 0.14
0.05 0.09 0.08 0.06 0.26 0.23 0.12 0.05 0.16 0.15 0.09 0.13 0.09 0.32 0.33 0.15 0.09 0.22 0.13 0.07 0.15 0.11 1.0 0.09 0.08 0.04 0.08 0.1 0.1 0.14 0.09
0.03 0.03 0.03 0.03 0.16 0.21 0.07 0.05 0.08 0.06 0.05 0.06 0.07 0.23 0.25 0.11 0.09 0.27 0.1 0.08 0.08 0.07 1.0 0.1 0.09 0.07 0.09 0.11 0.15 0.09 0.2
Bra021580 (TBL41)
 0.02 0.03 0.0 0.01 0.2 0.18 0.02 0.02 0.03 0.04 0.04 0.01 0.02 0.08 0.05 0.02 0.04 0.11 0.04 0.01 0.03 0.04 1.0 0.05 0.04 0.03 0.07 0.11 0.08 0.04 0.02
0.1 0.06 0.07 0.04 0.23 0.2 0.05 0.05 0.11 0.1 0.07 0.07 0.11 0.18 0.23 0.15 0.1 0.32 0.13 0.1 0.07 0.08 1.0 0.14 0.08 0.04 0.09 0.1 0.11 0.12 0.15
0.04 0.04 0.07 0.04 0.14 0.2 0.1 0.06 0.03 0.09 0.05 0.05 0.07 0.2 0.16 0.1 0.07 0.25 0.15 0.09 0.11 0.08 1.0 0.15 0.18 0.16 0.16 0.16 0.28 0.18 0.19
Bra022660 (CB5-E)
 0.18 0.19 0.23 0.17 0.39 0.32 0.19 0.22 0.27 0.21 0.22 0.2 0.26 0.45 0.43 0.22 0.19 0.27 0.2 0.22 0.21 0.24 1.0 0.24 0.22 0.2 0.22 0.24 0.27 0.2 0.23
Bra022768 (NDA2)
 0.03 0.02 0.02 0.03 0.27 0.21 0.06 0.06 0.1 0.08 0.07 0.07 0.1 0.29 0.29 0.09 0.08 0.24 0.08 0.06 0.06 0.07 1.0 0.07 0.07 0.06 0.07 0.1 0.14 0.06 0.08
Bra022781 (UGT87A2)
 0.02 0.01 0.02 0.02 0.13 0.2 0.15 0.09 0.09 0.08 0.08 0.08 0.09 0.25 0.25 0.18 0.09 0.16 0.14 0.11 0.11 0.1 1.0 0.07 0.05 0.02 0.05 0.06 0.09 0.04 0.05
0.02 0.02 0.03 0.02 0.14 0.22 0.19 0.14 0.08 0.1 0.09 0.09 0.11 0.21 0.23 0.25 0.18 0.08 0.15 0.15 0.14 0.12 1.0 0.14 0.16 0.12 0.13 0.13 0.15 0.05 0.06
0.21 0.23 0.21 0.22 0.36 0.41 0.21 0.17 0.23 0.21 0.22 0.21 0.26 0.35 0.39 0.32 0.24 0.34 0.22 0.23 0.22 0.25 1.0 0.18 0.22 0.19 0.19 0.22 0.22 0.22 0.2
0.22 0.21 0.15 0.17 0.3 0.25 0.16 0.14 0.14 0.17 0.12 0.15 0.13 0.24 0.3 0.16 0.16 0.3 0.1 0.15 0.11 0.17 1.0 0.13 0.15 0.22 0.14 0.14 0.17 0.15 0.14
Bra027849 (ZCF37)
 0.0 0.02 0.06 0.02 0.04 0.15 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.02 0.15 0.15 0.04 0.02 0.06 0.09 0.01 0.0 0.08 1.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.07 0.0
Bra029201 (NAC102)
 0.03 0.03 0.02 0.01 0.21 0.21 0.03 0.02 0.07 0.03 0.03 0.03 0.02 0.17 0.17 0.05 0.03 0.08 0.07 0.02 0.02 0.03 1.0 0.08 0.06 0.03 0.06 0.15 0.23 0.13 0.1
Bra029476 (SDRA)
 0.14 0.12 0.15 0.1 0.33 0.25 0.12 0.09 0.13 0.14 0.15 0.11 0.14 0.3 0.33 0.15 0.14 0.26 0.15 0.11 0.1 0.13 1.0 0.12 0.11 0.12 0.11 0.13 0.13 0.16 0.13
Bra029496 (CRK36)
 0.02 0.04 0.03 0.0 0.26 0.15 0.01 0.04 0.06 0.05 0.08 0.02 0.04 0.25 0.3 0.09 0.03 0.12 0.07 0.05 0.01 0.06 1.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.04 0.01 0.0
Bra029608 (MFP2)
 0.05 0.06 0.05 0.03 0.23 0.19 0.04 0.04 0.09 0.09 0.1 0.09 0.07 0.21 0.19 0.1 0.06 0.18 0.1 0.06 0.06 0.09 1.0 0.13 0.11 0.1 0.12 0.15 0.2 0.17 0.19
Bra031574 (HON)
 0.06 0.08 0.05 0.02 0.11 0.13 0.03 0.03 0.07 0.05 0.03 0.04 0.04 0.2 0.23 0.04 0.04 0.25 0.08 0.04 0.06 0.05 1.0 0.16 0.12 0.12 0.06 0.1 0.21 0.14 0.21
0.1 0.1 0.06 0.09 0.32 0.24 0.05 0.05 0.05 0.07 0.07 0.08 0.15 0.3 0.32 0.13 0.1 0.23 0.09 0.09 0.1 0.09 1.0 0.05 0.08 0.07 0.06 0.05 0.06 0.04 0.16
0.09 0.07 0.1 0.14 0.24 0.2 0.05 0.06 0.1 0.08 0.07 0.08 0.07 0.21 0.25 0.07 0.05 0.25 0.08 0.04 0.05 0.05 1.0 0.09 0.08 0.07 0.08 0.13 0.14 0.11 0.11
Bra033071 (AIG2)
 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.12 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.23 0.25 0.01 0.01 0.14 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.05 0.03 0.01 0.03
0.06 0.08 0.1 0.06 0.22 0.14 0.07 0.03 0.11 0.02 0.05 0.04 0.05 0.31 0.22 0.06 0.01 0.28 0.03 0.06 0.06 0.02 1.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.06
Bra036698 (GCS)
 0.13 0.08 0.3 0.15 0.41 0.19 0.12 0.13 0.11 0.13 0.12 0.13 0.22 0.17 0.2 0.16 0.1 0.33 0.12 0.11 0.1 0.11 1.0 0.05 0.07 0.13 0.07 0.11 0.07 0.06 0.12
Bra038949 (XGD1)
 0.07 0.06 0.07 0.02 0.22 0.36 0.07 0.05 0.1 0.11 0.07 0.08 0.06 0.42 0.33 0.09 0.08 0.37 0.13 0.11 0.08 0.14 1.0 0.07 0.08 0.03 0.06 0.1 0.11 0.06 0.06
Bra040472 (ARO2)
 0.06 0.08 0.12 0.0 0.17 0.09 0.0 0.01 0.03 0.0 0.03 0.03 0.04 0.22 0.09 0.01 0.01 0.46 0.03 0.0 0.01 0.07 1.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.05 0.02 0.03 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)