1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_226 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000954 (STE24)
 0.29 0.44 0.37 0.24 0.56 0.55 0.15 0.12 0.21 0.24 0.2 0.16 0.26 0.48 0.5 0.34 0.27 0.26 0.17 0.23 0.15 0.18 1.0 0.22 0.23 0.21 0.27 0.23 0.28 0.25 0.26
Bra002054 (AP19)
 0.64 0.74 0.62 0.62 1.0 0.8 0.51 0.48 0.5 0.56 0.46 0.47 0.61 0.79 0.7 0.49 0.42 0.47 0.42 0.51 0.48 0.54 0.89 0.48 0.45 0.45 0.45 0.57 0.51 0.43 0.44
0.21 0.31 0.26 0.15 1.0 0.78 0.12 0.04 0.23 0.38 0.21 0.18 0.08 0.45 0.62 0.19 0.27 0.46 0.28 0.2 0.19 0.42 1.0 0.28 0.21 0.17 0.21 0.16 0.22 0.17 0.11
0.27 0.29 0.19 0.16 0.59 0.56 0.15 0.15 0.16 0.26 0.19 0.16 0.23 0.43 0.33 0.34 0.24 0.26 0.22 0.21 0.2 0.21 1.0 0.31 0.31 0.28 0.31 0.27 0.38 0.35 0.29
0.42 0.51 0.48 0.45 0.82 0.76 0.38 0.38 0.4 0.44 0.4 0.39 0.43 0.67 0.83 0.61 0.5 0.46 0.5 0.5 0.42 0.54 1.0 0.43 0.46 0.56 0.49 0.45 0.47 0.45 0.4
Bra004761 (FPA)
 0.49 0.51 0.53 0.55 0.66 0.72 0.49 0.46 0.4 0.42 0.43 0.42 0.43 0.64 0.65 0.54 0.52 0.27 0.41 0.46 0.49 0.42 1.0 0.47 0.44 0.53 0.43 0.42 0.44 0.4 0.43
Bra007911 (ENT1)
 0.75 0.86 0.92 0.64 1.0 0.84 0.35 0.34 0.69 0.65 0.58 0.61 0.46 0.86 0.95 0.53 0.47 0.74 0.54 0.47 0.58 0.58 0.94 0.49 0.46 0.64 0.54 0.69 0.79 0.68 0.46
Bra008389 (HAC1)
 0.66 0.56 0.51 0.47 0.97 1.0 0.4 0.33 0.62 0.41 0.52 0.48 0.34 0.84 0.79 0.5 0.45 0.47 0.49 0.63 0.45 0.57 0.99 0.54 0.58 0.56 0.7 0.73 0.91 0.8 0.72
0.41 0.4 0.42 0.5 0.62 0.66 0.31 0.31 0.41 0.38 0.44 0.44 0.35 0.56 0.56 0.45 0.36 0.4 0.4 0.46 0.43 0.35 1.0 0.37 0.42 0.51 0.4 0.47 0.55 0.48 0.51
0.58 0.53 0.46 0.54 0.8 0.88 0.53 0.48 0.52 0.51 0.48 0.45 0.48 0.74 0.84 0.65 0.59 0.4 0.5 0.57 0.55 0.51 1.0 0.56 0.56 0.5 0.55 0.65 0.65 0.48 0.55
0.2 0.18 0.34 0.2 0.83 0.7 0.34 0.39 0.43 0.46 0.42 0.48 0.59 1.0 0.88 0.57 0.41 0.48 0.43 0.58 0.53 0.55 0.9 0.38 0.37 0.4 0.33 0.43 0.38 0.24 0.26
0.63 0.6 0.73 0.63 0.77 0.81 0.41 0.37 0.49 0.47 0.45 0.45 0.39 0.66 0.71 0.52 0.45 0.38 0.44 0.46 0.4 0.47 1.0 0.54 0.55 0.52 0.53 0.65 0.76 0.69 0.64
Bra011204 (INB2A)
 0.31 0.33 0.45 0.28 0.92 0.97 0.4 0.24 0.4 0.39 0.39 0.28 0.31 0.67 0.82 0.54 0.5 0.34 0.48 0.6 0.46 0.57 1.0 0.38 0.43 0.21 0.38 0.36 0.47 0.39 0.37
Bra011320 (Phox4)
 0.49 0.46 0.62 0.73 0.92 1.0 0.53 0.49 0.4 0.49 0.42 0.35 0.62 0.68 0.7 0.61 0.63 0.54 0.44 0.46 0.45 0.5 0.96 0.43 0.45 0.66 0.4 0.45 0.59 0.51 0.53
Bra013358 (HSF A4A)
 0.37 0.39 0.35 0.22 0.7 0.86 0.27 0.23 0.39 0.25 0.18 0.32 0.05 0.56 0.56 0.22 0.16 0.28 0.32 0.24 0.24 0.26 1.0 0.27 0.23 0.16 0.22 0.5 0.59 0.62 0.21
Bra016120 (HGPT)
 0.45 0.59 0.46 0.41 0.8 0.68 0.22 0.16 0.19 0.27 0.18 0.25 0.22 0.39 0.54 0.31 0.25 0.3 0.13 0.27 0.17 0.3 1.0 0.27 0.33 0.27 0.25 0.28 0.34 0.17 0.2
0.42 0.34 0.25 0.22 0.94 0.95 0.44 0.37 0.58 0.6 0.57 0.51 0.77 1.0 0.97 0.68 0.61 0.46 0.46 0.53 0.6 0.66 0.99 0.49 0.54 0.43 0.54 0.57 0.52 0.46 0.45
0.74 0.65 0.66 0.74 0.96 0.95 0.71 0.75 0.61 0.65 0.62 0.6 0.7 0.85 0.91 0.78 0.69 0.64 0.7 0.66 0.67 0.61 1.0 0.72 0.74 0.7 0.72 0.86 0.8 0.69 0.75
Bra017436 (VAC1)
 0.64 0.59 0.54 0.47 1.0 0.97 0.62 0.44 0.72 0.72 0.69 0.64 0.54 0.83 0.93 0.78 0.69 0.6 0.66 0.7 0.6 0.75 0.79 0.66 0.74 0.5 0.72 0.69 0.69 0.61 0.65
0.49 0.64 0.64 0.53 0.78 0.68 0.33 0.35 0.45 0.43 0.39 0.42 0.42 0.71 0.87 0.46 0.37 0.46 0.43 0.35 0.36 0.39 1.0 0.51 0.47 0.46 0.51 0.54 0.68 0.62 0.61
Bra017505 (AAD5)
 0.27 0.45 0.34 0.13 0.67 0.8 0.14 0.03 0.17 0.2 0.12 0.2 0.1 0.25 0.46 0.17 0.18 0.16 0.16 0.1 0.11 0.38 1.0 0.11 0.06 0.02 0.08 0.08 0.11 0.12 0.04
Bra017506 (AAD5)
 0.27 0.45 0.34 0.13 0.67 0.8 0.14 0.03 0.17 0.2 0.12 0.2 0.1 0.25 0.46 0.17 0.18 0.16 0.16 0.1 0.11 0.38 1.0 0.11 0.06 0.02 0.08 0.08 0.11 0.12 0.04
Bra017507 (AAD5)
 0.27 0.45 0.34 0.13 0.67 0.8 0.14 0.03 0.17 0.2 0.12 0.2 0.1 0.25 0.46 0.17 0.18 0.16 0.16 0.1 0.11 0.38 1.0 0.11 0.06 0.02 0.08 0.08 0.11 0.12 0.04
Bra017841 (ACA2)
 0.13 0.24 0.37 0.1 0.6 0.6 0.19 0.13 0.19 0.29 0.19 0.17 0.35 0.34 0.5 0.6 0.42 0.3 0.28 0.28 0.22 0.31 1.0 0.26 0.24 0.17 0.18 0.23 0.21 0.19 0.16
Bra018709 (MAIL3)
 0.5 0.61 0.57 0.32 0.76 0.75 0.23 0.26 0.28 0.23 0.22 0.21 0.33 0.6 0.71 0.4 0.26 0.35 0.35 0.26 0.24 0.29 1.0 0.31 0.33 0.42 0.34 0.51 0.55 0.47 0.39
0.7 0.89 0.57 0.57 0.78 0.68 0.41 0.47 0.51 0.4 0.43 0.43 0.47 0.77 0.67 0.4 0.4 0.48 0.44 0.35 0.41 0.44 1.0 0.45 0.41 0.38 0.41 0.44 0.55 0.4 0.42
Bra019147 (FFT)
 0.27 0.43 0.41 0.33 0.76 0.85 0.4 0.33 0.38 0.41 0.37 0.34 0.28 0.67 0.77 0.59 0.44 0.31 0.39 0.4 0.36 0.47 1.0 0.28 0.28 0.21 0.29 0.35 0.38 0.35 0.21
0.22 0.42 0.41 0.24 1.0 0.61 0.13 0.12 0.21 0.24 0.21 0.24 0.12 0.65 0.68 0.25 0.21 0.36 0.31 0.27 0.24 0.25 0.85 0.23 0.17 0.35 0.2 0.24 0.38 0.61 0.24
Bra020905 (CPL1)
 0.41 0.36 0.41 0.32 0.97 1.0 0.44 0.62 0.34 0.4 0.23 0.26 0.49 0.82 0.86 0.64 0.46 0.48 0.4 0.5 0.41 0.4 0.91 0.39 0.31 0.4 0.4 0.42 0.45 0.39 0.41
Bra021759 (EVR)
 0.24 0.33 0.44 0.17 0.88 0.75 0.1 0.06 0.31 0.21 0.16 0.22 0.04 0.31 0.5 0.25 0.19 0.16 0.18 0.16 0.14 0.24 1.0 0.19 0.15 0.16 0.18 0.3 0.37 0.54 0.11
Bra022100 (PBL19)
 0.36 0.43 0.55 0.25 0.56 0.6 0.24 0.14 0.14 0.17 0.06 0.26 0.26 0.42 0.65 0.18 0.41 0.36 0.17 0.07 0.17 0.27 1.0 0.1 0.03 0.07 0.06 0.04 0.07 0.1 0.06
Bra022827 (TBL40)
 0.38 0.25 0.41 0.24 1.0 0.79 0.06 0.04 0.16 0.22 0.22 0.1 0.08 0.4 0.34 0.13 0.17 0.06 0.13 0.05 0.15 0.15 0.85 0.05 0.05 0.04 0.05 0.07 0.06 0.03 0.02
Bra023258 (HSFA1D)
 0.43 0.51 0.49 0.57 0.71 0.65 0.27 0.21 0.21 0.37 0.35 0.31 0.52 0.49 0.84 0.48 0.56 0.44 0.28 0.28 0.28 0.36 1.0 0.4 0.38 0.34 0.36 0.29 0.35 0.29 0.4
Bra024058 (INB2A)
 0.26 0.21 0.51 0.24 0.69 0.71 0.36 0.3 0.39 0.39 0.45 0.38 0.33 0.67 0.85 0.63 0.42 0.33 0.42 0.45 0.4 0.5 1.0 0.36 0.28 0.18 0.3 0.31 0.4 0.38 0.28
0.52 0.64 0.58 0.35 0.76 0.73 0.44 0.4 0.47 0.44 0.45 0.32 0.52 0.88 0.79 0.51 0.43 0.61 0.43 0.46 0.43 0.42 1.0 0.31 0.36 0.23 0.3 0.4 0.37 0.36 0.35
0.56 0.36 0.45 0.34 0.85 0.82 0.5 0.59 0.46 0.53 0.5 0.34 0.67 0.84 0.81 0.7 0.61 0.56 0.54 0.54 0.46 0.55 1.0 0.51 0.53 0.44 0.56 0.63 0.6 0.54 0.56
0.42 0.45 0.4 0.43 0.88 1.0 0.39 0.3 0.59 0.43 0.49 0.49 0.31 0.7 0.77 0.53 0.49 0.41 0.55 0.61 0.55 0.62 0.84 0.62 0.55 0.58 0.59 0.6 0.7 0.5 0.52
0.65 0.66 0.73 0.56 1.0 1.0 0.4 0.42 0.57 0.47 0.45 0.47 0.5 0.92 0.89 0.51 0.48 0.68 0.62 0.57 0.51 0.62 0.95 0.41 0.3 0.31 0.36 0.37 0.49 0.45 0.41
Bra026001 (CWC16b)
 0.61 0.67 0.51 0.54 0.93 0.93 0.54 0.54 0.54 0.48 0.48 0.43 0.47 0.72 0.86 0.56 0.56 0.47 0.61 0.59 0.51 0.57 1.0 0.64 0.63 0.6 0.53 0.67 0.67 0.51 0.51
0.68 0.85 0.76 0.65 1.0 0.8 0.46 0.44 0.67 0.7 0.52 0.56 0.62 0.92 0.92 0.55 0.46 0.61 0.54 0.48 0.5 0.57 0.94 0.52 0.51 0.45 0.49 0.68 0.72 0.51 0.52
Bra028840 (PCRK2)
 0.14 0.35 0.54 0.14 0.67 0.6 0.11 0.06 0.17 0.15 0.1 0.21 0.04 0.56 0.44 0.18 0.11 0.12 0.18 0.12 0.14 0.18 1.0 0.27 0.26 0.14 0.19 0.25 0.31 0.28 0.08
Bra028877 (NAK)
 0.28 0.33 0.53 0.37 0.68 0.59 0.2 0.17 0.31 0.28 0.25 0.27 0.19 0.7 0.66 0.32 0.24 0.31 0.25 0.27 0.24 0.25 1.0 0.23 0.22 0.34 0.23 0.36 0.38 0.35 0.15
Bra029105 (MAKR5)
 0.12 0.17 0.29 0.23 0.51 0.65 0.28 0.12 0.23 0.19 0.18 0.25 0.29 0.78 0.7 0.43 0.36 0.59 0.53 0.43 0.43 0.35 1.0 0.3 0.32 0.37 0.34 0.37 0.34 0.4 0.28
Bra029273 (ATS3B)
 0.47 0.45 0.39 0.29 0.73 0.86 0.26 0.18 0.45 0.36 0.34 0.55 0.21 0.8 1.0 0.39 0.3 1.0 0.77 0.49 0.32 0.42 0.63 0.49 0.38 0.33 0.29 0.32 0.3 0.4 0.5
Bra029274 (ATS3B)
 0.38 0.44 0.4 0.28 0.77 1.0 0.26 0.16 0.43 0.31 0.3 0.42 0.2 0.61 0.75 0.29 0.26 0.57 0.6 0.34 0.24 0.33 0.53 0.21 0.23 0.19 0.23 0.19 0.27 0.33 0.44
Bra029313 (NAC100)
 0.33 0.15 0.12 0.05 0.47 1.0 0.32 0.16 0.35 0.27 0.23 0.2 0.23 0.69 0.63 0.27 0.29 0.37 0.41 0.43 0.27 0.31 0.39 0.25 0.25 0.1 0.22 0.23 0.28 0.17 0.27
0.32 0.39 0.33 0.41 0.7 0.74 0.38 0.42 0.27 0.25 0.26 0.24 0.31 0.57 0.66 0.36 0.31 0.24 0.28 0.36 0.25 0.28 1.0 0.33 0.38 0.47 0.37 0.34 0.51 0.4 0.41
Bra030651 (TPS7)
 0.71 0.66 0.58 0.61 0.93 0.95 0.75 0.75 0.54 0.63 0.55 0.57 0.7 0.81 0.8 0.8 0.75 0.59 0.62 0.64 0.59 0.63 1.0 0.61 0.65 0.57 0.6 0.73 0.7 0.62 0.64
0.12 0.08 0.15 0.1 0.69 0.82 0.17 0.03 0.12 0.34 0.16 0.16 0.22 0.63 0.82 0.4 0.35 0.39 0.3 0.26 0.2 0.31 1.0 0.37 0.31 0.21 0.3 0.31 0.3 0.2 0.27
0.54 0.61 0.59 0.44 1.0 0.8 0.32 0.27 0.45 0.44 0.41 0.39 0.31 0.66 0.66 0.35 0.35 0.35 0.34 0.32 0.37 0.4 0.83 0.33 0.31 0.28 0.32 0.41 0.49 0.34 0.3
0.28 0.46 0.6 0.19 1.0 0.91 0.28 0.17 0.4 0.36 0.3 0.36 0.2 0.93 0.93 0.5 0.36 0.28 0.41 0.31 0.32 0.43 0.95 0.38 0.33 0.4 0.34 0.4 0.42 0.46 0.29
Bra034623 (XLG2)
 0.27 0.43 0.57 0.35 0.76 0.93 0.27 0.18 0.33 0.28 0.28 0.29 0.12 0.7 0.73 0.38 0.33 0.3 0.36 0.25 0.23 0.32 1.0 0.23 0.17 0.27 0.17 0.27 0.33 0.37 0.15
Bra035326 (RLK)
 0.32 0.34 0.35 0.14 0.43 0.43 0.28 0.31 0.43 0.39 0.31 0.44 0.11 0.41 0.41 0.19 0.2 0.33 0.35 0.26 0.26 0.36 1.0 0.33 0.3 0.15 0.28 0.46 0.52 0.6 0.35
Bra036257 (AXR6)
 0.69 0.71 0.6 0.6 0.89 0.86 0.7 0.64 0.68 0.7 0.66 0.65 0.73 0.92 0.93 0.77 0.7 0.66 0.67 0.7 0.65 0.7 1.0 0.68 0.68 0.61 0.67 0.66 0.64 0.57 0.65
Bra036450 (ELMOD_E)
 0.7 0.67 0.74 0.57 0.95 0.77 0.41 0.38 0.42 0.46 0.43 0.43 0.3 0.74 0.68 0.46 0.37 0.5 0.46 0.43 0.47 0.49 1.0 0.41 0.35 0.34 0.32 0.41 0.46 0.38 0.34
Bra036861 (CASPL5C2)
 0.14 0.29 0.29 0.35 0.74 1.0 0.16 0.04 0.17 0.27 0.21 0.13 0.33 0.54 0.66 0.35 0.28 0.46 0.12 0.16 0.23 0.21 0.94 0.24 0.25 0.48 0.19 0.2 0.18 0.13 0.22
Bra037283 (NAC036)
 0.18 0.42 0.32 0.15 0.99 0.76 0.08 0.04 0.12 0.12 0.12 0.14 0.04 0.54 0.54 0.23 0.17 0.16 0.17 0.13 0.08 0.24 1.0 0.13 0.08 0.13 0.1 0.14 0.2 0.37 0.05
Bra038058 (FAHD1a)
 0.46 0.56 0.52 0.33 0.97 0.79 0.42 0.34 0.53 0.52 0.49 0.49 0.47 0.92 0.87 0.52 0.45 0.51 0.5 0.51 0.49 0.56 1.0 0.33 0.38 0.32 0.37 0.49 0.4 0.37 0.3
Bra038671 (NHL1)
 0.41 0.28 0.3 0.15 0.78 1.0 0.08 0.11 0.16 0.22 0.29 0.2 0.12 0.29 0.45 0.17 0.24 0.24 0.21 0.1 0.19 0.16 0.9 0.17 0.13 0.1 0.12 0.18 0.14 0.13 0.08
0.05 0.09 0.26 0.0 0.5 0.5 0.04 0.03 0.0 0.15 0.0 0.05 0.04 0.1 0.21 0.03 0.26 0.01 0.07 0.07 0.0 0.2 1.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.06 0.06 0.04 0.0
Bra040073 (UGNT1)
 0.51 0.53 0.49 0.36 0.95 0.88 0.39 0.35 0.42 0.37 0.36 0.46 0.35 0.82 0.85 0.62 0.47 0.53 0.53 0.51 0.35 0.56 1.0 0.35 0.34 0.27 0.28 0.37 0.4 0.39 0.31
Bra040167 (GATA26)
 0.43 0.43 0.34 0.25 0.81 1.0 0.41 0.26 0.49 0.44 0.36 0.41 0.3 0.63 0.71 0.46 0.45 0.42 0.58 0.53 0.42 0.6 0.71 0.42 0.39 0.22 0.38 0.35 0.43 0.41 0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)