1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_226 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000954 (STE24)
 4.15 6.38 5.33 3.48 8.03 7.98 2.13 1.74 3.08 3.43 2.93 2.25 3.72 6.97 7.15 4.94 3.94 3.75 2.48 3.35 2.1 2.55 14.39 3.15 3.25 3.05 3.84 3.35 3.97 3.66 3.71
Bra002054 (AP19)
 55.03 63.89 53.4 53.36 86.64 69.26 44.61 41.94 43.12 48.12 39.51 41.07 52.9 68.82 61.06 42.31 36.07 40.88 36.06 43.76 41.61 46.65 77.11 41.68 39.0 38.94 39.07 49.11 43.83 37.37 38.12
5.85 8.58 7.32 4.11 27.83 21.61 3.38 1.24 6.49 10.71 5.72 5.1 2.17 12.5 17.18 5.41 7.57 12.73 7.69 5.55 5.36 11.74 27.77 7.81 5.97 4.82 5.98 4.45 6.24 4.81 2.97
1.22 1.27 0.85 0.71 2.63 2.47 0.66 0.66 0.73 1.15 0.83 0.7 1.01 1.91 1.49 1.5 1.06 1.14 0.97 0.96 0.89 0.95 4.45 1.36 1.4 1.26 1.37 1.2 1.68 1.54 1.29
7.87 9.6 9.02 8.55 15.41 14.33 7.14 7.08 7.6 8.2 7.59 7.31 8.18 12.64 15.65 11.38 9.47 8.71 9.43 9.34 7.96 10.21 18.8 8.17 8.66 10.59 9.28 8.5 8.77 8.43 7.45
Bra004761 (FPA)
 6.04 6.23 6.42 6.68 8.03 8.81 6.01 5.57 4.85 5.07 5.25 5.15 5.27 7.86 7.91 6.65 6.29 3.3 5.02 5.6 5.99 5.14 12.2 5.74 5.33 6.49 5.22 5.11 5.32 4.93 5.25
Bra007911 (ENT1)
 12.43 14.19 15.24 10.52 16.55 13.87 5.81 5.67 11.35 10.67 9.6 10.02 7.65 14.3 15.65 8.7 7.72 12.26 9.01 7.85 9.68 9.64 15.56 8.07 7.65 10.61 8.95 11.38 13.06 11.32 7.59
Bra008389 (HAC1)
 3.56 3.06 2.76 2.55 5.28 5.44 2.19 1.77 3.37 2.24 2.82 2.64 1.83 4.56 4.28 2.7 2.47 2.58 2.68 3.43 2.44 3.07 5.36 2.92 3.15 3.02 3.79 3.94 4.94 4.33 3.92
2.63 2.53 2.7 3.19 3.96 4.2 1.98 1.97 2.61 2.45 2.8 2.83 2.27 3.61 3.58 2.88 2.3 2.59 2.54 2.96 2.72 2.23 6.41 2.34 2.71 3.25 2.56 3.01 3.53 3.05 3.24
5.05 4.63 4.05 4.7 6.98 7.71 4.62 4.21 4.53 4.46 4.21 3.96 4.18 6.46 7.39 5.66 5.14 3.5 4.42 4.97 4.86 4.48 8.77 4.92 4.92 4.41 4.78 5.72 5.71 4.18 4.82
1.4 1.29 2.44 1.4 5.91 4.96 2.45 2.74 3.06 3.27 3.0 3.38 4.22 7.11 6.28 4.07 2.93 3.43 3.07 4.1 3.75 3.92 6.43 2.71 2.64 2.88 2.34 3.09 2.73 1.73 1.83
8.0 7.66 9.28 8.02 9.88 10.38 5.28 4.74 6.27 6.07 5.69 5.8 4.94 8.4 9.09 6.67 5.77 4.9 5.58 5.86 5.17 6.0 12.78 6.89 6.99 6.59 6.78 8.32 9.73 8.78 8.23
Bra011204 (INB2A)
 7.78 8.43 11.47 7.07 23.43 24.75 10.28 6.13 10.2 9.95 9.99 7.06 7.92 17.09 20.93 13.9 12.77 8.77 12.24 15.18 11.82 14.45 25.5 9.79 10.99 5.47 9.68 9.07 12.06 10.0 9.44
Bra011320 (Phox4)
 6.94 6.57 8.74 10.42 13.02 14.21 7.53 6.93 5.64 7.03 5.98 5.01 8.77 9.69 9.95 8.65 8.95 7.67 6.28 6.5 6.36 7.11 13.59 6.07 6.39 9.41 5.75 6.39 8.4 7.26 7.6
Bra013358 (HSF A4A)
 3.29 3.49 3.18 1.98 6.35 7.79 2.47 2.06 3.5 2.23 1.64 2.89 0.41 5.06 5.02 2.0 1.44 2.53 2.85 2.15 2.17 2.33 9.01 2.39 2.09 1.46 1.96 4.53 5.33 5.59 1.85
Bra016120 (HGPT)
 8.67 11.44 8.9 8.0 15.52 13.16 4.27 3.13 3.73 5.17 3.45 4.89 4.34 7.55 10.44 5.91 4.86 5.76 2.53 5.26 3.34 5.71 19.29 5.22 6.35 5.16 4.78 5.37 6.56 3.3 3.78
10.77 8.83 6.46 5.6 24.38 24.65 11.4 9.54 15.12 15.56 14.64 13.16 19.94 25.84 25.16 17.53 15.75 11.95 11.98 13.75 15.59 17.03 25.47 12.61 13.83 11.21 13.99 14.81 13.55 11.81 11.6
10.14 8.93 9.08 10.2 13.23 13.09 9.73 10.33 8.37 8.91 8.49 8.26 9.63 11.75 12.46 10.72 9.54 8.81 9.59 9.11 9.16 8.42 13.74 9.88 10.22 9.58 9.89 11.84 10.94 9.51 10.25
Bra017436 (VAC1)
 8.34 7.73 7.01 6.07 13.05 12.67 8.13 5.77 9.43 9.4 8.94 8.34 7.04 10.79 12.09 10.12 9.02 7.87 8.56 9.16 7.87 9.73 10.27 8.64 9.64 6.55 9.41 8.94 9.0 7.95 8.51
2.5 3.29 3.27 2.72 4.0 3.49 1.69 1.78 2.33 2.19 2.01 2.15 2.14 3.68 4.47 2.38 1.89 2.37 2.21 1.81 1.86 2.01 5.15 2.62 2.41 2.34 2.64 2.76 3.5 3.2 3.11
Bra017505 (AAD5)
 3.84 6.51 4.9 1.84 9.7 11.54 2.02 0.51 2.48 2.89 1.74 2.9 1.46 3.62 6.67 2.39 2.66 2.34 2.25 1.5 1.59 5.56 14.46 1.56 0.94 0.26 1.1 1.19 1.53 1.8 0.53
Bra017506 (AAD5)
 3.84 6.51 4.9 1.84 9.7 11.54 2.02 0.51 2.48 2.89 1.74 2.9 1.46 3.62 6.67 2.39 2.66 2.34 2.25 1.5 1.59 5.56 14.46 1.56 0.94 0.26 1.1 1.19 1.53 1.8 0.53
Bra017507 (AAD5)
 3.84 6.51 4.9 1.84 9.7 11.54 2.02 0.51 2.48 2.89 1.74 2.9 1.46 3.62 6.67 2.39 2.66 2.34 2.25 1.5 1.59 5.56 14.46 1.56 0.94 0.26 1.1 1.19 1.53 1.8 0.53
Bra017841 (ACA2)
 1.31 2.5 3.83 1.0 6.14 6.2 2.0 1.36 1.95 2.98 1.95 1.79 3.57 3.51 5.12 6.13 4.3 3.12 2.84 2.83 2.26 3.19 10.26 2.67 2.45 1.72 1.87 2.31 2.14 1.98 1.65
Bra018709 (MAIL3)
 3.44 4.18 3.92 2.23 5.21 5.15 1.58 1.82 1.96 1.55 1.5 1.48 2.25 4.15 4.87 2.76 1.82 2.39 2.39 1.82 1.67 2.01 6.89 2.16 2.3 2.88 2.35 3.55 3.78 3.27 2.68
10.22 12.97 8.35 8.4 11.38 9.96 6.01 6.91 7.47 5.86 6.25 6.36 6.86 11.3 9.8 5.92 5.87 6.98 6.47 5.11 5.95 6.46 14.64 6.55 6.06 5.57 5.96 6.5 7.98 5.87 6.21
Bra019147 (FFT)
 16.03 25.87 24.48 19.97 46.07 51.1 24.12 19.61 22.91 24.84 22.08 20.33 16.71 40.69 46.48 35.86 26.68 18.66 23.76 23.88 21.49 28.48 60.3 17.03 16.99 12.74 17.3 20.95 22.73 21.12 12.36
0.94 1.79 1.71 1.01 4.21 2.57 0.56 0.49 0.87 1.03 0.88 1.02 0.49 2.74 2.85 1.06 0.88 1.5 1.28 1.14 1.01 1.05 3.58 0.97 0.72 1.48 0.86 1.03 1.61 2.58 1.0
Bra020905 (CPL1)
 0.86 0.77 0.87 0.68 2.07 2.13 0.94 1.33 0.73 0.85 0.5 0.56 1.04 1.75 1.83 1.37 0.99 1.03 0.86 1.06 0.87 0.86 1.94 0.84 0.67 0.86 0.86 0.89 0.97 0.82 0.87
Bra021759 (EVR)
 11.0 15.54 20.73 7.76 40.83 34.85 4.87 3.01 14.29 9.7 7.55 10.46 2.0 14.41 23.48 11.69 8.84 7.67 8.27 7.52 6.4 11.28 46.63 8.81 7.2 7.69 8.24 14.18 17.22 25.18 4.96
Bra022100 (PBL19)
 3.69 4.46 5.66 2.54 5.76 6.14 2.44 1.46 1.47 1.74 0.67 2.69 2.65 4.37 6.72 1.86 4.27 3.68 1.76 0.72 1.78 2.8 10.31 1.0 0.27 0.68 0.64 0.44 0.73 1.06 0.62
Bra022827 (TBL40)
 11.61 7.67 12.69 7.38 30.73 24.33 1.83 1.35 4.87 6.75 6.85 2.96 2.46 12.32 10.34 3.94 5.22 1.92 3.93 1.57 4.6 4.57 25.97 1.65 1.41 1.13 1.43 2.18 1.94 1.02 0.61
Bra023258 (HSFA1D)
 2.49 2.94 2.83 3.3 4.12 3.76 1.58 1.2 1.24 2.11 2.02 1.78 2.98 2.84 4.86 2.79 3.22 2.52 1.6 1.62 1.63 2.08 5.77 2.34 2.2 1.95 2.1 1.66 2.0 1.67 2.3
Bra024058 (INB2A)
 6.2 5.03 12.12 5.8 16.6 17.07 8.52 7.07 9.22 9.36 10.83 9.01 7.84 16.03 20.21 15.09 9.93 7.95 10.14 10.66 9.64 11.86 23.9 8.6 6.61 4.37 7.17 7.35 9.64 9.17 6.57
21.91 27.17 24.39 14.59 31.92 30.58 18.46 16.91 19.77 18.74 19.06 13.5 22.07 36.94 33.46 21.53 18.2 25.77 18.17 19.44 18.31 17.75 42.16 12.94 15.34 9.59 12.67 16.66 15.61 15.04 14.56
3.7 2.36 2.95 2.26 5.65 5.45 3.31 3.93 3.08 3.51 3.33 2.22 4.46 5.55 5.36 4.62 4.08 3.69 3.56 3.57 3.08 3.68 6.64 3.4 3.53 2.94 3.69 4.21 3.98 3.61 3.7
12.2 13.18 11.8 12.5 25.62 29.14 11.43 8.74 17.16 12.42 14.26 14.35 9.1 20.32 22.35 15.58 14.4 12.04 16.09 17.74 16.05 18.04 24.47 18.02 16.17 17.04 17.17 17.51 20.32 14.6 15.18
4.99 5.01 5.57 4.28 7.63 7.64 3.09 3.21 4.33 3.61 3.4 3.59 3.79 7.05 6.83 3.91 3.64 5.21 4.76 4.36 3.87 4.76 7.26 3.15 2.31 2.34 2.74 2.86 3.77 3.43 3.17
Bra026001 (CWC16b)
 19.88 21.62 16.64 17.68 30.09 30.31 17.4 17.44 17.48 15.62 15.49 13.93 15.33 23.28 27.97 18.22 18.24 15.4 19.92 19.09 16.64 18.47 32.44 20.81 20.55 19.36 17.34 21.64 21.72 16.52 16.6
18.09 22.62 20.31 17.37 26.64 21.36 12.13 11.66 17.94 18.52 13.87 14.81 16.56 24.54 24.39 14.69 12.18 16.29 14.41 12.91 13.32 15.31 25.06 13.81 13.47 11.94 13.08 18.01 19.06 13.69 13.95
Bra028840 (PCRK2)
 0.64 1.6 2.44 0.65 3.02 2.74 0.5 0.26 0.77 0.69 0.44 0.96 0.16 2.53 1.99 0.82 0.49 0.54 0.8 0.55 0.65 0.81 4.53 1.22 1.16 0.63 0.84 1.12 1.4 1.28 0.35
Bra028877 (NAK)
 5.03 5.94 9.53 6.64 12.25 10.61 3.71 3.08 5.64 5.16 4.54 4.96 3.44 12.65 11.97 5.73 4.35 5.58 4.58 4.84 4.27 4.62 18.12 4.14 4.01 6.16 4.25 6.55 6.81 6.33 2.78
Bra029105 (MAKR5)
 1.13 1.58 2.66 2.09 4.7 5.95 2.53 1.13 2.11 1.77 1.62 2.24 2.61 7.13 6.4 3.91 3.31 5.36 4.88 3.89 3.93 3.17 9.13 2.78 2.93 3.38 3.11 3.39 3.07 3.61 2.6
Bra029273 (ATS3B)
 34.76 33.27 28.99 21.47 53.95 63.72 19.34 12.96 32.93 26.93 25.34 40.64 15.39 59.17 73.77 28.47 22.28 73.88 57.05 36.04 23.5 31.23 46.33 36.47 28.0 24.34 21.16 23.68 21.95 29.3 37.05
Bra029274 (ATS3B)
 28.98 33.99 30.69 21.91 59.08 77.0 20.32 12.05 32.82 23.55 23.23 32.52 15.59 46.96 57.46 22.48 19.96 44.18 46.03 26.16 18.82 25.35 40.66 16.4 17.75 15.01 17.92 14.93 20.42 25.16 33.57
Bra029313 (NAC100)
 2.67 1.23 0.95 0.37 3.8 8.12 2.63 1.28 2.81 2.21 1.88 1.64 1.88 5.6 5.12 2.22 2.34 3.03 3.33 3.47 2.15 2.56 3.15 2.0 1.99 0.8 1.8 1.85 2.25 1.39 2.18
3.48 4.19 3.6 4.42 7.58 7.99 4.15 4.59 2.9 2.69 2.84 2.62 3.37 6.18 7.13 3.9 3.37 2.65 3.08 3.91 2.75 3.01 10.83 3.61 4.14 5.05 3.97 3.7 5.56 4.35 4.48
Bra030651 (TPS7)
 18.33 17.13 15.17 15.79 24.21 24.7 19.37 19.36 14.07 16.45 14.41 14.74 18.2 21.14 20.65 20.7 19.43 15.2 16.15 16.74 15.36 16.27 25.97 15.92 16.79 14.77 15.49 19.0 18.18 16.2 16.74
2.88 1.92 3.65 2.47 16.9 20.12 4.12 0.61 2.93 8.3 3.84 4.0 5.28 15.28 20.08 9.87 8.56 9.49 7.41 6.34 4.82 7.64 24.43 8.93 7.51 5.23 7.3 7.52 7.29 4.97 6.48
22.02 24.73 24.04 18.07 40.83 32.49 13.26 11.15 18.18 17.83 16.89 15.95 12.85 26.75 26.86 14.38 14.17 14.09 13.89 13.11 14.94 16.13 33.8 13.35 12.72 11.55 12.94 16.7 20.21 13.82 12.19
12.46 20.23 26.14 8.12 43.78 39.85 12.18 7.32 17.69 15.66 13.29 15.73 8.77 40.58 40.79 22.1 15.91 12.41 18.03 13.48 14.11 18.94 41.64 16.6 14.3 17.39 14.87 17.48 18.49 19.96 12.73
Bra034623 (XLG2)
 2.83 4.57 6.03 3.74 8.06 9.85 2.85 1.91 3.54 2.99 2.92 3.07 1.32 7.43 7.75 4.06 3.48 3.19 3.79 2.65 2.45 3.4 10.61 2.39 1.76 2.82 1.85 2.9 3.52 3.88 1.6
Bra035326 (RLK)
 3.12 3.31 3.35 1.39 4.12 4.19 2.75 2.98 4.12 3.74 3.03 4.29 1.1 4.01 3.96 1.86 1.98 3.19 3.38 2.5 2.5 3.5 9.67 3.15 2.87 1.45 2.68 4.41 5.03 5.82 3.38
Bra036257 (AXR6)
 20.09 20.66 17.41 17.43 25.95 25.08 20.39 18.77 19.74 20.35 19.31 18.94 21.16 26.89 27.01 22.37 20.52 19.22 19.49 20.33 18.88 20.31 29.17 19.73 19.95 17.93 19.5 19.16 18.75 16.7 18.91
Bra036450 (ELMOD_E)
 9.87 9.5 10.43 8.0 13.47 10.91 5.78 5.34 5.88 6.5 6.13 6.01 4.27 10.46 9.62 6.49 5.21 7.12 6.5 6.15 6.62 6.89 14.14 5.78 4.99 4.79 4.53 5.77 6.52 5.36 4.86
Bra036861 (CASPL5C2)
 2.71 5.68 5.61 6.81 14.55 19.55 3.17 0.71 3.38 5.21 4.2 2.47 6.49 10.5 12.87 6.79 5.57 8.99 2.43 3.21 4.42 4.06 18.43 4.74 4.86 9.38 3.63 3.9 3.61 2.57 4.29
Bra037283 (NAC036)
 9.31 21.62 16.57 7.95 51.07 39.18 3.95 1.94 6.01 6.28 6.13 6.94 2.21 27.93 27.96 12.0 8.95 8.27 8.74 6.64 4.02 12.44 51.39 6.69 3.95 6.88 5.07 7.16 10.11 19.04 2.42
Bra038058 (FAHD1a)
 13.13 16.11 14.9 9.46 27.95 22.78 12.12 9.67 15.31 14.9 14.07 14.21 13.56 26.69 24.96 14.9 12.92 14.68 14.37 14.64 14.02 16.04 28.86 9.45 10.84 9.34 10.72 14.19 11.4 10.61 8.78
Bra038671 (NHL1)
 14.06 9.54 10.29 5.21 26.87 34.33 2.71 3.78 5.66 7.63 9.95 6.86 4.17 9.96 15.48 5.79 8.25 8.17 7.22 3.35 6.47 5.65 30.82 5.8 4.63 3.52 4.16 6.03 4.69 4.32 2.58
0.05 0.08 0.23 0.0 0.45 0.45 0.03 0.03 0.0 0.13 0.0 0.04 0.04 0.09 0.19 0.03 0.23 0.01 0.06 0.06 0.0 0.18 0.89 0.05 0.0 0.0 0.05 0.06 0.05 0.04 0.0
Bra040073 (UGNT1)
 5.78 5.96 5.55 4.05 10.74 9.92 4.41 3.95 4.78 4.15 4.03 5.16 3.97 9.35 9.68 7.09 5.34 6.01 6.05 5.76 3.99 6.31 11.34 4.02 3.8 3.09 3.18 4.23 4.54 4.45 3.5
Bra040167 (GATA26)
 4.42 4.42 3.45 2.6 8.25 10.21 4.15 2.65 5.02 4.5 3.72 4.16 3.09 6.46 7.23 4.68 4.57 4.32 5.91 5.41 4.24 6.17 7.22 4.26 3.98 2.26 3.86 3.56 4.39 4.2 4.81

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)