1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_55 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000052 (PYL4)
 0.52 1.0 0.91 0.92 0.21 0.26 0.18 0.27 0.14 0.34 0.38 0.24 0.33 0.09 0.05 0.15 0.34 0.26 0.15 0.27 0.36 0.34 0.27 0.23 0.31 0.92 0.35 0.32 0.37 0.28 0.13
0.91 0.89 0.88 0.8 0.99 0.92 0.36 0.34 0.43 0.45 0.42 0.47 0.24 0.56 0.54 0.4 0.36 0.88 0.56 0.36 0.4 0.44 1.0 0.5 0.6 0.68 0.55 0.76 0.72 0.76 0.46
0.63 0.58 1.0 0.63 0.31 0.16 0.22 0.29 0.43 0.3 0.36 0.47 0.42 0.16 0.18 0.22 0.23 0.26 0.14 0.16 0.18 0.17 0.13 0.14 0.24 0.31 0.24 0.23 0.23 0.58 0.32
0.91 0.81 0.89 1.0 0.73 0.41 0.43 0.69 0.5 0.62 0.57 0.63 0.58 0.62 0.46 0.46 0.56 0.73 0.47 0.43 0.42 0.47 0.35 0.33 0.38 0.67 0.36 0.55 0.45 0.67 0.59
0.92 0.95 0.94 1.0 0.73 0.1 0.15 0.24 0.13 0.29 0.15 0.26 0.37 0.11 0.06 0.09 0.24 0.26 0.09 0.14 0.14 0.1 0.21 0.12 0.1 0.81 0.13 0.19 0.16 0.74 0.35
Bra001721 (ATL77)
 0.61 1.0 0.91 0.85 0.21 0.17 0.18 0.25 0.27 0.21 0.29 0.31 0.13 0.13 0.12 0.17 0.19 0.06 0.17 0.2 0.2 0.27 0.25 0.18 0.25 0.37 0.26 0.27 0.3 0.62 0.28
Bra001774 (CYP705A15)
 0.56 0.63 1.0 0.38 0.34 0.06 0.04 0.12 0.21 0.09 0.03 0.08 0.04 0.06 0.08 0.07 0.03 0.06 0.08 0.08 0.04 0.04 0.17 0.06 0.09 0.08 0.09 0.08 0.09 0.46 0.23
Bra002061 (RHA3A)
 0.83 0.81 1.0 0.67 0.42 0.25 0.19 0.15 0.44 0.31 0.4 0.43 0.2 0.14 0.19 0.23 0.21 0.05 0.16 0.32 0.31 0.34 0.14 0.28 0.31 0.44 0.35 0.33 0.39 0.5 0.43
0.7 0.84 0.91 1.0 0.14 0.18 0.21 0.21 0.2 0.21 0.24 0.26 0.14 0.1 0.11 0.24 0.25 0.07 0.12 0.2 0.18 0.22 0.13 0.17 0.21 0.67 0.23 0.35 0.32 0.54 0.28
Bra002709 (COL5)
 0.73 0.6 0.68 1.0 0.12 0.11 0.2 0.24 0.2 0.13 0.22 0.25 0.11 0.08 0.07 0.07 0.07 0.21 0.13 0.16 0.14 0.18 0.15 0.22 0.24 0.48 0.26 0.23 0.24 0.45 0.24
0.59 0.78 1.0 0.75 0.14 0.1 0.14 0.31 0.36 0.23 0.38 0.48 0.27 0.08 0.11 0.14 0.14 0.16 0.34 0.48 0.38 0.32 0.15 0.27 0.38 0.7 0.42 0.21 0.3 0.58 0.54
Bra003640 (LZF1)
 1.0 0.65 0.71 0.67 0.55 0.28 0.12 0.25 0.36 0.17 0.27 0.27 0.18 0.2 0.22 0.14 0.13 0.41 0.08 0.15 0.1 0.18 0.62 0.27 0.17 0.46 0.2 0.56 0.56 0.81 0.48
1.0 0.91 0.85 0.8 0.26 0.2 0.43 0.55 0.51 0.54 0.51 0.8 0.26 0.1 0.1 0.23 0.3 0.35 0.54 0.36 0.4 0.44 0.3 0.44 0.44 0.45 0.54 0.45 0.4 0.75 0.55
Bra004035 (BBX14)
 0.82 1.0 0.95 0.94 0.46 0.49 0.3 0.33 0.29 0.39 0.45 0.32 0.28 0.23 0.22 0.37 0.5 0.28 0.37 0.41 0.41 0.47 0.07 0.46 0.49 0.77 0.49 0.39 0.5 0.45 0.46
Bra004244 (PSPM3)
 0.81 0.83 1.0 0.88 0.46 0.41 0.63 0.7 0.49 0.48 0.57 0.61 0.55 0.3 0.26 0.41 0.44 0.24 0.34 0.41 0.49 0.48 0.22 0.47 0.5 0.55 0.5 0.57 0.53 0.66 0.65
Bra004604 (SIB2)
 0.68 0.81 1.0 0.92 0.58 0.2 0.15 0.25 0.3 0.34 0.32 0.36 0.1 0.22 0.22 0.32 0.22 0.5 0.3 0.24 0.21 0.27 0.17 0.11 0.12 0.45 0.21 0.38 0.27 0.36 0.14
Bra005611 (OFP16)
 0.84 0.96 0.97 1.0 0.39 0.12 0.18 0.22 0.3 0.21 0.29 0.35 0.1 0.06 0.03 0.05 0.07 0.03 0.11 0.15 0.12 0.14 0.02 0.17 0.22 0.82 0.27 0.33 0.36 0.56 0.3
Bra005997 (MYBS2)
 0.8 0.83 1.0 0.65 0.57 0.21 0.07 0.08 0.17 0.26 0.21 0.28 0.11 0.09 0.07 0.11 0.12 0.06 0.12 0.14 0.15 0.18 0.05 0.08 0.14 0.6 0.13 0.14 0.18 0.31 0.19
Bra006226 (KYP)
 1.0 0.65 0.55 0.62 0.46 0.11 0.07 0.25 0.25 0.22 0.15 0.28 0.25 0.09 0.1 0.07 0.13 0.3 0.13 0.1 0.09 0.11 0.2 0.16 0.14 0.65 0.17 0.37 0.29 0.64 0.38
Bra008448 (RTL1)
 0.94 1.0 0.91 0.9 0.47 0.33 0.32 0.38 0.44 0.42 0.52 0.55 0.44 0.31 0.29 0.33 0.37 0.38 0.28 0.37 0.42 0.49 0.39 0.38 0.36 0.62 0.47 0.36 0.42 0.47 0.49
Bra008659 (NIK1)
 1.0 0.89 0.91 0.86 0.76 0.29 0.29 0.41 0.37 0.43 0.44 0.42 0.66 0.45 0.37 0.41 0.36 0.58 0.32 0.29 0.32 0.3 0.33 0.3 0.31 0.53 0.33 0.46 0.45 0.44 0.32
Bra009346 (MYBS2)
 0.88 0.86 1.0 0.72 0.57 0.27 0.19 0.27 0.3 0.31 0.39 0.36 0.15 0.15 0.23 0.14 0.17 0.19 0.13 0.22 0.19 0.25 0.2 0.21 0.25 0.74 0.33 0.32 0.39 0.65 0.45
Bra009609 (FIP)
 0.75 0.88 1.0 0.99 0.18 0.12 0.39 0.48 0.38 0.43 0.55 0.63 0.32 0.08 0.06 0.27 0.31 0.05 0.14 0.31 0.42 0.34 0.07 0.36 0.45 0.57 0.53 0.3 0.4 0.83 0.51
Bra009620 (SIS)
 0.84 0.92 1.0 0.93 0.26 0.07 0.05 0.07 0.24 0.1 0.22 0.25 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.04 0.04 0.07 0.06 0.1 0.18 0.22 0.22 0.4 0.23 0.26 0.37 0.46 0.32
Bra009985 (CYSD2)
 0.61 0.76 0.72 1.0 0.41 0.12 0.2 0.18 0.08 0.06 0.07 0.04 0.07 0.07 0.01 0.07 0.01 0.03 0.0 0.04 0.04 0.05 0.03 0.08 0.09 0.66 0.16 0.14 0.37 0.25 0.14
Bra010807 (CAB1)
 0.82 0.79 1.0 0.98 0.29 0.27 0.58 0.64 0.54 0.55 0.54 0.54 0.34 0.2 0.14 0.38 0.41 0.22 0.45 0.4 0.49 0.44 0.04 0.34 0.36 0.4 0.37 0.5 0.43 0.69 0.43
Bra011540 (CIB1)
 0.91 0.86 0.96 1.0 0.35 0.28 0.52 0.73 0.46 0.51 0.55 0.53 0.42 0.15 0.14 0.27 0.31 0.24 0.39 0.48 0.49 0.39 0.41 0.35 0.39 0.57 0.46 0.5 0.54 0.83 0.66
0.76 0.89 0.77 0.68 1.0 0.74 0.36 0.54 0.64 0.5 0.47 0.58 0.32 0.66 0.7 0.47 0.38 0.69 0.5 0.44 0.42 0.46 0.76 0.43 0.32 0.72 0.53 0.65 0.67 0.97 0.32
0.89 0.95 1.0 0.9 0.34 0.27 0.51 0.67 0.6 0.59 0.65 0.72 0.52 0.19 0.15 0.38 0.45 0.25 0.36 0.44 0.45 0.46 0.08 0.42 0.45 0.53 0.49 0.44 0.47 0.69 0.56
Bra012714 (INT4)
 0.92 1.0 1.0 0.86 0.25 0.14 0.16 0.26 0.41 0.42 0.52 0.56 0.32 0.06 0.05 0.14 0.2 0.04 0.06 0.17 0.23 0.24 0.16 0.21 0.26 0.5 0.39 0.24 0.45 0.82 0.61
Bra012779 (DXS)
 0.69 0.83 1.0 0.77 0.13 0.11 0.14 0.2 0.37 0.35 0.45 0.53 0.2 0.05 0.06 0.22 0.22 0.1 0.19 0.2 0.18 0.2 0.06 0.28 0.31 0.41 0.3 0.32 0.42 0.62 0.5
Bra013275 (IP5PII)
 1.0 0.84 0.71 0.68 0.88 0.69 0.21 0.27 0.3 0.26 0.27 0.35 0.21 0.41 0.34 0.14 0.18 0.78 0.25 0.24 0.26 0.27 0.95 0.25 0.24 0.84 0.24 0.72 0.52 0.98 0.46
0.73 0.78 1.0 0.59 0.25 0.3 0.43 0.31 0.34 0.39 0.64 0.51 0.27 0.22 0.25 0.24 0.26 0.14 0.31 0.43 0.41 0.47 0.18 0.41 0.49 0.72 0.56 0.25 0.39 0.52 0.65
Bra013754 (NLP7)
 0.94 0.96 1.0 0.89 0.1 0.06 0.23 0.35 0.24 0.32 0.36 0.52 0.2 0.02 0.04 0.14 0.2 0.21 0.22 0.21 0.18 0.27 0.45 0.27 0.33 0.59 0.46 0.27 0.31 0.77 0.54
Bra013970 (RCP1)
 1.0 0.92 0.86 0.93 0.51 0.25 0.47 0.69 0.59 0.52 0.5 0.85 0.39 0.16 0.15 0.27 0.36 0.45 0.5 0.39 0.38 0.45 0.07 0.36 0.36 0.38 0.43 0.47 0.33 0.78 0.45
Bra014244 (BPH1)
 0.86 0.79 1.0 0.7 0.45 0.28 0.39 0.62 0.52 0.49 0.61 0.64 0.39 0.15 0.14 0.3 0.34 0.21 0.3 0.29 0.34 0.4 0.17 0.34 0.37 0.45 0.42 0.48 0.53 0.63 0.6
Bra014983 (RALFL24)
 0.82 0.99 1.0 0.72 0.31 0.26 0.25 0.34 0.3 0.36 0.42 0.41 0.27 0.16 0.11 0.24 0.24 0.22 0.2 0.32 0.34 0.32 0.12 0.32 0.3 0.75 0.41 0.34 0.37 0.52 0.44
0.91 0.92 1.0 0.97 0.48 0.16 0.17 0.26 0.37 0.39 0.49 0.46 0.23 0.16 0.1 0.13 0.16 0.11 0.15 0.23 0.23 0.29 0.04 0.09 0.13 0.82 0.18 0.21 0.28 0.39 0.14
0.78 1.0 0.96 0.87 0.33 0.13 0.11 0.14 0.19 0.23 0.17 0.21 0.1 0.14 0.06 0.15 0.08 0.07 0.08 0.09 0.15 0.16 0.26 0.28 0.32 0.43 0.31 0.24 0.3 0.43 0.37
Bra016372 (RAB7)
 0.83 0.95 1.0 0.9 0.4 0.39 0.54 0.53 0.48 0.47 0.57 0.5 0.39 0.29 0.28 0.43 0.5 0.24 0.36 0.51 0.54 0.55 0.11 0.4 0.45 0.54 0.47 0.41 0.48 0.48 0.47
1.0 0.93 0.54 0.59 0.42 0.18 0.06 0.18 0.21 0.13 0.14 0.18 0.07 0.2 0.15 0.07 0.09 0.08 0.13 0.12 0.15 0.09 0.12 0.17 0.17 0.56 0.19 0.34 0.28 0.63 0.33
Bra017125 (PYL4)
 0.97 0.88 0.83 0.97 0.54 0.57 0.26 0.25 0.29 0.45 0.5 0.42 0.36 0.33 0.28 0.31 0.41 0.62 0.41 0.37 0.48 0.4 0.4 0.43 0.47 1.0 0.46 0.48 0.55 0.45 0.31
Bra017946 (Kin7.1)
 1.0 0.73 0.62 0.68 0.45 0.27 0.2 0.33 0.37 0.3 0.34 0.29 0.37 0.42 0.39 0.27 0.27 0.45 0.3 0.25 0.23 0.23 0.19 0.38 0.41 0.7 0.36 0.52 0.46 0.53 0.53
Bra018046 (HAP5A)
 0.76 0.88 1.0 0.7 0.31 0.17 0.12 0.08 0.38 0.39 0.59 0.43 0.24 0.1 0.08 0.24 0.22 0.06 0.18 0.29 0.26 0.34 0.13 0.21 0.25 0.35 0.29 0.18 0.31 0.39 0.32
Bra018347 (TBL45)
 0.76 0.77 0.99 1.0 0.32 0.07 0.16 0.19 0.17 0.36 0.34 0.16 0.26 0.12 0.09 0.24 0.25 0.55 0.18 0.24 0.3 0.24 0.13 0.16 0.14 0.26 0.17 0.37 0.2 0.11 0.06
Bra018454 (WLIM1)
 0.61 0.69 1.0 0.48 0.52 0.14 0.13 0.2 0.3 0.26 0.28 0.27 0.23 0.12 0.19 0.16 0.15 0.22 0.24 0.24 0.2 0.28 0.22 0.25 0.25 0.34 0.31 0.25 0.25 0.47 0.38
Bra018619 (ALB1)
 0.93 0.94 1.0 0.9 0.43 0.35 0.55 0.58 0.58 0.65 0.64 0.7 0.52 0.23 0.22 0.49 0.54 0.23 0.4 0.52 0.47 0.5 0.15 0.38 0.41 0.48 0.42 0.43 0.41 0.57 0.5
Bra018781 (ATL78)
 1.0 0.93 0.63 0.81 0.26 0.21 0.05 0.09 0.09 0.24 0.1 0.11 0.04 0.07 0.28 0.14 0.12 0.28 0.22 0.14 0.19 0.15 0.12 0.11 0.08 0.69 0.16 0.05 0.06 0.32 0.09
Bra019251 (NLP7)
 1.0 0.86 0.96 0.94 0.18 0.2 0.49 0.49 0.42 0.53 0.6 0.62 0.43 0.11 0.13 0.43 0.54 0.54 0.45 0.53 0.39 0.49 0.38 0.4 0.47 0.79 0.55 0.28 0.38 0.64 0.61
Bra019264 (PGF13)
 1.0 0.89 0.96 0.91 0.8 0.14 0.19 0.36 0.31 0.58 0.45 0.47 0.35 0.28 0.22 0.35 0.37 0.73 0.36 0.35 0.39 0.25 0.2 0.24 0.31 0.53 0.37 0.6 0.44 0.69 0.35
Bra019357 (ACR7)
 0.98 0.73 0.73 0.84 1.0 0.86 0.33 0.28 0.53 0.4 0.39 0.53 0.16 0.39 0.49 0.2 0.23 0.41 0.25 0.27 0.29 0.26 0.58 0.29 0.31 0.73 0.34 0.72 0.74 0.95 0.42
Bra020425 (COL5)
 0.86 0.99 0.92 1.0 0.29 0.28 0.34 0.32 0.42 0.32 0.49 0.52 0.27 0.36 0.25 0.2 0.23 0.31 0.28 0.37 0.38 0.38 0.52 0.47 0.51 0.71 0.55 0.38 0.47 0.64 0.35
0.9 1.0 0.95 0.88 0.29 0.26 0.32 0.29 0.37 0.4 0.48 0.44 0.32 0.17 0.18 0.37 0.38 0.11 0.22 0.46 0.4 0.44 0.12 0.34 0.41 0.55 0.47 0.27 0.36 0.37 0.49
Bra023958 (IAA29)
 0.6 0.34 1.0 0.57 0.19 0.15 0.09 0.18 0.34 0.23 0.3 0.18 0.1 0.1 0.06 0.1 0.09 0.03 0.18 0.3 0.21 0.2 0.02 0.23 0.23 0.37 0.33 0.21 0.32 0.55 0.48
Bra029372 (FTRA1)
 0.93 0.95 1.0 0.83 0.48 0.46 0.56 0.54 0.46 0.47 0.55 0.48 0.48 0.35 0.31 0.4 0.49 0.24 0.5 0.69 0.6 0.53 0.28 0.55 0.55 0.6 0.6 0.45 0.42 0.56 0.59
0.78 1.0 0.91 0.84 0.07 0.04 0.09 0.13 0.14 0.17 0.19 0.28 0.07 0.02 0.03 0.05 0.08 0.03 0.07 0.08 0.08 0.11 0.03 0.11 0.14 0.34 0.17 0.16 0.16 0.6 0.27
Bra032273 (BBX17)
 0.57 0.69 1.0 0.41 0.43 0.2 0.11 0.15 0.26 0.25 0.29 0.21 0.12 0.14 0.15 0.11 0.17 0.04 0.27 0.21 0.19 0.24 0.04 0.2 0.21 0.29 0.24 0.33 0.3 0.27 0.16
0.86 1.0 0.62 0.73 0.48 0.33 0.19 0.21 0.33 0.4 0.46 0.43 0.24 0.3 0.3 0.3 0.25 0.17 0.2 0.29 0.29 0.33 0.17 0.18 0.24 0.69 0.34 0.28 0.45 0.6 0.48
Bra033925 (BBX14)
 0.85 1.0 0.91 0.83 0.23 0.23 0.26 0.27 0.29 0.35 0.43 0.31 0.22 0.08 0.12 0.34 0.31 0.09 0.25 0.38 0.36 0.46 0.04 0.28 0.37 0.63 0.39 0.27 0.32 0.36 0.37
Bra035023 (OSU1)
 0.92 0.76 1.0 0.53 0.51 0.17 0.17 0.23 0.33 0.34 0.37 0.37 0.18 0.2 0.19 0.2 0.2 0.25 0.21 0.22 0.22 0.24 0.4 0.25 0.29 0.51 0.34 0.31 0.34 0.46 0.39
Bra036731 (GTL1)
 0.92 0.97 1.0 0.99 0.42 0.29 0.26 0.32 0.35 0.44 0.47 0.47 0.23 0.16 0.13 0.26 0.25 0.12 0.2 0.32 0.36 0.38 0.08 0.23 0.27 0.74 0.33 0.29 0.31 0.39 0.24
Bra037761 (PSAN)
 0.86 0.9 1.0 0.97 0.43 0.37 0.51 0.53 0.59 0.58 0.62 0.6 0.46 0.3 0.21 0.36 0.39 0.28 0.41 0.46 0.51 0.5 0.06 0.34 0.35 0.36 0.35 0.43 0.5 0.43 0.35
Bra038469 (INT4)
 0.89 0.9 0.98 1.0 0.46 0.15 0.13 0.25 0.43 0.32 0.32 0.52 0.52 0.17 0.05 0.1 0.17 0.07 0.08 0.15 0.13 0.1 0.26 0.24 0.17 0.74 0.24 0.34 0.55 0.93 0.59
1.0 0.99 0.93 0.88 0.18 0.29 0.37 0.33 0.25 0.44 0.36 0.44 0.14 0.16 0.16 0.24 0.39 0.09 0.16 0.24 0.34 0.35 0.1 0.31 0.37 0.57 0.36 0.29 0.26 0.57 0.46
0.54 0.44 1.0 0.23 0.13 0.15 0.07 0.22 0.25 0.21 0.22 0.31 0.12 0.09 0.12 0.15 0.14 0.07 0.18 0.13 0.18 0.3 0.14 0.18 0.2 0.32 0.25 0.28 0.29 0.63 0.43

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)