1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_252 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.54 0.65 0.91 0.48 0.58 0.64 0.44 0.47 0.53 0.46 0.49 0.5 0.55 0.89 1.0 0.61 0.51 0.7 0.57 0.54 0.48 0.53 0.76 0.39 0.38 0.34 0.39 0.36 0.41 0.46 0.51
Bra000153 (TOPP4)
 0.68 0.79 0.8 0.63 0.99 1.0 0.52 0.47 0.7 0.61 0.58 0.54 0.55 0.88 0.91 0.61 0.53 0.62 0.52 0.59 0.57 0.58 0.83 0.64 0.66 0.46 0.59 0.64 0.74 0.64 0.74
0.51 0.53 0.51 0.42 0.81 0.78 0.4 0.29 0.51 0.39 0.45 0.41 0.39 0.85 0.92 0.45 0.38 0.53 0.51 0.49 0.42 0.5 1.0 0.47 0.46 0.33 0.45 0.54 0.62 0.51 0.6
0.46 0.62 0.74 0.51 0.55 0.57 0.41 0.47 0.47 0.49 0.49 0.47 0.57 0.9 1.0 0.66 0.54 0.64 0.46 0.51 0.46 0.44 0.94 0.41 0.49 0.49 0.45 0.46 0.53 0.48 0.58
Bra001334 (KA120)
 0.76 0.74 0.78 0.58 0.79 0.76 0.47 0.57 0.56 0.49 0.57 0.51 0.45 0.77 0.83 0.6 0.5 0.49 0.49 0.51 0.52 0.43 1.0 0.59 0.65 0.62 0.64 0.63 0.71 0.75 0.87
Bra002200 (BPM2)
 0.72 0.91 0.93 0.81 0.88 0.71 0.39 0.31 0.62 0.56 0.54 0.47 0.42 1.0 0.85 0.51 0.44 0.49 0.46 0.43 0.43 0.44 0.87 0.58 0.49 0.58 0.55 0.73 0.79 0.57 0.59
Bra002315 (PMIR1)
 0.9 0.83 1.0 0.64 0.91 0.99 0.58 0.63 0.66 0.52 0.52 0.57 0.54 0.89 0.92 0.6 0.55 0.76 0.68 0.61 0.62 0.66 1.0 0.52 0.53 0.48 0.46 0.55 0.65 0.6 0.66
Bra002930 (SIR1)
 0.54 0.72 0.74 0.45 0.74 0.71 0.34 0.41 0.41 0.26 0.35 0.38 0.47 0.83 0.95 0.46 0.5 0.64 0.42 0.39 0.36 0.4 1.0 0.34 0.34 0.35 0.36 0.33 0.46 0.46 0.55
Bra003173 (FIP37)
 0.7 0.63 0.59 0.46 0.77 0.66 0.4 0.37 0.5 0.47 0.51 0.43 0.56 0.77 1.0 0.53 0.46 0.49 0.42 0.46 0.42 0.4 0.95 0.52 0.46 0.42 0.46 0.51 0.58 0.53 0.66
Bra003614 (NUA)
 0.75 0.79 0.72 0.58 0.71 0.7 0.44 0.55 0.5 0.49 0.51 0.49 0.51 1.0 1.0 0.67 0.57 0.66 0.61 0.57 0.51 0.47 0.77 0.41 0.46 0.49 0.49 0.45 0.45 0.49 0.79
Bra004751 (POP4)
 0.35 0.43 0.33 0.31 0.42 0.48 0.22 0.25 0.31 0.22 0.28 0.27 0.37 0.63 0.66 0.35 0.26 0.38 0.31 0.26 0.3 0.24 1.0 0.36 0.3 0.22 0.43 0.37 0.33 0.27 0.35
Bra005036 (PGP6)
 0.69 0.71 0.84 0.84 0.9 0.74 0.34 0.36 0.48 0.42 0.41 0.44 0.42 0.81 0.93 0.54 0.48 0.75 0.47 0.36 0.4 0.39 1.0 0.4 0.39 0.51 0.44 0.54 0.64 0.64 0.6
Bra006502 (RBP45d)
 0.67 0.67 0.79 0.5 0.66 0.66 0.46 0.46 0.56 0.54 0.52 0.49 0.6 0.92 1.0 0.59 0.51 0.63 0.53 0.46 0.52 0.46 0.87 0.41 0.44 0.39 0.41 0.41 0.42 0.42 0.53
Bra006513 (S1P)
 0.75 0.79 0.8 0.56 0.8 0.82 0.4 0.35 0.48 0.39 0.36 0.4 0.38 0.8 0.7 0.46 0.37 0.56 0.45 0.42 0.3 0.39 1.0 0.45 0.44 0.37 0.46 0.49 0.63 0.66 0.65
Bra007048 (SDG22)
 0.61 0.77 0.67 0.66 0.75 0.79 0.49 0.49 0.56 0.59 0.56 0.53 0.52 0.96 1.0 0.68 0.61 0.61 0.59 0.54 0.46 0.59 0.96 0.61 0.6 0.53 0.61 0.67 0.73 0.61 0.63
Bra007084 (NDC80)
 0.63 0.64 0.61 0.51 0.78 0.55 0.24 0.38 0.43 0.37 0.31 0.28 0.48 0.77 0.88 0.37 0.32 0.67 0.33 0.4 0.26 0.19 1.0 0.43 0.34 0.33 0.45 0.5 0.52 0.6 0.52
0.54 0.64 0.57 0.52 0.62 0.72 0.39 0.4 0.45 0.42 0.48 0.5 0.49 0.83 0.8 0.49 0.44 0.61 0.43 0.47 0.55 0.51 1.0 0.52 0.56 0.44 0.59 0.54 0.58 0.57 0.6
Bra007534 (SHOT1)
 0.63 0.68 0.54 0.5 0.75 0.65 0.3 0.44 0.38 0.36 0.32 0.36 0.37 0.9 1.0 0.45 0.34 0.44 0.35 0.38 0.34 0.33 0.83 0.23 0.26 0.18 0.29 0.41 0.42 0.33 0.27
0.74 0.89 0.88 0.69 0.71 0.63 0.36 0.44 0.51 0.52 0.58 0.47 0.73 0.91 0.97 0.59 0.53 0.73 0.44 0.46 0.43 0.46 1.0 0.44 0.47 0.62 0.56 0.55 0.59 0.59 0.78
Bra008832 (NEF1)
 0.53 0.72 0.6 0.46 0.66 0.67 0.38 0.36 0.46 0.41 0.48 0.46 0.46 0.79 0.98 0.52 0.48 0.67 0.48 0.42 0.44 0.46 1.0 0.48 0.45 0.41 0.47 0.47 0.56 0.56 0.6
0.5 0.54 0.49 0.42 0.7 0.62 0.28 0.35 0.44 0.32 0.34 0.39 0.41 0.81 0.83 0.49 0.39 0.63 0.4 0.42 0.34 0.43 1.0 0.46 0.46 0.32 0.35 0.49 0.52 0.46 0.44
Bra009196 (UBA 2)
 0.64 0.69 0.65 0.59 0.67 0.73 0.45 0.53 0.44 0.47 0.42 0.47 0.54 0.72 1.0 0.59 0.55 0.54 0.5 0.46 0.49 0.44 0.9 0.47 0.47 0.43 0.47 0.49 0.48 0.47 0.58
Bra009754 (IRE1)
 0.6 0.58 0.6 0.61 0.89 0.81 0.51 0.54 0.59 0.5 0.54 0.51 0.55 0.86 0.79 0.53 0.5 0.87 0.58 0.52 0.49 0.43 1.0 0.51 0.53 0.53 0.51 0.55 0.58 0.55 0.56
Bra010108 (ELF5)
 0.58 0.57 0.59 0.53 0.57 0.61 0.36 0.37 0.56 0.45 0.5 0.47 0.49 0.67 0.77 0.51 0.51 0.53 0.46 0.52 0.46 0.49 1.0 0.51 0.54 0.54 0.55 0.52 0.55 0.52 0.55
Bra010193 (NAC014)
 1.0 0.76 0.74 0.5 0.7 0.67 0.33 0.28 0.4 0.37 0.36 0.38 0.38 0.76 0.78 0.47 0.39 0.47 0.47 0.39 0.36 0.37 0.74 0.5 0.55 0.53 0.5 0.62 0.68 0.52 0.52
Bra010355 (PHR1)
 0.71 0.68 0.92 0.65 0.75 0.84 0.55 0.58 0.7 0.64 0.72 0.63 0.7 0.99 1.0 0.78 0.73 0.75 0.62 0.77 0.71 0.73 0.68 0.62 0.6 0.61 0.63 0.62 0.57 0.56 0.59
Bra010520 (RecQl3)
 1.0 0.83 1.0 0.65 0.92 0.82 0.5 0.47 0.61 0.59 0.56 0.63 0.62 0.98 0.96 0.58 0.61 0.72 0.65 0.52 0.56 0.6 0.76 0.49 0.64 0.56 0.55 0.55 0.55 0.65 0.83
0.58 0.68 0.66 0.5 0.63 0.67 0.42 0.47 0.62 0.45 0.46 0.41 0.44 0.87 1.0 0.58 0.55 0.52 0.58 0.47 0.46 0.45 0.87 0.39 0.43 0.43 0.46 0.46 0.51 0.49 0.57
Bra010953 (NTF2A)
 0.56 0.64 0.82 0.47 0.58 0.55 0.31 0.34 0.61 0.5 0.44 0.45 0.59 1.0 0.98 0.59 0.54 0.54 0.41 0.47 0.47 0.55 0.45 0.32 0.36 0.3 0.32 0.42 0.44 0.31 0.45
Bra011458 (ADL2)
 0.68 0.88 0.78 0.68 0.92 0.71 0.45 0.56 0.46 0.5 0.46 0.48 0.56 0.75 0.79 0.59 0.55 0.75 0.48 0.5 0.44 0.49 1.0 0.48 0.5 0.52 0.47 0.55 0.61 0.58 0.64
Bra011745 (IRX14)
 0.5 0.67 0.6 0.6 0.85 0.69 0.43 0.48 0.46 0.44 0.45 0.37 0.65 0.79 0.84 0.49 0.5 0.82 0.48 0.42 0.45 0.44 1.0 0.45 0.46 0.61 0.49 0.52 0.61 0.6 0.69
Bra011807 (PICALM10a)
 0.45 0.84 0.78 0.43 0.78 0.64 0.14 0.06 0.32 0.23 0.23 0.26 0.08 0.78 0.9 0.21 0.13 0.33 0.35 0.26 0.18 0.25 1.0 0.15 0.13 0.22 0.12 0.36 0.41 0.74 0.37
Bra013958 (TFL2)
 0.63 0.66 0.8 0.5 0.72 0.77 0.38 0.5 0.38 0.33 0.42 0.39 0.39 0.68 0.82 0.47 0.43 0.58 0.56 0.5 0.45 0.48 1.0 0.47 0.38 0.46 0.41 0.43 0.46 0.49 0.53
Bra014495 (ARABIDILLO2)
 0.6 0.84 0.75 0.63 0.87 0.78 0.45 0.48 0.59 0.56 0.57 0.51 0.53 0.92 1.0 0.61 0.53 0.64 0.57 0.46 0.51 0.46 0.9 0.55 0.51 0.48 0.5 0.63 0.7 0.61 0.75
0.91 0.71 0.85 0.66 0.86 0.9 0.54 0.49 0.63 0.55 0.63 0.52 0.5 0.8 0.89 0.61 0.55 0.62 0.55 0.57 0.52 0.5 1.0 0.56 0.62 0.61 0.59 0.7 0.82 0.6 0.65
Bra019993 (CDC5)
 0.66 0.76 0.91 0.63 0.65 0.69 0.44 0.5 0.54 0.47 0.5 0.46 0.61 0.94 1.0 0.6 0.52 0.72 0.53 0.5 0.46 0.49 0.94 0.43 0.47 0.43 0.47 0.55 0.58 0.64 0.73
0.77 0.86 1.0 0.78 0.67 0.76 0.4 0.43 0.56 0.45 0.52 0.46 0.4 0.86 0.85 0.51 0.4 0.59 0.49 0.51 0.43 0.48 0.77 0.59 0.55 0.74 0.57 0.71 0.72 0.61 0.71
Bra021297 (MOS4)
 0.61 0.79 0.92 0.58 0.83 0.68 0.42 0.47 0.58 0.57 0.57 0.54 0.65 0.9 0.81 0.6 0.56 0.61 0.43 0.49 0.52 0.55 1.0 0.5 0.53 0.55 0.53 0.58 0.63 0.66 0.74
Bra021474 (RPK2)
 0.71 0.73 0.74 0.7 0.75 0.81 0.46 0.56 0.54 0.45 0.48 0.45 0.48 0.91 1.0 0.64 0.57 0.66 0.52 0.47 0.44 0.45 0.8 0.46 0.43 0.44 0.5 0.46 0.53 0.49 0.58
0.8 0.74 0.88 0.6 0.92 0.91 0.5 0.47 0.61 0.53 0.56 0.47 0.56 0.79 0.95 0.68 0.51 0.66 0.54 0.51 0.49 0.47 1.0 0.58 0.69 0.46 0.53 0.72 0.71 0.59 0.75
Bra022561 (RAR1)
 0.47 0.74 0.64 0.48 0.56 0.6 0.3 0.34 0.46 0.35 0.34 0.36 0.59 0.68 0.83 0.42 0.35 0.62 0.33 0.34 0.3 0.37 1.0 0.41 0.43 0.38 0.4 0.49 0.51 0.48 0.56
0.76 1.0 0.91 0.74 0.89 0.88 0.53 0.57 0.57 0.5 0.48 0.48 0.67 0.76 0.88 0.58 0.54 0.72 0.56 0.63 0.53 0.57 0.92 0.63 0.58 0.5 0.6 0.57 0.62 0.62 0.69
Bra023426 (PDAT)
 0.51 0.53 0.54 0.46 0.6 0.58 0.3 0.33 0.4 0.37 0.46 0.38 0.46 0.71 0.75 0.38 0.4 0.57 0.41 0.39 0.32 0.33 1.0 0.35 0.36 0.59 0.35 0.46 0.52 0.44 0.57
Bra024511 (IRE1A)
 0.77 0.99 0.85 0.6 0.86 0.92 0.31 0.29 0.6 0.53 0.53 0.6 0.37 0.89 0.96 0.56 0.49 0.63 0.46 0.41 0.44 0.49 1.0 0.38 0.42 0.41 0.41 0.38 0.56 0.69 0.9
Bra025703 (DDR4)
 0.71 0.85 0.93 0.61 0.88 0.76 0.47 0.52 0.58 0.54 0.5 0.5 0.51 0.71 0.83 0.54 0.49 0.75 0.57 0.53 0.45 0.56 1.0 0.58 0.48 0.48 0.51 0.62 0.63 0.72 0.7
Bra026248 (PQT3)
 0.8 0.74 0.62 0.78 0.86 0.86 0.43 0.4 0.51 0.47 0.47 0.43 0.43 0.79 1.0 0.56 0.51 0.51 0.48 0.51 0.47 0.47 0.96 0.5 0.47 0.53 0.51 0.57 0.54 0.49 0.59
Bra028519 (ORM2)
 0.51 0.56 0.72 0.67 0.74 0.77 0.46 0.71 0.58 0.7 0.62 0.53 0.62 1.0 0.93 0.77 0.68 0.84 0.57 0.56 0.52 0.66 0.77 0.56 0.46 0.6 0.52 0.43 0.52 0.4 0.54
Bra029862 (SUN2)
 0.73 0.75 0.66 0.65 0.88 0.81 0.38 0.36 0.5 0.45 0.48 0.39 0.5 0.79 0.9 0.46 0.42 0.67 0.48 0.4 0.42 0.45 1.0 0.49 0.5 0.53 0.5 0.58 0.61 0.63 0.57
Bra031661 (ADCP1)
 0.59 0.79 0.87 0.62 0.77 0.79 0.38 0.47 0.53 0.49 0.49 0.48 0.51 0.84 0.88 0.58 0.51 0.78 0.46 0.52 0.42 0.42 1.0 0.5 0.48 0.52 0.49 0.57 0.59 0.7 0.82
0.53 0.62 0.66 0.57 0.67 0.69 0.41 0.34 0.54 0.46 0.46 0.47 0.43 0.98 1.0 0.57 0.54 0.57 0.5 0.53 0.56 0.53 0.56 0.52 0.52 0.56 0.49 0.46 0.56 0.5 0.54
Bra033368 (PFB1)
 0.68 0.87 0.82 0.58 0.88 0.9 0.55 0.57 0.6 0.49 0.51 0.48 0.68 0.95 1.0 0.63 0.56 0.82 0.63 0.58 0.59 0.61 0.94 0.57 0.55 0.53 0.61 0.56 0.68 0.61 0.8
0.55 0.5 0.62 0.39 0.71 0.77 0.43 0.45 0.44 0.38 0.39 0.39 0.48 0.87 1.0 0.53 0.45 0.66 0.54 0.45 0.47 0.4 0.83 0.54 0.52 0.42 0.5 0.5 0.73 0.56 0.73
0.67 0.68 0.75 0.44 0.79 0.56 0.27 0.34 0.43 0.46 0.42 0.46 0.4 0.52 0.71 0.39 0.41 0.85 0.49 0.35 0.32 0.37 1.0 0.33 0.35 0.29 0.38 0.48 0.45 0.73 0.75
Bra034744 (HUA1)
 0.55 0.64 0.79 0.59 0.62 0.63 0.4 0.4 0.58 0.54 0.57 0.51 0.56 0.95 1.0 0.65 0.53 0.64 0.55 0.49 0.49 0.54 0.73 0.53 0.51 0.53 0.55 0.5 0.53 0.54 0.58
0.82 0.78 1.0 0.73 0.88 0.84 0.45 0.47 0.6 0.52 0.55 0.5 0.44 0.85 0.87 0.56 0.53 0.62 0.55 0.48 0.48 0.48 0.98 0.64 0.67 0.67 0.64 0.62 0.74 0.78 0.84
0.72 0.64 0.81 0.59 0.89 0.86 0.54 0.58 0.56 0.45 0.48 0.5 0.51 0.81 0.95 0.55 0.46 0.48 0.51 0.44 0.42 0.46 1.0 0.44 0.41 0.38 0.41 0.51 0.52 0.58 0.48
0.51 0.56 0.65 0.52 0.65 0.57 0.24 0.27 0.51 0.47 0.44 0.46 0.33 0.95 1.0 0.5 0.38 0.44 0.51 0.41 0.36 0.44 0.57 0.31 0.31 0.45 0.31 0.32 0.48 0.39 0.38
Bra037410 (VPS8)
 0.83 0.9 0.88 0.61 0.99 0.99 0.51 0.5 0.63 0.63 0.62 0.59 0.51 0.96 1.0 0.64 0.65 0.68 0.63 0.55 0.53 0.57 0.82 0.57 0.6 0.59 0.62 0.61 0.75 0.77 0.89
0.52 0.62 0.65 0.39 0.67 0.73 0.35 0.38 0.46 0.29 0.44 0.33 0.5 0.77 0.9 0.45 0.38 0.52 0.43 0.43 0.32 0.3 1.0 0.45 0.48 0.37 0.42 0.48 0.59 0.57 0.67
Bra037646 (COX10)
 0.59 0.61 0.61 0.49 0.54 0.46 0.32 0.48 0.36 0.43 0.4 0.44 0.46 0.49 0.57 0.41 0.45 0.66 0.41 0.4 0.39 0.41 1.0 0.47 0.46 0.39 0.55 0.45 0.48 0.64 0.67
Bra037951 (EXO84B)
 0.86 0.88 0.82 0.69 0.92 0.85 0.41 0.4 0.58 0.54 0.55 0.51 0.42 0.96 1.0 0.59 0.5 0.64 0.64 0.53 0.51 0.5 0.79 0.55 0.58 0.51 0.55 0.71 0.72 0.66 0.66
Bra038078 (CASPL1E1)
 0.23 0.33 0.55 0.3 0.62 0.52 0.22 0.31 0.43 0.37 0.32 0.39 0.55 1.0 0.86 0.39 0.49 0.56 0.28 0.29 0.17 0.33 0.26 0.15 0.2 0.1 0.2 0.15 0.22 0.24 0.18
Bra039296 (BRM)
 0.91 0.9 0.82 0.65 1.0 0.87 0.43 0.46 0.68 0.61 0.58 0.63 0.53 0.94 0.98 0.62 0.53 0.69 0.63 0.55 0.51 0.51 0.77 0.48 0.51 0.52 0.53 0.66 0.71 0.74 0.73
Bra039381 (FNBP4)
 0.6 0.58 0.66 0.48 0.69 0.71 0.29 0.43 0.38 0.34 0.42 0.4 0.41 0.72 1.0 0.54 0.47 0.64 0.44 0.39 0.41 0.48 0.67 0.43 0.44 0.44 0.43 0.45 0.48 0.39 0.44
0.27 0.23 0.22 0.16 0.25 0.19 0.04 0.02 0.02 0.06 0.03 0.04 0.16 0.26 0.06 0.06 0.03 0.5 0.06 0.04 0.05 0.03 1.0 0.16 0.13 0.14 0.15 0.19 0.18 0.23 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)