1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_252 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
7.5 8.9 12.6 6.68 7.98 8.79 6.09 6.5 7.25 6.35 6.75 6.88 7.61 12.3 13.8 8.38 7.08 9.68 7.83 7.45 6.6 7.35 10.42 5.38 5.29 4.66 5.34 4.97 5.69 6.29 6.98
Bra000153 (TOPP4)
 6.9 7.99 8.09 6.31 10.01 10.09 5.24 4.77 7.06 6.16 5.84 5.48 5.6 8.88 9.22 6.18 5.33 6.22 5.27 5.95 5.78 5.88 8.34 6.45 6.65 4.59 5.94 6.44 7.44 6.48 7.47
556.26 576.85 563.33 461.51 889.01 859.05 439.06 318.17 557.78 427.15 491.09 454.87 426.42 933.77 1011.61 496.58 413.96 582.98 554.31 536.62 461.63 544.49 1096.17 518.09 500.7 365.59 497.61 586.82 684.46 555.67 660.62
12.07 16.09 19.19 13.23 14.33 14.87 10.74 12.36 12.32 12.69 12.7 12.29 14.94 23.42 26.06 17.15 14.16 16.81 12.02 13.27 11.96 11.57 24.5 10.72 12.88 12.66 11.66 11.98 13.7 12.39 15.16
Bra001334 (KA120)
 2.97 2.89 3.06 2.26 3.1 2.98 1.83 2.23 2.18 1.9 2.23 1.99 1.75 3.0 3.23 2.35 1.96 1.92 1.9 2.01 2.03 1.67 3.91 2.32 2.55 2.4 2.51 2.44 2.77 2.92 3.4
Bra002200 (BPM2)
 10.81 13.73 14.04 12.2 13.27 10.63 5.93 4.67 9.36 8.45 8.09 7.04 6.35 15.08 12.83 7.74 6.61 7.45 6.92 6.42 6.53 6.56 13.1 8.82 7.32 8.75 8.35 11.01 11.89 8.52 8.83
Bra002315 (PMIR1)
 5.97 5.48 6.61 4.24 6.01 6.55 3.84 4.19 4.4 3.45 3.45 3.75 3.59 5.86 6.1 3.94 3.65 5.03 4.47 4.06 4.11 4.37 6.6 3.43 3.49 3.18 3.05 3.62 4.26 3.95 4.37
Bra002930 (SIR1)
 8.13 10.77 11.17 6.83 11.14 10.66 5.15 6.13 6.17 3.97 5.29 5.78 7.06 12.53 14.29 6.91 7.53 9.58 6.37 5.79 5.42 5.97 15.01 5.16 5.1 5.32 5.47 4.95 6.85 6.95 8.33
Bra003173 (FIP37)
 17.35 15.67 14.61 11.33 19.12 16.4 9.8 9.2 12.46 11.74 12.62 10.61 13.95 18.99 24.75 13.2 11.51 12.19 10.49 11.48 10.51 9.85 23.62 12.83 11.47 10.43 11.3 12.5 14.35 13.15 16.45
Bra003614 (NUA)
 7.54 8.0 7.22 5.81 7.18 7.01 4.42 5.5 5.02 4.96 5.17 4.94 5.1 10.03 10.06 6.77 5.69 6.6 6.14 5.77 5.16 4.75 7.79 4.15 4.61 4.92 4.94 4.48 4.5 4.97 7.94
Bra004751 (POP4)
 3.05 3.79 2.91 2.77 3.71 4.23 1.91 2.22 2.7 1.98 2.47 2.41 3.25 5.55 5.79 3.14 2.33 3.32 2.77 2.27 2.61 2.11 8.84 3.17 2.61 1.96 3.81 3.27 2.92 2.39 3.07
Bra005036 (PGP6)
 3.21 3.33 3.92 3.93 4.2 3.45 1.6 1.69 2.23 1.97 1.9 2.05 1.98 3.8 4.33 2.51 2.24 3.53 2.2 1.69 1.87 1.84 4.68 1.89 1.82 2.38 2.07 2.51 2.98 2.98 2.8
Bra006502 (RBP45d)
 6.7 6.65 7.88 5.02 6.56 6.58 4.6 4.56 5.64 5.39 5.21 4.85 5.98 9.23 9.99 5.9 5.09 6.29 5.31 4.64 5.19 4.63 8.7 4.13 4.4 3.87 4.11 4.12 4.19 4.23 5.33
Bra006513 (S1P)
 7.28 7.67 7.78 5.46 7.8 7.99 3.9 3.46 4.72 3.79 3.54 3.9 3.75 7.8 6.87 4.44 3.57 5.5 4.39 4.09 2.97 3.82 9.75 4.39 4.27 3.58 4.48 4.74 6.09 6.43 6.35
Bra007048 (SDG22)
 10.56 13.22 11.55 11.4 12.95 13.57 8.41 8.41 9.61 10.15 9.66 9.16 8.94 16.55 17.19 11.7 10.44 10.56 10.1 9.34 7.99 10.2 16.51 10.41 10.36 9.03 10.48 11.51 12.53 10.53 10.79
Bra007084 (NDC80)
 2.42 2.45 2.36 1.98 2.99 2.13 0.91 1.45 1.65 1.41 1.2 1.07 1.86 2.95 3.4 1.41 1.22 2.56 1.28 1.52 1.02 0.75 3.85 1.65 1.31 1.26 1.74 1.93 2.0 2.32 2.01
10.31 12.27 10.85 9.94 11.89 13.7 7.41 7.67 8.55 8.03 9.14 9.47 9.4 15.78 15.28 9.29 8.34 11.66 8.19 9.0 10.61 9.71 19.11 9.99 10.68 8.45 11.21 10.26 11.12 10.97 11.48
Bra007534 (SHOT1)
 5.4 5.82 4.6 4.27 6.45 5.52 2.6 3.79 3.29 3.09 2.7 3.04 3.2 7.73 8.54 3.87 2.92 3.77 2.99 3.27 2.88 2.82 7.06 1.96 2.25 1.55 2.47 3.48 3.58 2.82 2.31
6.28 7.51 7.45 5.88 6.06 5.32 3.08 3.7 4.32 4.44 4.93 3.99 6.2 7.75 8.26 5.01 4.51 6.17 3.72 3.93 3.6 3.88 8.48 3.77 4.0 5.28 4.71 4.66 5.02 4.99 6.59
Bra008832 (NEF1)
 3.46 4.72 3.95 2.99 4.35 4.42 2.5 2.36 3.02 2.72 3.17 3.02 3.05 5.18 6.45 3.43 3.16 4.38 3.16 2.78 2.9 3.02 6.57 3.13 2.97 2.69 3.07 3.12 3.66 3.65 3.97
8.09 8.74 7.81 6.8 11.35 9.98 4.55 5.65 7.11 5.12 5.44 6.31 6.65 12.99 13.41 7.84 6.2 10.07 6.46 6.73 5.5 6.87 16.1 7.35 7.33 5.18 5.6 7.86 8.32 7.4 7.1
Bra009196 (UBA 2)
 6.91 7.37 6.97 6.37 7.23 7.84 4.79 5.68 4.69 4.99 4.53 5.01 5.77 7.72 10.73 6.29 5.87 5.78 5.39 4.92 5.23 4.67 9.65 5.08 5.04 4.57 5.0 5.23 5.12 5.06 6.22
Bra009754 (IRE1)
 5.06 4.91 5.07 5.09 7.47 6.76 4.29 4.49 4.92 4.22 4.54 4.3 4.58 7.24 6.61 4.46 4.19 7.31 4.84 4.35 4.14 3.6 8.39 4.28 4.49 4.43 4.25 4.65 4.9 4.61 4.73
Bra010108 (ELF5)
 16.71 16.23 16.98 15.2 16.23 17.6 10.45 10.71 16.09 12.83 14.34 13.35 13.97 19.27 22.12 14.7 14.76 15.19 13.17 15.04 13.21 14.01 28.66 14.58 15.42 15.56 15.88 14.92 15.78 14.79 15.83
Bra010193 (NAC014)
 8.57 6.55 6.38 4.27 6.0 5.76 2.83 2.37 3.43 3.13 3.05 3.22 3.28 6.51 6.68 4.01 3.32 3.99 4.0 3.35 3.1 3.2 6.37 4.32 4.7 4.5 4.33 5.31 5.85 4.48 4.48
Bra010355 (PHR1)
 14.66 14.17 19.03 13.47 15.6 17.44 11.46 11.93 14.51 13.31 14.91 12.98 14.54 20.6 20.72 16.19 15.12 15.5 12.83 15.93 14.63 15.11 14.05 12.89 12.48 12.71 12.99 12.77 11.85 11.63 12.31
Bra010520 (RecQl3)
 3.87 3.21 3.85 2.53 3.58 3.16 1.95 1.82 2.35 2.28 2.16 2.43 2.41 3.79 3.72 2.26 2.35 2.79 2.52 2.0 2.18 2.31 2.94 1.9 2.49 2.16 2.12 2.15 2.12 2.51 3.22
4.68 5.48 5.33 3.99 5.09 5.37 3.36 3.79 5.03 3.62 3.72 3.27 3.55 7.03 8.06 4.67 4.41 4.19 4.67 3.8 3.69 3.66 7.04 3.13 3.45 3.45 3.74 3.74 4.15 3.95 4.61
Bra010953 (NTF2A)
 45.17 51.53 66.18 37.65 46.97 44.46 24.68 27.09 49.29 40.3 35.58 36.16 47.27 80.65 79.14 47.55 43.69 43.26 33.07 38.31 37.59 44.53 35.93 26.15 28.93 23.82 25.86 34.16 35.32 24.64 36.3
Bra011458 (ADL2)
 7.96 10.32 9.12 7.98 10.78 8.4 5.33 6.63 5.42 5.86 5.35 5.63 6.6 8.84 9.31 6.92 6.48 8.83 5.69 5.92 5.17 5.73 11.76 5.61 5.85 6.14 5.55 6.51 7.16 6.81 7.47
Bra011745 (IRX14)
 5.05 6.67 5.98 5.98 8.49 6.91 4.31 4.78 4.57 4.43 4.53 3.66 6.47 7.88 8.44 4.9 5.03 8.25 4.8 4.24 4.54 4.4 10.0 4.55 4.56 6.14 4.91 5.24 6.14 5.97 6.87
Bra011807 (PICALM10a)
 1.35 2.48 2.32 1.29 2.32 1.91 0.4 0.18 0.95 0.67 0.68 0.79 0.23 2.33 2.66 0.62 0.38 0.97 1.05 0.76 0.52 0.74 2.97 0.43 0.4 0.65 0.37 1.06 1.22 2.2 1.09
Bra013958 (TFL2)
 7.06 7.3 8.86 5.61 7.97 8.6 4.22 5.55 4.18 3.67 4.66 4.38 4.38 7.55 9.09 5.26 4.84 6.44 6.24 5.59 5.05 5.31 11.14 5.2 4.19 5.16 4.52 4.74 5.17 5.45 5.87
Bra014495 (ARABIDILLO2)
 5.49 7.68 6.9 5.76 7.98 7.16 4.09 4.36 5.4 5.12 5.19 4.69 4.82 8.45 9.13 5.59 4.85 5.84 5.17 4.24 4.66 4.24 8.23 4.98 4.67 4.43 4.57 5.71 6.37 5.58 6.84
10.39 8.14 9.73 7.55 9.79 10.24 6.15 5.61 7.15 6.33 7.15 5.89 5.7 9.09 10.18 6.97 6.29 7.04 6.23 6.5 5.89 5.71 11.41 6.37 7.11 6.94 6.77 8.02 9.31 6.86 7.46
Bra019993 (CDC5)
 21.17 24.13 29.11 20.08 20.83 21.93 14.08 15.85 17.07 14.97 15.99 14.75 19.32 30.01 31.86 19.0 16.72 23.01 16.76 15.84 14.77 15.66 29.88 13.67 15.01 13.78 14.93 17.61 18.56 20.33 23.12
22.99 25.46 29.75 23.12 20.01 22.61 12.03 12.7 16.63 13.47 15.37 13.56 12.04 25.56 25.29 15.08 12.04 17.43 14.43 15.24 12.72 14.39 22.92 17.59 16.33 21.95 17.07 21.02 21.56 18.07 21.22
Bra021297 (MOS4)
 19.38 24.81 29.02 18.38 26.16 21.42 13.26 14.71 18.43 18.01 18.15 16.99 20.58 28.36 25.53 19.02 17.63 19.38 13.67 15.39 16.31 17.26 31.6 15.69 16.84 17.34 16.87 18.24 19.88 20.72 23.41
Bra021474 (RPK2)
 3.78 3.88 3.94 3.74 3.98 4.31 2.46 2.97 2.84 2.4 2.56 2.38 2.53 4.84 5.31 3.37 3.04 3.5 2.74 2.51 2.35 2.38 4.26 2.42 2.26 2.36 2.65 2.47 2.8 2.59 3.09
4.63 4.32 5.12 3.51 5.35 5.32 2.93 2.73 3.54 3.06 3.25 2.73 3.27 4.58 5.55 3.95 2.97 3.84 3.15 2.96 2.86 2.71 5.81 3.39 3.98 2.66 3.05 4.18 4.11 3.45 4.35
Bra022561 (RAR1)
 7.4 11.62 10.03 7.52 8.69 9.44 4.62 5.33 7.18 5.54 5.37 5.55 9.23 10.69 13.03 6.6 5.49 9.72 5.16 5.34 4.64 5.75 15.63 6.37 6.74 5.94 6.22 7.7 7.97 7.5 8.7
8.57 11.28 10.23 8.3 10.02 9.89 5.98 6.41 6.45 5.69 5.47 5.46 7.59 8.54 9.9 6.48 6.11 8.1 6.32 7.12 6.01 6.46 10.36 7.11 6.54 5.64 6.75 6.46 6.95 7.03 7.74
Bra023426 (PDAT)
 7.06 7.3 7.45 6.36 8.35 8.02 4.16 4.54 5.6 5.14 6.37 5.31 6.37 9.88 10.49 5.31 5.49 7.94 5.74 5.4 4.42 4.56 13.89 4.84 4.99 8.22 4.91 6.43 7.23 6.09 7.98
Bra024511 (IRE1A)
 13.45 17.11 14.72 10.33 15.01 15.95 5.36 5.11 10.48 9.19 9.18 10.35 6.49 15.46 16.73 9.65 8.5 10.89 8.05 7.06 7.65 8.56 17.36 6.57 7.25 7.13 7.12 6.61 9.76 12.03 15.67
Bra025703 (DDR4)
 4.23 5.09 5.55 3.66 5.26 4.52 2.77 3.07 3.48 3.21 2.96 2.96 3.03 4.22 4.97 3.24 2.89 4.46 3.41 3.13 2.65 3.31 5.96 3.46 2.87 2.83 3.03 3.71 3.78 4.26 4.18
Bra026248 (PQT3)
 10.29 9.57 7.95 10.02 11.06 11.05 5.49 5.14 6.58 6.05 6.02 5.52 5.57 10.22 12.87 7.25 6.57 6.58 6.17 6.59 6.01 6.07 12.29 6.39 6.05 6.77 6.51 7.29 6.91 6.26 7.59
Bra028519 (ORM2)
 12.28 13.56 17.58 16.22 18.08 18.65 11.24 17.14 14.05 16.98 15.1 12.83 14.98 24.3 22.67 18.72 16.61 20.45 13.79 13.57 12.62 16.1 18.65 13.54 11.22 14.48 12.71 10.48 12.64 9.75 13.15
Bra029862 (SUN2)
 10.91 11.33 9.97 9.83 13.22 12.13 5.66 5.48 7.49 6.7 7.17 5.88 7.46 11.81 13.54 6.91 6.3 10.04 7.25 5.96 6.35 6.69 15.04 7.36 7.59 7.98 7.54 8.78 9.11 9.55 8.56
Bra031661 (ADCP1)
 6.4 8.66 9.55 6.8 8.4 8.65 4.14 5.12 5.76 5.37 5.36 5.25 5.6 9.19 9.56 6.34 5.61 8.53 5.04 5.63 4.64 4.62 10.92 5.45 5.26 5.63 5.3 6.23 6.41 7.63 8.98
24.77 28.8 30.97 26.46 31.53 32.44 19.29 16.05 25.03 21.38 21.55 22.08 20.16 45.69 46.71 26.67 25.17 26.76 23.46 24.55 26.27 24.8 26.07 24.22 24.07 26.01 22.76 21.41 26.17 23.3 25.21
Bra033368 (PFB1)
 16.96 21.7 20.61 14.49 22.16 22.7 13.69 14.4 15.01 12.35 12.89 12.03 17.03 23.92 25.09 15.89 14.14 20.53 15.76 14.61 14.86 15.23 23.59 14.4 13.69 13.32 15.27 14.09 17.02 15.23 19.97
8.92 8.14 9.96 6.27 11.54 12.41 6.97 7.22 7.08 6.11 6.34 6.3 7.8 14.09 16.16 8.5 7.22 10.68 8.72 7.28 7.54 6.43 13.49 8.76 8.42 6.78 8.04 8.13 11.8 9.09 11.85
5.16 5.24 5.73 3.37 6.06 4.3 2.04 2.6 3.31 3.56 3.24 3.53 3.06 4.01 5.49 2.97 3.11 6.5 3.77 2.72 2.47 2.87 7.68 2.5 2.72 2.25 2.91 3.72 3.46 5.62 5.79
Bra034744 (HUA1)
 15.38 17.68 21.81 16.24 17.32 17.59 10.97 11.01 16.21 15.09 15.9 14.04 15.61 26.23 27.73 18.03 14.61 17.78 15.17 13.6 13.69 14.87 20.2 14.75 14.12 14.82 15.21 13.9 14.77 14.96 16.13
6.7 6.41 8.18 5.97 7.2 6.89 3.7 3.81 4.91 4.21 4.53 4.13 3.61 6.98 7.09 4.55 4.38 5.08 4.49 3.9 3.91 3.97 7.98 5.24 5.44 5.46 5.25 5.07 6.01 6.36 6.88
16.42 14.64 18.51 13.39 20.25 19.54 12.34 13.28 12.69 10.31 11.03 11.33 11.6 18.48 21.73 12.49 10.58 11.01 11.73 10.15 9.61 10.4 22.85 10.07 9.45 8.66 9.38 11.66 11.8 13.16 11.05
4.09 4.43 5.2 4.12 5.17 4.56 1.91 2.12 4.08 3.72 3.53 3.64 2.67 7.61 7.99 4.03 3.02 3.49 4.04 3.31 2.91 3.53 4.53 2.46 2.48 3.57 2.48 2.59 3.83 3.1 3.01
Bra037410 (VPS8)
 4.58 4.98 4.87 3.39 5.47 5.46 2.81 2.75 3.5 3.48 3.4 3.28 2.81 5.33 5.52 3.54 3.61 3.74 3.47 3.02 2.93 3.15 4.53 3.14 3.32 3.27 3.45 3.39 4.17 4.24 4.89
2.06 2.44 2.55 1.55 2.66 2.87 1.39 1.5 1.82 1.14 1.73 1.31 1.98 3.02 3.55 1.77 1.52 2.06 1.71 1.71 1.26 1.18 3.94 1.78 1.88 1.47 1.65 1.89 2.32 2.26 2.64
Bra037646 (COX10)
 15.77 16.57 16.47 13.24 14.46 12.38 8.73 12.82 9.75 11.6 10.79 11.78 12.43 13.24 15.44 11.04 12.16 17.72 11.13 10.9 10.64 10.98 26.95 12.54 12.52 10.57 14.73 12.17 13.05 17.27 17.96
Bra037951 (EXO84B)
 18.49 18.78 17.57 14.74 19.78 18.23 8.85 8.61 12.42 11.56 11.77 10.94 8.97 20.64 21.42 12.57 10.65 13.76 13.8 11.37 10.9 10.69 16.95 11.73 12.39 10.86 11.79 15.3 15.39 14.23 14.11
Bra038078 (CASPL1E1)
 4.75 6.98 11.47 6.35 13.0 10.83 4.66 6.44 9.13 7.8 6.76 8.29 11.61 21.02 18.13 8.14 10.36 11.68 5.99 6.14 3.47 6.98 5.52 3.13 4.17 2.18 4.19 3.15 4.58 5.03 3.81
Bra039296 (BRM)
 11.0 10.89 9.9 7.86 12.14 10.58 5.25 5.54 8.2 7.4 7.04 7.61 6.38 11.47 11.91 7.58 6.41 8.41 7.65 6.74 6.16 6.22 9.34 5.87 6.22 6.36 6.43 8.03 8.59 9.05 8.87
Bra039381 (FNBP4)
 6.78 6.48 7.35 5.35 7.71 7.94 3.27 4.77 4.3 3.78 4.68 4.51 4.62 8.09 11.22 6.07 5.26 7.19 4.92 4.41 4.55 5.36 7.49 4.83 4.89 4.99 4.81 5.04 5.33 4.34 4.99
0.84 0.72 0.69 0.48 0.76 0.59 0.12 0.06 0.07 0.19 0.08 0.13 0.5 0.82 0.18 0.19 0.1 1.53 0.19 0.14 0.17 0.08 3.09 0.49 0.41 0.42 0.46 0.6 0.56 0.72 1.03

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)