1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_243 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.96 1.0 0.51 0.65 0.28 0.13 0.16 0.29 0.16 0.21 0.21 0.22 0.14 0.05 0.06 0.1 0.14 0.06 0.14 0.17 0.14 0.13 0.08 0.31 0.36 0.55 0.34 0.22 0.28 0.5 0.24
Bra001043 (BBX3)
 0.48 0.55 0.58 1.0 0.08 0.14 0.29 0.31 0.12 0.2 0.21 0.12 0.08 0.09 0.06 0.39 0.39 0.04 0.13 0.29 0.26 0.29 0.01 0.07 0.06 0.05 0.08 0.04 0.04 0.02 0.01
Bra001182 (TBL10)
 0.83 0.82 0.81 1.0 0.61 0.51 0.51 0.56 0.39 0.42 0.4 0.4 0.33 0.41 0.42 0.35 0.36 0.2 0.26 0.39 0.37 0.4 0.13 0.38 0.39 0.74 0.36 0.5 0.57 0.45 0.38
Bra002374 (PAA2)
 0.89 1.0 1.0 1.0 0.48 0.63 0.65 0.59 0.51 0.58 0.6 0.59 0.54 0.54 0.48 0.69 0.68 0.38 0.54 0.62 0.59 0.58 0.35 0.56 0.59 0.73 0.61 0.56 0.55 0.55 0.78
Bra002510 (TOE2)
 1.0 0.92 0.89 0.97 0.31 0.29 0.2 0.24 0.29 0.42 0.32 0.47 0.39 0.24 0.25 0.17 0.22 0.27 0.2 0.19 0.2 0.27 0.31 0.35 0.31 0.41 0.34 0.52 0.38 0.65 0.41
Bra004045 (BBX27)
 1.0 0.85 0.85 0.86 0.25 0.2 0.24 0.33 0.4 0.32 0.41 0.43 0.21 0.12 0.11 0.18 0.2 0.1 0.18 0.22 0.23 0.26 0.06 0.27 0.26 0.4 0.28 0.37 0.45 0.38 0.28
Bra004077 (HHL1)
 0.96 1.0 0.98 0.96 0.5 0.6 0.78 0.71 0.59 0.71 0.73 0.71 0.65 0.44 0.43 0.77 0.78 0.36 0.58 0.84 0.79 0.73 0.26 0.53 0.55 0.59 0.56 0.54 0.47 0.5 0.61
Bra005302 (OFP15)
 0.64 0.89 1.0 0.76 0.07 0.01 0.05 0.18 0.04 0.07 0.09 0.17 0.15 0.01 0.01 0.05 0.07 0.09 0.04 0.05 0.05 0.04 0.11 0.15 0.13 0.59 0.26 0.13 0.16 0.37 0.28
0.82 0.8 0.98 1.0 0.23 0.15 0.22 0.26 0.26 0.27 0.33 0.28 0.34 0.11 0.12 0.17 0.16 0.06 0.14 0.29 0.27 0.29 0.31 0.23 0.29 0.35 0.3 0.22 0.29 0.4 0.28
0.85 0.91 0.89 1.0 0.09 0.07 0.32 0.25 0.33 0.21 0.41 0.33 0.13 0.02 0.02 0.18 0.17 0.02 0.06 0.17 0.19 0.29 0.1 0.24 0.31 0.33 0.32 0.21 0.36 0.38 0.24
Bra006470 (MIEL1)
 0.81 0.89 1.0 0.67 0.71 0.56 0.39 0.35 0.46 0.48 0.57 0.42 0.44 0.34 0.3 0.35 0.46 0.2 0.32 0.41 0.31 0.45 0.32 0.31 0.41 0.4 0.4 0.33 0.48 0.36 0.39
Bra006851 (GNC)
 0.46 0.85 1.0 0.48 0.33 0.37 0.25 0.19 0.12 0.28 0.31 0.31 0.21 0.05 0.14 0.16 0.32 0.08 0.23 0.26 0.25 0.34 0.33 0.21 0.22 0.1 0.3 0.1 0.23 0.34 0.47
0.62 0.79 0.55 1.0 0.08 0.09 0.28 0.29 0.17 0.37 0.44 0.45 0.28 0.04 0.06 0.25 0.31 0.03 0.15 0.3 0.33 0.49 0.01 0.09 0.14 0.2 0.19 0.06 0.07 0.14 0.13
Bra007819 (GPX1)
 0.72 0.97 1.0 0.7 0.22 0.26 0.34 0.4 0.31 0.34 0.35 0.39 0.38 0.19 0.18 0.34 0.3 0.13 0.22 0.28 0.35 0.28 0.22 0.38 0.41 0.52 0.44 0.32 0.3 0.52 0.54
Bra007937 (JAZ9)
 0.84 1.0 0.95 0.97 0.07 0.03 0.24 0.31 0.11 0.21 0.18 0.26 0.14 0.02 0.02 0.17 0.23 0.33 0.16 0.13 0.13 0.16 0.11 0.22 0.22 0.32 0.26 0.2 0.12 0.49 0.42
Bra008769 (SAFE1)
 1.0 0.86 0.92 0.85 0.58 0.38 0.4 0.55 0.56 0.44 0.52 0.62 0.39 0.26 0.27 0.24 0.26 0.38 0.35 0.3 0.3 0.35 0.32 0.35 0.37 0.41 0.45 0.6 0.52 0.71 0.63
0.86 1.0 0.9 0.74 0.26 0.14 0.07 0.08 0.22 0.29 0.32 0.33 0.2 0.08 0.1 0.11 0.13 0.23 0.15 0.11 0.23 0.18 0.08 0.09 0.1 0.19 0.15 0.14 0.14 0.32 0.45
1.0 0.99 0.96 0.61 0.2 0.16 0.05 0.05 0.09 0.1 0.2 0.22 0.0 0.06 0.04 0.04 0.02 0.06 0.05 0.03 0.17 0.19 0.02 0.07 0.09 0.16 0.09 0.03 0.1 0.26 0.34
0.95 0.86 1.0 0.8 0.71 0.49 0.44 0.43 0.36 0.46 0.48 0.31 0.45 0.35 0.37 0.46 0.42 0.23 0.3 0.37 0.35 0.44 0.22 0.39 0.45 0.46 0.45 0.45 0.43 0.42 0.59
Bra010558 (BEE2)
 0.97 0.95 0.72 1.0 0.65 0.58 0.46 0.52 0.42 0.51 0.57 0.51 0.4 0.33 0.22 0.55 0.65 0.2 0.34 0.47 0.69 0.63 0.21 0.57 0.64 0.59 0.55 0.55 0.49 0.49 0.6
Bra011243 (DLDG1)
 0.94 1.0 0.94 0.68 0.45 0.31 0.42 0.45 0.44 0.44 0.52 0.45 0.49 0.23 0.36 0.6 0.55 0.3 0.32 0.32 0.41 0.44 0.22 0.29 0.32 0.44 0.38 0.42 0.4 0.65 0.67
Bra011656 (J11)
 0.81 0.96 1.0 0.89 0.09 0.13 0.23 0.17 0.31 0.27 0.34 0.33 0.13 0.08 0.1 0.25 0.12 0.05 0.18 0.32 0.19 0.29 0.06 0.17 0.19 0.47 0.23 0.25 0.32 0.32 0.31
Bra013532 (FBS2)
 0.9 1.0 0.96 0.95 0.46 0.33 0.33 0.4 0.37 0.37 0.38 0.36 0.23 0.22 0.27 0.16 0.23 0.3 0.26 0.33 0.27 0.28 0.21 0.37 0.36 0.48 0.36 0.39 0.44 0.43 0.38
Bra014973 (SRRP1)
 0.88 0.89 0.91 1.0 0.56 0.55 0.68 0.6 0.48 0.67 0.72 0.61 0.5 0.34 0.35 0.61 0.59 0.23 0.43 0.65 0.64 0.62 0.27 0.52 0.56 0.63 0.57 0.61 0.56 0.46 0.56
Bra015552 (F2KP)
 0.82 0.86 1.0 0.8 0.65 0.56 0.56 0.49 0.59 0.58 0.64 0.64 0.55 0.48 0.49 0.63 0.69 0.43 0.5 0.56 0.56 0.55 0.43 0.54 0.51 0.54 0.54 0.53 0.53 0.59 0.73
0.9 1.0 0.62 0.59 0.33 0.16 0.08 0.2 0.15 0.16 0.18 0.4 0.12 0.04 0.02 0.09 0.1 0.04 0.03 0.09 0.15 0.15 0.1 0.13 0.12 0.27 0.2 0.21 0.2 0.57 0.52
Bra015879 (FAB1)
 1.0 0.87 0.81 0.74 0.28 0.24 0.38 0.54 0.28 0.35 0.34 0.49 0.4 0.15 0.18 0.31 0.34 0.3 0.25 0.33 0.39 0.35 0.4 0.39 0.43 0.45 0.5 0.48 0.34 0.73 0.63
Bra016096 (SPI-1)
 0.59 1.0 0.69 0.5 0.17 0.25 0.18 0.11 0.16 0.21 0.24 0.23 0.21 0.21 0.07 0.17 0.17 0.02 0.12 0.16 0.17 0.18 0.06 0.16 0.15 0.23 0.14 0.09 0.14 0.18 0.17
1.0 0.91 0.86 0.97 0.8 0.54 0.66 0.9 0.49 0.48 0.44 0.53 0.51 0.46 0.34 0.34 0.39 0.47 0.41 0.41 0.4 0.44 0.22 0.52 0.55 0.68 0.57 0.67 0.62 0.7 0.64
Bra017435 (CP5)
 0.63 0.74 1.0 0.82 0.17 0.24 0.27 0.3 0.28 0.26 0.31 0.3 0.21 0.17 0.14 0.21 0.23 0.15 0.19 0.25 0.24 0.24 0.12 0.25 0.29 0.45 0.28 0.26 0.32 0.31 0.37
1.0 0.86 0.79 0.79 0.46 0.36 0.35 0.48 0.49 0.39 0.43 0.55 0.26 0.2 0.2 0.23 0.26 0.17 0.29 0.28 0.27 0.33 0.1 0.3 0.33 0.38 0.39 0.46 0.47 0.6 0.41
Bra020293 (RIBA3)
 0.89 0.99 1.0 0.82 0.24 0.29 0.55 0.51 0.4 0.53 0.67 0.68 0.53 0.2 0.14 0.49 0.58 0.29 0.48 0.61 0.55 0.6 0.25 0.32 0.4 0.57 0.43 0.19 0.28 0.37 0.47
Bra021733 (GUN1)
 0.81 0.88 1.0 0.87 0.54 0.52 0.53 0.54 0.54 0.63 0.62 0.61 0.59 0.48 0.53 0.65 0.63 0.47 0.49 0.57 0.53 0.55 0.39 0.53 0.57 0.6 0.6 0.59 0.66 0.64 0.69
Bra022354 (ATL77)
 0.96 0.95 1.0 0.75 0.26 0.35 0.4 0.58 0.39 0.51 0.6 0.64 0.28 0.14 0.17 0.36 0.44 0.12 0.26 0.49 0.35 0.49 0.14 0.23 0.4 0.73 0.41 0.22 0.24 0.49 0.22
0.42 0.86 1.0 0.77 0.04 0.04 0.05 0.04 0.03 0.13 0.09 0.05 0.08 0.0 0.06 0.14 0.16 0.15 0.1 0.14 0.13 0.26 0.06 0.04 0.05 0.35 0.05 0.02 0.02 0.12 0.08
0.7 0.47 1.0 0.66 0.21 0.18 0.23 0.25 0.38 0.37 0.4 0.35 0.27 0.22 0.25 0.3 0.36 0.23 0.25 0.34 0.28 0.29 0.15 0.22 0.22 0.32 0.25 0.14 0.25 0.45 0.55
Bra023908 (RBL)
 0.76 0.92 0.98 1.0 0.46 0.32 0.27 0.41 0.43 0.36 0.39 0.42 0.3 0.27 0.25 0.28 0.26 0.27 0.28 0.3 0.29 0.3 0.23 0.3 0.28 0.38 0.32 0.38 0.38 0.57 0.56
0.63 0.66 1.0 0.61 0.42 0.33 0.44 0.5 0.33 0.4 0.41 0.4 0.39 0.24 0.28 0.34 0.36 0.22 0.28 0.4 0.39 0.4 0.18 0.33 0.34 0.35 0.36 0.4 0.33 0.39 0.35
Bra024968 (LON2)
 0.84 0.85 0.81 1.0 0.31 0.26 0.31 0.28 0.44 0.37 0.43 0.45 0.27 0.2 0.17 0.27 0.28 0.09 0.22 0.32 0.29 0.33 0.1 0.22 0.25 0.33 0.26 0.27 0.33 0.3 0.28
Bra026029 (HCF173)
 0.83 0.79 1.0 0.93 0.28 0.37 0.49 0.4 0.38 0.45 0.57 0.46 0.41 0.25 0.24 0.49 0.45 0.19 0.33 0.53 0.5 0.5 0.21 0.38 0.47 0.53 0.48 0.32 0.41 0.34 0.35
0.83 1.0 0.8 0.86 0.07 0.05 0.24 0.28 0.19 0.27 0.41 0.41 0.19 0.04 0.04 0.14 0.16 0.04 0.06 0.21 0.19 0.23 0.04 0.13 0.16 0.25 0.22 0.14 0.16 0.24 0.24
0.51 0.54 1.0 0.56 0.17 0.14 0.2 0.25 0.18 0.24 0.22 0.25 0.16 0.11 0.11 0.21 0.23 0.12 0.13 0.27 0.27 0.26 0.09 0.2 0.21 0.21 0.2 0.26 0.23 0.23 0.29
0.81 0.91 1.0 0.81 0.32 0.19 0.23 0.44 0.27 0.29 0.33 0.45 0.25 0.13 0.18 0.14 0.19 0.19 0.15 0.18 0.23 0.18 0.27 0.34 0.35 0.44 0.43 0.53 0.42 0.58 0.62
Bra026893 (PGL1)
 0.75 1.0 0.75 0.85 0.05 0.03 0.2 0.3 0.17 0.25 0.3 0.28 0.34 0.01 0.03 0.23 0.2 0.07 0.06 0.16 0.17 0.17 0.1 0.2 0.23 0.49 0.26 0.12 0.14 0.38 0.36
Bra027604 (UMAMIT1)
 0.9 1.0 0.86 0.87 0.43 0.34 0.36 0.34 0.38 0.35 0.46 0.3 0.3 0.25 0.17 0.24 0.36 0.21 0.37 0.37 0.32 0.28 0.41 0.42 0.36 0.34 0.37 0.31 0.31 0.39 0.39
Bra027685 (PGD1)
 0.68 0.72 1.0 0.58 0.22 0.16 0.19 0.51 0.25 0.26 0.28 0.34 0.28 0.12 0.24 0.17 0.14 0.35 0.2 0.19 0.2 0.21 0.3 0.21 0.26 0.31 0.28 0.31 0.23 0.57 0.36
0.78 0.85 1.0 0.82 0.18 0.15 0.14 0.16 0.2 0.21 0.28 0.23 0.25 0.1 0.08 0.14 0.17 0.14 0.07 0.14 0.13 0.15 0.14 0.1 0.12 0.44 0.15 0.15 0.16 0.21 0.22
Bra028288 (ATSDH)
 0.64 1.0 0.92 0.79 0.29 0.34 0.32 0.24 0.39 0.27 0.46 0.38 0.25 0.3 0.28 0.31 0.25 0.11 0.24 0.32 0.32 0.37 0.12 0.29 0.32 0.37 0.35 0.22 0.42 0.36 0.53
Bra028478 (CLCA)
 0.54 1.0 0.69 0.76 0.01 0.01 0.13 0.11 0.05 0.19 0.17 0.15 0.23 0.0 0.01 0.16 0.22 0.22 0.09 0.16 0.16 0.22 0.19 0.09 0.16 0.56 0.17 0.03 0.04 0.13 0.2
0.69 0.75 1.0 0.75 0.45 0.4 0.38 0.49 0.38 0.41 0.42 0.39 0.43 0.34 0.31 0.39 0.42 0.28 0.32 0.43 0.43 0.39 0.2 0.35 0.41 0.44 0.44 0.4 0.42 0.42 0.55
Bra029488 (RbcX1)
 1.0 0.94 0.9 0.71 0.69 0.37 0.22 0.34 0.54 0.49 0.51 0.64 0.19 0.19 0.25 0.21 0.24 0.22 0.34 0.31 0.3 0.41 0.14 0.34 0.29 0.35 0.4 0.54 0.54 0.88 0.58
0.79 0.75 1.0 0.95 0.24 0.4 0.24 0.17 0.19 0.29 0.35 0.3 0.18 0.18 0.17 0.28 0.25 0.1 0.21 0.4 0.36 0.44 0.05 0.13 0.1 0.37 0.14 0.06 0.14 0.08 0.06
0.62 0.84 1.0 0.63 0.24 0.23 0.3 0.19 0.19 0.26 0.21 0.26 0.18 0.22 0.17 0.2 0.26 0.14 0.23 0.26 0.2 0.22 0.15 0.4 0.42 0.4 0.44 0.37 0.43 0.49 0.45
Bra034141 (ARAF)
 0.91 1.0 0.87 0.78 0.47 0.4 0.29 0.23 0.44 0.41 0.55 0.48 0.22 0.33 0.37 0.33 0.3 0.23 0.26 0.33 0.26 0.38 0.2 0.34 0.4 0.37 0.4 0.39 0.45 0.53 0.55
0.75 0.77 1.0 0.84 0.48 0.4 0.22 0.38 0.26 0.23 0.28 0.3 0.26 0.34 0.26 0.33 0.24 0.17 0.32 0.23 0.24 0.28 0.09 0.32 0.32 0.36 0.27 0.31 0.35 0.35 0.41
0.7 0.82 0.98 1.0 0.39 0.27 0.21 0.2 0.31 0.26 0.3 0.33 0.3 0.17 0.15 0.18 0.19 0.19 0.22 0.21 0.21 0.25 0.13 0.24 0.27 0.54 0.28 0.18 0.31 0.35 0.42
1.0 0.77 0.75 0.57 0.27 0.18 0.25 0.21 0.16 0.15 0.19 0.16 0.17 0.04 0.03 0.14 0.17 0.03 0.05 0.14 0.13 0.13 0.05 0.16 0.2 0.25 0.19 0.16 0.23 0.22 0.43
Bra037880 (HY4)
 0.95 1.0 0.97 0.95 0.33 0.37 0.26 0.27 0.4 0.29 0.4 0.34 0.23 0.29 0.27 0.28 0.26 0.18 0.28 0.28 0.28 0.29 0.13 0.27 0.3 0.44 0.31 0.36 0.45 0.39 0.4
Bra038340 (PHYLLO)
 1.0 0.9 0.84 0.9 0.62 0.62 0.6 0.62 0.46 0.5 0.49 0.56 0.51 0.5 0.48 0.56 0.56 0.29 0.39 0.52 0.48 0.43 0.34 0.47 0.53 0.67 0.63 0.55 0.55 0.57 0.71
Bra039048 (VHA-d2)
 0.75 0.87 1.0 0.68 0.36 0.25 0.29 0.25 0.19 0.18 0.25 0.25 0.19 0.17 0.12 0.18 0.18 0.18 0.17 0.16 0.16 0.15 0.16 0.35 0.37 0.41 0.41 0.42 0.37 0.52 0.4
Bra040483 (MYC70)
 0.47 0.36 1.0 0.34 0.03 0.0 0.1 0.13 0.25 0.24 0.28 0.16 0.08 0.02 0.01 0.13 0.19 0.11 0.12 0.18 0.14 0.22 0.15 0.04 0.08 0.12 0.08 0.02 0.05 0.31 0.57

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)