1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_265 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000090 (AtANN4)
 0.04 0.01 0.05 0.04 0.25 0.15 0.66 0.6 0.34 0.53 0.47 0.35 1.0 0.18 0.11 0.48 0.56 0.7 0.2 0.26 0.29 0.36 0.47 0.41 0.46 0.44 0.35 0.25 0.36 0.32 0.63
Bra000091 (ANN3)
 0.22 0.11 0.2 0.34 0.53 0.29 0.69 0.57 0.45 0.58 0.55 0.42 1.0 0.33 0.18 0.5 0.5 0.67 0.2 0.29 0.31 0.34 0.47 0.59 0.62 0.62 0.61 0.4 0.71 0.57 0.82
Bra000942 (GT72B1)
 0.2 0.1 0.14 0.14 0.26 0.4 0.64 0.66 0.41 0.53 0.49 0.41 0.84 0.25 0.38 0.92 0.65 0.5 0.31 0.59 0.49 0.55 0.36 0.45 0.53 0.25 0.54 0.3 0.36 0.38 1.0
0.08 0.05 0.07 0.08 0.47 0.66 0.79 0.66 0.42 0.47 0.43 0.42 0.74 0.79 0.75 0.88 0.79 1.0 0.65 0.62 0.52 0.54 0.23 0.63 0.68 0.52 0.62 0.51 0.46 0.48 0.82
0.0 0.13 0.03 0.1 0.08 0.0 0.27 0.16 0.22 0.22 0.48 0.69 1.0 0.09 0.15 0.24 0.22 0.96 0.34 0.11 0.38 0.11 0.08 0.07 0.07 0.03 0.0 0.0 0.18 0.03 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.18 0.22 0.06 0.15 0.19 0.15 1.0 0.1 0.07 0.26 0.08 0.35 0.23 0.18 0.39 0.14 0.84 0.49 0.27 0.21 0.45 0.03 0.11 0.2 0.21
0.0 0.0 0.04 0.04 0.13 0.08 0.16 0.03 0.08 0.15 0.1 0.06 1.0 0.27 0.08 0.06 0.18 0.42 0.08 0.09 0.2 0.11 0.83 0.61 0.36 0.3 0.4 0.31 0.36 0.36 0.43
0.31 0.15 0.07 0.15 0.25 0.36 0.92 0.8 0.68 0.74 0.64 0.74 0.91 0.32 0.32 0.7 0.72 0.63 0.41 0.69 0.51 0.64 0.34 0.85 0.81 0.81 0.71 0.54 0.53 0.62 1.0
Bra003397 (MTHFR1)
 0.67 0.69 0.62 0.72 0.82 0.8 1.0 0.91 0.61 0.75 0.57 0.57 1.0 0.81 0.85 1.0 0.89 0.82 0.67 0.8 0.73 0.71 0.68 0.85 0.87 0.77 0.77 0.83 0.74 0.49 0.57
Bra004319 (XYL1)
 0.18 0.13 0.18 0.06 0.29 0.26 0.36 0.35 0.19 0.5 0.37 0.25 0.68 0.37 0.35 0.81 0.82 1.0 0.29 0.28 0.4 0.35 0.67 0.54 0.61 0.46 0.66 0.34 0.26 0.48 0.94
Bra004945 (GEF4)
 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.13 0.11 0.3 0.19 0.26 0.02 0.09 0.47 0.08 0.11 0.38 0.22 0.18 0.14 0.21 0.23 0.15 0.04 0.46 0.42 0.31 0.44 0.34 0.41 0.31 1.0
Bra005238 (XTH32)
 0.07 0.04 0.02 0.02 0.11 0.08 0.27 0.6 0.23 0.22 0.21 0.25 1.0 0.24 0.22 0.27 0.33 0.54 0.25 0.18 0.22 0.2 0.51 0.43 0.47 0.22 0.46 0.31 0.21 0.36 0.71
Bra006942 (CAH1)
 0.18 0.14 0.1 0.05 0.2 0.42 0.74 0.6 0.43 0.4 0.5 0.52 0.74 0.47 0.46 0.64 0.6 1.0 0.66 0.64 0.52 0.57 0.16 0.8 0.8 0.61 0.72 0.37 0.53 0.43 0.86
Bra007609 (PGF9)
 0.42 0.32 0.2 0.18 0.23 0.35 1.0 0.74 0.47 0.46 0.64 0.61 0.92 0.3 0.4 0.58 0.52 0.93 0.69 0.53 0.4 0.42 0.58 0.96 0.91 0.57 0.75 0.5 0.45 0.48 1.0
Bra009052 (AST68)
 0.14 0.11 0.08 0.11 0.09 0.31 0.82 0.93 0.31 0.41 0.32 0.45 0.74 0.23 0.36 0.73 0.64 0.81 0.47 0.76 0.48 0.5 0.09 0.5 0.62 0.34 0.58 0.26 0.31 0.26 1.0
Bra009396 (PPa6)
 0.22 0.22 0.22 0.41 0.19 0.25 0.74 0.84 0.28 0.55 0.45 0.43 1.0 0.32 0.2 0.68 0.83 0.69 0.53 0.82 0.66 0.45 0.33 0.67 0.7 0.67 0.65 0.42 0.27 0.29 0.54
Bra009536 (ADK2)
 0.38 0.35 0.36 0.59 0.65 0.52 1.0 0.68 0.32 0.43 0.45 0.32 0.78 0.47 0.43 0.64 0.73 0.7 0.45 0.38 0.41 0.4 0.6 0.47 0.5 0.45 0.5 0.36 0.25 0.27 0.35
0.36 0.28 0.48 0.32 0.48 0.42 0.7 0.74 0.45 0.58 0.5 0.43 0.64 0.37 0.33 0.87 1.0 0.39 0.39 0.6 0.51 0.48 0.26 0.78 0.8 0.7 0.75 0.68 0.64 0.52 0.95
Bra011132 (PAO5)
 0.27 0.16 0.22 0.3 0.43 0.46 0.67 0.62 0.35 0.39 0.39 0.35 1.0 0.6 0.5 0.69 0.65 0.81 0.45 0.56 0.57 0.38 0.55 0.55 0.62 0.7 0.53 0.55 0.52 0.43 0.66
Bra011235 (FADC)
 0.3 0.19 0.28 0.38 0.34 0.4 0.52 0.72 0.47 0.48 0.52 0.46 1.0 0.45 0.34 0.71 0.59 0.54 0.46 0.6 0.48 0.46 0.35 0.58 0.6 0.53 0.56 0.6 0.56 0.49 0.79
Bra011971 (CSD2)
 0.09 0.11 0.13 0.15 0.02 0.05 0.4 0.74 0.26 0.52 0.36 0.42 1.0 0.07 0.08 0.55 0.43 0.09 0.22 0.53 0.34 0.36 0.45 0.48 0.51 0.58 0.52 0.34 0.21 0.24 0.41
Bra012052 (NPF6.2)
 0.27 0.27 0.32 0.27 0.26 0.49 0.84 0.59 0.57 0.64 0.7 0.68 0.74 0.42 0.37 0.84 0.74 0.57 0.58 0.87 0.74 0.71 0.67 0.81 0.9 0.64 0.77 0.43 0.52 0.53 1.0
0.07 0.09 0.06 0.13 0.19 0.11 0.62 0.53 0.33 0.27 0.31 0.13 1.0 0.25 0.22 0.49 0.3 0.59 0.39 0.19 0.26 0.25 0.69 0.29 0.39 0.28 0.21 0.33 0.2 0.18 0.32
0.15 0.23 0.21 0.29 0.12 0.18 0.66 0.55 0.45 0.36 0.52 0.32 1.0 0.28 0.14 0.5 0.3 0.38 0.32 0.36 0.36 0.37 0.41 0.35 0.43 0.4 0.28 0.24 0.28 0.17 0.43
0.15 0.06 0.11 0.09 0.31 0.23 0.26 0.22 0.25 0.31 0.2 0.29 0.54 0.52 0.3 0.37 0.46 0.26 0.21 0.4 0.26 0.33 0.25 0.5 0.54 0.47 0.59 0.46 0.52 0.54 1.0
0.29 0.21 0.23 0.4 0.34 0.37 0.64 0.64 0.26 0.37 0.38 0.32 1.0 0.54 0.43 0.74 0.84 0.56 0.38 0.48 0.46 0.49 0.42 0.47 0.57 0.65 0.5 0.36 0.32 0.27 0.49
Bra014831 (F3H)
 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.52 0.76 0.08 0.14 0.05 0.1 1.0 0.0 0.04 0.06 0.05 0.83 0.05 0.03 0.04 0.04 0.19 0.09 0.22 0.11 0.14 0.09 0.25 0.23 0.67
Bra015404 (PER3)
 0.08 0.05 0.03 0.13 0.22 0.17 0.55 0.52 0.57 0.78 0.65 0.81 0.97 0.34 0.2 0.73 0.95 0.75 0.5 0.76 0.64 0.61 0.31 0.56 0.58 1.0 0.66 0.35 0.42 0.73 0.96
0.19 0.27 0.32 0.35 0.07 0.1 0.51 0.38 0.22 0.29 0.33 0.26 0.58 0.13 0.23 0.5 0.58 1.0 0.34 0.4 0.29 0.33 0.46 0.45 0.46 0.44 0.39 0.19 0.2 0.14 0.26
Bra015788 (PETE1)
 0.33 0.39 0.44 0.47 0.27 0.45 0.94 0.85 0.52 0.9 0.72 0.87 0.84 0.28 0.26 0.72 0.93 0.51 0.5 0.81 1.0 0.94 0.54 0.56 0.6 0.57 0.68 0.35 0.35 0.68 0.72
Bra016223 (CA4)
 0.37 0.44 0.33 0.42 0.27 0.39 0.78 0.77 0.49 0.64 0.7 0.59 1.0 0.5 0.52 0.82 0.8 0.51 0.6 0.76 0.67 0.61 0.3 0.63 0.66 0.7 0.67 0.61 0.57 0.45 0.72
0.1 0.17 0.15 0.22 0.13 0.09 0.31 0.82 0.19 0.41 0.31 0.26 1.0 0.16 0.19 0.47 0.38 0.54 0.24 0.38 0.35 0.23 0.49 0.4 0.42 0.43 0.44 0.24 0.18 0.33 0.42
Bra016614 (CASPL2A1)
 0.14 0.12 0.15 0.19 0.28 0.26 0.46 0.33 0.39 0.44 0.52 0.45 1.0 0.22 0.24 0.58 0.41 0.57 0.26 0.39 0.45 0.46 0.34 0.47 0.4 0.37 0.51 0.34 0.43 0.3 0.5
Bra017017 (JAL22)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.28 0.69 0.15 0.14 0.16 0.19 1.0 0.08 0.06 0.16 0.39 0.84 0.13 0.1 0.27 0.16 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09
Bra017083 (JAL22)
 0.01 0.05 0.1 0.15 0.01 0.12 0.43 0.78 0.14 0.36 0.25 0.21 0.9 0.11 0.09 0.28 0.4 1.0 0.14 0.12 0.47 0.22 0.05 0.25 0.29 0.26 0.32 0.07 0.14 0.26 0.8
Bra017222 (TIP1;1)
 0.16 0.15 0.18 0.34 0.15 0.24 0.9 0.99 0.45 0.74 0.81 0.64 1.0 0.26 0.19 0.82 0.89 0.36 0.28 0.64 0.67 0.6 0.22 0.47 0.51 0.51 0.47 0.18 0.2 0.28 0.61
Bra017666 (BLH6)
 0.36 0.24 0.29 0.43 0.46 0.57 0.92 0.86 0.74 0.77 0.53 0.59 1.0 0.52 0.5 0.97 0.97 0.69 0.66 0.92 0.75 0.81 0.34 0.81 0.83 0.87 0.76 0.74 0.76 0.53 0.6
Bra020115 (GER3)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.33 0.32 0.06 0.18 0.14 0.18 1.0 0.01 0.02 0.09 0.27 0.43 0.18 0.12 0.2 0.09 0.74 0.23 0.33 0.2 0.22 0.23 0.17 0.22 0.56
0.43 0.14 0.28 0.47 0.46 0.61 0.88 0.89 0.44 0.75 0.79 0.51 0.92 0.7 0.81 1.0 0.78 0.91 0.63 0.96 0.79 0.81 0.62 0.76 0.93 0.63 0.73 0.75 0.71 0.44 0.95
Bra024992 (MYC5)
 0.17 0.1 0.05 0.11 0.23 0.52 0.73 0.76 0.56 0.37 0.33 0.58 1.0 0.54 0.43 0.54 0.36 0.93 0.57 0.35 0.38 0.39 0.18 0.37 0.35 0.15 0.33 0.46 0.43 0.41 0.64
Bra025601 (SCPL13)
 0.19 0.2 0.21 0.4 0.22 0.12 0.73 0.5 0.33 0.57 0.4 0.44 0.96 0.05 0.05 0.84 0.77 0.95 0.45 0.63 0.51 0.58 0.43 0.49 0.49 0.51 0.52 0.23 0.23 0.51 1.0
0.21 0.19 0.3 0.34 0.14 0.15 0.86 0.78 0.48 0.68 0.78 0.7 1.0 0.21 0.16 0.78 0.94 0.25 0.32 0.79 0.65 0.69 0.64 0.53 0.52 0.43 0.55 0.29 0.39 0.36 0.78
0.16 0.18 0.27 0.2 0.37 0.53 0.48 0.62 0.32 0.33 0.3 0.21 0.58 0.33 0.41 0.61 0.68 0.71 0.28 0.42 0.44 0.33 0.42 0.96 0.61 0.6 0.7 0.61 0.65 0.56 1.0
Bra028191 (TSBtype2)
 0.03 0.05 0.03 0.05 0.11 0.14 0.32 0.43 0.24 0.38 0.38 0.37 1.0 0.29 0.23 0.38 0.34 0.63 0.3 0.21 0.23 0.27 0.81 0.31 0.35 0.35 0.43 0.28 0.21 0.3 0.41
0.36 0.35 0.33 0.39 0.26 0.28 0.79 0.82 0.24 0.47 0.3 0.32 0.65 0.15 0.07 0.62 0.74 0.67 0.43 0.53 0.39 0.59 0.45 0.44 0.67 0.35 0.7 0.23 0.21 0.51 1.0
Bra029515 (IF1)
 0.17 0.13 0.04 0.12 0.19 0.34 0.48 0.68 0.45 0.3 0.5 0.33 0.62 0.54 0.41 0.42 0.29 1.0 0.42 0.38 0.34 0.28 0.26 0.42 0.42 0.39 0.39 0.36 0.37 0.31 0.48
Bra030459 (bHLH115)
 0.13 0.2 0.19 0.13 0.1 0.15 0.56 0.49 0.3 0.36 0.37 0.41 0.75 0.15 0.21 0.61 0.45 1.0 0.59 0.62 0.42 0.61 0.36 0.53 0.56 0.42 0.43 0.36 0.29 0.27 0.52
Bra031496 (ABC4)
 0.4 0.42 0.35 0.42 0.47 0.34 0.68 0.8 0.44 0.63 0.6 0.61 1.0 0.28 0.27 0.67 0.61 0.35 0.33 0.51 0.58 0.43 0.34 0.46 0.51 0.42 0.48 0.35 0.33 0.42 0.72
0.12 0.2 0.26 0.29 0.42 0.33 0.38 0.54 0.26 0.39 0.36 0.33 0.9 0.28 0.38 0.8 0.77 0.43 0.37 0.52 0.37 0.46 0.43 0.53 0.58 0.59 0.59 0.58 0.73 0.46 1.0
Bra034205 (DFL2)
 0.14 0.05 0.06 0.1 0.39 0.46 0.57 0.75 0.39 0.37 0.37 0.44 0.69 0.48 0.51 0.65 0.53 1.0 0.6 0.37 0.47 0.4 0.23 0.52 0.5 0.38 0.52 0.44 0.53 0.49 0.81
Bra034242 (ORF02)
 0.29 0.27 0.29 0.44 0.29 0.51 0.75 0.81 0.5 0.65 0.63 0.57 0.97 0.52 0.54 1.0 0.87 0.58 0.57 0.79 0.74 0.81 0.59 0.82 0.87 0.72 0.82 0.5 0.57 0.5 0.72
Bra034629 (CAP1)
 0.3 0.33 0.34 0.42 0.53 0.46 0.71 0.64 0.41 0.65 0.49 0.52 1.0 0.59 0.56 0.96 0.82 0.64 0.57 0.63 0.47 0.63 0.57 0.63 0.68 0.69 0.71 0.49 0.5 0.63 0.76
Bra035201 (DJA7)
 0.46 0.48 0.38 0.5 0.36 0.38 0.78 0.77 0.55 0.69 0.63 0.61 0.82 0.51 0.49 0.66 0.69 0.44 0.48 0.59 0.49 0.67 0.35 0.66 0.7 0.72 0.78 0.6 0.56 0.63 1.0
Bra036812 (IQD20)
 0.0 0.0 0.08 0.14 0.06 0.03 0.45 0.33 0.16 0.45 0.33 0.17 1.0 0.16 0.09 0.67 0.44 0.28 0.2 0.44 0.36 0.33 0.46 0.21 0.28 0.37 0.07 0.11 0.04 0.13 0.21
Bra036946 (ILL6)
 0.22 0.25 0.33 0.5 0.16 0.29 0.78 0.99 0.36 0.62 0.67 0.64 1.0 0.21 0.15 0.81 0.93 0.38 0.25 0.59 0.75 0.6 0.53 0.47 0.68 0.54 0.75 0.3 0.4 0.35 0.99
Bra037005 (PGF14)
 0.13 0.05 0.1 0.14 0.18 0.23 0.62 0.53 0.09 0.36 0.29 0.15 1.0 0.17 0.09 0.49 0.5 0.5 0.15 0.66 0.42 0.31 0.28 0.57 0.59 0.29 0.61 0.4 0.49 0.46 0.62
Bra037244 (AtCAP2)
 0.0 0.05 0.02 0.03 0.02 0.01 0.35 0.63 0.12 0.41 0.31 0.16 1.0 0.0 0.09 0.59 0.85 0.17 0.08 0.55 0.27 0.58 0.14 0.14 0.07 0.0 0.2 0.04 0.04 0.06 0.16
0.28 0.23 0.19 0.46 0.31 0.43 0.78 1.0 0.35 0.5 0.33 0.31 0.96 0.49 0.35 0.84 0.7 0.56 0.46 0.57 0.46 0.38 0.61 0.57 0.67 0.47 0.66 0.48 0.42 0.53 0.65
0.01 0.01 0.05 0.05 0.0 0.02 0.47 0.21 0.14 0.22 0.43 0.13 1.0 0.03 0.0 0.58 0.51 0.28 0.07 0.21 0.32 0.26 0.46 0.3 0.21 0.15 0.22 0.16 0.09 0.12 0.39
Bra039274 (LAC6)
 0.28 0.25 0.14 0.35 0.19 0.27 0.32 0.69 0.39 0.44 0.42 0.21 1.0 0.25 0.42 0.68 0.38 0.59 0.38 0.38 0.29 0.4 0.13 0.38 0.28 0.3 0.44 0.23 0.15 0.22 0.16
Bra039290 (LCBK2)
 0.44 0.52 0.55 0.64 0.44 0.47 0.67 0.74 0.5 0.58 0.59 0.45 0.84 0.49 0.45 0.72 0.64 0.49 0.35 0.55 0.61 0.52 0.57 0.63 0.7 0.66 0.71 0.7 0.66 0.78 1.0
Bra039409 (AIF1)
 0.06 0.03 0.03 0.07 0.37 0.48 0.53 0.28 0.27 0.53 0.3 0.27 1.0 0.87 0.52 0.89 0.61 0.72 0.35 0.57 0.8 0.48 0.66 0.49 0.7 0.67 0.57 0.46 0.57 0.53 0.91
Bra039888 (ESV1)
 0.55 0.66 0.77 0.64 0.63 0.59 0.84 1.0 0.48 0.6 0.6 0.6 0.98 0.64 0.6 0.92 0.89 0.62 0.53 0.68 0.56 0.59 0.55 0.77 0.81 0.77 0.79 0.8 0.78 0.79 1.0
Bra040225 (MEE32)
 0.32 0.34 0.41 0.68 0.62 0.61 0.87 0.84 0.47 0.57 0.46 0.36 1.0 0.42 0.51 0.67 0.81 0.75 0.53 0.48 0.57 0.5 0.57 0.68 0.69 0.59 0.79 0.53 0.47 0.57 0.92

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)