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Heatmap: Cluster_259 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.7 0.59 0.56 0.7 0.63 0.62 0.8 0.87 0.66 0.75 0.71 0.78 0.89 0.59 0.55 0.64 0.74 0.43 0.58 0.72 0.87 0.78 0.49 0.72 0.64 0.65 0.7 0.65 0.55 0.64 1.0
Bra003913 (CSTF64)
 0.75 0.76 0.75 0.59 1.0 0.75 0.43 0.48 0.47 0.44 0.35 0.43 0.65 0.64 0.66 0.62 0.47 0.72 0.39 0.46 0.37 0.43 0.7 0.42 0.49 0.45 0.49 0.42 0.49 0.45 0.52
0.4 0.39 0.41 0.52 0.61 0.7 0.26 0.56 0.23 0.13 0.27 0.14 0.69 0.83 1.0 0.64 0.45 0.35 0.22 0.37 0.32 0.33 0.92 0.33 0.34 0.31 0.28 0.36 0.27 0.13 0.26
Bra005573 (PRORP1)
 0.77 0.65 0.54 0.72 0.74 0.78 0.69 1.0 0.69 0.77 0.7 0.78 0.88 0.55 0.58 0.66 0.75 0.64 0.53 0.59 0.66 0.63 0.43 0.57 0.6 0.63 0.61 0.7 0.54 0.49 0.84
Bra005690 (SFC1)
 0.67 0.76 0.7 0.84 1.0 0.93 0.95 0.88 0.5 0.61 0.55 0.6 0.87 0.83 0.79 0.73 0.78 0.81 0.63 0.68 0.68 0.67 0.69 0.68 0.73 0.54 0.69 0.64 0.62 0.52 0.75
Bra006694 (MYB59)
 0.55 0.64 0.53 0.4 0.42 1.0 0.4 0.37 0.36 0.3 0.31 0.24 0.51 0.86 0.92 0.38 0.35 0.2 0.28 0.35 0.42 0.36 0.27 0.44 0.52 0.26 0.51 0.4 0.56 0.37 0.6
0.37 0.59 0.64 0.51 0.55 0.64 0.54 0.54 0.32 0.47 0.34 0.41 0.74 1.0 0.69 0.52 0.67 0.89 0.62 0.46 0.44 0.44 0.53 0.48 0.48 0.48 0.42 0.42 0.36 0.36 0.5
Bra008480 (GA4H)
 0.61 0.39 0.33 0.4 0.47 0.71 0.83 0.65 0.28 0.27 0.47 0.46 1.0 0.62 0.54 0.72 0.45 0.23 0.37 0.5 0.62 0.55 0.13 0.33 0.24 0.11 0.2 0.18 0.03 0.11 0.05
Bra009435 (DAP2)
 0.79 0.7 0.59 0.74 1.0 0.88 0.8 0.88 0.56 0.7 0.59 0.53 0.79 0.81 0.68 0.75 0.75 0.9 0.61 0.64 0.57 0.55 0.32 0.48 0.49 0.51 0.5 0.55 0.52 0.54 0.57
Bra009782 (Tric2)
 0.7 0.82 0.7 0.78 0.82 0.87 0.73 0.9 0.53 0.61 0.62 0.58 1.0 0.76 0.77 0.77 0.71 0.8 0.55 0.59 0.71 0.58 0.77 0.63 0.67 0.7 0.67 0.85 0.62 0.5 0.78
0.83 0.87 0.77 0.67 1.0 0.96 0.72 0.87 0.68 0.7 0.62 0.65 0.85 0.91 0.9 0.68 0.67 0.63 0.65 0.65 0.64 0.67 0.53 0.57 0.59 0.53 0.61 0.62 0.73 0.66 0.85
Bra011962 (LOG1)
 0.62 0.53 0.45 0.44 0.78 1.0 0.77 0.92 0.56 0.44 0.45 0.42 0.61 0.76 0.65 0.48 0.38 0.51 0.62 0.54 0.56 0.51 0.27 0.53 0.48 0.49 0.44 0.76 0.78 0.5 0.49
Bra012872 (TRX1)
 0.43 0.48 0.28 0.35 0.77 0.64 0.57 0.59 0.31 0.54 0.41 0.3 1.0 0.69 0.52 0.4 0.36 0.61 0.41 0.43 0.36 0.51 0.15 0.38 0.23 0.41 0.23 0.29 0.31 0.28 0.42
0.68 0.64 0.65 0.59 1.0 0.9 0.72 0.83 0.49 0.46 0.41 0.42 0.55 0.67 0.59 0.48 0.51 0.3 0.45 0.45 0.45 0.47 0.38 0.52 0.47 0.41 0.44 0.67 0.75 0.55 0.65
Bra013511 (emb1417)
 0.79 0.75 0.69 0.76 0.83 1.0 0.82 0.92 0.62 0.57 0.63 0.73 0.77 0.8 0.9 0.7 0.72 0.69 0.69 0.79 0.7 0.69 0.69 0.58 0.58 0.5 0.53 0.67 0.58 0.57 0.7
Bra014662 (CRD1)
 1.0 0.81 0.64 0.86 0.44 0.58 0.72 0.84 0.34 0.48 0.42 0.57 0.45 0.29 0.26 0.58 0.57 0.22 0.47 0.38 0.37 0.35 0.07 0.35 0.28 0.33 0.37 0.74 0.8 0.56 0.68
1.0 0.93 0.85 0.88 0.83 0.97 0.67 0.65 0.82 0.74 0.69 0.7 0.59 0.83 0.86 0.62 0.69 0.59 0.55 0.63 0.59 0.68 0.59 0.59 0.65 0.72 0.64 0.73 0.81 0.79 0.88
Bra015367 (TIC20)
 0.82 0.66 0.71 0.8 0.93 0.87 0.77 0.74 0.68 0.79 0.78 0.54 1.0 0.71 0.67 0.69 0.68 0.49 0.58 0.66 0.76 0.75 0.49 0.64 0.64 0.54 0.64 0.67 0.53 0.49 0.81
Bra016410 (RFC4)
 0.81 0.65 0.82 0.95 0.89 1.0 0.56 0.56 0.31 0.33 0.32 0.26 0.84 0.64 0.97 0.55 0.59 0.78 0.53 0.25 0.54 0.37 0.57 0.35 0.28 0.25 0.22 0.33 0.13 0.24 0.37
Bra016629 (SHOU4L)
 0.79 0.8 0.81 0.96 0.84 0.61 0.8 1.0 0.74 0.74 0.58 0.75 0.88 0.73 0.66 0.72 0.73 0.69 0.55 0.65 0.63 0.68 0.34 0.46 0.48 0.54 0.48 0.58 0.6 0.75 0.6
0.74 0.61 0.64 0.81 0.87 0.63 0.87 0.78 0.62 0.86 0.9 0.9 1.0 0.48 0.45 0.81 0.85 0.74 0.6 0.79 0.63 0.6 0.38 0.55 0.52 0.56 0.48 0.59 0.33 0.46 0.68
0.82 0.88 0.74 0.73 0.97 1.0 0.82 0.7 0.73 0.65 0.66 0.67 0.72 0.92 0.92 0.82 0.81 0.54 0.68 0.7 0.64 0.67 0.67 0.74 0.64 0.56 0.63 0.8 0.81 0.62 0.77
Bra019040 (NARA5)
 0.82 0.76 0.8 0.97 0.73 0.69 0.85 1.0 0.45 0.55 0.6 0.52 0.77 0.68 0.61 0.73 0.83 0.47 0.43 0.7 0.72 0.69 0.4 0.51 0.57 0.62 0.58 0.61 0.56 0.46 0.72
Bra019099 (CBL3)
 0.77 0.78 0.83 0.67 1.0 0.96 0.65 0.7 0.66 0.69 0.62 0.58 0.57 0.92 0.87 0.52 0.52 0.46 0.53 0.61 0.54 0.57 0.35 0.54 0.57 0.54 0.55 0.7 0.9 0.68 0.63
Bra022262 (DAC)
 0.82 0.75 0.73 0.87 0.79 0.99 0.93 1.0 0.64 0.63 0.67 0.66 0.74 0.8 0.78 0.68 0.7 0.57 0.66 0.73 0.75 0.75 0.52 0.68 0.67 0.62 0.67 0.75 0.67 0.63 0.79
0.65 0.72 0.69 0.57 0.85 0.95 0.66 0.74 0.59 0.51 0.5 0.51 0.59 0.81 1.0 0.63 0.66 0.42 0.56 0.56 0.57 0.57 0.42 0.53 0.52 0.47 0.53 0.57 0.61 0.52 0.83
1.0 0.9 0.87 0.86 0.93 0.9 0.73 0.93 0.51 0.5 0.5 0.5 0.78 0.82 0.78 0.64 0.61 0.57 0.55 0.53 0.54 0.57 0.71 0.54 0.63 0.57 0.53 0.64 0.65 0.52 0.62
Bra022946 (AHL10)
 0.69 0.46 0.77 0.5 1.0 0.57 0.53 0.35 0.46 0.36 0.43 0.33 0.64 0.56 0.6 0.61 0.4 0.59 0.41 0.48 0.4 0.42 0.54 0.19 0.26 0.31 0.23 0.48 0.56 0.25 0.35
0.54 0.65 0.45 0.48 0.51 1.0 0.53 0.58 0.33 0.41 0.33 0.41 0.23 0.37 0.59 0.28 0.28 0.31 0.55 0.37 0.45 0.39 0.15 0.25 0.31 0.24 0.28 0.41 0.38 0.23 0.1
Bra023954 (APX6)
 0.7 0.55 0.51 0.52 0.92 1.0 0.6 0.66 0.46 0.56 0.52 0.42 0.68 0.73 0.72 0.64 0.63 0.54 0.56 0.58 0.5 0.46 0.42 0.41 0.39 0.38 0.48 0.5 0.55 0.47 0.67
Bra024097 (VIL2)
 0.88 0.81 0.98 0.98 0.92 0.96 0.88 0.87 0.68 0.82 0.81 0.68 0.92 0.84 0.82 0.91 0.82 0.8 0.67 0.73 0.87 0.85 0.67 0.82 0.81 1.0 0.75 0.79 0.77 0.63 0.78
Bra025613 (SOS2)
 0.99 0.8 0.87 0.79 0.91 1.0 0.68 0.53 0.82 0.61 0.77 0.67 0.65 0.96 0.94 0.55 0.63 0.57 0.72 0.77 0.65 0.79 0.78 0.74 0.78 0.79 0.72 0.84 1.0 0.74 0.73
0.45 0.89 0.78 0.56 0.99 0.95 0.64 0.7 0.53 0.65 0.42 0.48 0.92 1.0 0.83 0.79 0.75 0.89 0.53 0.58 0.61 0.51 0.62 0.63 0.45 0.35 0.4 0.41 0.32 0.48 0.48
0.62 0.69 0.76 0.75 1.0 0.79 0.79 0.97 0.6 0.64 0.62 0.61 0.76 0.93 0.82 0.64 0.71 0.61 0.64 0.64 0.6 0.61 0.76 0.77 0.69 0.62 0.62 0.82 0.7 0.6 0.69
0.61 0.69 0.78 0.6 0.83 1.0 0.84 0.9 0.53 0.58 0.51 0.54 0.7 0.6 0.64 0.66 0.69 0.48 0.55 0.63 0.64 0.59 0.62 0.61 0.63 0.59 0.72 0.71 0.76 0.82 0.79
0.67 0.65 0.62 0.67 0.86 0.82 1.0 0.97 0.64 0.71 0.75 0.8 0.79 0.7 0.66 0.7 0.67 0.57 0.64 0.75 0.67 0.71 0.4 0.67 0.67 0.63 0.75 0.85 0.62 0.47 0.82
0.67 0.71 0.79 0.66 0.68 0.85 0.85 1.0 0.62 0.75 0.71 0.73 0.87 0.72 0.56 0.76 0.83 0.48 0.65 0.68 0.68 0.69 0.44 0.58 0.65 0.62 0.63 0.72 0.69 0.61 0.7
Bra029139 (CCB2)
 0.79 0.82 0.87 0.91 0.86 0.68 0.8 0.86 0.62 0.8 0.67 0.75 1.0 0.59 0.5 0.86 0.85 0.64 0.59 0.8 0.8 0.86 0.43 0.73 0.76 0.72 0.73 0.77 0.57 0.61 0.9
0.82 0.9 0.91 1.0 0.87 0.93 0.81 0.76 0.6 0.68 0.73 0.6 0.72 0.72 0.76 0.7 0.7 0.42 0.58 0.65 0.61 0.76 0.47 0.73 0.75 0.76 0.78 0.87 0.75 0.55 0.55
Bra029828 (GYRB1)
 0.88 0.77 0.69 0.97 1.0 0.97 0.7 0.89 0.57 0.63 0.55 0.55 0.82 0.63 0.7 0.62 0.67 0.56 0.59 0.61 0.68 0.58 0.61 0.6 0.64 0.6 0.66 0.78 0.66 0.57 0.68
0.67 0.69 0.51 0.59 1.0 0.9 0.75 0.84 0.53 0.7 0.75 0.58 0.66 0.9 0.85 0.69 0.87 0.57 0.52 0.66 0.72 0.67 0.5 0.59 0.62 0.66 0.55 0.57 0.6 0.49 0.59
Bra032460 (HEXO2)
 0.92 0.82 0.84 0.83 0.72 0.94 0.55 0.62 0.71 0.58 0.67 0.6 0.59 1.0 0.82 0.63 0.61 0.54 0.57 0.65 0.6 0.67 0.51 0.73 0.71 0.63 0.7 0.75 0.83 0.66 0.88
Bra033215 (CCR16)
 0.87 0.76 0.7 0.89 0.84 1.0 0.89 0.82 0.8 0.93 0.89 0.88 0.86 0.88 0.84 0.98 0.87 0.74 0.72 0.79 0.83 0.71 0.38 0.66 0.64 0.6 0.67 0.89 0.73 0.62 0.79
0.8 0.78 0.77 0.85 1.0 0.89 0.67 0.85 0.47 0.52 0.49 0.57 0.72 0.89 0.83 0.63 0.77 0.62 0.61 0.62 0.62 0.64 0.55 0.64 0.66 0.51 0.56 0.59 0.65 0.59 0.86
Bra033475 (CPK18)
 0.81 0.78 0.54 0.7 1.0 0.89 0.89 0.88 0.32 0.47 0.38 0.37 0.94 0.94 0.95 0.68 0.63 0.54 0.48 0.49 0.51 0.48 0.96 0.51 0.48 0.45 0.5 0.48 0.47 0.45 0.55
0.74 0.73 0.68 0.66 0.62 0.85 0.81 1.0 0.77 0.74 0.66 0.73 0.75 0.82 0.64 0.72 0.78 0.52 0.62 0.72 0.66 0.77 0.26 0.61 0.62 0.45 0.63 0.67 0.76 0.61 0.71
Bra034829 (TBL8)
 0.73 0.81 0.79 1.0 0.71 0.77 0.77 0.73 0.78 0.65 0.65 0.53 0.63 0.81 0.7 0.67 0.64 0.42 0.64 0.71 0.62 0.79 0.49 0.73 0.65 0.65 0.71 0.83 0.76 0.55 0.63
0.88 0.87 0.81 0.96 0.84 1.0 0.91 0.84 0.8 0.74 0.75 0.7 0.64 0.91 0.84 0.71 0.7 0.51 0.76 0.76 0.77 0.85 0.41 0.73 0.73 0.73 0.73 0.84 0.77 0.59 0.62
0.38 0.53 0.54 0.42 0.96 0.99 0.83 0.79 0.54 0.67 0.66 0.65 1.0 0.8 0.98 0.76 0.65 0.83 0.66 0.78 0.72 0.62 0.59 0.5 0.42 0.32 0.46 0.38 0.43 0.51 0.87
0.61 0.68 0.66 0.58 0.93 0.99 0.69 1.0 0.46 0.42 0.47 0.46 0.77 0.78 0.81 0.69 0.8 0.58 0.6 0.53 0.6 0.55 0.66 0.53 0.51 0.53 0.52 0.61 0.5 0.39 0.43
Bra039482 (EVR3)
 0.71 0.61 0.61 0.72 0.72 0.62 0.65 0.69 0.57 0.8 0.63 0.78 1.0 0.39 0.46 0.74 0.8 0.55 0.6 0.71 0.69 0.58 0.23 0.53 0.53 0.61 0.58 0.53 0.42 0.58 1.0
Bra040299 (TGD4)
 0.92 0.88 1.0 0.83 0.93 0.74 0.71 0.93 0.54 0.63 0.68 0.62 0.86 0.91 0.93 0.67 0.72 0.72 0.54 0.59 0.71 0.49 0.67 0.59 0.66 0.7 0.66 0.73 0.65 0.7 0.87
Bra040469 (FD2)
 0.64 0.65 0.61 1.0 0.27 0.35 0.72 0.82 0.13 0.23 0.19 0.16 0.28 0.19 0.14 0.52 0.53 0.15 0.21 0.31 0.31 0.22 0.14 0.26 0.33 0.35 0.26 0.53 0.45 0.41 0.49
0.29 0.15 0.16 0.34 0.69 0.53 0.68 0.64 0.34 0.43 0.48 0.33 1.0 0.47 0.33 0.63 0.38 0.62 0.35 0.52 0.52 0.37 0.43 0.31 0.34 0.29 0.29 0.33 0.38 0.2 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)