1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_207 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000394 (LPEAT2)
 0.49 0.52 0.53 0.47 0.75 0.96 0.54 0.42 0.65 0.55 0.58 0.48 0.4 0.92 1.0 0.64 0.51 0.5 0.67 0.69 0.57 0.63 0.52 0.54 0.52 0.42 0.51 0.47 0.58 0.42 0.45
Bra000410 (UBC6)
 0.52 0.43 0.45 0.42 0.98 0.69 0.29 0.27 0.65 0.38 0.5 0.47 0.36 1.0 0.84 0.28 0.25 0.37 0.33 0.31 0.31 0.35 0.73 0.41 0.38 0.39 0.33 0.52 0.67 0.37 0.32
0.45 0.4 0.31 0.25 1.0 0.9 0.4 0.32 0.62 0.35 0.48 0.46 0.33 0.91 0.93 0.44 0.37 0.44 0.53 0.39 0.45 0.42 0.37 0.45 0.42 0.32 0.41 0.56 0.54 0.35 0.34
Bra002137 (DJC69)
 0.34 0.14 0.2 0.11 0.72 0.79 0.16 0.11 0.55 0.4 0.41 0.36 0.13 0.99 1.0 0.38 0.25 0.26 0.5 0.4 0.35 0.37 0.18 0.44 0.41 0.32 0.33 0.54 0.65 0.34 0.3
Bra003001 (DND2)
 0.36 0.28 0.32 0.24 0.84 0.83 0.4 0.46 0.59 0.44 0.42 0.47 0.38 1.0 0.96 0.44 0.42 0.28 0.53 0.41 0.46 0.5 0.32 0.46 0.47 0.36 0.44 0.57 0.65 0.48 0.47
Bra003753 (BLH3)
 0.3 0.31 0.28 0.27 0.73 1.0 0.57 0.37 0.53 0.33 0.35 0.38 0.23 0.96 0.85 0.51 0.48 0.33 0.4 0.48 0.61 0.48 0.3 0.33 0.3 0.21 0.27 0.32 0.35 0.23 0.28
Bra004796 (ITPK4)
 0.69 0.58 0.55 0.42 1.0 0.89 0.46 0.38 0.77 0.71 0.65 0.66 0.57 0.9 0.98 0.62 0.54 0.63 0.7 0.6 0.58 0.59 0.47 0.57 0.55 0.46 0.54 0.71 0.64 0.55 0.54
0.47 0.32 0.26 0.31 0.9 1.0 0.41 0.28 0.58 0.46 0.5 0.47 0.4 0.79 0.92 0.61 0.55 0.23 0.68 0.51 0.53 0.5 0.15 0.5 0.47 0.35 0.43 0.71 0.76 0.63 0.67
0.18 0.17 0.14 0.06 0.84 1.0 0.36 0.28 0.43 0.28 0.31 0.3 0.09 0.73 0.87 0.24 0.16 0.05 0.34 0.3 0.31 0.34 0.06 0.36 0.34 0.16 0.31 0.46 0.48 0.2 0.11
Bra006010 (ASK2)
 0.62 0.46 0.4 0.49 0.83 0.97 0.64 0.37 0.77 0.48 0.6 0.56 0.34 1.0 0.86 0.53 0.49 0.41 0.55 0.54 0.66 0.63 0.22 0.45 0.45 0.36 0.4 0.5 0.58 0.35 0.42
0.53 0.34 0.5 0.44 0.82 0.95 0.51 0.42 0.7 0.44 0.52 0.45 0.34 0.93 1.0 0.53 0.43 0.41 0.53 0.58 0.48 0.44 0.3 0.52 0.53 0.41 0.45 0.68 0.78 0.43 0.39
0.62 0.62 0.59 0.51 0.74 0.72 0.39 0.39 0.63 0.52 0.57 0.53 0.45 0.88 1.0 0.55 0.52 0.58 0.53 0.47 0.48 0.45 0.52 0.54 0.53 0.52 0.56 0.65 0.73 0.58 0.58
Bra009364 (PPP1)
 0.53 0.38 0.31 0.42 0.65 1.0 0.48 0.44 0.65 0.38 0.48 0.53 0.4 0.79 0.83 0.55 0.44 0.53 0.65 0.51 0.48 0.49 0.23 0.41 0.4 0.35 0.36 0.57 0.57 0.4 0.53
Bra009971 (PDM4)
 0.62 0.45 0.49 0.55 0.8 0.97 0.68 0.6 0.73 0.61 0.62 0.6 0.55 0.88 1.0 0.72 0.62 0.58 0.86 0.75 0.62 0.62 0.5 0.58 0.6 0.55 0.57 0.72 0.65 0.5 0.62
Bra010379 (RMA2)
 0.23 0.27 0.21 0.23 0.68 1.0 0.33 0.19 0.37 0.28 0.23 0.21 0.15 0.75 0.92 0.36 0.25 0.11 0.42 0.42 0.33 0.42 0.11 0.3 0.35 0.17 0.34 0.2 0.38 0.26 0.39
Bra010671 (AGT2)
 0.21 0.12 0.2 0.12 0.68 1.0 0.35 0.24 0.46 0.26 0.34 0.28 0.15 0.79 0.88 0.26 0.23 0.07 0.33 0.4 0.33 0.24 0.15 0.21 0.2 0.22 0.21 0.21 0.33 0.25 0.2
Bra011388 (nPAP)
 0.57 0.57 0.58 0.42 0.91 0.85 0.34 0.32 0.65 0.55 0.57 0.56 0.39 0.9 1.0 0.58 0.49 0.6 0.54 0.57 0.48 0.5 0.36 0.56 0.55 0.46 0.52 0.64 0.76 0.59 0.55
Bra011405 (GLDP1)
 0.5 0.33 0.29 0.32 0.69 0.92 0.55 0.43 0.61 0.5 0.51 0.44 0.39 0.77 1.0 0.64 0.5 0.4 0.66 0.54 0.5 0.48 0.14 0.43 0.41 0.38 0.4 0.69 0.67 0.34 0.37
Bra011429 (FAB1A)
 0.53 0.42 0.4 0.38 1.0 0.98 0.55 0.4 0.65 0.53 0.57 0.54 0.37 1.0 0.99 0.67 0.6 0.6 0.67 0.62 0.52 0.53 0.41 0.48 0.52 0.49 0.5 0.66 0.71 0.47 0.58
0.59 0.56 0.6 0.41 0.9 0.86 0.35 0.27 0.57 0.52 0.55 0.5 0.38 0.9 1.0 0.56 0.5 0.64 0.59 0.54 0.43 0.45 0.42 0.49 0.52 0.46 0.5 0.53 0.71 0.61 0.62
Bra011750 (HMA1)
 0.68 0.53 0.42 0.5 0.92 1.0 0.59 0.5 0.77 0.66 0.65 0.66 0.51 0.96 0.95 0.72 0.65 0.41 0.71 0.67 0.59 0.64 0.35 0.63 0.62 0.58 0.64 0.77 0.87 0.65 0.68
Bra012790 (ATB' GAMMA)
 0.5 0.45 0.53 0.47 0.75 0.88 0.45 0.48 0.59 0.49 0.5 0.55 0.44 0.92 1.0 0.56 0.57 0.63 0.67 0.59 0.54 0.55 0.4 0.62 0.58 0.58 0.57 0.64 0.73 0.55 0.49
Bra012950 (ATG3)
 0.52 0.5 0.39 0.44 1.0 0.96 0.47 0.34 0.95 0.58 0.63 0.59 0.37 0.97 0.98 0.48 0.4 0.44 0.52 0.51 0.5 0.53 0.46 0.49 0.44 0.4 0.43 0.76 0.77 0.5 0.37
Bra013428 (AN5)
 0.6 0.27 0.24 0.2 1.0 0.88 0.31 0.28 0.59 0.42 0.43 0.48 0.16 0.82 0.75 0.48 0.38 0.43 0.55 0.38 0.47 0.44 0.06 0.37 0.4 0.39 0.44 0.4 0.56 0.57 0.58
Bra013612 (CDS2)
 0.56 0.5 0.37 0.31 0.82 0.99 0.3 0.34 0.49 0.27 0.41 0.32 0.24 0.81 1.0 0.37 0.26 0.22 0.35 0.35 0.35 0.34 0.3 0.49 0.5 0.45 0.48 0.58 0.73 0.4 0.52
0.56 0.47 0.45 0.5 0.78 0.78 0.45 0.43 0.75 0.57 0.62 0.59 0.41 1.0 0.9 0.54 0.49 0.43 0.57 0.5 0.51 0.57 0.37 0.5 0.45 0.43 0.46 0.67 0.64 0.4 0.45
0.45 0.44 0.53 0.35 0.78 0.83 0.29 0.24 0.56 0.44 0.5 0.46 0.32 1.0 0.99 0.5 0.44 0.46 0.52 0.44 0.36 0.49 0.43 0.51 0.5 0.39 0.48 0.56 0.63 0.42 0.38
Bra017303 (PTPMT1)
 0.42 0.38 0.39 0.39 0.79 1.0 0.48 0.28 0.66 0.5 0.55 0.5 0.3 0.9 0.98 0.57 0.53 0.47 0.63 0.59 0.48 0.55 0.27 0.5 0.52 0.39 0.49 0.55 0.68 0.47 0.47
Bra017346 (PRP4KA)
 0.55 0.5 0.59 0.41 0.82 0.81 0.4 0.37 0.61 0.52 0.6 0.5 0.42 0.92 1.0 0.59 0.52 0.61 0.52 0.55 0.42 0.49 0.46 0.42 0.43 0.38 0.41 0.49 0.62 0.57 0.61
Bra017424 (IME)
 0.47 0.39 0.38 0.28 0.78 0.52 0.29 0.31 0.62 0.39 0.34 0.52 0.26 1.0 0.96 0.32 0.33 0.45 0.57 0.44 0.33 0.39 0.16 0.4 0.36 0.23 0.38 0.44 0.56 0.51 0.5
0.37 0.36 0.46 0.27 0.77 0.94 0.47 0.34 0.52 0.39 0.47 0.39 0.31 0.82 1.0 0.55 0.43 0.26 0.54 0.49 0.48 0.5 0.14 0.44 0.42 0.28 0.38 0.55 0.59 0.39 0.42
Bra018726 (DCD)
 0.66 0.63 0.64 0.51 1.0 0.84 0.57 0.44 0.79 0.76 0.69 0.63 0.58 0.97 0.97 0.67 0.65 0.63 0.74 0.69 0.67 0.69 0.49 0.67 0.68 0.64 0.66 0.72 0.74 0.72 0.64
0.56 0.48 0.39 0.41 0.78 0.96 0.65 0.44 0.73 0.44 0.55 0.52 0.41 1.0 0.95 0.57 0.51 0.39 0.65 0.64 0.59 0.58 0.33 0.48 0.49 0.4 0.43 0.62 0.74 0.41 0.49
Bra019332 (CAD2)
 0.5 0.31 0.27 0.36 0.89 1.0 0.58 0.5 0.65 0.6 0.57 0.58 0.56 0.88 0.9 0.66 0.67 0.48 0.63 0.65 0.58 0.61 0.45 0.52 0.53 0.49 0.54 0.56 0.61 0.55 0.59
0.36 0.35 0.25 0.28 0.71 1.0 0.59 0.4 0.41 0.36 0.42 0.39 0.37 0.74 0.78 0.62 0.62 0.28 0.49 0.63 0.62 0.51 0.23 0.42 0.42 0.35 0.4 0.43 0.49 0.27 0.32
0.54 0.39 0.36 0.33 1.0 0.84 0.38 0.24 0.54 0.43 0.44 0.41 0.25 0.67 0.73 0.47 0.38 0.28 0.41 0.35 0.41 0.39 0.14 0.38 0.35 0.31 0.34 0.44 0.39 0.32 0.26
Bra022147 (NF-YB2)
 0.33 0.34 0.32 0.35 0.69 1.0 0.44 0.26 0.44 0.41 0.36 0.36 0.24 0.91 0.98 0.51 0.5 0.39 0.53 0.48 0.56 0.47 0.14 0.39 0.38 0.38 0.37 0.37 0.45 0.3 0.42
0.6 0.54 0.48 0.44 0.93 0.89 0.39 0.33 0.66 0.59 0.58 0.59 0.35 0.93 1.0 0.59 0.5 0.42 0.62 0.57 0.51 0.55 0.22 0.51 0.52 0.49 0.55 0.57 0.69 0.59 0.55
Bra024519 (NPF5.10)
 0.36 0.32 0.29 0.35 0.78 0.92 0.34 0.31 0.54 0.47 0.53 0.49 0.3 0.86 1.0 0.55 0.47 0.48 0.48 0.47 0.45 0.44 0.24 0.42 0.41 0.34 0.42 0.44 0.51 0.43 0.54
Bra024833 (IME)
 0.43 0.34 0.32 0.2 0.67 0.69 0.25 0.26 0.57 0.41 0.46 0.47 0.18 0.86 1.0 0.38 0.35 0.33 0.57 0.46 0.44 0.44 0.2 0.37 0.33 0.24 0.35 0.28 0.41 0.33 0.35
Bra024853 (RIE1)
 0.42 0.55 0.44 0.37 0.76 0.8 0.29 0.29 0.6 0.36 0.44 0.44 0.24 1.0 0.95 0.4 0.33 0.26 0.39 0.34 0.38 0.32 0.16 0.49 0.51 0.41 0.37 0.78 0.67 0.47 0.26
Bra026460 (ACHT1)
 0.51 0.49 0.47 0.47 1.0 0.88 0.4 0.31 0.58 0.52 0.44 0.4 0.38 0.93 0.87 0.46 0.53 0.42 0.52 0.5 0.4 0.49 0.54 0.6 0.46 0.42 0.49 0.6 0.7 0.41 0.43
Bra026953 (AFB3)
 0.48 0.43 0.53 0.42 0.92 1.0 0.58 0.57 0.66 0.56 0.54 0.48 0.61 0.95 0.98 0.57 0.59 0.42 0.56 0.67 0.63 0.71 0.32 0.55 0.54 0.39 0.54 0.55 0.65 0.51 0.55
Bra027227 (APG8H)
 0.46 0.4 0.4 0.31 0.78 0.81 0.34 0.24 0.72 0.58 0.59 0.6 0.4 0.84 1.0 0.47 0.41 0.48 0.62 0.51 0.48 0.55 0.34 0.44 0.43 0.34 0.47 0.52 0.55 0.47 0.39
Bra029537 (ALN)
 0.44 0.2 0.2 0.2 1.0 0.94 0.14 0.09 0.52 0.26 0.51 0.19 0.12 0.69 0.71 0.23 0.14 0.04 0.14 0.24 0.26 0.29 0.08 0.28 0.24 0.23 0.19 0.62 0.72 0.17 0.1
Bra029670 (SIA1)
 0.62 0.41 0.27 0.45 0.7 1.0 0.7 0.57 0.69 0.5 0.5 0.54 0.41 0.85 0.9 0.58 0.45 0.5 0.56 0.66 0.61 0.52 0.44 0.47 0.48 0.45 0.46 0.7 0.69 0.32 0.47
0.44 0.26 0.22 0.2 1.0 0.92 0.37 0.28 0.57 0.39 0.39 0.46 0.18 0.86 0.8 0.44 0.35 0.29 0.53 0.48 0.36 0.45 0.04 0.3 0.3 0.22 0.31 0.41 0.54 0.49 0.32
0.81 0.62 0.65 0.65 0.98 0.98 0.62 0.58 0.8 0.71 0.73 0.69 0.51 1.0 1.0 0.77 0.65 0.54 0.75 0.71 0.67 0.62 0.35 0.64 0.64 0.63 0.66 0.81 0.84 0.66 0.75
0.39 0.29 0.29 0.23 0.71 1.0 0.43 0.31 0.49 0.39 0.4 0.34 0.3 0.74 0.72 0.43 0.43 0.23 0.44 0.47 0.47 0.41 0.34 0.45 0.42 0.21 0.39 0.44 0.57 0.38 0.36
0.29 0.3 0.38 0.37 0.82 0.79 0.38 0.32 0.48 0.55 0.34 0.37 0.29 1.0 0.79 0.47 0.41 0.36 0.45 0.42 0.43 0.5 0.46 0.53 0.51 0.46 0.43 0.57 0.57 0.42 0.4
Bra032713 (HIL1)
 0.66 0.69 0.5 0.58 0.87 1.0 0.61 0.6 0.66 0.68 0.66 0.61 0.51 0.92 0.96 0.63 0.59 0.49 0.61 0.62 0.57 0.64 0.44 0.64 0.65 0.63 0.6 0.7 0.74 0.55 0.73
0.57 0.63 0.55 0.48 0.87 0.89 0.53 0.45 0.83 0.59 0.69 0.71 0.44 0.93 1.0 0.58 0.53 0.47 0.56 0.66 0.64 0.6 0.36 0.54 0.59 0.46 0.56 0.62 0.68 0.61 0.57
Bra035459 (MSL3)
 0.52 0.37 0.34 0.4 0.96 0.93 0.49 0.39 0.74 0.53 0.58 0.54 0.35 0.87 1.0 0.51 0.49 0.52 0.65 0.6 0.51 0.55 0.31 0.5 0.47 0.4 0.44 0.66 0.66 0.44 0.45
Bra035728 (AtUSB1)
 0.7 0.81 0.6 0.45 0.95 1.0 0.49 0.4 0.57 0.46 0.54 0.45 0.43 0.79 1.0 0.41 0.41 0.45 0.5 0.45 0.33 0.59 0.58 0.58 0.6 0.55 0.53 0.62 0.75 0.58 0.77
Bra036297 (STP7)
 0.22 0.2 0.18 0.07 0.83 1.0 0.38 0.3 0.48 0.37 0.38 0.43 0.18 0.93 0.98 0.47 0.39 0.33 0.53 0.45 0.48 0.56 0.13 0.32 0.34 0.16 0.32 0.29 0.38 0.31 0.32
Bra036491 (FLY2)
 0.51 0.4 0.52 0.44 0.83 0.97 0.46 0.38 0.59 0.59 0.69 0.58 0.43 0.91 1.0 0.54 0.48 0.5 0.75 0.6 0.46 0.6 0.27 0.47 0.49 0.43 0.49 0.48 0.54 0.49 0.44
Bra036926 (TT15)
 0.44 0.34 0.31 0.38 0.89 0.92 0.47 0.52 0.67 0.52 0.61 0.63 0.53 0.95 1.0 0.69 0.6 0.59 0.56 0.58 0.48 0.53 0.46 0.48 0.51 0.51 0.5 0.58 0.63 0.48 0.55
Bra037862 (ATG14b)
 0.41 0.34 0.34 0.33 0.73 0.76 0.34 0.23 0.55 0.39 0.41 0.43 0.25 0.82 1.0 0.43 0.41 0.41 0.48 0.43 0.4 0.48 0.31 0.5 0.45 0.4 0.46 0.56 0.65 0.38 0.31
Bra037966 (RSH3)
 0.32 0.22 0.13 0.14 0.37 0.45 0.13 0.14 0.54 0.22 0.26 0.24 0.12 0.81 1.0 0.18 0.17 0.07 0.19 0.17 0.27 0.24 0.25 0.29 0.27 0.22 0.25 0.61 0.63 0.31 0.22
0.4 0.37 0.29 0.32 0.83 1.0 0.52 0.37 0.62 0.45 0.48 0.4 0.41 0.83 0.92 0.5 0.48 0.31 0.67 0.53 0.57 0.6 0.43 0.52 0.47 0.37 0.49 0.6 0.61 0.4 0.41
Bra038339 (WIT2)
 0.58 0.5 0.49 0.53 0.77 1.0 0.64 0.56 0.59 0.52 0.61 0.52 0.46 0.92 0.82 0.78 0.66 0.44 0.74 0.66 0.68 0.67 0.51 0.55 0.56 0.4 0.5 0.61 0.64 0.48 0.47
Bra038424 (SH3P1)
 0.48 0.39 0.33 0.34 0.79 1.0 0.49 0.41 0.58 0.48 0.45 0.42 0.31 0.85 0.85 0.38 0.37 0.39 0.5 0.41 0.4 0.45 0.25 0.53 0.51 0.38 0.47 0.59 0.65 0.42 0.38
Bra039295 (UBC6)
 0.62 0.56 0.53 0.57 1.0 0.92 0.35 0.29 0.73 0.51 0.66 0.55 0.4 0.95 0.91 0.45 0.38 0.27 0.38 0.47 0.44 0.47 0.39 0.47 0.46 0.49 0.44 0.69 0.76 0.42 0.36
0.51 0.48 0.56 0.42 0.76 0.82 0.45 0.41 0.63 0.55 0.55 0.54 0.39 0.89 1.0 0.6 0.55 0.58 0.6 0.62 0.52 0.56 0.58 0.63 0.58 0.52 0.59 0.65 0.78 0.59 0.58
Bra040593 (NBS1)
 0.62 0.64 0.51 0.5 0.88 1.0 0.46 0.41 0.53 0.43 0.51 0.45 0.46 0.86 0.98 0.53 0.44 0.41 0.63 0.49 0.5 0.54 0.48 0.53 0.51 0.42 0.52 0.62 0.61 0.49 0.52
0.15 0.05 0.06 0.08 0.75 0.81 0.41 0.34 0.47 0.46 0.4 0.45 0.32 0.95 1.0 0.5 0.59 0.42 0.45 0.42 0.35 0.34 0.18 0.44 0.46 0.36 0.32 0.39 0.46 0.34 0.38
Bra040648 (RLP31)
 0.57 0.41 0.41 0.44 0.79 1.0 0.69 0.56 0.75 0.53 0.57 0.55 0.43 0.97 0.97 0.5 0.48 0.34 0.54 0.57 0.51 0.53 0.21 0.54 0.51 0.36 0.49 0.56 0.68 0.51 0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)