1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_35 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000084 (PECT1)
 0.39 0.49 0.37 0.4 0.44 0.34 0.5 0.58 0.3 0.31 0.3 0.34 0.65 0.4 0.43 0.47 0.44 1.0 0.49 0.43 0.44 0.38 0.57 0.45 0.43 0.41 0.48 0.41 0.31 0.4 0.42
Bra000498 (SLP)
 0.09 0.12 0.16 0.2 0.09 0.13 0.24 0.25 0.07 0.23 0.16 0.16 0.57 0.11 0.13 0.31 0.35 1.0 0.41 0.21 0.26 0.18 0.54 0.25 0.23 0.25 0.23 0.23 0.08 0.15 0.39
Bra002954 (TRP2)
 0.32 0.31 0.41 0.38 0.3 0.36 0.48 0.61 0.22 0.33 0.26 0.28 0.51 0.34 0.33 0.41 0.42 1.0 0.36 0.36 0.34 0.32 0.52 0.43 0.47 0.37 0.45 0.35 0.28 0.37 0.49
0.28 0.51 0.41 0.33 0.2 0.33 0.44 0.51 0.23 0.4 0.34 0.37 0.43 0.32 0.33 0.39 0.46 1.0 0.54 0.34 0.33 0.41 0.53 0.29 0.28 0.28 0.29 0.14 0.2 0.43 0.64
Bra003485 (PLY)
 0.09 0.11 0.19 0.11 0.15 0.07 0.12 0.18 0.14 0.21 0.19 0.13 0.29 0.14 0.14 0.22 0.21 1.0 0.27 0.16 0.15 0.15 0.17 0.11 0.12 0.11 0.11 0.08 0.07 0.06 0.08
0.15 0.1 0.09 0.15 0.15 0.13 0.24 0.23 0.14 0.22 0.32 0.24 0.33 0.23 0.23 0.27 0.36 1.0 0.28 0.22 0.26 0.23 0.14 0.2 0.16 0.25 0.19 0.14 0.09 0.13 0.2
0.34 0.27 0.28 0.29 0.12 0.13 0.26 0.22 0.28 0.36 0.29 0.33 0.19 0.1 0.05 0.29 0.34 1.0 0.73 0.4 0.37 0.35 0.02 0.3 0.32 0.37 0.31 0.17 0.19 0.32 0.4
Bra004628 (GPDHC1)
 0.04 0.04 0.05 0.09 0.14 0.14 0.15 0.11 0.18 0.16 0.12 0.12 0.45 0.22 0.17 0.23 0.23 1.0 0.24 0.29 0.17 0.25 0.28 0.14 0.19 0.15 0.15 0.09 0.09 0.09 0.15
Bra006273 (GASA14)
 0.04 0.03 0.07 0.03 0.07 0.03 0.01 0.03 0.08 0.23 0.21 0.12 0.3 0.12 0.14 0.34 0.12 1.0 0.33 0.17 0.14 0.06 0.07 0.02 0.03 0.1 0.02 0.02 0.01 0.03 0.01
Bra006813 (BIO3)
 0.06 0.04 0.11 0.07 0.08 0.04 0.24 0.41 0.08 0.03 0.18 0.1 0.69 0.09 0.11 0.14 0.1 1.0 0.06 0.12 0.06 0.07 0.36 0.17 0.2 0.27 0.12 0.17 0.11 0.1 0.32
Bra007218 (BLP3)
 0.11 0.12 0.16 0.16 0.14 0.12 0.25 0.29 0.1 0.18 0.15 0.12 0.39 0.15 0.13 0.26 0.27 1.0 0.25 0.2 0.21 0.21 0.28 0.25 0.25 0.25 0.25 0.18 0.13 0.14 0.23
Bra007569 (FLA10)
 0.03 0.03 0.05 0.03 0.13 0.06 0.21 0.28 0.26 0.22 0.22 0.2 0.59 0.26 0.25 0.4 0.34 1.0 0.31 0.22 0.18 0.17 0.27 0.18 0.16 0.15 0.13 0.1 0.12 0.12 0.17
Bra009035 (AtDTX28)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.08 0.25 0.14 0.12 0.07 0.06 0.08 0.4 0.08 0.11 0.41 0.24 1.0 0.19 0.08 0.12 0.09 0.22 0.1 0.07 0.07 0.08 0.1 0.16 0.08 0.27
Bra009130 (TRP5)
 0.22 0.18 0.32 0.11 0.11 0.16 0.51 0.57 0.18 0.25 0.2 0.22 0.44 0.24 0.22 0.37 0.31 1.0 0.4 0.3 0.28 0.2 0.35 0.32 0.31 0.28 0.29 0.18 0.26 0.24 0.31
Bra009148 (CYP71B11)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.01 0.04 0.21 0.02 0.03 0.5 0.09 0.28 0.15 0.13 1.0 0.09 0.03 0.03 0.19 0.42 0.24 0.23 0.13 0.18 0.03 0.07 0.0 0.09
Bra009413 (KCS11)
 0.14 0.15 0.2 0.17 0.17 0.28 0.42 0.46 0.21 0.28 0.26 0.24 0.52 0.3 0.28 0.5 0.44 1.0 0.42 0.38 0.33 0.35 0.51 0.32 0.33 0.25 0.31 0.21 0.24 0.24 0.3
0.0 0.0 0.01 0.05 0.18 0.15 0.37 0.32 0.13 0.23 0.14 0.11 0.66 0.27 0.27 0.5 0.34 1.0 0.24 0.2 0.21 0.13 0.15 0.16 0.12 0.17 0.18 0.07 0.1 0.06 0.13
Bra011449 (DHS2)
 0.4 0.43 0.47 0.47 0.47 0.46 0.33 0.31 0.25 0.47 0.36 0.34 0.47 0.34 0.41 0.54 0.55 1.0 0.62 0.44 0.44 0.45 0.66 0.38 0.39 0.37 0.41 0.36 0.26 0.46 0.6
0.33 0.32 0.28 0.38 0.33 0.27 0.36 0.3 0.27 0.48 0.42 0.39 0.39 0.14 0.17 0.43 0.56 1.0 0.95 0.43 0.42 0.38 0.2 0.38 0.4 0.38 0.4 0.52 0.26 0.32 0.33
Bra012130 (RALF34)
 0.04 0.05 0.08 0.07 0.14 0.04 0.14 0.33 0.23 0.16 0.27 0.15 0.59 0.19 0.13 0.25 0.17 1.0 0.33 0.25 0.21 0.14 0.32 0.32 0.34 0.29 0.28 0.26 0.18 0.18 0.29
Bra015719 (IGMT5)
 0.09 0.08 0.07 0.08 0.09 0.06 0.21 0.41 0.14 0.35 0.13 0.15 0.56 0.19 0.15 0.43 0.39 1.0 0.31 0.25 0.26 0.25 0.16 0.21 0.19 0.14 0.2 0.12 0.13 0.09 0.2
Bra016653 (AVP1)
 0.32 0.32 0.31 0.4 0.33 0.32 0.47 0.57 0.24 0.38 0.3 0.31 0.55 0.38 0.4 0.52 0.53 1.0 0.58 0.37 0.36 0.38 0.27 0.3 0.35 0.37 0.39 0.31 0.26 0.29 0.36
0.13 0.17 0.18 0.13 0.24 0.2 0.31 0.52 0.13 0.16 0.13 0.17 0.37 0.18 0.26 0.35 0.39 1.0 0.7 0.29 0.21 0.2 0.52 0.19 0.17 0.13 0.23 0.13 0.15 0.18 0.22
Bra019044 (ENODL2)
 0.03 0.03 0.06 0.04 0.08 0.06 0.15 0.15 0.1 0.24 0.17 0.17 0.21 0.14 0.19 0.36 0.34 1.0 0.3 0.24 0.21 0.23 0.12 0.2 0.23 0.2 0.23 0.07 0.06 0.07 0.1
0.13 0.16 0.28 0.25 0.27 0.27 0.45 0.44 0.28 0.31 0.36 0.29 0.57 0.43 0.41 0.43 0.4 1.0 0.33 0.39 0.33 0.31 0.43 0.42 0.41 0.41 0.35 0.25 0.31 0.24 0.42
Bra023111 (ADK)
 0.14 0.14 0.13 0.15 0.25 0.26 0.25 0.42 0.12 0.15 0.12 0.16 0.35 0.2 0.23 0.26 0.25 1.0 0.44 0.18 0.21 0.16 0.4 0.14 0.18 0.16 0.16 0.16 0.12 0.16 0.2
Bra024137 (PAO5)
 0.05 0.02 0.05 0.03 0.15 0.13 0.2 0.24 0.15 0.22 0.15 0.16 0.35 0.27 0.33 0.38 0.26 1.0 0.36 0.21 0.26 0.15 0.19 0.14 0.15 0.12 0.11 0.1 0.1 0.06 0.09
Bra024751 (CLE43)
 0.01 0.02 0.05 0.06 0.06 0.03 0.12 0.17 0.15 0.2 0.18 0.17 0.37 0.12 0.15 0.13 0.16 1.0 0.31 0.15 0.1 0.19 0.1 0.16 0.16 0.06 0.17 0.04 0.04 0.05 0.11
0.05 0.03 0.04 0.05 0.26 0.14 0.1 0.17 0.16 0.17 0.13 0.18 0.59 0.29 0.29 0.5 0.27 1.0 0.26 0.25 0.11 0.13 0.49 0.3 0.34 0.24 0.22 0.18 0.16 0.19 0.3
0.15 0.16 0.18 0.18 0.29 0.38 0.49 0.42 0.25 0.29 0.27 0.28 0.5 0.37 0.29 0.5 0.45 1.0 0.45 0.38 0.39 0.35 0.41 0.37 0.41 0.29 0.32 0.31 0.26 0.2 0.34
0.26 0.24 0.25 0.13 0.34 0.32 0.39 0.57 0.22 0.32 0.23 0.23 0.52 0.35 0.32 0.39 0.58 1.0 0.46 0.34 0.29 0.34 0.55 0.28 0.35 0.2 0.35 0.2 0.25 0.32 0.46
Bra029297 (ML1)
 0.23 0.19 0.23 0.13 0.3 0.34 0.48 0.57 0.31 0.33 0.31 0.29 0.47 0.38 0.41 0.49 0.55 1.0 0.64 0.44 0.33 0.39 0.55 0.38 0.42 0.21 0.45 0.24 0.28 0.29 0.4
Bra029831 (PAL4)
 0.06 0.06 0.09 0.1 0.11 0.16 0.35 0.34 0.13 0.18 0.18 0.16 0.39 0.15 0.29 0.43 0.34 1.0 0.23 0.32 0.19 0.17 0.24 0.16 0.15 0.09 0.13 0.08 0.11 0.09 0.14
Bra029968 (RLP44)
 0.07 0.09 0.2 0.14 0.19 0.17 0.21 0.2 0.22 0.2 0.18 0.26 0.6 0.31 0.28 0.31 0.23 1.0 0.35 0.28 0.26 0.21 0.37 0.47 0.37 0.39 0.33 0.21 0.23 0.19 0.21
Bra030799 (iPGAM1)
 0.16 0.15 0.16 0.15 0.22 0.27 0.44 0.56 0.16 0.28 0.24 0.24 0.61 0.21 0.3 0.33 0.37 1.0 0.38 0.36 0.33 0.33 0.66 0.37 0.42 0.33 0.47 0.31 0.25 0.37 0.34
Bra031329 (CWLP)
 0.02 0.01 0.04 0.01 0.09 0.04 0.1 0.15 0.06 0.13 0.07 0.09 0.24 0.07 0.11 0.19 0.22 1.0 0.11 0.09 0.1 0.13 0.24 0.11 0.13 0.11 0.13 0.17 0.06 0.04 0.04
0.14 0.15 0.18 0.22 0.15 0.16 0.43 0.55 0.14 0.21 0.22 0.17 0.47 0.22 0.29 0.39 0.38 1.0 0.42 0.3 0.26 0.21 0.43 0.19 0.22 0.22 0.22 0.2 0.14 0.2 0.34
0.09 0.12 0.07 0.12 0.09 0.18 0.27 0.21 0.24 0.2 0.31 0.25 0.16 0.12 0.13 0.31 0.32 1.0 0.49 0.34 0.27 0.26 0.03 0.16 0.16 0.14 0.15 0.16 0.17 0.12 0.16
Bra032872 (AtDTX28)
 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.13 0.26 0.15 0.11 0.09 0.06 0.09 0.4 0.08 0.06 0.36 0.23 1.0 0.21 0.1 0.1 0.12 0.23 0.15 0.11 0.08 0.07 0.09 0.17 0.06 0.27
0.15 0.19 0.26 0.26 0.06 0.13 0.36 0.33 0.13 0.18 0.17 0.13 0.27 0.08 0.12 0.19 0.24 1.0 0.5 0.22 0.2 0.15 0.12 0.22 0.29 0.31 0.29 0.14 0.16 0.21 0.35
Bra033526 (HCT)
 0.05 0.13 0.29 0.12 0.08 0.04 0.1 0.13 0.12 0.12 0.18 0.13 0.64 0.14 0.16 0.29 0.26 1.0 0.16 0.11 0.13 0.15 0.32 0.24 0.27 0.18 0.16 0.06 0.15 0.15 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.18 0.19 0.18 0.12 0.16 0.21 0.2 0.16 0.18 0.18 0.23 1.0 0.33 0.34 0.27 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.04 0.03 0.01 0.14 0.11 0.25 0.13 0.14 0.22 0.15 0.11 0.43 0.28 0.31 0.41 0.39 1.0 0.28 0.22 0.21 0.23 0.28 0.26 0.26 0.21 0.28 0.19 0.14 0.14 0.2
Bra036802 (RALF34)
 0.05 0.02 0.04 0.02 0.04 0.01 0.11 0.24 0.17 0.13 0.04 0.11 0.49 0.08 0.06 0.21 0.26 1.0 0.14 0.1 0.23 0.1 0.35 0.13 0.16 0.13 0.2 0.09 0.08 0.1 0.14
Bra040136 (RAF1)
 0.32 0.32 0.28 0.33 0.24 0.21 0.31 0.38 0.09 0.25 0.16 0.21 0.41 0.1 0.13 0.4 0.49 1.0 0.54 0.31 0.35 0.3 0.28 0.29 0.32 0.29 0.37 0.31 0.15 0.31 0.42
Bra040479 (PPa3)
 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.03 0.09 0.0 0.11 0.26 0.13 0.1 0.03 0.06 0.06 0.25 0.18 1.0 0.3 0.17 0.09 0.22 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)