Heatmap: Cluster_197 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000171 (TBL28)
0.82 0.79 0.93 1.0 0.51 0.32 0.46 0.54 0.51 0.58 0.62 0.58 0.46 0.4 0.38 0.5 0.45 0.54 0.39 0.46 0.46 0.5 0.3 0.46 0.46 0.96 0.57 0.56 0.52 0.59 0.51
Bra000377 (DRN1)
0.84 0.83 1.0 0.83 0.17 0.03 0.25 0.52 0.1 0.18 0.18 0.21 0.29 0.02 0.01 0.07 0.14 0.38 0.07 0.1 0.17 0.08 0.11 0.11 0.13 0.44 0.16 0.27 0.16 0.21 0.07
0.73 0.98 0.86 1.0 0.21 0.14 0.38 0.59 0.37 0.36 0.35 0.47 0.29 0.1 0.11 0.2 0.2 0.23 0.22 0.26 0.24 0.25 0.23 0.28 0.27 0.36 0.31 0.37 0.38 0.27 0.19
0.76 0.86 1.0 0.81 0.45 0.39 0.56 0.59 0.58 0.58 0.6 0.63 0.66 0.35 0.28 0.53 0.61 0.36 0.46 0.52 0.56 0.53 0.21 0.51 0.53 0.56 0.59 0.47 0.45 0.63 0.68
Bra000953 (PRPL5)
0.52 0.77 1.0 1.0 0.21 0.22 0.36 0.42 0.22 0.4 0.35 0.35 0.57 0.1 0.11 0.35 0.35 0.29 0.15 0.29 0.32 0.29 0.31 0.31 0.32 0.34 0.34 0.39 0.23 0.28 0.38
1.0 0.86 0.78 0.86 0.61 0.41 0.38 0.4 0.44 0.49 0.52 0.59 0.32 0.23 0.23 0.44 0.44 0.23 0.28 0.41 0.45 0.47 0.14 0.34 0.39 0.77 0.45 0.47 0.45 0.49 0.36
Bra001535 (FLU)
0.81 0.94 0.96 1.0 0.56 0.41 0.55 0.75 0.29 0.57 0.61 0.6 0.75 0.35 0.33 0.47 0.6 0.34 0.47 0.5 0.48 0.43 0.43 0.54 0.57 0.58 0.59 0.52 0.42 0.6 0.72
Bra001626 (AQP1)
0.18 0.76 0.83 1.0 0.02 0.0 0.1 0.2 0.05 0.11 0.11 0.1 0.27 0.02 0.01 0.09 0.05 0.15 0.02 0.06 0.06 0.04 0.03 0.04 0.04 0.19 0.04 0.06 0.04 0.07 0.04
Bra001704 (EMB1865)
0.85 1.0 0.92 0.89 0.44 0.36 0.55 0.67 0.27 0.48 0.4 0.47 0.64 0.26 0.27 0.42 0.53 0.42 0.31 0.45 0.46 0.43 0.39 0.51 0.56 0.64 0.6 0.55 0.41 0.55 0.88
Bra003053 (TL17)
0.62 0.81 1.0 0.89 0.33 0.28 0.66 0.84 0.39 0.54 0.47 0.69 0.78 0.16 0.17 0.54 0.61 0.39 0.45 0.56 0.55 0.61 0.25 0.66 0.66 0.73 0.78 0.45 0.41 0.65 0.78
Bra004149 (TMK1)
0.89 0.88 0.78 0.96 0.55 0.46 0.53 0.64 0.49 0.51 0.57 0.61 0.6 0.39 0.33 0.49 0.49 0.34 0.4 0.5 0.52 0.45 0.31 0.44 0.49 1.0 0.49 0.56 0.54 0.64 0.6
Bra006206 (SULTR4;1)
0.49 0.7 0.65 0.51 0.17 0.36 0.9 1.0 0.25 0.37 0.37 0.36 0.36 0.35 0.36 0.4 0.28 0.39 0.4 0.31 0.33 0.43 0.14 0.49 0.52 0.48 0.5 0.35 0.23 0.37 0.39
Bra007589 (REM1.2)
0.55 0.76 1.0 0.87 0.4 0.25 0.3 0.48 0.18 0.25 0.22 0.17 0.44 0.38 0.33 0.29 0.31 0.33 0.18 0.24 0.24 0.19 0.12 0.19 0.18 0.51 0.18 0.35 0.25 0.14 0.16
Bra007733 (RRF)
0.84 0.8 1.0 0.87 0.48 0.34 0.4 0.64 0.39 0.46 0.54 0.45 0.64 0.28 0.25 0.5 0.46 0.42 0.28 0.42 0.42 0.28 0.25 0.37 0.38 0.43 0.3 0.49 0.34 0.36 0.53
Bra007994 (HISN6B)
0.95 0.71 0.75 0.96 0.23 0.29 0.81 1.0 0.42 0.56 0.69 0.59 0.71 0.17 0.24 0.56 0.67 0.43 0.44 0.74 0.55 0.71 0.34 0.56 0.58 0.62 0.55 0.48 0.4 0.53 0.51
Bra008663 (TBL19)
0.75 0.89 1.0 0.98 0.21 0.3 0.44 0.46 0.47 0.52 0.64 0.62 0.51 0.27 0.18 0.47 0.46 0.29 0.41 0.44 0.5 0.46 0.25 0.36 0.42 0.77 0.46 0.42 0.45 0.51 0.52
0.6 0.65 0.83 1.0 0.25 0.11 0.31 0.32 0.23 0.25 0.29 0.26 0.3 0.23 0.22 0.31 0.34 0.29 0.14 0.21 0.18 0.22 0.09 0.28 0.32 0.75 0.31 0.27 0.26 0.56 0.51
Bra010475 (ACP4)
1.0 0.81 0.89 0.89 0.35 0.35 0.64 0.92 0.34 0.41 0.4 0.48 0.67 0.16 0.2 0.41 0.55 0.24 0.24 0.45 0.53 0.39 0.17 0.35 0.38 0.45 0.43 0.37 0.27 0.3 0.4
Bra010820 (GGL6)
0.65 0.93 0.94 1.0 0.36 0.14 0.37 0.45 0.35 0.53 0.47 0.38 0.45 0.29 0.24 0.43 0.56 0.64 0.28 0.29 0.27 0.3 0.16 0.22 0.25 0.7 0.25 0.24 0.24 0.42 0.39
Bra010821 (GGL5)
0.44 0.59 0.6 1.0 0.14 0.04 0.13 0.21 0.1 0.23 0.21 0.24 0.26 0.05 0.03 0.18 0.28 0.22 0.07 0.1 0.13 0.13 0.16 0.04 0.06 0.31 0.11 0.05 0.04 0.16 0.1
Bra010852 (PRPL34)
0.82 0.86 1.0 0.97 0.56 0.46 0.74 0.84 0.5 0.64 0.43 0.63 0.8 0.35 0.39 0.52 0.62 0.38 0.39 0.59 0.66 0.52 0.3 0.61 0.63 0.72 0.67 0.67 0.53 0.56 0.67
1.0 0.82 0.83 0.92 0.54 0.54 0.71 0.65 0.38 0.43 0.45 0.42 0.62 0.38 0.34 0.47 0.49 0.45 0.47 0.43 0.44 0.47 0.23 0.42 0.5 0.52 0.39 0.5 0.44 0.29 0.37
Bra012595 (CH42)
0.81 0.7 0.79 0.93 0.37 0.32 0.69 1.0 0.33 0.59 0.57 0.5 0.65 0.15 0.2 0.42 0.5 0.27 0.37 0.52 0.53 0.52 0.21 0.45 0.49 0.49 0.51 0.46 0.35 0.51 0.66
0.91 0.91 0.87 0.97 0.73 0.69 0.86 0.91 0.6 0.72 0.68 0.71 0.81 0.54 0.48 0.65 0.75 0.62 0.56 0.71 0.72 0.7 0.37 0.67 0.7 0.69 0.72 0.79 0.74 0.84 1.0
Bra012812 (PDE191)
0.98 0.95 0.96 1.0 0.43 0.31 0.66 0.72 0.31 0.46 0.48 0.42 1.0 0.29 0.27 0.54 0.49 0.47 0.27 0.47 0.47 0.34 0.39 0.51 0.52 0.75 0.54 0.52 0.38 0.44 0.66
Bra013394 (PAE7)
0.77 1.0 0.97 0.84 0.15 0.12 0.27 0.28 0.16 0.27 0.28 0.2 0.34 0.15 0.12 0.2 0.19 0.44 0.19 0.23 0.24 0.22 0.29 0.26 0.29 0.41 0.31 0.35 0.34 0.3 0.22
Bra014254 (HKL1)
0.61 0.96 1.0 0.51 0.05 0.06 0.19 0.24 0.07 0.18 0.12 0.13 0.51 0.04 0.04 0.13 0.26 0.58 0.12 0.12 0.1 0.12 0.09 0.06 0.07 0.29 0.07 0.03 0.02 0.09 0.12
0.79 0.85 0.84 0.98 0.59 0.66 0.94 1.0 0.52 0.63 0.68 0.76 0.81 0.5 0.46 0.67 0.68 0.43 0.57 0.67 0.73 0.72 0.35 0.69 0.71 0.7 0.8 0.6 0.56 0.75 0.79
Bra015896 (CPK30)
0.62 0.62 0.93 1.0 0.57 0.36 0.44 0.33 0.24 0.42 0.38 0.26 0.44 0.29 0.22 0.48 0.48 0.34 0.25 0.38 0.26 0.32 0.12 0.32 0.33 0.72 0.34 0.51 0.5 0.54 0.43
Bra016047 (GER1)
0.61 0.73 0.88 1.0 0.25 0.04 0.27 0.62 0.15 0.35 0.29 0.33 0.39 0.05 0.03 0.21 0.35 0.41 0.12 0.13 0.18 0.14 0.07 0.12 0.14 0.53 0.22 0.24 0.16 0.53 0.26
Bra016989 (HEME2)
0.62 0.59 0.69 1.0 0.36 0.32 0.62 0.84 0.38 0.68 0.56 0.7 0.75 0.19 0.19 0.47 0.66 0.39 0.35 0.48 0.5 0.5 0.37 0.45 0.46 0.5 0.52 0.53 0.34 0.58 0.65
Bra017269 (SL1)
0.7 0.81 0.96 1.0 0.43 0.42 0.7 0.82 0.56 0.69 0.62 0.77 0.79 0.37 0.37 0.62 0.66 0.38 0.4 0.64 0.57 0.6 0.28 0.64 0.61 0.71 0.73 0.48 0.54 0.6 0.77
Bra017418 (TOM3)
0.7 0.74 0.73 1.0 0.45 0.39 0.29 0.3 0.32 0.34 0.4 0.37 0.39 0.37 0.38 0.41 0.34 0.33 0.36 0.41 0.3 0.38 0.44 0.28 0.29 0.59 0.29 0.28 0.38 0.32 0.32
Bra017765 (BEE2)
0.55 0.75 0.57 1.0 0.15 0.19 0.15 0.14 0.08 0.04 0.04 0.14 0.1 0.02 0.0 0.07 0.08 0.07 0.01 0.16 0.05 0.06 0.06 0.05 0.05 0.03 0.04 0.03 0.05 0.03 0.07
0.93 1.0 0.9 0.92 0.57 0.39 0.26 0.38 0.34 0.43 0.55 0.57 0.25 0.34 0.28 0.38 0.37 0.13 0.38 0.28 0.45 0.44 0.17 0.38 0.39 0.49 0.35 0.48 0.41 0.45 0.2
Bra018466 (ERG28)
0.69 0.86 0.64 1.0 0.41 0.22 0.35 0.32 0.33 0.44 0.42 0.35 0.63 0.21 0.19 0.34 0.49 0.32 0.27 0.36 0.45 0.32 0.18 0.26 0.33 0.58 0.31 0.22 0.21 0.23 0.2
0.83 0.9 0.86 1.0 0.15 0.08 0.38 0.52 0.3 0.36 0.56 0.7 0.72 0.17 0.13 0.37 0.35 0.38 0.22 0.4 0.4 0.36 0.22 0.28 0.32 0.85 0.35 0.29 0.29 0.4 0.55
Bra020038 (PHGAP2)
0.84 0.75 0.7 1.0 0.44 0.42 0.65 0.78 0.57 0.67 0.64 0.71 0.63 0.37 0.4 0.57 0.63 0.41 0.45 0.55 0.49 0.54 0.18 0.51 0.51 0.75 0.55 0.54 0.53 0.56 0.56
Bra020975 (ERD3)
0.85 0.91 0.79 0.62 0.6 0.34 0.36 0.46 0.4 0.63 0.67 0.59 0.45 0.22 0.19 0.46 0.55 0.41 0.26 0.47 0.52 0.39 0.26 0.39 0.53 1.0 0.51 0.47 0.39 0.4 0.39
Bra021037 (GRF5)
0.43 0.46 0.62 1.0 0.17 0.11 0.41 0.4 0.32 0.57 0.36 0.75 0.62 0.07 0.09 0.34 0.37 0.19 0.08 0.18 0.26 0.23 0.13 0.3 0.32 0.41 0.31 0.48 0.14 0.25 0.39
Bra021171 (AQP1)
0.53 0.72 0.76 1.0 0.11 0.04 0.17 0.48 0.25 0.34 0.24 0.36 0.77 0.09 0.07 0.19 0.26 0.34 0.06 0.17 0.19 0.11 0.23 0.19 0.21 0.48 0.22 0.21 0.23 0.47 0.52
Bra021386 (BOR1)
0.46 0.36 0.49 0.28 0.53 0.2 0.12 0.12 0.19 0.34 0.24 0.21 0.32 0.27 0.22 0.22 0.25 0.14 0.16 0.2 0.18 0.17 0.05 0.11 0.14 1.0 0.18 0.17 0.24 0.31 0.2
Bra021450 (DEG2)
0.9 0.88 1.0 0.99 0.6 0.51 0.62 0.7 0.64 0.76 0.74 0.8 0.98 0.47 0.42 0.68 0.7 0.47 0.51 0.62 0.65 0.61 0.42 0.55 0.59 0.67 0.66 0.66 0.58 0.68 0.81
0.56 0.64 0.98 1.0 0.24 0.17 0.24 0.43 0.33 0.38 0.41 0.39 0.27 0.17 0.13 0.17 0.19 0.16 0.11 0.25 0.25 0.31 0.16 0.19 0.21 0.58 0.28 0.16 0.28 0.28 0.21
Bra022058 (PLATZ11)
0.32 0.73 1.0 0.39 0.02 0.0 0.13 0.15 0.03 0.07 0.06 0.08 0.15 0.0 0.01 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.01 0.21 0.1 0.12 0.2 0.08 0.16 0.08 0.13 0.3
Bra022805 (RPT2)
0.48 0.63 0.77 1.0 0.15 0.15 0.23 0.38 0.32 0.24 0.32 0.32 0.14 0.04 0.05 0.13 0.16 0.04 0.12 0.19 0.18 0.23 0.02 0.2 0.23 0.45 0.25 0.12 0.28 0.35 0.18
0.68 0.75 0.85 1.0 0.36 0.22 0.5 0.63 0.41 0.49 0.43 0.46 0.71 0.35 0.24 0.52 0.51 0.42 0.38 0.41 0.4 0.38 0.25 0.42 0.44 0.68 0.5 0.46 0.46 0.47 0.47
Bra023563 (CAC1)
0.71 0.77 1.0 0.76 0.29 0.18 0.37 0.48 0.16 0.31 0.29 0.25 0.62 0.22 0.25 0.36 0.45 0.4 0.3 0.29 0.32 0.26 0.32 0.46 0.55 0.74 0.56 0.35 0.29 0.45 0.62
0.71 0.79 1.0 0.81 0.41 0.19 0.34 0.59 0.26 0.41 0.33 0.37 0.49 0.31 0.25 0.34 0.4 0.42 0.25 0.28 0.4 0.3 0.25 0.31 0.35 0.55 0.38 0.4 0.32 0.37 0.39
Bra028175 (RBCS3B)
0.75 0.88 0.89 1.0 0.14 0.12 0.61 0.58 0.17 0.31 0.35 0.3 0.28 0.07 0.05 0.3 0.4 0.13 0.17 0.26 0.26 0.21 0.07 0.27 0.32 0.42 0.3 0.58 0.33 0.57 0.57
0.75 0.88 0.85 1.0 0.32 0.29 0.54 0.61 0.27 0.45 0.5 0.46 0.53 0.16 0.18 0.5 0.57 0.25 0.23 0.46 0.53 0.38 0.17 0.37 0.43 0.62 0.49 0.32 0.33 0.5 0.64
Bra030628 (ELP)
0.73 0.94 1.0 0.96 0.53 0.35 0.55 0.64 0.53 0.75 0.66 0.73 0.69 0.56 0.55 0.69 0.76 0.79 0.65 0.65 0.63 0.58 0.25 0.56 0.61 0.8 0.6 0.5 0.45 0.44 0.48
Bra030923 (SRF6)
0.55 0.75 0.48 1.0 0.2 0.12 0.13 0.18 0.1 0.14 0.13 0.12 0.26 0.16 0.11 0.15 0.17 0.19 0.11 0.11 0.13 0.11 0.16 0.09 0.11 0.22 0.1 0.09 0.11 0.11 0.14
0.56 0.58 1.0 0.68 0.24 0.21 0.23 0.26 0.22 0.25 0.26 0.3 0.42 0.25 0.12 0.23 0.24 0.27 0.12 0.22 0.24 0.22 0.17 0.28 0.27 0.32 0.32 0.29 0.27 0.31 0.36
Bra032398 (AAE14)
0.69 0.8 0.98 0.97 0.21 0.16 0.58 1.0 0.36 0.48 0.48 0.66 0.59 0.12 0.1 0.36 0.35 0.23 0.18 0.31 0.3 0.31 0.26 0.33 0.4 0.4 0.39 0.34 0.38 0.54 0.49
Bra033542 (AIF3)
0.51 0.67 0.78 1.0 0.27 0.02 0.02 0.15 0.06 0.13 0.11 0.14 0.23 0.06 0.01 0.08 0.06 0.17 0.03 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.17 0.02 0.03 0.02 0.13 0.09
0.56 0.55 0.74 1.0 0.33 0.13 0.27 0.52 0.31 0.38 0.37 0.36 0.33 0.14 0.09 0.27 0.38 0.6 0.3 0.24 0.26 0.21 0.15 0.26 0.28 0.84 0.37 0.36 0.43 0.67 0.5
Bra033737 (TUB4)
0.77 1.0 0.97 0.89 0.57 0.38 0.37 0.55 0.35 0.44 0.4 0.4 0.59 0.49 0.4 0.42 0.39 0.57 0.35 0.35 0.37 0.35 0.63 0.39 0.42 0.72 0.44 0.6 0.46 0.54 0.4
Bra034128 (SIR)
0.79 0.79 0.87 0.95 0.3 0.48 0.86 1.0 0.35 0.51 0.5 0.56 0.73 0.38 0.45 0.74 0.58 0.42 0.52 0.54 0.67 0.6 0.22 0.67 0.78 0.79 0.77 0.45 0.36 0.62 0.74
Bra034235 (CYP71B4)
0.63 0.91 0.78 1.0 0.31 0.46 0.24 0.23 0.37 0.2 0.29 0.29 0.15 0.27 0.16 0.08 0.11 0.01 0.18 0.11 0.3 0.23 0.01 0.3 0.31 0.42 0.26 0.3 0.41 0.32 0.27
0.42 0.49 0.38 1.0 0.09 0.08 0.1 0.19 0.05 0.11 0.12 0.07 0.1 0.12 0.07 0.09 0.12 0.17 0.09 0.09 0.12 0.11 0.09 0.06 0.05 0.21 0.06 0.08 0.09 0.07 0.07
0.82 0.92 0.84 1.0 0.13 0.13 0.42 0.5 0.16 0.48 0.49 0.52 0.51 0.04 0.04 0.26 0.33 0.14 0.12 0.27 0.23 0.27 0.13 0.12 0.2 0.73 0.27 0.06 0.08 0.31 0.34
Bra036538 (HPAT1)
0.57 0.82 1.0 0.88 0.27 0.13 0.14 0.2 0.2 0.36 0.26 0.25 0.55 0.28 0.22 0.25 0.25 0.47 0.24 0.23 0.23 0.18 0.39 0.32 0.23 0.42 0.34 0.25 0.23 0.34 0.37
Bra036739 (OHP2)
0.58 0.6 0.56 0.9 0.23 0.33 0.78 1.0 0.34 0.45 0.45 0.56 0.64 0.23 0.27 0.48 0.62 0.42 0.41 0.61 0.56 0.52 0.24 0.53 0.61 0.58 0.66 0.4 0.35 0.38 0.59
0.65 0.74 0.98 1.0 0.08 0.02 0.33 0.51 0.14 0.4 0.25 0.25 0.66 0.05 0.03 0.38 0.46 0.43 0.15 0.21 0.26 0.2 0.16 0.21 0.24 0.74 0.3 0.25 0.14 0.28 0.26
Bra037997 (NDF5)
0.91 1.0 0.97 0.91 0.56 0.53 0.7 0.79 0.47 0.62 0.61 0.56 0.78 0.43 0.34 0.66 0.71 0.47 0.53 0.77 0.59 0.59 0.25 0.58 0.61 0.6 0.6 0.69 0.5 0.53 0.8
Bra038038 (AIF3)
0.67 0.93 1.0 0.96 0.21 0.15 0.21 0.16 0.21 0.4 0.42 0.52 0.26 0.23 0.12 0.22 0.31 0.22 0.23 0.39 0.33 0.35 0.09 0.16 0.2 0.51 0.22 0.16 0.21 0.4 0.31
Bra038970 (PEL2)
0.27 0.7 0.81 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Bra039206 (ME8)
0.69 1.0 0.83 0.95 0.07 0.25 0.32 0.99 0.38 0.35 0.37 0.63 0.36 0.07 0.13 0.14 0.18 0.11 0.12 0.14 0.25 0.36 0.06 0.1 0.17 0.2 0.22 0.15 0.25 0.52 0.48
0.89 0.69 0.83 0.82 0.69 0.35 0.4 0.5 0.4 0.62 0.56 0.49 0.44 0.28 0.34 0.51 0.56 0.24 0.32 0.39 0.5 0.44 0.13 0.39 0.46 1.0 0.46 0.43 0.48 0.54 0.44
Bra039648 (TUA2)
0.53 0.79 1.0 0.82 0.14 0.05 0.22 0.51 0.14 0.24 0.17 0.21 0.62 0.14 0.1 0.33 0.34 0.37 0.14 0.19 0.16 0.18 0.21 0.14 0.17 0.26 0.17 0.14 0.08 0.2 0.18
Bra041142 (CYP81K2)
0.46 0.46 0.6 0.96 0.23 0.14 0.53 0.45 0.38 0.59 0.46 1.0 0.86 0.12 0.17 0.32 0.4 0.35 0.1 0.35 0.38 0.35 0.16 0.43 0.5 0.59 0.46 0.48 0.15 0.28 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)