Heatmap: Cluster_169 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g04790.1 (EIF2 GAMMA)
0.49 0.47 0.79 0.55 0.45 0.5 0.51 0.46 0.69 0.4 0.53 0.5 0.49 0.4 0.44 0.56 0.49 0.47 1.0 0.49 0.48 0.8 0.54 0.99 0.47 0.52 0.47 0.47 0.52 0.49 0.61 0.61
0.28 0.19 0.65 0.16 0.18 0.28 0.18 0.29 0.52 0.08 0.29 0.27 0.28 0.32 0.17 0.12 0.13 0.27 1.0 0.33 0.27 0.78 0.23 0.88 0.33 0.28 0.2 0.33 0.34 0.46 0.45 0.3
Mp1g13670.1 (CDP1)
0.54 0.35 0.72 0.47 0.49 0.57 0.55 0.55 0.67 0.37 0.45 0.42 0.42 0.43 0.51 0.47 0.5 0.57 1.0 0.49 0.58 0.85 0.57 0.98 0.57 0.59 0.48 0.52 0.54 0.49 0.5 0.49
0.56 0.59 0.95 0.57 0.44 0.55 0.43 0.45 0.81 0.45 0.59 0.55 0.49 0.6 0.55 0.46 0.51 0.44 1.0 0.46 0.48 0.93 0.43 0.95 0.49 0.48 0.48 0.49 0.53 0.52 0.63 0.65
0.1 0.02 0.71 0.05 0.03 0.04 0.08 0.06 0.64 0.03 0.02 0.01 0.01 0.38 0.05 0.06 0.06 0.02 0.71 0.02 0.04 0.63 0.04 1.0 0.03 0.06 0.09 0.12 0.11 0.18 0.21 0.2
0.29 0.16 0.95 0.28 0.26 0.24 0.25 0.25 0.53 0.16 0.15 0.13 0.17 0.62 0.22 0.41 0.25 0.21 0.79 0.28 0.22 0.96 0.3 1.0 0.24 0.23 0.3 0.3 0.3 0.29 0.38 0.38
Mp1g27930.1 (GLE1)
0.15 0.09 0.85 0.05 0.07 0.12 0.07 0.08 0.37 0.25 0.16 0.08 0.17 0.15 0.07 0.05 0.04 0.07 1.0 0.12 0.11 0.77 0.07 0.94 0.11 0.11 0.09 0.14 0.18 0.11 0.08 0.09
Mp2g00570.1 (RPL23A)
0.55 0.5 1.0 0.48 0.45 0.5 0.44 0.44 0.77 0.37 0.49 0.47 0.42 0.46 0.5 0.45 0.48 0.41 0.98 0.47 0.45 0.9 0.41 0.96 0.47 0.45 0.53 0.53 0.54 0.52 0.62 0.61
0.26 0.12 0.82 0.38 0.23 0.18 0.25 0.16 0.57 0.09 0.16 0.13 0.11 0.64 0.28 0.44 0.39 0.23 0.83 0.27 0.25 0.83 0.29 1.0 0.18 0.26 0.25 0.24 0.24 0.2 0.3 0.36
0.45 0.55 0.99 0.44 0.34 0.41 0.42 0.39 0.85 0.41 0.53 0.51 0.49 0.57 0.36 0.44 0.39 0.34 1.0 0.38 0.39 0.86 0.35 0.96 0.41 0.42 0.43 0.44 0.47 0.45 0.51 0.51
0.0 0.0 0.45 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 1.0 0.01 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02
Mp2g13040.1 (HAC2)
0.32 0.48 0.88 0.31 0.27 0.35 0.29 0.28 0.65 0.23 0.49 0.34 0.52 0.37 0.29 0.31 0.3 0.28 0.94 0.36 0.29 0.75 0.35 1.0 0.36 0.34 0.23 0.3 0.33 0.27 0.42 0.45
Mp2g14530.1 (LecRK-S.5)
0.02 0.01 0.6 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.18 0.04 0.01 0.0 0.01 0.51 0.0 0.0 0.0 0.01 0.81 0.01 0.01 0.95 0.01 1.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.05 0.16 0.14
0.45 0.44 0.86 0.56 0.36 0.47 0.41 0.42 0.83 0.4 0.57 0.54 0.48 0.72 0.58 0.52 0.57 0.45 0.97 0.51 0.5 0.9 0.45 1.0 0.53 0.5 0.48 0.48 0.49 0.48 0.59 0.6
Mp2g17600.1 (I14H)
0.0 0.0 1.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.02 0.03 0.01 0.0 0.92 0.01 0.01 0.55 0.01 0.75 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.36 0.18 0.72 0.24 0.34 0.37 0.38 0.34 0.43 0.22 0.27 0.25 0.24 0.2 0.27 0.25 0.25 0.35 1.0 0.37 0.35 0.82 0.37 0.79 0.38 0.39 0.24 0.35 0.34 0.35 0.44 0.42
Mp2g23000.1 (BES1)
0.05 0.04 0.3 0.04 0.03 0.04 0.03 0.01 0.04 0.03 0.02 0.08 0.04 0.23 0.01 0.03 0.02 0.04 0.59 0.01 0.0 1.0 0.09 0.94 0.01 0.0 0.08 0.02 0.07 0.0 0.01 0.01
Mp2g24290.1 (RPS30B)
0.32 0.39 0.93 0.43 0.25 0.38 0.4 0.33 0.76 0.33 0.41 0.38 0.36 0.76 0.42 0.41 0.37 0.3 1.0 0.34 0.39 0.96 0.32 0.99 0.4 0.38 0.36 0.38 0.4 0.39 0.5 0.51
Mp2g26040.1 (TCTP1)
0.39 0.32 1.0 0.43 0.3 0.32 0.24 0.28 0.64 0.21 0.27 0.24 0.25 0.54 0.4 0.36 0.43 0.26 0.84 0.3 0.28 0.87 0.28 0.88 0.29 0.32 0.38 0.31 0.32 0.32 0.45 0.49
0.4 0.26 0.7 0.26 0.38 0.36 0.31 0.37 0.47 0.31 0.32 0.27 0.3 0.33 0.28 0.24 0.28 0.38 1.0 0.4 0.31 0.73 0.37 0.92 0.35 0.34 0.35 0.44 0.44 0.46 0.47 0.44
0.02 0.02 1.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.02 0.04 0.0 0.04 0.18 0.2 0.23 0.22 0.0 0.7 0.03 0.0 0.46 0.0 0.26 0.16 0.02 0.0 0.04 0.05 0.11 0.09 0.12
0.32 0.28 0.95 0.36 0.27 0.33 0.28 0.3 0.76 0.23 0.31 0.27 0.25 0.66 0.39 0.34 0.37 0.26 0.88 0.29 0.31 0.8 0.27 1.0 0.32 0.3 0.37 0.32 0.33 0.35 0.46 0.47
0.31 0.12 0.97 0.3 0.15 0.29 0.27 0.32 0.47 0.11 0.17 0.11 0.14 0.49 0.29 0.3 0.31 0.25 0.92 0.27 0.3 0.9 0.25 1.0 0.29 0.31 0.26 0.41 0.45 0.47 0.47 0.44
Mp3g13760.1 (PAE2)
0.06 0.04 0.41 0.08 0.03 0.04 0.14 0.04 0.06 0.02 0.05 0.08 0.03 0.1 0.07 0.11 0.08 0.04 0.78 0.03 0.11 1.0 0.08 0.83 0.03 0.1 0.04 0.03 0.03 0.04 0.07 0.09
0.39 0.31 1.0 0.46 0.52 0.35 0.48 0.33 0.61 0.6 0.35 0.43 0.41 0.61 0.36 0.5 0.38 0.33 0.81 0.41 0.34 0.6 0.51 0.7 0.32 0.38 0.29 0.41 0.39 0.42 0.39 0.45
0.09 0.01 1.0 0.05 0.03 0.08 0.07 0.08 0.3 0.04 0.01 0.02 0.02 0.27 0.05 0.04 0.04 0.06 0.57 0.03 0.03 0.64 0.02 0.87 0.03 0.08 0.06 0.13 0.11 0.13 0.2 0.27
Mp4g05360.1 (CaM KMT)
0.16 0.15 0.86 0.33 0.14 0.16 0.12 0.17 0.59 0.1 0.18 0.15 0.21 0.51 0.25 0.21 0.29 0.14 1.0 0.15 0.13 0.8 0.11 0.96 0.18 0.16 0.11 0.18 0.21 0.25 0.21 0.21
Mp4g08100.1 (EIF4B2)
0.03 0.0 0.64 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.43 0.1 0.01 0.02 0.01 0.7 0.03 0.07 0.02 0.03 0.93 0.0 0.01 0.62 0.01 1.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.03 0.04 0.11 0.13
0.27 0.27 0.94 0.13 0.18 0.24 0.28 0.21 0.4 0.19 0.27 0.28 0.27 0.22 0.11 0.13 0.12 0.2 0.91 0.2 0.24 0.95 0.21 1.0 0.22 0.26 0.21 0.25 0.33 0.29 0.43 0.47
Mp4g23190.1 (PKSA)
0.02 0.01 0.71 0.02 0.03 0.02 0.02 0.03 0.25 0.01 0.01 0.01 0.01 0.39 0.04 0.03 0.02 0.04 0.8 0.03 0.02 0.49 0.03 1.0 0.02 0.02 0.05 0.03 0.02 0.03 0.07 0.14
0.35 0.33 1.0 0.38 0.33 0.32 0.33 0.28 0.56 0.2 0.23 0.24 0.19 0.5 0.31 0.33 0.3 0.28 0.81 0.3 0.26 0.74 0.35 0.74 0.26 0.29 0.31 0.35 0.34 0.32 0.45 0.48
Mp5g18500.1 (ACIP1)
0.04 0.26 0.84 0.05 0.07 0.04 0.04 0.03 0.44 0.2 0.3 0.05 0.29 0.34 0.04 0.04 0.04 0.03 0.89 0.07 0.03 0.64 0.04 1.0 0.05 0.03 0.04 0.04 0.04 0.04 0.05 0.06
Mp5g18870.1 (CYP705A8)
0.21 0.06 1.0 0.07 0.07 0.2 0.04 0.08 0.35 0.03 0.33 0.02 0.21 0.33 0.1 0.09 0.11 0.01 0.82 0.09 0.16 0.8 0.04 0.87 0.22 0.12 0.16 0.18 0.23 0.03 0.09 0.15
Mp6g01040.1 (RTP1)
0.01 0.02 0.75 0.03 0.01 0.01 0.02 0.0 0.22 0.03 0.0 0.02 0.01 0.11 0.02 0.04 0.02 0.02 0.8 0.01 0.01 0.75 0.02 1.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04
0.06 0.05 0.72 0.02 0.03 0.07 0.07 0.06 0.17 0.02 0.05 0.07 0.05 0.05 0.02 0.02 0.02 0.06 0.7 0.08 0.09 0.83 0.08 1.0 0.07 0.09 0.05 0.05 0.05 0.09 0.09 0.07
0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.47 0.0 0.0 0.01 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.01 0.01 0.87 0.01 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.04 0.62 0.11 0.07 0.06 0.01 0.09 0.19 0.26 0.03 0.1 0.03 0.25 0.06 0.18 0.06 0.06 1.0 0.09 0.14 0.54 0.07 0.92 0.08 0.09 0.1 0.07 0.1 0.1 0.13 0.23
0.08 0.06 0.91 0.28 0.1 0.08 0.1 0.08 0.36 0.17 0.06 0.07 0.06 0.22 0.27 0.31 0.26 0.14 1.0 0.07 0.13 0.88 0.17 0.98 0.12 0.06 0.14 0.08 0.09 0.05 0.06 0.12
0.22 0.14 1.0 0.18 0.23 0.23 0.08 0.35 0.9 0.19 0.14 0.05 0.11 0.17 0.16 0.12 0.16 0.61 0.75 0.18 0.22 0.54 0.13 0.72 0.25 0.18 0.22 0.2 0.21 0.38 0.29 0.22
0.15 0.3 1.0 0.11 0.15 0.23 0.24 0.23 0.59 0.32 0.4 0.38 0.37 0.6 0.23 0.08 0.18 0.3 0.87 0.36 0.26 0.88 0.19 0.95 0.37 0.3 0.27 0.14 0.17 0.28 0.35 0.24
Mp7g16490.1 (LRX8)
0.11 0.05 0.86 0.2 0.18 0.18 0.07 0.19 0.35 0.05 0.13 0.07 0.1 0.46 0.17 0.27 0.21 0.12 0.74 0.22 0.14 0.95 0.14 1.0 0.12 0.13 0.1 0.13 0.14 0.14 0.15 0.21
Mp8g00780.1 (HAP4)
0.5 0.44 0.98 0.48 0.39 0.49 0.36 0.43 0.73 0.36 0.49 0.4 0.4 0.61 0.52 0.41 0.42 0.34 1.0 0.43 0.42 0.86 0.33 0.86 0.44 0.39 0.47 0.47 0.47 0.48 0.54 0.54
0.5 0.51 0.87 0.42 0.39 0.51 0.45 0.45 0.7 0.4 0.57 0.52 0.46 0.45 0.45 0.42 0.42 0.39 1.0 0.46 0.46 0.92 0.42 0.89 0.49 0.49 0.52 0.52 0.55 0.53 0.62 0.61
0.06 0.04 0.49 0.03 0.03 0.07 0.03 0.07 0.2 0.02 0.07 0.06 0.07 0.17 0.05 0.03 0.04 0.09 0.86 0.1 0.07 0.99 0.06 1.0 0.11 0.07 0.03 0.04 0.06 0.13 0.16 0.15
0.01 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.01 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 1.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.09 0.1 0.07
0.03 0.0 0.73 0.06 0.05 0.05 0.1 0.05 0.13 0.02 0.07 0.03 0.05 0.31 0.06 0.15 0.09 0.03 0.6 0.01 0.05 1.0 0.11 0.83 0.07 0.13 0.06 0.03 0.05 0.04 0.05 0.05
0.01 0.0 1.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.35 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.01 0.39 0.01 0.0 0.25 0.03 0.35 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01
Mp8g15220.1 (TRM2a)
0.01 0.0 1.0 0.04 0.01 0.0 0.02 0.01 0.32 0.0 0.02 0.0 0.0 0.26 0.01 0.04 0.02 0.0 0.69 0.0 0.01 0.43 0.01 0.64 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)