Heatmap: Cluster_104 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.5 0.4 0.03 0.28 0.17 0.36 0.32 0.46 0.13 0.44 0.36 0.31 0.34 0.03 0.3 0.25 0.3 0.24 0.06 0.2 0.32 0.04 0.17 0.03 0.32 0.41 1.0 0.85 0.44 0.4 0.41 0.6
Mp1g16850.1 (LHCB4.2)
0.55 0.44 0.06 0.46 0.24 0.4 0.45 0.55 0.04 0.22 0.33 0.33 0.41 0.02 0.49 0.38 0.59 0.37 0.04 0.28 0.42 0.03 0.3 0.03 0.47 0.5 0.76 1.0 0.85 0.66 0.43 0.4
Mp1g22820.1 (HEMB1)
0.64 0.2 0.46 0.67 0.45 0.55 0.57 0.68 0.27 0.22 0.23 0.18 0.2 0.4 0.72 0.71 0.8 0.53 0.56 0.51 0.57 0.44 0.5 0.58 0.62 0.64 0.91 1.0 0.79 0.78 0.73 0.68
Mp1g24020.1 (IKU2)
0.59 0.45 0.12 0.46 0.28 0.39 0.41 0.49 0.09 0.25 0.29 0.34 0.36 0.06 0.43 0.37 0.51 0.33 0.07 0.27 0.37 0.08 0.27 0.07 0.38 0.42 0.77 1.0 0.84 0.67 0.49 0.5
0.67 0.13 0.32 0.71 0.45 0.55 0.39 0.61 0.27 0.15 0.17 0.1 0.17 0.29 0.71 0.56 0.85 0.51 0.36 0.44 0.5 0.32 0.39 0.39 0.52 0.53 0.72 1.0 0.88 0.79 0.69 0.67
Mp2g02960.1 (PSAF)
0.61 0.49 0.2 0.55 0.36 0.38 0.42 0.5 0.1 0.22 0.3 0.32 0.37 0.08 0.48 0.44 0.64 0.35 0.14 0.31 0.36 0.12 0.32 0.17 0.38 0.43 0.85 1.0 0.89 0.84 0.72 0.72
Mp2g07740.1 (HEMC)
0.6 0.23 0.21 0.51 0.35 0.56 0.5 0.69 0.13 0.21 0.35 0.19 0.24 0.19 0.58 0.57 0.62 0.44 0.32 0.39 0.55 0.23 0.39 0.27 0.61 0.63 1.0 0.91 0.73 0.75 0.72 0.67
0.73 0.16 0.36 0.78 0.5 0.5 0.6 0.61 0.78 0.4 0.18 0.16 0.14 0.32 0.61 0.66 0.78 0.49 0.29 0.44 0.5 0.29 0.57 0.32 0.51 0.62 0.87 1.0 0.85 0.86 0.72 0.69
Mp2g11020.1 (AIR9)
0.75 0.45 0.29 0.62 0.21 0.5 0.5 0.53 0.27 0.25 0.49 0.46 0.44 0.2 0.55 0.56 0.65 0.34 0.19 0.32 0.44 0.32 0.39 0.12 0.44 0.63 0.63 0.89 1.0 0.93 0.59 0.47
0.62 0.22 0.36 0.5 0.48 0.58 0.54 0.67 0.36 0.19 0.31 0.19 0.22 0.34 0.62 0.48 0.64 0.62 0.44 0.6 0.61 0.45 0.53 0.44 0.66 0.7 1.0 0.93 0.79 0.71 0.63 0.56
Mp2g15420.1 (LHCA1)
0.54 0.39 0.05 0.36 0.18 0.32 0.41 0.48 0.02 0.13 0.27 0.27 0.33 0.02 0.36 0.33 0.47 0.23 0.03 0.18 0.33 0.03 0.2 0.03 0.35 0.41 0.76 1.0 0.78 0.57 0.37 0.35
0.63 0.2 0.28 0.72 0.44 0.45 0.43 0.65 0.19 0.23 0.2 0.13 0.21 0.36 0.74 0.65 0.89 0.54 0.34 0.39 0.43 0.3 0.43 0.37 0.45 0.51 0.91 1.0 0.77 0.83 0.73 0.71
Mp2g20930.1 (PGF9)
0.67 0.65 0.43 0.54 0.46 0.5 0.52 0.64 0.38 0.52 0.53 0.57 0.68 0.46 0.53 0.49 0.56 0.69 0.36 0.48 0.51 0.35 0.51 0.37 0.54 0.59 1.0 0.94 0.79 0.76 0.76 0.79
Mp3g07620.1 (CYP71B17)
0.63 0.39 0.37 0.46 0.39 0.5 0.52 0.56 0.4 0.28 0.33 0.43 0.36 0.44 0.41 0.52 0.48 0.5 0.33 0.48 0.52 0.36 0.51 0.38 0.51 0.64 0.91 1.0 0.85 0.75 0.68 0.69
Mp3g07840.1 (CAB4)
0.53 0.39 0.02 0.48 0.15 0.33 0.43 0.45 0.02 0.19 0.27 0.3 0.33 0.0 0.47 0.45 0.6 0.24 0.01 0.19 0.38 0.01 0.22 0.01 0.4 0.46 0.77 1.0 0.84 0.64 0.42 0.38
0.57 0.63 0.29 0.5 0.48 0.42 0.37 0.49 0.26 0.39 0.46 0.41 0.5 0.15 0.45 0.42 0.53 0.39 0.24 0.4 0.36 0.23 0.39 0.27 0.36 0.39 1.0 0.95 0.6 0.39 0.41 0.62
Mp3g17410.1 (LIN2)
0.65 0.22 0.4 0.59 0.33 0.55 0.67 0.71 0.49 0.2 0.28 0.19 0.25 0.3 0.68 0.72 0.78 0.45 0.44 0.39 0.51 0.42 0.45 0.46 0.58 0.67 0.93 1.0 0.9 0.89 0.75 0.64
Mp3g19780.1 (PSB27)
0.58 0.36 0.12 0.58 0.35 0.4 0.35 0.52 0.11 0.23 0.3 0.24 0.35 0.06 0.54 0.41 0.6 0.33 0.14 0.29 0.37 0.1 0.22 0.15 0.4 0.42 0.93 1.0 0.76 0.71 0.76 0.82
Mp4g00930.1 (LHCA3)
0.53 0.33 0.05 0.51 0.19 0.35 0.4 0.5 0.04 0.13 0.24 0.25 0.3 0.03 0.52 0.46 0.65 0.28 0.03 0.21 0.35 0.03 0.25 0.03 0.36 0.44 0.78 1.0 0.78 0.58 0.37 0.36
Mp4g06880.1 (PSAK)
0.56 0.4 0.08 0.62 0.22 0.39 0.38 0.54 0.06 0.2 0.31 0.38 0.44 0.04 0.57 0.46 0.68 0.29 0.06 0.21 0.4 0.06 0.22 0.06 0.45 0.5 0.74 1.0 0.82 0.58 0.38 0.37
Mp4g07510.1 (RPL24A)
0.53 0.3 0.05 0.39 0.18 0.31 0.34 0.45 0.02 0.1 0.16 0.17 0.2 0.04 0.35 0.29 0.44 0.22 0.05 0.13 0.28 0.04 0.15 0.05 0.28 0.34 0.67 1.0 0.83 0.7 0.42 0.35
Mp4g10900.1 (LHCB5)
0.58 0.29 0.06 0.42 0.25 0.44 0.4 0.59 0.05 0.14 0.21 0.18 0.24 0.01 0.49 0.32 0.56 0.34 0.04 0.28 0.4 0.03 0.24 0.04 0.42 0.44 0.81 1.0 0.77 0.62 0.42 0.4
0.54 0.29 0.09 0.46 0.17 0.33 0.39 0.46 0.03 0.12 0.19 0.16 0.22 0.04 0.49 0.35 0.53 0.17 0.06 0.15 0.34 0.05 0.13 0.05 0.35 0.38 0.71 1.0 0.87 0.66 0.49 0.43
Mp5g04200.1 (PSAD1)
0.57 0.47 0.09 0.43 0.31 0.36 0.42 0.48 0.08 0.23 0.31 0.31 0.37 0.05 0.41 0.38 0.5 0.32 0.05 0.26 0.37 0.05 0.29 0.07 0.37 0.42 0.79 1.0 0.84 0.66 0.48 0.47
0.56 0.54 0.05 0.44 0.25 0.35 0.5 0.45 0.12 0.24 0.32 0.34 0.35 0.03 0.45 0.38 0.48 0.27 0.02 0.26 0.38 0.03 0.29 0.02 0.37 0.42 0.73 1.0 0.77 0.61 0.44 0.45
Mp5g19460.1 (VIP2)
0.57 0.51 0.23 0.58 0.4 0.53 0.51 0.63 0.35 0.5 0.57 0.44 0.55 0.37 0.6 0.51 0.64 0.46 0.5 0.48 0.5 0.31 0.38 0.42 0.54 0.59 0.77 1.0 0.77 0.7 0.69 0.62
Mp5g20200.1 (NFU1)
0.6 0.5 0.39 0.81 0.4 0.47 0.51 0.59 0.75 0.42 0.62 0.51 0.54 0.77 0.62 0.76 0.78 0.54 0.38 0.43 0.48 0.39 0.49 0.5 0.48 0.65 0.93 1.0 0.88 0.81 0.73 0.67
Mp5g20290.1 (OE23)
0.66 0.38 0.06 0.44 0.29 0.41 0.46 0.56 0.05 0.17 0.26 0.29 0.34 0.05 0.39 0.38 0.54 0.37 0.04 0.27 0.46 0.04 0.3 0.04 0.44 0.54 0.87 1.0 0.78 0.66 0.5 0.5
0.3 0.08 0.01 0.33 0.18 0.21 0.25 0.26 0.04 0.08 0.11 0.06 0.12 0.03 0.34 0.1 0.37 0.26 0.01 0.16 0.09 0.0 0.15 0.01 0.15 0.16 0.52 0.92 1.0 0.46 0.19 0.17
Mp6g01650.1 (CP24)
0.55 0.47 0.07 0.63 0.24 0.43 0.47 0.57 0.04 0.26 0.37 0.33 0.39 0.04 0.68 0.54 0.74 0.35 0.06 0.33 0.43 0.04 0.31 0.04 0.49 0.52 0.92 1.0 0.81 0.75 0.75 0.82
Mp6g10490.1 (PAKRP2)
0.41 0.2 0.25 0.54 0.25 0.27 0.28 0.4 0.41 0.18 0.24 0.16 0.2 0.34 0.57 0.45 0.63 0.28 0.25 0.25 0.28 0.24 0.25 0.25 0.29 0.33 0.5 1.0 0.88 0.74 0.59 0.42
Mp6g15300.1 (OEE1)
0.62 0.49 0.22 0.48 0.39 0.44 0.42 0.57 0.19 0.27 0.37 0.3 0.41 0.05 0.49 0.39 0.58 0.39 0.14 0.36 0.4 0.12 0.34 0.16 0.43 0.44 0.96 1.0 0.81 0.72 0.68 0.73
0.66 0.19 0.17 0.54 0.36 0.5 0.33 0.59 0.11 0.17 0.27 0.11 0.23 0.18 0.48 0.39 0.64 0.43 0.16 0.36 0.45 0.16 0.31 0.17 0.51 0.55 0.96 1.0 0.74 0.58 0.53 0.57
Mp6g18440.1 (PSAG)
0.62 0.35 0.06 0.48 0.2 0.33 0.37 0.46 0.03 0.12 0.18 0.19 0.25 0.04 0.44 0.38 0.53 0.16 0.03 0.13 0.29 0.03 0.15 0.03 0.29 0.33 0.69 1.0 0.9 0.61 0.38 0.35
0.71 0.26 0.07 0.3 0.14 0.22 0.55 0.66 0.07 0.16 0.18 0.27 0.33 0.02 0.17 0.3 0.35 0.29 0.09 0.12 0.26 0.12 0.26 0.09 0.22 0.4 0.69 1.0 0.65 0.63 0.43 0.52
Mp6g21460.1 (TYDC)
0.69 0.47 0.32 0.47 0.46 0.45 0.44 0.54 0.15 0.25 0.28 0.27 0.31 0.19 0.48 0.38 0.52 0.35 0.24 0.36 0.39 0.21 0.31 0.3 0.39 0.4 0.9 1.0 0.9 0.91 0.82 0.8
Mp7g01620.1 (MPH2)
0.47 0.47 0.13 0.43 0.45 0.39 0.34 0.5 0.32 0.36 0.42 0.28 0.48 0.13 0.43 0.33 0.44 0.42 0.13 0.37 0.34 0.15 0.32 0.13 0.37 0.38 1.0 0.94 0.53 0.38 0.5 0.77
Mp7g06710.1 (LHCB2)
0.66 0.64 0.01 0.27 0.08 0.18 0.45 0.34 0.01 0.38 0.13 0.36 0.26 0.0 0.2 0.28 0.3 0.09 0.0 0.06 0.17 0.0 0.08 0.0 0.21 0.3 0.97 1.0 0.76 0.59 0.32 0.36
Mp7g06730.1 (DEG11)
0.54 0.5 0.02 0.08 0.07 0.14 0.26 0.28 0.08 0.37 0.11 0.24 0.2 0.02 0.05 0.08 0.1 0.06 0.01 0.03 0.1 0.01 0.05 0.01 0.13 0.18 1.0 0.89 0.5 0.27 0.18 0.28
Mp7g06760.1 (LHB1B2)
0.45 0.18 0.04 0.11 0.1 0.16 0.27 0.25 0.06 0.09 0.05 0.08 0.08 0.0 0.11 0.12 0.19 0.09 0.01 0.07 0.12 0.06 0.09 0.01 0.12 0.22 0.82 1.0 0.57 0.26 0.15 0.24
Mp7g06780.1 (LHCB2)
0.3 0.17 0.0 0.12 0.01 0.1 0.24 0.2 0.01 0.04 0.07 0.11 0.11 0.0 0.17 0.19 0.27 0.04 0.0 0.02 0.09 0.0 0.03 0.0 0.1 0.19 0.62 1.0 0.53 0.12 0.06 0.07
Mp7g06790.1 (LHCB2)
0.54 0.43 0.02 0.41 0.23 0.36 0.54 0.47 0.07 0.18 0.28 0.26 0.29 0.01 0.41 0.41 0.51 0.27 0.01 0.2 0.32 0.01 0.27 0.0 0.29 0.37 0.85 1.0 0.69 0.24 0.12 0.15
Mp7g08940.1 (LHB1B2)
0.41 0.15 0.06 0.47 0.18 0.26 0.41 0.41 0.02 0.06 0.12 0.1 0.13 0.05 0.49 0.45 0.56 0.24 0.04 0.22 0.28 0.04 0.21 0.04 0.29 0.35 0.87 1.0 0.66 0.5 0.34 0.32
Mp7g13220.1 (PSAH-1)
0.59 0.33 0.05 0.6 0.29 0.35 0.37 0.45 0.03 0.15 0.2 0.22 0.25 0.09 0.61 0.47 0.69 0.26 0.05 0.25 0.34 0.04 0.23 0.05 0.35 0.37 0.83 1.0 0.77 0.56 0.4 0.47
Mp7g15030.1 (SIG4)
0.59 0.21 0.24 0.57 0.4 0.37 0.35 0.48 0.34 0.33 0.27 0.17 0.2 0.29 0.45 0.41 0.57 0.42 0.23 0.36 0.35 0.21 0.5 0.19 0.34 0.42 0.73 1.0 0.86 0.81 0.71 0.57
Mp7g15180.1 (NPC4)
0.47 0.27 0.01 0.25 0.06 0.27 0.28 0.35 0.02 0.22 0.19 0.16 0.29 0.0 0.21 0.13 0.44 0.1 0.0 0.33 0.33 0.0 0.15 0.0 0.43 0.64 1.0 0.95 0.77 0.63 0.23 0.19
Mp7g16030.1 (ckl7)
0.68 0.41 0.07 0.51 0.55 0.57 0.49 0.66 0.06 0.3 0.39 0.3 0.39 0.03 0.55 0.42 0.54 0.49 0.07 0.47 0.6 0.05 0.41 0.07 0.58 0.56 0.9 1.0 0.85 0.74 0.55 0.53
Mp7g18150.1 (PSAL)
0.59 0.55 0.1 0.38 0.3 0.45 0.45 0.57 0.06 0.32 0.41 0.43 0.53 0.05 0.44 0.33 0.53 0.4 0.06 0.35 0.46 0.08 0.32 0.06 0.52 0.53 0.73 1.0 0.91 0.67 0.44 0.43
Mp7g19250.1 (EXL2)
0.42 0.36 0.16 0.67 0.03 0.26 0.23 0.43 0.03 0.11 0.24 0.2 0.18 0.02 0.27 0.28 0.8 0.15 0.05 0.14 0.32 0.32 0.12 0.05 0.22 0.41 0.35 0.71 1.0 0.73 0.3 0.13
Mp8g01210.1 (PSAO)
0.57 0.49 0.04 0.38 0.22 0.33 0.45 0.48 0.02 0.16 0.22 0.29 0.32 0.01 0.34 0.3 0.4 0.17 0.03 0.14 0.28 0.03 0.15 0.02 0.29 0.31 0.68 1.0 0.94 0.67 0.46 0.43
0.57 0.32 0.1 0.54 0.38 0.54 0.51 0.65 0.13 0.19 0.38 0.28 0.34 0.34 0.57 0.5 0.57 0.43 0.14 0.38 0.42 0.08 0.38 0.13 0.49 0.56 0.85 1.0 0.82 0.75 0.65 0.6
Mp8g11790.1 (SAFE1)
0.63 0.51 0.24 0.59 0.35 0.49 0.55 0.61 0.36 0.51 0.59 0.43 0.51 0.38 0.53 0.59 0.63 0.52 0.22 0.39 0.55 0.26 0.5 0.21 0.56 0.67 0.93 1.0 0.76 0.67 0.64 0.59
Mp8g12730.1 (PSBY)
0.61 0.51 0.23 0.49 0.43 0.55 0.5 0.65 0.27 0.31 0.46 0.34 0.48 0.18 0.51 0.43 0.59 0.5 0.22 0.42 0.45 0.18 0.4 0.21 0.48 0.49 0.98 1.0 0.78 0.6 0.61 0.66
Mp8g12930.1 (LOX3)
0.33 0.04 0.08 0.42 0.1 0.31 0.14 0.33 0.37 0.12 0.09 0.03 0.08 0.08 0.5 0.12 0.46 0.13 0.09 0.27 0.36 0.08 0.09 0.07 0.31 0.3 0.32 1.0 0.83 0.42 0.22 0.11
Mp8g13180.1 (LHCA2)
0.52 0.42 0.03 0.46 0.18 0.31 0.44 0.48 0.02 0.19 0.26 0.3 0.3 0.01 0.42 0.42 0.52 0.23 0.01 0.17 0.32 0.01 0.21 0.01 0.33 0.41 0.8 1.0 0.8 0.62 0.44 0.41
Mp8g16460.1 (PTAC16)
0.62 0.28 0.33 0.5 0.49 0.55 0.44 0.71 0.24 0.27 0.29 0.2 0.27 0.35 0.43 0.45 0.53 0.54 0.31 0.43 0.42 0.26 0.41 0.34 0.49 0.47 0.96 1.0 0.76 0.73 0.76 0.77
Mp8g17330.1 (ACP4)
0.65 0.55 0.27 0.44 0.38 0.55 0.58 0.62 0.49 0.45 0.61 0.53 0.55 0.27 0.51 0.43 0.51 0.5 0.24 0.47 0.59 0.27 0.4 0.27 0.56 0.69 0.8 1.0 0.87 0.77 0.67 0.56

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)