Heatmap: Cluster_99 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.35 1.0 0.0 0.65 0.77 0.13 0.98 0.16 0.04 0.78 0.52 0.18 0.52 0.0 0.04 0.08 0.03 0.12 0.0 0.17 0.17 0.0 0.18 0.0 0.06 0.04 0.62 0.08 0.05 0.02 0.03 0.04
Mp1g07680.1 (CYP81D4)
0.68 0.24 0.06 0.32 0.43 0.12 1.0 0.14 0.11 0.36 0.07 0.15 0.1 0.06 0.06 0.3 0.06 0.06 0.03 0.07 0.15 0.07 0.07 0.02 0.07 0.04 0.27 0.11 0.09 0.1 0.09 0.06
Mp2g00630.1 (MBD9)
0.43 0.23 0.23 0.5 0.45 0.36 1.0 0.5 0.34 0.26 0.21 0.29 0.21 0.12 0.48 0.54 0.58 0.46 0.29 0.4 0.54 0.28 0.61 0.32 0.32 0.45 0.5 0.39 0.42 0.42 0.4 0.37
Mp2g14730.1 (NAGK)
0.6 0.29 0.04 0.08 0.12 0.44 1.0 0.38 0.11 0.3 0.14 0.59 0.12 0.02 0.07 0.13 0.08 0.22 0.14 0.12 0.46 0.07 0.56 0.07 0.13 0.71 0.3 0.31 0.33 0.5 0.6 0.31
1.0 0.49 0.11 0.63 0.75 0.59 0.86 0.68 0.79 0.62 0.49 0.33 0.56 0.46 0.33 0.6 0.31 0.46 0.08 0.42 0.61 0.17 0.43 0.09 0.37 0.38 0.47 0.39 0.41 0.39 0.55 0.74
Mp2g20610.1 (PHT3)
0.28 0.2 0.05 0.08 0.12 0.26 0.41 0.22 0.06 0.29 0.21 0.24 0.21 0.0 0.21 0.24 0.19 0.11 0.11 0.14 0.3 0.27 0.28 0.04 0.27 1.0 0.15 0.13 0.14 0.18 0.24 0.1
0.3 0.29 0.0 0.18 0.03 0.23 1.0 0.1 0.05 0.51 0.21 0.92 0.16 0.07 0.21 0.31 0.15 0.04 0.11 0.13 0.34 0.03 0.19 0.0 0.27 0.26 0.16 0.15 0.15 0.25 0.23 0.11
Mp2g24530.1 (PER39)
0.54 0.44 0.01 0.27 0.27 0.32 1.0 0.08 0.0 0.39 0.58 0.66 0.22 0.0 0.11 0.4 0.06 0.01 0.01 0.1 0.61 0.0 0.34 0.01 0.03 0.86 0.44 0.43 0.38 0.42 0.33 0.4
0.43 1.0 0.01 0.13 0.09 0.45 0.53 0.0 0.03 0.62 0.26 0.35 0.1 0.0 0.09 0.23 0.02 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.04 0.0 0.01 0.06 0.1 0.22 0.14 0.16 0.12 0.06
0.43 1.0 0.01 0.13 0.09 0.45 0.53 0.0 0.03 0.62 0.26 0.35 0.1 0.0 0.09 0.23 0.02 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.04 0.0 0.01 0.06 0.1 0.22 0.14 0.16 0.12 0.06
Mp3g10250.1 (TRM14)
0.82 0.58 0.02 0.41 0.54 0.5 1.0 0.11 0.0 0.35 0.71 0.6 0.29 0.0 0.41 0.41 0.13 0.01 0.05 0.23 0.63 0.0 0.52 0.0 0.11 0.92 0.58 0.6 0.45 0.52 0.66 0.55
0.35 0.32 0.01 0.02 0.02 0.28 1.0 0.08 0.04 0.41 0.24 0.79 0.09 0.0 0.01 0.05 0.0 0.01 0.0 0.01 0.32 0.01 0.17 0.0 0.03 0.28 0.1 0.08 0.08 0.11 0.11 0.07
Mp4g00380.1 (ERF7)
0.66 0.37 0.39 0.35 0.38 0.35 1.0 0.39 0.15 0.23 0.27 0.45 0.33 0.42 0.18 0.68 0.36 0.53 0.34 0.27 0.4 0.44 0.71 0.29 0.22 0.61 0.54 0.57 0.44 0.23 0.24 0.28
Mp4g03020.1 (TMP-B)
0.5 0.44 0.0 0.12 0.36 0.62 1.0 0.11 0.0 0.36 0.78 0.95 0.33 0.0 0.16 0.38 0.06 0.03 0.01 0.31 0.71 0.0 0.79 0.0 0.19 0.7 0.52 0.34 0.31 0.4 0.47 0.47
Mp4g07780.1 (NF-YC13)
0.23 0.69 0.13 0.16 0.14 0.17 0.55 0.09 0.27 0.35 0.21 1.0 0.26 0.12 0.05 0.36 0.1 0.25 0.04 0.04 0.07 0.12 0.29 0.03 0.07 0.22 0.13 0.1 0.15 0.3 0.17 0.11
Mp4g19950.1 (SMN2)
0.24 0.1 0.01 0.06 0.01 0.15 1.0 0.2 0.01 0.17 0.01 0.35 0.02 0.02 0.05 0.36 0.03 0.2 0.0 0.03 0.46 0.01 0.32 0.0 0.04 0.67 0.02 0.1 0.07 0.14 0.04 0.04
0.52 0.51 0.0 0.07 0.01 0.4 1.0 0.16 0.0 0.49 0.2 0.66 0.15 0.0 0.02 0.09 0.02 0.03 0.0 0.06 0.43 0.0 0.07 0.0 0.04 0.55 0.19 0.11 0.19 0.4 0.15 0.08
Mp5g00730.1 (GLP5)
0.62 0.45 0.21 0.09 0.37 0.28 0.87 0.1 0.0 0.23 0.05 0.46 0.05 0.0 0.09 0.08 0.01 0.07 0.02 0.08 1.0 0.31 0.39 0.0 0.05 1.0 0.12 0.32 0.18 0.31 0.23 0.39
Mp5g00740.1 (GL22)
0.84 0.97 0.13 0.19 0.37 0.67 0.73 0.14 0.07 0.42 0.15 0.72 0.09 0.01 0.07 0.21 0.06 0.2 0.04 0.28 0.89 0.2 0.51 0.0 0.15 1.0 0.32 0.4 0.23 0.36 0.29 0.35
0.33 0.45 0.0 0.03 0.03 0.25 0.91 0.02 0.0 0.61 0.3 1.0 0.02 0.0 0.04 0.08 0.01 0.03 0.0 0.02 0.26 0.01 0.14 0.0 0.02 0.35 0.11 0.15 0.2 0.22 0.12 0.07
Mp5g00760.1 (MPK8)
0.21 0.42 0.01 0.01 0.01 0.2 0.81 0.01 0.0 0.4 0.15 1.0 0.01 0.0 0.03 0.07 0.02 0.0 0.0 0.02 0.17 0.03 0.07 0.0 0.02 0.19 0.09 0.08 0.13 0.14 0.05 0.05
Mp5g00870.1 (GER1)
0.54 1.0 0.16 0.72 0.31 0.24 0.4 0.38 0.2 0.92 0.59 0.09 0.59 0.18 0.41 0.52 0.54 0.23 0.21 0.13 0.38 0.2 0.07 0.26 0.22 0.19 0.5 0.28 0.22 0.32 0.23 0.22
0.56 1.0 0.15 0.22 0.39 0.36 0.4 0.15 0.28 0.5 0.33 0.62 0.38 0.01 0.03 0.12 0.06 0.1 0.07 0.3 0.56 0.16 0.37 0.03 0.1 0.59 0.3 0.5 0.31 0.26 0.35 0.36
Mp5g02270.1 (KMD4)
0.52 0.17 0.05 0.13 0.09 0.38 1.0 0.39 0.05 0.24 0.16 0.47 0.16 0.02 0.13 0.18 0.17 0.14 0.06 0.06 0.59 0.05 0.46 0.04 0.32 0.59 0.21 0.23 0.22 0.3 0.24 0.2
0.58 0.5 0.05 0.37 0.18 0.36 1.0 0.01 0.03 0.54 0.37 0.64 0.01 0.01 0.13 0.43 0.0 0.07 0.04 0.1 0.41 0.03 0.37 0.01 0.0 0.3 0.26 0.19 0.12 0.19 0.1 0.11
0.86 0.49 0.01 0.26 0.17 0.34 1.0 0.31 0.01 0.36 0.27 0.66 0.25 0.0 0.15 0.27 0.21 0.19 0.0 0.1 0.49 0.0 0.42 0.0 0.17 0.98 0.25 0.34 0.41 0.16 0.07 0.12
Mp5g05540.1 (GAE2)
0.68 0.63 0.06 0.29 0.35 0.69 0.92 0.35 0.01 0.43 0.27 0.62 0.31 0.01 0.09 0.28 0.13 0.31 0.03 0.48 0.96 0.07 0.64 0.0 0.36 1.0 0.47 0.36 0.35 0.39 0.37 0.41
0.65 0.61 0.24 0.51 0.45 0.93 0.99 0.3 0.29 0.53 1.0 0.79 0.42 0.41 0.59 0.71 0.5 0.17 0.41 0.45 0.79 0.34 0.62 0.35 0.37 0.97 0.72 0.68 0.6 0.63 0.61 0.56
Mp5g09160.1 (RAF36)
0.22 0.41 0.02 0.03 0.15 0.19 0.97 0.24 0.01 0.69 0.24 0.25 0.47 0.01 0.01 0.13 0.08 0.22 0.02 0.24 0.18 0.0 0.12 0.02 0.12 1.0 0.04 0.17 0.16 0.02 0.02 0.0
0.55 1.0 0.02 0.02 0.09 0.36 0.44 0.25 0.11 0.44 0.24 0.85 0.48 0.04 0.05 0.21 0.06 0.2 0.0 0.05 0.68 0.02 0.07 0.0 0.11 0.77 0.22 0.07 0.25 0.11 0.0 0.04
Mp5g13680.1 (GOXL2)
0.39 0.28 0.02 0.18 0.01 0.17 1.0 0.17 0.02 0.02 0.08 0.33 0.06 0.0 0.13 0.13 0.08 0.13 0.0 0.05 0.48 0.02 0.32 0.02 0.22 0.71 0.3 0.13 0.14 0.07 0.05 0.04
0.32 0.26 0.0 0.16 0.19 0.73 0.89 0.03 0.0 0.48 1.0 0.52 0.22 0.04 0.17 0.24 0.06 0.0 0.0 0.14 0.81 0.02 0.33 0.0 0.06 0.66 0.61 0.66 0.39 0.47 0.4 0.2
0.63 0.8 0.0 0.1 0.13 0.05 1.0 0.03 0.0 0.95 0.07 0.77 0.04 0.0 0.02 0.12 0.03 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.05 0.0 0.01 0.04 0.05 0.02 0.13 0.04 0.03 0.03
0.64 0.34 0.55 0.64 0.62 0.47 1.0 0.48 0.65 0.45 0.38 0.5 0.37 0.36 0.49 0.8 0.61 0.56 0.41 0.44 0.56 0.46 0.7 0.44 0.42 0.66 0.52 0.51 0.43 0.38 0.47 0.61
Mp5g24320.1 (BLH3)
0.36 0.2 0.0 0.02 0.09 0.28 1.0 0.32 0.0 0.22 0.32 0.3 0.16 0.02 0.02 0.34 0.01 0.03 0.01 0.06 0.56 0.01 0.19 0.0 0.14 0.16 0.34 0.21 0.12 0.11 0.02 0.01
Mp5g24330.1 (BLH3)
0.57 0.27 0.02 0.08 0.14 0.41 1.0 0.43 0.05 0.21 0.39 0.28 0.26 0.03 0.07 0.26 0.06 0.07 0.03 0.13 0.55 0.04 0.18 0.01 0.23 0.29 0.54 0.39 0.3 0.19 0.07 0.06
1.0 0.3 0.11 0.82 0.86 0.59 0.83 0.72 0.68 0.49 0.45 0.2 0.41 0.35 0.46 0.39 0.5 0.68 0.05 0.55 0.62 0.1 0.56 0.12 0.51 0.44 0.75 0.7 0.6 0.24 0.45 0.55
Mp6g04600.1 (LOX6)
1.0 0.76 0.0 0.06 0.01 0.03 0.93 0.02 0.01 0.59 0.01 0.76 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.02 0.35 0.28 0.3 0.02 0.01
Mp6g04610.1 (LOX6)
1.0 0.76 0.0 0.06 0.01 0.03 0.93 0.02 0.01 0.59 0.01 0.76 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.02 0.35 0.28 0.3 0.02 0.01
Mp6g12320.1 (RD21B)
0.78 0.64 0.23 0.54 0.64 0.4 0.86 0.19 0.2 0.72 0.18 0.49 0.28 0.0 0.06 0.61 0.28 0.18 0.09 0.27 0.92 0.3 0.6 0.02 0.09 1.0 0.52 0.4 0.44 0.45 0.55 0.57
0.59 0.33 0.12 0.22 0.09 0.38 0.36 0.12 0.0 1.0 0.06 0.22 0.12 0.0 0.0 0.25 0.0 0.2 0.03 0.11 0.22 0.12 0.44 0.03 0.03 0.6 0.15 0.18 0.07 0.14 0.15 0.25
Mp6g15460.1 (MyoB2)
1.0 0.86 0.33 0.69 0.75 0.53 0.75 0.48 0.31 0.72 0.37 0.84 0.38 0.38 0.41 0.57 0.43 0.38 0.24 0.39 0.41 0.38 0.66 0.19 0.29 0.51 0.52 0.71 0.7 0.69 0.73 0.72
Mp6g17350.1 (SEOa)
0.69 0.49 0.09 0.19 0.2 0.52 0.86 0.48 0.08 0.33 0.26 0.38 0.43 0.01 0.08 0.25 0.21 0.37 0.07 0.43 0.69 0.05 0.63 0.02 0.29 1.0 0.57 0.53 0.38 0.31 0.2 0.14
Mp6g19870.1 (Nug2)
0.91 0.74 0.6 0.83 0.95 0.85 0.77 0.84 0.89 1.0 0.76 0.71 0.69 0.97 0.81 0.83 0.79 0.83 0.73 0.75 0.77 0.63 0.94 0.63 0.75 0.76 0.8 0.84 0.9 0.79 0.87 0.87
Mp7g01250.1 (ASPG1)
0.55 0.61 0.01 0.43 0.07 0.17 1.0 0.26 0.0 0.16 0.12 0.66 0.26 0.0 0.36 0.55 0.47 0.33 0.01 0.19 0.47 0.01 0.42 0.01 0.47 0.92 0.26 0.25 0.24 0.08 0.05 0.03
Mp7g01390.1 (PRCE3)
0.51 0.37 0.02 0.11 0.36 0.8 0.88 0.36 0.02 0.66 0.67 0.53 0.52 0.03 0.34 0.13 0.12 0.38 0.04 0.62 0.96 0.03 0.39 0.01 0.74 1.0 0.5 0.38 0.47 0.51 0.44 0.55
Mp7g04460.1 (CYP710A4)
0.65 0.8 0.02 0.35 0.32 0.52 1.0 0.17 0.0 0.33 0.31 0.65 0.37 0.0 0.03 0.29 0.08 0.19 0.0 0.27 1.0 0.0 0.54 0.0 0.1 0.92 0.38 0.32 0.25 0.19 0.13 0.18
0.33 0.24 0.0 0.03 0.21 0.5 0.83 0.19 0.0 0.18 0.72 0.55 0.21 0.0 0.1 0.1 0.02 0.01 0.02 0.21 0.88 0.0 0.45 0.01 0.3 1.0 0.38 0.34 0.26 0.31 0.42 0.32
1.0 0.68 0.66 0.88 1.0 0.64 0.74 0.69 0.89 0.55 0.65 0.53 0.73 0.7 0.55 0.64 0.64 0.75 0.57 0.62 0.58 0.72 0.97 0.53 0.5 0.81 0.81 0.98 0.87 0.55 0.7 0.73
Mp8g00960.1 (FRG1)
0.78 0.38 0.01 0.89 1.0 0.19 0.54 0.2 0.01 0.33 0.08 0.43 0.15 0.02 0.09 0.5 0.14 0.25 0.0 0.18 0.17 0.0 0.79 0.0 0.03 0.21 0.33 0.23 0.18 0.19 0.19 0.34
0.65 0.13 0.0 0.39 0.13 0.17 1.0 0.28 0.0 0.11 0.05 0.13 0.03 0.0 0.11 0.2 0.23 0.08 0.0 0.07 0.33 0.02 0.4 0.0 0.03 0.58 0.0 0.03 0.05 0.01 0.01 0.0
Mp8g04800.1 (NRT2)
0.35 0.31 0.0 0.07 0.04 0.39 1.0 0.09 0.02 0.55 0.18 0.65 0.13 0.01 0.08 0.26 0.05 0.07 0.01 0.09 0.54 0.01 0.2 0.0 0.17 0.36 0.29 0.2 0.21 0.38 0.24 0.15
Mp8g05340.1 (SMP1)
1.0 0.62 0.21 0.74 0.27 0.49 0.88 0.16 0.1 0.44 0.42 0.73 0.14 0.08 0.27 0.69 0.25 0.08 0.08 0.25 0.47 0.21 0.25 0.05 0.22 0.63 0.37 0.42 0.49 0.54 0.56 0.52
0.15 0.27 0.04 0.02 0.11 0.08 1.0 0.0 0.0 0.67 0.59 0.01 0.43 0.0 0.0 0.25 0.0 0.01 0.0 0.03 0.13 0.01 0.0 0.0 0.05 0.04 0.25 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0
Mp8g10590.1 (POK1)
0.57 0.16 0.28 0.23 0.07 0.17 0.48 0.15 0.11 0.7 0.2 0.35 0.12 0.22 0.14 0.15 0.2 0.05 0.11 0.04 0.43 0.2 0.26 0.12 0.18 1.0 0.27 0.28 0.33 0.31 0.21 0.23
Mpzg00290.1 (PLAT3)
0.8 0.83 0.02 0.26 0.26 0.48 1.0 0.02 0.02 0.71 0.4 0.83 0.13 0.01 0.25 0.36 0.01 0.03 0.04 0.09 0.38 0.01 0.24 0.0 0.03 0.49 0.33 0.2 0.07 0.13 0.27 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)