Heatmap: Cluster_99 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
98.1 281.48 0.72 182.62 217.58 37.33 274.47 45.4 10.58 220.12 146.12 49.47 147.07 1.14 12.6 23.11 7.07 34.47 0.16 47.16 48.57 0.62 51.66 0.34 17.61 11.83 175.24 21.46 15.01 5.03 8.33 11.08
Mp1g07680.1 (CYP81D4)
39.38 13.83 3.73 18.6 25.18 6.92 58.24 8.4 6.37 21.2 4.22 8.88 5.6 3.6 3.43 17.32 3.43 3.38 2.02 4.25 8.85 3.96 4.0 1.21 3.99 2.51 15.81 6.59 5.34 5.63 5.1 3.5
Mp2g00630.1 (MBD9)
4.7 2.51 2.57 5.47 4.94 3.95 10.99 5.53 3.79 2.83 2.26 3.16 2.26 1.29 5.23 5.92 6.36 5.07 3.18 4.38 5.9 3.09 6.69 3.47 3.53 4.97 5.51 4.33 4.57 4.62 4.38 4.08
Mp2g14730.1 (NAGK)
2.58 1.25 0.18 0.34 0.52 1.88 4.3 1.63 0.48 1.29 0.59 2.55 0.53 0.08 0.3 0.56 0.32 0.94 0.6 0.52 1.97 0.3 2.41 0.31 0.55 3.04 1.29 1.33 1.42 2.16 2.58 1.32
23.18 11.32 2.53 14.71 17.37 13.66 19.94 15.75 18.37 14.32 11.43 7.56 13.06 10.75 7.71 13.99 7.12 10.75 1.85 9.77 14.05 4.0 10.04 2.01 8.5 8.77 10.97 9.01 9.47 9.08 12.66 17.04
Mp2g20610.1 (PHT3)
0.47 0.33 0.08 0.14 0.2 0.42 0.68 0.37 0.1 0.47 0.35 0.39 0.34 0.0 0.34 0.39 0.31 0.18 0.18 0.23 0.5 0.44 0.45 0.07 0.45 1.64 0.24 0.22 0.23 0.29 0.4 0.16
0.3 0.29 0.0 0.18 0.03 0.23 1.0 0.1 0.05 0.51 0.21 0.91 0.16 0.07 0.21 0.31 0.15 0.04 0.11 0.13 0.34 0.03 0.19 0.0 0.27 0.26 0.16 0.15 0.15 0.24 0.23 0.11
Mp2g24530.1 (PER39)
1.78 1.47 0.03 0.89 0.91 1.08 3.32 0.27 0.01 1.29 1.91 2.19 0.72 0.0 0.37 1.31 0.21 0.03 0.02 0.35 2.04 0.01 1.12 0.02 0.08 2.85 1.48 1.43 1.26 1.39 1.11 1.32
0.08 0.18 0.0 0.02 0.02 0.08 0.09 0.0 0.01 0.11 0.05 0.06 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.02 0.03 0.02 0.01
0.08 0.18 0.0 0.02 0.02 0.08 0.09 0.0 0.01 0.11 0.05 0.06 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.02 0.03 0.02 0.01
Mp3g10250.1 (TRM14)
4.16 2.95 0.08 2.06 2.73 2.53 5.08 0.58 0.0 1.8 3.61 3.03 1.45 0.02 2.07 2.08 0.65 0.07 0.25 1.15 3.2 0.02 2.67 0.01 0.58 4.66 2.96 3.04 2.28 2.63 3.37 2.8
5.69 5.12 0.21 0.24 0.26 4.59 16.13 1.34 0.63 6.57 3.94 12.67 1.45 0.0 0.24 0.84 0.01 0.1 0.04 0.23 5.09 0.1 2.8 0.0 0.46 4.58 1.55 1.36 1.28 1.72 1.85 1.19
Mp4g00380.1 (ERF7)
1.19 0.67 0.71 0.64 0.7 0.63 1.81 0.7 0.27 0.42 0.49 0.81 0.6 0.77 0.32 1.22 0.66 0.97 0.61 0.48 0.72 0.8 1.28 0.53 0.41 1.1 0.99 1.03 0.8 0.41 0.44 0.51
Mp4g03020.1 (TMP-B)
1.11 0.98 0.0 0.26 0.8 1.36 2.21 0.23 0.0 0.79 1.73 2.11 0.72 0.0 0.35 0.84 0.14 0.07 0.03 0.69 1.56 0.0 1.74 0.0 0.43 1.55 1.14 0.75 0.68 0.88 1.04 1.03
Mp4g07780.1 (NF-YC13)
0.15 0.44 0.08 0.1 0.09 0.11 0.35 0.05 0.18 0.23 0.14 0.64 0.17 0.07 0.03 0.23 0.06 0.16 0.03 0.03 0.05 0.07 0.18 0.02 0.04 0.14 0.08 0.06 0.1 0.19 0.11 0.07
Mp4g19950.1 (SMN2)
0.9 0.36 0.03 0.23 0.05 0.56 3.71 0.73 0.04 0.62 0.04 1.31 0.09 0.08 0.19 1.34 0.12 0.74 0.0 0.09 1.71 0.04 1.18 0.0 0.15 2.49 0.07 0.36 0.27 0.51 0.16 0.16
19.34 18.85 0.04 2.56 0.42 14.86 37.13 6.08 0.03 18.14 7.47 24.4 5.49 0.0 0.75 3.32 0.76 1.04 0.0 2.06 16.0 0.0 2.6 0.02 1.65 20.53 6.93 3.99 7.05 14.92 5.66 3.07
Mp5g00730.1 (GLP5)
0.55 0.4 0.19 0.08 0.33 0.24 0.77 0.08 0.0 0.2 0.05 0.4 0.05 0.0 0.08 0.07 0.01 0.06 0.01 0.07 0.88 0.27 0.34 0.0 0.04 0.88 0.1 0.28 0.16 0.27 0.2 0.34
Mp5g00740.1 (GL22)
1.7 1.95 0.26 0.38 0.74 1.35 1.47 0.29 0.13 0.84 0.3 1.46 0.18 0.02 0.14 0.42 0.11 0.41 0.08 0.56 1.8 0.4 1.04 0.0 0.3 2.02 0.64 0.8 0.46 0.73 0.59 0.72
3.24 4.45 0.04 0.34 0.28 2.43 8.9 0.18 0.0 6.01 2.94 9.82 0.19 0.0 0.4 0.77 0.11 0.33 0.04 0.24 2.52 0.05 1.39 0.01 0.18 3.39 1.05 1.51 1.95 2.16 1.13 0.65
Mp5g00760.1 (MPK8)
2.92 5.93 0.09 0.18 0.18 2.78 11.26 0.2 0.05 5.52 2.04 13.96 0.11 0.02 0.37 0.94 0.24 0.05 0.02 0.29 2.41 0.38 0.99 0.0 0.3 2.7 1.25 1.07 1.76 1.91 0.69 0.65
Mp5g00870.1 (GER1)
5.19 9.67 1.5 6.99 3.01 2.29 3.87 3.68 1.91 8.93 5.67 0.92 5.7 1.72 3.93 4.98 5.25 2.2 2.0 1.22 3.69 1.96 0.72 2.49 2.15 1.81 4.85 2.68 2.09 3.13 2.19 2.15
0.78 1.4 0.2 0.3 0.54 0.51 0.56 0.21 0.4 0.7 0.46 0.87 0.53 0.01 0.04 0.17 0.09 0.13 0.1 0.42 0.79 0.22 0.51 0.05 0.15 0.83 0.42 0.71 0.44 0.37 0.48 0.51
Mp5g02270.1 (KMD4)
1.64 0.54 0.16 0.39 0.29 1.19 3.14 1.21 0.14 0.75 0.51 1.46 0.5 0.05 0.4 0.57 0.52 0.42 0.18 0.19 1.85 0.14 1.43 0.13 0.99 1.85 0.66 0.71 0.7 0.94 0.76 0.63
2.64 2.28 0.21 1.72 0.84 1.65 4.58 0.03 0.12 2.46 1.68 2.93 0.05 0.04 0.61 1.97 0.02 0.32 0.17 0.45 1.9 0.12 1.71 0.04 0.0 1.39 1.18 0.88 0.56 0.86 0.46 0.5
6.36 3.63 0.05 1.95 1.29 2.55 7.39 2.29 0.05 2.69 2.03 4.87 1.88 0.01 1.13 1.97 1.58 1.38 0.0 0.74 3.61 0.0 3.13 0.0 1.29 7.22 1.82 2.54 3.02 1.21 0.51 0.85
Mp5g05540.1 (GAE2)
4.28 3.94 0.38 1.8 2.19 4.3 5.79 2.2 0.07 2.7 1.7 3.87 1.94 0.07 0.54 1.75 0.8 1.97 0.21 3.03 6.0 0.41 4.02 0.02 2.26 6.27 2.97 2.27 2.17 2.42 2.33 2.56
3.19 2.98 1.17 2.51 2.22 4.58 4.84 1.48 1.41 2.59 4.9 3.89 2.07 2.03 2.91 3.5 2.43 0.81 2.03 2.19 3.89 1.66 3.06 1.71 1.82 4.75 3.51 3.32 2.96 3.11 2.98 2.76
Mp5g09160.1 (RAF36)
0.47 0.9 0.04 0.06 0.33 0.41 2.12 0.54 0.02 1.52 0.54 0.55 1.04 0.03 0.03 0.28 0.17 0.48 0.05 0.52 0.39 0.0 0.27 0.05 0.27 2.2 0.1 0.38 0.35 0.04 0.05 0.0
1.05 1.92 0.04 0.03 0.18 0.7 0.85 0.48 0.2 0.85 0.45 1.62 0.93 0.07 0.09 0.4 0.12 0.39 0.0 0.09 1.29 0.03 0.13 0.0 0.21 1.48 0.41 0.13 0.49 0.2 0.0 0.08
Mp5g13680.1 (GOXL2)
0.32 0.23 0.02 0.14 0.01 0.14 0.82 0.14 0.02 0.02 0.07 0.27 0.05 0.0 0.11 0.11 0.06 0.11 0.0 0.04 0.39 0.02 0.27 0.01 0.18 0.58 0.25 0.1 0.11 0.06 0.04 0.03
0.43 0.35 0.0 0.22 0.26 0.98 1.2 0.05 0.0 0.65 1.35 0.7 0.29 0.05 0.23 0.32 0.09 0.0 0.0 0.19 1.1 0.03 0.44 0.0 0.09 0.89 0.83 0.89 0.53 0.64 0.54 0.27
0.66 0.84 0.0 0.1 0.14 0.05 1.05 0.04 0.0 1.0 0.07 0.82 0.04 0.0 0.02 0.12 0.03 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.06 0.0 0.01 0.05 0.05 0.02 0.14 0.04 0.03 0.03
11.52 6.05 9.86 11.49 11.07 8.44 17.87 8.64 11.64 8.02 6.71 8.96 6.61 6.35 8.73 14.35 10.88 10.0 7.41 7.86 10.07 8.28 12.51 7.78 7.47 11.82 9.33 9.06 7.72 6.82 8.39 10.89
Mp5g24320.1 (BLH3)
14.47 7.92 0.03 0.81 3.42 11.13 40.09 12.73 0.15 8.81 12.66 11.9 6.39 0.86 0.67 13.82 0.39 1.35 0.23 2.5 22.31 0.55 7.77 0.06 5.56 6.43 13.68 8.28 4.98 4.38 0.61 0.56
Mp5g24330.1 (BLH3)
30.12 14.17 1.16 3.95 7.21 21.38 52.45 22.46 2.69 11.0 20.35 14.54 13.67 1.59 3.89 13.45 3.25 3.66 1.34 6.81 28.67 2.22 9.67 0.6 12.19 14.96 28.09 20.51 15.62 9.72 3.56 3.35
36.4 10.98 3.87 29.83 31.19 21.61 30.28 26.33 24.62 17.83 16.42 7.27 15.06 12.58 16.58 14.19 18.1 24.59 1.69 20.03 22.68 3.56 20.32 4.45 18.48 16.07 27.45 25.31 21.83 8.86 16.41 19.89
Mp6g04600.1 (LOX6)
1.13 0.86 0.0 0.07 0.01 0.03 1.05 0.02 0.01 0.67 0.01 0.86 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.06 0.0 0.01 0.0 0.02 0.11 0.02 0.39 0.32 0.34 0.03 0.01
Mp6g04610.1 (LOX6)
1.13 0.86 0.0 0.07 0.01 0.03 1.05 0.02 0.01 0.67 0.01 0.86 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.06 0.0 0.01 0.0 0.02 0.11 0.02 0.39 0.32 0.34 0.03 0.01
Mp6g12320.1 (RD21B)
0.9 0.73 0.27 0.63 0.74 0.46 0.99 0.21 0.23 0.83 0.21 0.56 0.32 0.0 0.07 0.7 0.32 0.21 0.1 0.31 1.06 0.34 0.7 0.03 0.11 1.15 0.6 0.46 0.51 0.52 0.64 0.65
0.1 0.06 0.02 0.04 0.02 0.06 0.06 0.02 0.0 0.17 0.01 0.04 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.02 0.04 0.02 0.07 0.01 0.0 0.1 0.03 0.03 0.01 0.02 0.03 0.04
Mp6g15460.1 (MyoB2)
57.18 49.3 18.84 39.27 43.03 30.42 43.09 27.61 17.49 41.33 21.43 47.82 21.77 21.75 23.18 32.68 24.71 21.57 13.45 22.04 23.34 21.93 37.55 11.11 16.33 29.04 29.69 40.49 40.14 39.24 41.87 41.32
Mp6g17350.1 (SEOa)
0.78 0.55 0.1 0.22 0.22 0.58 0.97 0.54 0.09 0.37 0.29 0.43 0.48 0.01 0.09 0.28 0.24 0.41 0.08 0.48 0.77 0.06 0.7 0.02 0.32 1.12 0.64 0.59 0.42 0.34 0.22 0.16
Mp6g19870.1 (Nug2)
1.79 1.45 1.18 1.63 1.88 1.67 1.52 1.65 1.75 1.97 1.5 1.4 1.35 1.91 1.6 1.64 1.56 1.63 1.44 1.48 1.53 1.24 1.85 1.24 1.48 1.51 1.58 1.66 1.77 1.56 1.72 1.72
Mp7g01250.1 (ASPG1)
0.59 0.64 0.01 0.46 0.08 0.18 1.06 0.28 0.0 0.17 0.12 0.7 0.28 0.0 0.38 0.59 0.49 0.35 0.01 0.21 0.5 0.01 0.45 0.01 0.5 0.98 0.27 0.27 0.26 0.08 0.05 0.03
Mp7g01390.1 (PRCE3)
2.52 1.84 0.08 0.56 1.8 4.0 4.35 1.8 0.12 3.29 3.32 2.62 2.59 0.13 1.68 0.64 0.62 1.91 0.18 3.06 4.75 0.15 1.94 0.06 3.67 4.97 2.48 1.91 2.34 2.54 2.21 2.72
Mp7g04460.1 (CYP710A4)
2.37 2.91 0.06 1.28 1.17 1.91 3.64 0.63 0.01 1.21 1.12 2.36 1.34 0.0 0.13 1.07 0.3 0.7 0.01 0.99 3.65 0.0 1.98 0.01 0.38 3.37 1.37 1.18 0.9 0.7 0.46 0.64
0.5 0.36 0.0 0.05 0.31 0.76 1.25 0.28 0.0 0.27 1.08 0.83 0.32 0.0 0.14 0.15 0.04 0.02 0.03 0.32 1.33 0.0 0.68 0.01 0.46 1.51 0.58 0.52 0.39 0.46 0.63 0.49
22.32 15.22 14.7 19.71 22.33 14.38 16.51 15.52 19.95 12.36 14.59 11.85 16.41 15.73 12.29 14.4 14.34 16.77 12.74 13.77 12.88 16.06 21.66 11.91 11.11 18.1 18.14 21.93 19.47 12.34 15.53 16.25
Mp8g00960.1 (FRG1)
4.77 2.3 0.05 5.43 6.09 1.14 3.27 1.22 0.04 2.03 0.49 2.62 0.93 0.12 0.52 3.03 0.88 1.53 0.0 1.12 1.06 0.0 4.8 0.0 0.16 1.3 2.02 1.39 1.07 1.15 1.15 2.05
19.57 4.05 0.0 11.63 3.78 5.19 30.09 8.38 0.0 3.39 1.49 3.77 1.05 0.0 3.17 5.96 7.07 2.31 0.0 1.97 9.8 0.52 12.07 0.0 1.05 17.38 0.0 0.79 1.43 0.39 0.17 0.0
Mp8g04800.1 (NRT2)
1.69 1.5 0.02 0.34 0.21 1.88 4.83 0.45 0.1 2.66 0.87 3.12 0.65 0.03 0.37 1.26 0.22 0.34 0.06 0.43 2.59 0.05 0.95 0.0 0.82 1.72 1.41 0.96 1.02 1.85 1.17 0.74
Mp8g05340.1 (SMP1)
54.77 33.86 11.39 40.59 14.95 26.91 48.22 8.82 5.62 23.94 23.0 40.02 7.56 4.21 14.9 37.93 13.77 4.53 4.62 13.47 25.59 11.61 13.62 2.88 11.79 34.49 20.5 23.24 27.05 29.65 30.91 28.24
0.08 0.14 0.02 0.01 0.05 0.04 0.5 0.0 0.0 0.34 0.29 0.01 0.22 0.0 0.0 0.12 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.12 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0
Mp8g10590.1 (POK1)
7.12 2.03 3.53 2.91 0.88 2.13 6.11 1.93 1.45 8.8 2.57 4.37 1.5 2.72 1.71 1.88 2.47 0.57 1.35 0.46 5.44 2.47 3.28 1.53 2.27 12.6 3.36 3.59 4.1 3.91 2.65 2.87
Mpzg00290.1 (PLAT3)
5.85 6.09 0.11 1.93 1.89 3.49 7.32 0.18 0.18 5.21 2.9 6.1 0.95 0.08 1.82 2.61 0.09 0.23 0.27 0.66 2.75 0.04 1.73 0.0 0.23 3.57 2.44 1.43 0.54 0.97 1.95 1.13

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)