1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_76 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000248 (MRI)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.43 0.57 0.62 0.0 0.17 0.4 0.0 0.0 0.36 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.21 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.26 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.06 0.17 0.07 0.22 0.08 0.14 0.14 0.19 0.9 0.24 0.02 0.78 0.05 0.05 1.0 0.23 0.07 0.06 0.5 0.63 0.24 0.1 0.36 0.45 0.4 0.44 0.33 0.3 0.27 0.24
Bra005308 (ATL16)
 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.53 0.63 0.18 0.29 0.22 0.0 0.63 0.86 0.1 0.0 0.09 0.36 0.5 0.0 0.31 1.0 0.11 0.67 0.42 0.85 0.39 0.24
Bra005343 (ATL28)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra007075 (LNK2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra008514 (JLO)
 0.34 0.0 0.18 0.22 0.43 0.29 0.38 0.15 0.16 1.0 0.38 0.21 0.24 0.39 0.56 0.39 0.31 0.2 0.25 0.06 0.2 0.33 0.43 0.72 0.52 0.15 0.39 0.32 0.2 0.31 0.39
Bra008648 (RAD23C)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra009049 (ANN6)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.44 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra010093 (BEH4)
 0.0 0.22 0.0 0.44 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 1.0 0.31 0.34 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
Bra010799 (TWD40-2)
 0.26 0.0 0.84 0.2 0.0 0.0 0.0 0.35 0.19 1.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.39 0.0 0.14 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0
0.88 0.49 0.0 1.0 0.0 0.44 0.34 0.0 0.0 0.0 0.19 0.38 0.0 0.0 0.25 0.35 0.08 0.16 0.22 0.0 0.82 0.49 0.44 0.41 0.42 0.48 0.07 0.09 0.0 0.16 0.08
Bra012579 (MYB98)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra012589 (FDM5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.18 0.0 0.49 0.89 0.1 0.0 0.82 0.2 0.0 1.0 0.5 0.37 0.16 0.06 0.29 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0
Bra012893 (UGT72E1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 1.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra013062 (HY2)
 0.0 0.09 0.0 0.54 0.0 0.38 0.07 0.09 0.14 1.0 0.29 0.28 0.0 0.4 0.11 0.0 0.76 0.22 0.36 0.0 0.16 0.61 0.17 0.0 0.27 0.25 0.09 0.48 0.16 0.08 0.32
1.0 0.23 0.5 0.17 0.54 0.42 0.17 0.32 0.09 0.81 0.63 0.48 0.67 0.72 0.18 0.39 0.15 0.43 0.05 0.0 0.09 0.18 0.2 0.54 0.95 0.53 0.14 0.5 0.16 0.3 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra014142 (ASAT1)
 0.0 0.12 0.0 0.0 0.27 0.56 0.45 0.0 0.17 1.0 0.09 0.31 0.0 0.0 0.33 0.2 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.09 0.73 0.09 0.0 0.5 0.0 0.0 0.36 0.0
Bra014668 (DPBF3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra014872 (PFK6)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0
0.59 0.0 0.87 0.0 0.37 0.0 0.33 0.28 0.46 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.94 0.0 0.12 0.54 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.2 0.37 0.8 0.0 0.2 0.0 0.0 0.29 1.0 0.0 0.64 0.22 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.25 0.0
Bra017255 (SAUR45)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0
Bra017885 (ZIG)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.16 0.19 0.41 0.18 0.14 0.36 0.28 0.59 0.84 0.87 0.39 0.79 0.35 0.41 0.8 0.22 0.74 0.33 0.22 1.0 0.07 0.0 0.0 0.14 0.11 0.21 0.11 0.03 0.05 0.03
0.22 0.0 0.0 0.16 0.07 0.26 0.09 0.28 0.02 1.0 0.0 0.05 0.07 0.37 0.14 0.02 0.35 0.02 0.34 0.03 0.23 0.01 0.06 0.07 0.03 0.01 0.03 0.18 0.19 0.23 0.16
0.0 0.13 0.27 0.0 0.33 0.0 0.0 0.12 0.26 1.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.09 0.09 0.1 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra019419 (PA200)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra019844 (ADH)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra020048 (GEF10)
 0.0 0.0 0.21 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.52 0.33 0.38 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2
0.15 0.34 0.06 0.22 0.97 0.4 0.3 0.29 0.23 0.68 1.0 0.54 0.76 0.75 0.73 0.48 0.42 0.57 0.22 0.54 0.11 0.31 0.48 0.0 0.03 0.09 0.38 0.23 0.41 0.0 0.16
Bra020384 (SVL4)
 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.31 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.78 0.75 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.13 0.29
Bra020691 (CIB2)
 0.13 0.39 0.37 0.12 0.11 0.1 0.38 0.39 0.13 0.6 0.19 0.06 0.89 0.0 0.2 1.0 0.68 0.81 0.46 0.31 0.24 0.14 0.15 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.11 0.06 0.16
0.0 0.22 0.49 0.42 0.56 0.0 0.21 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 1.0 0.0 0.11 0.13 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.24 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.31 0.41 0.0 0.3 0.4 0.14 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra025919 (LTPG3)
 0.0 0.22 0.26 0.0 0.0 0.31 0.0 0.16 0.14 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.31 0.28 0.17 0.1 0.0 0.23 1.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 0.83 0.75 0.58 0.2 0.2 0.48 0.49 0.16 0.99 0.61 0.56 1.0 0.23 0.25 0.36 0.4 0.46 0.27 0.64 0.37 0.14 0.44 0.46 0.36 0.44 0.24 0.32 0.53 0.63 0.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.06 0.01 0.02 0.08 0.0 0.0 0.75 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.26 0.43 0.1 1.0 0.91 0.29 0.0 0.09 0.71 0.21 0.4 0.38 0.0 0.29 0.0 0.8 0.4 0.37 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.23 0.1 0.23 0.34 0.23 0.22 0.0
Bra029115 (HCF106)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.25 0.39 0.66 0.77 0.34 0.23 0.48 1.0 0.73 0.34 0.43 0.67 0.44 0.93 0.5 0.37 0.55 0.14 0.28 0.26 0.11 0.58 0.51 0.46 0.0 0.25 0.04 0.2 0.29 0.39
Bra029591 (SINE3)
 0.1 0.28 0.09 0.22 0.31 0.0 0.0 0.0 0.36 1.0 0.52 0.08 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.22 0.0 0.29 0.0 0.08 0.49 0.15 0.37 0.0 0.19 0.09 0.38 0.34
0.61 0.58 0.58 0.36 1.0 0.5 0.47 0.68 0.45 0.48 0.6 0.71 0.96 0.52 0.67 0.86 0.54 0.53 0.54 0.72 0.77 0.58 0.67 0.83 0.83 0.74 0.84 0.85 0.6 0.77 0.7
0.0 0.0 0.23 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.68 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra031311 (UGT71B6)
 0.0 0.99 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.15 0.34 0.18 0.17 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.4 0.16 0.35 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra033219 (FUS5)
 0.01 0.08 0.04 0.18 0.28 0.41 0.49 0.17 0.15 0.72 0.19 0.25 0.29 0.33 1.0 0.96 0.16 0.56 0.07 0.23 0.31 0.0 0.62 0.31 0.17 0.05 0.22 0.2 0.18 0.12 0.19
Bra033798 (PAA2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.79 0.0 0.0 0.1 0.0 0.09 0.0 0.0 0.29 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.52
Bra037269 (GLDP2)
 0.08 0.84 0.04 0.34 0.93 0.07 0.12 0.0 0.0 1.0 0.54 0.12 0.08 0.0 0.22 0.21 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra038187 (MLH1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra038684 (MyoB8)
 0.79 0.87 0.91 0.79 0.91 0.77 0.6 0.68 0.66 0.82 0.84 0.73 1.0 0.69 0.91 0.89 0.77 0.66 0.66 0.69 0.74 0.92 0.86 0.77 0.71 0.84 0.72 0.8 0.58 0.81 0.8

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)