Heatmap: Cluster_53 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.27 -0.27 -1.85 0.09 -0.65 -0.49 0.22 -0.03 -1.56 -1.29 -0.36 0.58 -0.04 1.87 -0.08 0.39 0.25 0.35 -0.97 -0.29 -0.36 -1.21 0.5 -1.08 -0.26 0.51 0.58 0.17 0.04 0.23 -0.21 -0.34
-0.08 -0.25 -0.78 0.5 -1.04 -0.07 -0.26 -0.24 -1.15 -1.01 0.45 0.04 0.13 1.65 0.21 0.54 0.23 -0.75 0.2 -0.52 -0.1 -0.17 -0.51 -0.05 0.01 0.18 -0.52 -0.17 0.15 0.09 0.07 -0.21
Mp1g03770.1 (CYCA3;2)
-2.66 -2.96 - 1.73 -0.2 -1.18 - -3.21 - -0.39 -3.08 -2.11 - 4.23 0.05 1.03 0.26 -3.06 -3.18 -1.28 -2.47 - -1.17 -1.45 - -3.29 -3.24 -3.47 -3.25 -1.93 -2.02 -1.88
0.03 -0.68 0.3 0.25 -0.9 -0.08 -0.1 -0.18 -0.23 -1.67 -0.18 -0.48 -0.15 1.34 0.18 0.25 0.02 -0.53 0.55 -0.26 0.09 0.49 -0.38 0.58 0.03 0.07 -0.3 -0.07 -0.04 -0.16 -0.28 -0.23
Mp1g04480.1 (RLT1)
-0.05 -0.22 -0.6 0.53 -0.65 -0.39 -0.19 -0.44 0.2 -0.59 0.28 0.18 0.03 1.24 0.23 0.63 0.43 -0.17 0.06 -0.36 -0.2 0.0 0.08 -0.04 -0.35 0.08 -0.36 -0.15 -0.01 -0.23 -0.35 -0.53
0.02 -0.49 -0.67 0.29 -0.41 -0.03 0.21 -0.17 -2.23 -2.05 0.06 -0.24 -0.13 1.43 0.01 0.73 0.1 -0.41 -0.08 -0.08 -0.09 -0.26 0.22 -0.18 -0.0 0.31 0.11 0.23 0.09 -0.24 0.15 -0.04
-0.39 -0.55 -0.38 0.37 -0.89 -0.39 0.19 -0.51 -0.24 -0.37 -0.63 0.74 -0.26 1.67 0.19 0.88 0.31 -0.27 0.13 -0.75 -0.39 -0.08 0.01 0.11 -0.5 -0.02 -0.59 -0.49 -0.35 0.02 0.03 -0.03
Mp1g06040.1 (SDG7)
-0.0 -0.25 -0.33 0.42 -1.04 -0.14 -0.0 -0.19 -0.58 -0.89 0.33 0.23 0.08 1.2 0.35 0.68 0.32 -0.19 0.15 -0.28 -0.1 0.22 0.01 -0.28 -0.08 0.13 -0.28 -0.07 -0.03 -0.29 -0.52 -0.71
Mp1g07390.1 (MAS2)
-3.05 -4.72 -2.65 -1.17 -2.57 -2.68 -2.55 -3.17 -3.5 -3.33 -3.82 -5.11 -4.45 4.84 -3.22 -2.57 -3.78 -3.64 -3.15 -3.48 -3.94 -3.09 -3.05 -4.73 -6.09 -3.29 -3.26 -1.82 -2.58 -5.28 -4.88 -7.12
-0.31 -0.49 -0.88 0.46 -0.22 -0.38 -0.58 -0.3 -0.45 -0.6 -0.07 -0.57 -0.12 1.4 0.54 0.3 0.53 0.14 0.44 0.1 -0.22 0.1 0.11 -0.01 0.13 -0.08 -0.26 -0.05 -0.13 -0.21 -0.3 -0.39
-1.01 -0.79 -1.2 1.12 -0.64 -0.97 -0.77 -1.54 -0.99 -0.6 -0.39 -1.09 -0.76 3.32 0.7 1.28 0.47 -0.85 -0.48 -0.67 -0.96 -1.1 -0.49 -0.71 -1.29 -0.95 -1.15 -0.97 -1.32 -0.87 -1.08 -1.57
0.04 0.33 -2.75 0.33 -1.65 -0.13 0.34 0.06 -1.88 -1.32 0.51 0.03 0.68 1.3 0.31 0.79 0.42 0.1 -0.72 -0.63 -0.13 -1.02 -0.44 -1.39 -0.23 0.19 0.2 0.09 0.12 0.16 0.1 -0.07
0.1 -0.37 -0.73 0.33 -0.58 -0.37 -0.14 -0.16 -0.15 -0.59 0.26 -0.17 0.15 0.98 0.24 0.54 0.36 0.14 -0.03 -0.42 -0.1 -0.15 0.08 -0.33 -0.29 0.21 -0.17 -0.09 0.02 0.14 -0.06 0.0
Mp1g13870.1 (MCTP5)
-3.13 - -2.4 0.13 -3.01 - -0.34 -3.05 - 1.65 -3.11 -2.95 - 3.61 1.52 2.42 1.15 - 0.13 -2.3 -1.41 -0.77 -1.2 -2.11 - -3.3 -3.18 - - - -1.76 -2.89
Mp1g16030.1 (BGLU7)
-0.21 0.04 -1.13 0.72 -0.94 0.04 -0.07 -0.21 -1.34 -1.41 0.58 0.4 0.51 1.19 0.72 0.98 0.56 -0.25 -0.61 -0.11 -0.01 -0.68 -0.06 -0.83 0.23 0.19 -0.69 -0.25 0.0 -0.6 -0.48 -0.87
Mp1g20410.1 (WRKY27)
0.03 -0.07 -0.95 0.91 -0.73 -0.23 -0.35 -0.21 -0.02 0.25 0.4 0.12 0.2 0.39 0.63 0.79 0.75 -0.38 -0.46 -0.23 -0.22 -0.63 -0.17 -0.91 -0.06 0.02 -0.23 -0.13 -0.12 0.01 -0.29 -0.4
-0.66 -0.59 -1.83 0.28 -0.87 -0.65 -0.29 -0.71 -0.17 -0.35 -0.08 -0.01 -0.2 2.75 0.16 0.93 0.17 -0.55 0.08 -0.3 -0.39 -0.97 -0.19 -0.93 -0.41 -0.35 -0.1 -0.61 -0.66 -0.69 -0.46 -0.17
Mp1g21830.1 (GSH2)
-1.36 -2.68 -0.37 0.17 -1.15 -2.45 -2.64 -2.51 -1.57 -1.23 -1.96 -1.08 -2.45 3.82 -0.52 0.73 -0.26 -1.68 1.07 -2.13 -2.65 1.06 -1.28 1.06 -2.14 -2.23 -2.49 -2.21 -1.76 -2.37 -1.15 -1.19
-0.24 -0.83 0.06 0.22 -0.93 -0.09 -0.19 -0.23 -0.31 -1.0 -0.12 -0.41 -0.42 1.45 0.27 0.35 0.18 -0.19 0.53 -0.0 0.08 0.36 -0.32 0.17 0.22 0.17 -0.51 -0.43 -0.16 0.03 0.1 -0.29
Mp1g24420.1 (RBL7)
- -0.8 - -1.51 - - -1.27 - -1.4 - - - -1.34 4.39 - - - - 2.6 - -0.69 -0.33 - -0.42 -1.55 - - -1.59 - - - -
Mp1g27090.1 (ZRK13)
-0.15 -0.01 -1.2 0.31 -1.22 0.05 0.49 0.0 -2.15 -1.15 0.41 0.15 0.23 1.45 0.15 0.92 0.03 -0.04 -0.35 0.08 0.07 -0.67 0.16 0.01 0.45 0.29 -0.62 -0.2 -0.13 -0.42 -0.58 -1.09
-1.19 - -0.18 1.13 -3.14 -3.61 -0.92 -2.56 -0.5 - -1.93 -2.29 -1.93 3.67 -1.1 1.84 -0.1 - 0.16 -2.73 -2.86 1.03 -0.99 0.17 -3.73 -1.76 -2.68 -1.19 -0.85 -2.8 -0.38 -0.04
Mp2g00250.1 (NDHF)
-2.95 -0.36 -2.61 0.09 -0.57 -1.89 -0.64 -2.8 -2.89 0.48 -1.42 -2.96 -3.07 3.93 -0.62 0.91 -0.89 -0.24 0.98 -0.81 -1.75 - -0.06 0.33 -2.13 -0.32 -1.96 - -1.87 - - -2.76
Mp2g00300.1 (PLIM2c)
-3.73 -0.99 -3.43 0.48 - - -1.46 - 0.14 -0.12 -3.82 -0.68 -3.9 4.02 0.21 2.24 -0.33 -2.28 0.39 -2.99 -2.52 -0.66 -0.86 -1.29 - -2.89 -3.84 -2.67 - - -3.61 -3.53
-0.27 -0.41 -0.91 0.59 -0.8 -0.03 0.07 -0.31 -1.54 -1.38 -0.08 -0.5 -0.3 2.18 0.25 0.77 0.35 -0.4 -0.19 0.03 0.01 -0.71 0.04 -0.72 0.1 -0.03 0.13 -0.01 -0.06 -0.44 -0.41 -0.73
-0.88 -4.96 -2.13 -1.91 -1.69 -2.59 -0.74 -1.95 -1.75 -4.25 -3.75 -1.86 -6.3 4.41 -1.15 -1.1 -1.88 1.05 -1.0 -1.38 -2.74 -0.89 -1.91 -1.99 -4.15 -3.63 -3.33 -4.01 -4.54 -2.19 -0.74 0.18
-2.44 -2.17 0.27 -0.01 -0.52 -4.74 -3.7 -4.66 0.82 -1.07 -2.21 -4.79 -3.82 3.73 0.22 -0.7 -1.01 1.49 0.98 -1.07 - 0.31 -3.31 0.94 -5.07 -4.94 -2.32 -4.7 - -2.04 -0.75 -0.44
Mp2g02390.1 (RECQSIM)
-0.11 -0.67 -0.33 0.3 -0.1 -0.11 -0.01 -0.17 -0.35 -0.74 0.15 -0.45 -0.13 0.91 0.27 0.63 0.34 0.02 0.26 -0.19 -0.06 0.05 0.15 0.14 -0.23 -0.02 -0.14 0.0 0.02 -0.19 -0.18 -0.27
Mp2g08790.1 (REM1)
-0.15 0.06 -0.67 0.38 -0.96 -0.02 0.47 -0.08 -0.5 -0.86 0.25 0.34 0.1 1.18 0.23 0.97 0.16 -0.63 -0.64 -0.3 0.13 -0.28 -0.16 -0.52 0.21 0.24 -0.38 0.05 0.24 -0.46 -0.4 -0.78
-0.29 -0.44 -0.53 0.09 -0.44 -0.17 0.47 -0.3 -0.22 -0.05 -0.12 0.22 -0.23 1.71 -0.0 0.9 -0.01 -0.15 0.12 -0.15 -0.25 0.06 0.19 -0.36 -0.36 -0.18 -0.53 -0.3 -0.2 -0.27 -0.41 -0.6
-0.86 -0.28 -1.18 0.8 -0.78 0.04 -0.12 -0.66 -0.45 -1.13 0.39 0.27 0.26 1.81 0.11 0.63 0.37 -0.36 0.43 0.24 0.34 -0.16 0.27 0.37 0.12 0.06 -1.07 -0.81 -0.86 -1.22 -1.02 -1.59
Mp2g17140.1 (EB1B)
-0.19 -0.56 -0.84 0.5 -0.29 -0.23 0.25 -0.36 -0.74 -0.83 0.17 -0.08 0.02 1.02 0.58 0.85 0.67 -0.15 -0.27 -0.12 0.05 -0.23 0.41 -0.55 -0.07 0.2 -0.22 -0.26 -0.11 -0.33 -0.19 -0.45
Mp2g18950.1 (UVR7)
-0.74 -1.53 -0.59 0.7 -0.39 -0.83 0.12 -0.86 -0.83 -0.81 -1.11 -0.34 -1.14 2.66 0.5 1.13 0.54 -0.4 0.02 -0.48 -0.38 -0.08 0.38 -0.26 -0.95 -0.26 -0.65 -0.55 -0.57 -0.8 -0.45 -0.77
Mp2g22520.1 (MRG1)
-0.41 -0.82 -0.67 0.46 -0.34 -0.36 -0.35 -0.42 -0.08 -0.47 0.19 0.08 0.11 1.21 0.67 0.68 0.6 0.06 0.13 -0.03 0.03 -0.05 0.3 0.08 -0.12 0.13 -0.64 -0.48 -0.45 -0.53 -0.51 -0.48
-0.08 -0.01 -2.01 0.74 -2.0 0.12 0.28 -0.15 -1.59 -1.6 0.55 0.22 0.29 1.2 0.75 1.04 0.63 -0.51 -1.62 -0.09 0.15 -1.39 -0.25 -1.73 0.25 0.36 -0.12 0.25 0.36 -0.12 -0.55 -0.9
Mp3g02470.1 (PILS1)
-1.95 -1.71 -3.4 0.87 -0.6 -1.79 -0.38 -0.91 -2.22 -0.51 -2.56 -1.18 -2.34 3.72 1.01 2.04 1.02 -0.63 -2.6 -1.2 -1.51 -2.67 -0.32 -2.54 -2.09 -1.47 -1.94 -2.11 -2.5 -3.53 -4.1 -3.83
Mp3g02550.1 (INDL)
-2.22 -1.4 -0.19 -1.34 -2.72 -3.11 -3.51 -2.83 0.56 -1.75 -1.4 -1.85 -1.45 4.35 -1.96 -1.15 -2.1 -3.26 0.61 -3.51 -3.96 0.2 -3.2 0.4 -3.88 -3.32 -3.07 -2.59 -2.69 -2.31 -2.95 -2.75
-0.97 -4.16 -0.9 0.15 -0.5 -0.45 0.93 -0.49 -1.95 -0.95 -3.21 -0.47 -1.8 2.97 0.17 1.81 -0.09 -0.4 -0.83 -0.53 0.34 -1.4 0.73 0.52 -1.27 -0.08 -2.27 -1.63 -1.51 -1.19 -1.1 -0.97
Mp3g08270.1 (MCM8)
-0.29 -1.92 -0.34 1.04 0.09 -0.28 -0.34 -0.39 -1.59 -1.47 -1.13 -1.71 -1.58 1.7 0.62 1.01 0.6 -0.08 0.46 0.31 -0.26 -0.12 0.19 0.38 0.07 0.01 -0.48 -0.4 -0.28 -0.17 -0.28 -0.5
-0.13 -0.39 -0.45 0.66 -1.01 0.01 0.04 -0.18 -0.65 -1.24 0.31 -0.02 0.05 1.03 0.51 0.99 0.66 -0.39 -0.43 -0.32 -0.01 -0.28 0.02 -0.35 0.06 0.27 -0.63 -0.28 0.12 -0.13 -0.24 -0.42
Mp3g11320.1 (RPS6)
-0.16 -0.94 0.18 0.54 -0.1 -0.07 -0.33 -0.16 -0.84 -1.2 -0.4 -1.02 -0.6 1.61 0.31 0.34 0.32 -0.03 0.54 0.07 -0.25 0.42 0.16 0.14 -0.16 -0.09 -0.33 -0.11 -0.09 -0.45 -0.26 -0.37
Mp3g14370.1 (EXOVL)
-0.58 -1.15 -0.55 0.38 -0.61 -0.53 0.29 -0.79 -1.07 -0.93 -0.73 -0.41 -0.85 2.58 0.39 0.99 0.19 0.02 0.37 -0.08 -0.4 0.2 0.07 -0.18 -0.38 -0.22 -0.94 -0.82 -0.58 -0.66 -0.42 -0.81
Mp3g14730.1 (CLC1)
-0.33 -1.5 -1.05 0.04 -0.39 -0.61 -0.3 -0.83 -1.67 -0.71 -1.66 -1.21 -1.61 3.06 -0.19 0.71 -0.0 -1.11 0.28 -1.09 -0.68 -0.25 -0.18 0.16 -1.0 -0.41 -1.57 -0.75 -0.51 0.26 0.37 0.77
Mp3g15870.1 (PIA1)
-0.54 -1.87 -1.32 0.91 -1.49 -0.59 0.7 -0.89 -2.5 -0.47 -0.94 -0.52 -1.12 2.69 0.39 1.19 0.71 -0.88 -0.52 -0.74 -0.3 -0.41 0.22 -1.5 -0.73 -0.09 -0.28 -0.13 -0.29 -0.47 -0.35 -0.34
Mp3g16750.1 (JHS1)
0.02 -1.0 0.09 0.76 -0.37 -0.23 -0.21 -0.11 -0.87 -0.97 -0.39 -0.89 -0.63 1.52 0.37 0.74 0.46 -0.35 0.25 -0.27 -0.23 0.21 -0.04 0.38 -0.17 -0.07 -0.25 0.03 0.04 -0.27 -0.34 -0.59
0.05 -0.26 -2.08 0.21 -2.37 0.19 0.32 0.0 -0.15 -1.12 0.54 -0.0 0.57 1.8 0.1 0.61 0.14 -0.65 -1.67 -0.13 0.19 -1.62 -0.47 -1.58 0.52 0.47 0.15 0.38 0.09 -0.43 -0.53 -0.89
0.03 -0.0 -1.71 0.73 -1.8 -0.07 0.08 -0.26 0.34 0.18 0.73 0.17 0.19 1.22 0.72 0.94 0.59 -0.77 -1.38 -0.52 0.0 -1.86 -0.72 -1.62 -0.05 0.13 -0.38 0.09 -0.02 -0.02 -0.16 -0.93
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Mp5g06430.1 (SMC3)
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Mp6g06120.1 (CHR11)
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Mp6g16910.1 (CCMFC)
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Mp6g20220.1 (CDC45)
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Mp7g00070.1 (CuAO1)
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Mp7g03960.1 (ICU2)
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Mp7g07110.1 (CYP705A12)
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Mp7g07280.1 (RTEL1)
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Mp7g11060.1 (CYL2)
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Mp7g17230.1 (PrimPol)
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Mp7g17330.1 (ATL85)
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Mp7g17480.1 (EMB2813)
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Mp7g17630.1 (LIG6)
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0.02 -0.32 -0.47 0.46 -1.57 0.02 -0.05 -0.13 -0.45 -0.28 0.38 -0.02 0.12 0.76 0.28 0.63 0.4 -0.65 -0.25 -0.37 -0.07 -0.24 -0.41 -0.41 0.28 0.19 -0.38 0.06 0.27 0.29 0.06 -0.05
Mp7g19290.1 (SRS2)
-0.01 -2.07 -0.29 1.0 -0.32 -0.28 -0.31 -0.29 -2.67 -2.1 -1.59 -1.92 -1.82 1.79 0.66 1.03 0.86 0.01 0.35 -0.16 -0.26 0.06 0.09 0.12 -0.26 0.08 -0.4 0.03 0.02 -0.15 -0.15 -0.24
-0.61 -1.55 -1.06 1.07 -0.67 -0.36 -0.21 -1.34 -2.22 0.25 -1.17 -0.54 -3.03 2.94 1.03 1.56 1.23 -0.02 -1.41 0.55 -0.91 -1.72 -0.24 -0.6 -0.46 -0.5 -1.45 -1.93 -1.71 -2.83 -2.13 -2.25
Mp8g08250.1 (TES1)
0.24 0.27 -0.98 1.15 -0.88 0.45 0.07 -0.55 -2.26 -0.12 0.6 -0.03 -0.06 0.75 0.35 0.98 0.13 -1.18 -0.23 -0.61 0.08 -1.49 -0.34 -1.59 -0.44 0.28 0.37 0.16 -0.12 -0.17 0.21 -0.27
Mp8g09180.1 (DGK3)
-2.1 -4.28 -0.54 1.14 -0.36 -1.11 -1.13 -1.84 -1.86 1.25 -1.51 -2.08 -4.47 3.22 1.14 1.03 1.56 -1.75 0.25 -1.65 -1.78 -0.94 0.18 0.6 -2.35 -1.05 -1.26 -1.61 -2.88 - -2.57 -4.13
Mp8g11430.1 (JHS1)
-1.39 -3.88 -2.23 1.19 -0.91 -1.72 -1.95 -1.79 -5.23 -5.43 -3.41 -5.37 -3.75 3.47 0.72 2.05 1.12 -0.4 0.73 0.02 -2.22 -0.65 0.44 -0.65 -0.96 -1.18 -1.91 -2.29 -1.36 -4.16 -3.74 -2.75
Mp8g12760.1 (TINY2)
-0.96 -0.52 -1.15 0.52 0.5 0.15 -1.1 -0.51 -1.24 -0.0 -0.27 0.47 -0.31 2.6 -0.02 1.2 0.43 0.25 -1.24 0.15 -0.49 -1.1 1.03 -2.09 -0.71 -0.31 -0.83 -1.51 -2.49 -1.3 -0.94 -1.12
Mp8g13900.1 (CTF18)
-1.49 -0.57 -0.14 -1.18 0.18 -1.11 -1.62 -1.56 0.65 1.22 -0.74 -1.56 -0.75 3.71 -2.59 -1.0 -2.9 -3.45 1.49 -0.52 -2.6 0.56 -1.9 -1.71 -1.78 -2.12 -4.39 -2.19 -1.93 -0.84 -1.21 -2.14
-2.11 -1.58 -0.45 -0.73 0.48 -1.69 -3.12 -3.81 -0.09 0.52 -1.35 -3.14 -1.24 4.05 -1.44 -0.99 -1.86 -2.34 1.33 -0.13 -2.28 0.04 -1.95 -0.06 -2.11 -3.45 -4.74 -2.46 -2.32 -2.71 -3.46 -3.05
Mp8g14930.1 (PIP3)
-4.7 -3.9 -0.68 0.43 -4.35 -5.05 -5.19 -5.35 -0.94 -3.82 -3.71 -3.28 -4.65 4.35 -0.93 0.32 -0.6 -4.46 0.51 -4.7 -4.76 0.66 -4.23 1.38 -5.16 -4.47 -5.17 -4.48 -4.82 -4.96 -4.64 -4.0
Mp8g16390.1 (UBDK GAMMA 7)
-0.97 -2.57 -0.21 0.67 -0.42 -0.85 -0.61 -0.79 -0.28 0.99 -2.46 -1.9 -2.49 2.36 0.64 1.26 0.44 -0.33 0.75 -0.35 -1.11 0.34 -0.04 0.74 -0.79 -1.12 -1.54 -1.49 -0.95 -0.35 0.03 -0.41
-1.1 -3.86 -0.39 1.18 -0.34 -1.62 -0.91 -1.73 -1.05 -1.46 -4.05 -2.18 -3.9 3.28 0.68 1.43 1.01 -0.51 0.15 -1.01 -1.55 0.09 -0.1 0.31 -1.91 -1.25 -2.1 -1.2 -1.19 -0.98 -0.99 -0.88
- - - 2.0 - - - - -7.45 - - - - 4.22 -3.59 2.65 1.6 - - -6.66 - - - - - - - - - - -6.63 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.