Heatmap: Cluster_177 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
12.11 16.49 6.19 18.03 14.06 14.13 14.33 14.64 8.0 10.72 19.88 16.02 19.37 4.68 17.34 19.45 18.99 17.81 8.23 18.38 14.9 7.07 18.72 7.15 15.57 15.59 17.16 16.81 16.37 13.06 11.69 9.93
Mp1g08110.1 (OTP51)
0.92 1.3 0.47 2.59 1.29 1.56 1.55 1.23 0.51 0.9 2.07 1.4 1.78 0.75 2.52 2.98 2.53 1.47 1.0 2.11 1.57 0.73 1.64 0.74 1.66 1.34 0.96 1.13 1.44 1.24 0.92 0.76
13.82 13.71 7.87 20.82 15.14 14.06 13.8 14.88 13.19 12.05 19.32 12.76 16.62 13.53 20.19 20.26 19.78 17.3 9.53 15.71 14.36 9.23 18.36 8.65 15.18 14.89 17.41 16.92 13.78 13.99 13.04 11.9
4.95 7.16 1.1 9.1 4.13 6.76 6.58 5.36 2.14 6.97 10.93 7.85 8.89 1.67 10.15 11.22 10.1 7.33 1.29 9.42 7.9 1.57 8.24 1.1 8.0 8.16 7.07 4.82 3.94 3.01 2.86 2.35
Mp1g20560.1 (CBP20)
17.43 19.47 11.67 31.35 20.8 20.5 21.2 18.64 22.08 13.72 29.14 25.96 26.94 28.87 31.2 32.78 29.23 23.02 15.17 24.25 22.92 16.23 24.46 14.14 23.47 23.55 18.24 18.97 18.25 13.99 13.06 10.61
Mp1g21410.1 (DHDPS2)
25.27 30.21 14.84 32.74 32.07 29.85 30.9 29.5 21.72 22.23 36.44 27.15 33.65 10.5 33.6 34.26 33.69 33.97 19.36 39.91 30.06 17.82 34.38 15.24 32.47 30.7 33.09 31.93 33.59 22.49 19.37 15.52
Mp1g21880.1 (DSP4)
5.63 5.13 4.96 7.95 7.84 5.87 7.0 6.06 6.39 4.54 7.07 6.66 7.04 4.99 8.52 9.24 8.7 8.48 6.58 7.98 6.44 6.25 10.01 5.11 6.66 6.92 5.59 5.58 5.72 4.73 5.17 5.06
7.04 10.46 5.15 13.34 9.28 8.61 8.85 8.34 10.32 7.07 14.44 10.09 13.31 6.44 13.61 15.08 14.67 9.97 6.47 12.02 9.16 6.05 11.56 6.42 10.18 8.9 10.11 9.63 9.91 6.9 7.05 6.22
22.47 20.69 16.23 26.68 22.11 25.06 34.89 23.01 19.44 20.57 27.18 25.22 25.81 12.87 27.74 33.89 27.3 26.27 17.16 25.44 27.23 17.79 30.63 15.09 26.65 28.18 21.14 22.05 25.09 22.15 21.59 16.29
11.37 15.89 6.85 18.67 11.63 13.95 15.61 13.19 8.81 9.03 21.43 16.18 18.88 5.37 18.0 20.33 18.21 12.77 6.99 15.49 14.86 7.18 15.03 5.6 15.34 14.22 12.2 13.78 15.8 12.02 10.81 8.32
14.32 17.82 4.83 24.86 17.5 14.06 13.84 18.29 9.94 14.21 22.76 13.23 25.81 5.38 26.37 24.64 31.23 18.7 5.27 16.08 16.86 4.36 20.07 4.83 17.55 19.05 19.53 17.18 14.72 11.6 10.78 13.01
Mp2g01060.1 (VDAC3)
23.71 27.84 20.44 30.15 29.91 28.96 26.16 30.37 21.35 20.23 31.99 28.34 31.01 15.29 32.0 32.17 29.88 29.58 22.38 33.44 28.38 20.72 31.14 21.45 31.55 27.66 29.85 26.93 26.33 25.13 29.64 28.73
2.37 2.31 1.04 3.35 2.01 2.24 1.89 2.31 0.81 1.64 2.93 1.68 3.13 1.01 3.39 2.84 3.77 2.97 1.84 2.87 1.94 1.44 2.97 1.59 2.35 2.28 2.14 2.05 1.99 1.91 1.69 1.74
Mp2g01390.1 (COQ6)
4.0 3.53 3.61 5.72 6.21 4.29 5.77 4.75 4.87 4.72 4.61 4.61 4.54 4.82 6.62 7.14 6.47 6.51 5.41 7.05 5.04 4.75 7.14 4.28 4.91 5.34 4.25 4.48 4.45 3.62 3.81 3.48
Mp2g03750.1 (PIL1)
33.03 38.62 18.44 40.11 43.77 47.78 39.32 35.61 24.6 35.03 49.26 46.44 47.55 18.47 46.64 46.54 39.12 40.5 25.73 53.25 47.95 17.56 40.52 21.0 52.89 43.71 28.6 27.06 34.38 38.24 23.39 18.28
271.38 333.44 212.1 622.2 609.55 319.92 532.64 290.47 418.52 359.85 268.66 585.23 331.22 374.79 602.01 968.61 640.58 673.55 293.43 609.4 360.42 249.0 828.57 251.39 350.27 424.26 353.32 240.56 161.37 170.96 223.96 360.93
10.61 14.35 6.89 19.2 12.06 13.48 14.93 12.94 12.47 11.07 20.39 15.0 17.82 7.51 19.14 24.39 19.44 14.37 9.49 18.15 14.54 8.95 15.66 8.04 15.9 14.35 12.7 11.6 13.65 10.69 9.18 6.9
Mp2g22970.1 (FUS4)
22.63 21.21 18.26 29.22 25.31 24.09 26.6 22.02 21.92 20.83 26.43 24.66 25.37 22.94 29.53 33.51 29.33 23.54 22.56 26.1 23.67 21.41 28.75 21.29 24.39 23.04 21.04 23.43 24.72 19.11 15.62 13.54
6.67 9.19 2.43 10.4 9.1 11.97 10.33 9.65 7.21 8.51 14.34 9.52 11.73 7.21 13.1 12.28 11.43 11.14 4.64 12.51 10.82 3.23 10.08 4.25 13.15 10.69 7.94 8.46 9.26 6.79 5.96 4.45
2.4 2.52 2.32 5.49 5.15 3.27 6.71 2.75 1.86 2.99 3.47 4.25 3.68 2.71 5.97 7.65 6.13 6.27 3.22 6.44 4.06 3.17 8.48 2.85 3.92 4.34 3.59 2.53 2.29 1.46 1.66 1.83
Mp3g12220.1 (RRA3)
7.37 8.6 6.25 9.24 7.63 8.42 11.52 9.1 7.92 7.43 10.77 9.88 9.61 4.64 9.42 12.51 10.16 10.58 6.07 9.38 9.07 7.23 11.13 5.93 8.82 9.86 7.5 8.6 9.43 8.41 6.63 4.7
Mp3g15650.1 (PDI6)
36.38 34.18 36.43 89.22 61.26 49.32 75.64 55.11 49.87 49.12 39.9 63.38 39.92 23.75 93.46 118.74 99.06 91.59 47.16 85.51 53.25 41.28 87.62 39.42 57.74 51.29 39.99 45.12 44.58 28.56 23.66 18.81
1.35 1.39 1.35 2.72 1.82 1.68 1.9 1.57 1.85 1.28 2.07 1.66 1.89 2.4 2.82 3.34 2.94 2.34 1.92 2.24 1.74 1.66 2.79 1.7 1.82 1.82 1.23 1.43 1.62 1.03 1.2 1.05
Mp3g25120.1 (THO6)
5.83 6.32 4.66 10.67 8.3 6.83 7.8 6.54 6.1 5.35 8.43 6.85 7.14 7.77 11.53 12.91 10.46 8.95 6.95 10.03 8.16 5.64 10.12 5.47 7.93 8.43 6.21 6.23 5.69 5.87 5.94 5.4
Mp3g25230.1 (HCS1)
2.73 3.47 1.56 4.65 3.4 3.04 3.6 2.93 1.89 2.3 4.86 3.29 4.24 1.88 4.79 6.27 4.94 3.99 1.69 3.96 2.9 1.58 3.52 1.54 3.08 2.93 2.03 2.56 2.88 2.11 1.49 1.35
Mp3g25370.1 (SMC2B)
4.34 4.39 4.01 7.68 4.51 4.89 5.63 4.94 5.83 3.42 5.01 5.23 4.97 2.71 8.48 8.6 9.31 7.27 4.37 6.06 5.64 3.86 7.47 4.1 5.18 5.71 4.23 4.31 4.18 4.09 4.17 3.53
9.36 12.85 4.13 15.19 15.08 11.62 14.17 12.36 3.62 13.1 15.62 13.33 14.14 5.7 15.67 18.18 15.22 15.9 5.89 18.49 13.75 4.56 16.11 4.52 14.73 12.86 13.82 10.92 10.77 9.39 9.63 7.62
19.18 17.63 15.16 32.45 30.02 25.41 27.88 25.16 26.75 33.31 31.38 39.19 23.84 22.0 33.38 36.99 30.45 29.45 25.4 31.99 29.51 18.25 28.84 19.27 31.8 25.87 20.68 20.84 18.85 15.94 16.1 15.33
8.06 6.1 7.45 10.49 9.63 7.81 10.41 7.42 9.31 7.57 8.83 8.59 8.61 9.07 10.3 11.61 9.93 10.06 8.86 10.81 8.96 9.31 12.3 8.71 8.66 9.19 8.24 7.62 8.18 7.18 6.34 5.85
Mp5g12580.1 (U2BL)
28.6 34.73 15.68 42.72 32.15 36.57 31.21 31.78 29.32 30.53 49.88 36.7 41.65 17.62 52.16 44.84 46.54 43.62 22.05 49.08 38.74 19.91 37.89 18.78 42.55 36.52 30.8 30.85 31.57 24.49 22.95 19.44
Mp5g12770.1 (GPI8)
4.76 5.71 4.35 9.17 6.93 5.7 7.4 5.62 4.83 4.02 6.75 5.35 7.38 2.78 8.57 10.47 9.39 8.91 4.41 7.69 6.02 4.12 9.03 4.37 6.11 5.37 4.6 3.73 4.24 4.04 3.75 3.41
Mp5g13180.1 (PICALM3)
3.63 3.43 2.32 4.24 4.06 4.57 3.88 4.12 2.45 2.9 5.19 3.51 4.73 2.4 4.68 5.02 4.25 4.37 3.46 5.09 4.87 2.83 4.91 3.19 4.86 4.63 3.84 4.45 3.71 4.13 4.74 4.54
Mp5g18210.1 (RAE1)
14.22 16.09 8.98 16.84 15.68 17.27 19.59 15.29 12.07 12.64 22.24 17.74 20.18 10.27 19.67 23.28 17.98 18.98 9.63 18.81 16.41 9.22 19.29 7.86 17.63 16.82 14.59 15.56 17.79 12.78 10.98 9.17
4.99 6.29 0.81 9.71 7.39 7.04 4.39 7.14 1.18 7.58 10.78 5.89 10.6 2.63 7.53 8.7 8.25 11.52 1.14 8.4 6.5 1.0 7.55 0.93 7.92 7.49 7.89 4.55 4.38 2.28 2.89 2.68
Mp5g24090.1 (PDI3)
8.63 13.17 6.94 20.27 12.36 12.4 12.56 10.85 10.48 13.02 19.33 14.42 17.7 9.79 19.3 24.9 20.39 16.71 8.27 18.36 13.67 8.36 16.12 8.43 14.23 13.11 10.53 10.11 11.48 7.69 6.31 4.69
Mp6g01330.1 (NADK1)
5.86 4.43 6.02 10.76 8.16 7.53 10.82 6.92 8.68 10.95 9.99 7.75 8.44 6.12 11.27 12.28 10.9 10.3 8.53 12.68 9.42 7.74 11.79 7.09 9.04 10.03 5.28 5.86 6.21 5.98 5.77 4.84
Mp6g10100.1 (DIM1A)
14.94 17.7 14.66 19.99 18.36 16.08 18.8 14.5 14.08 13.02 20.18 18.01 18.81 14.51 21.66 24.38 19.27 17.3 18.23 19.26 15.82 16.15 21.86 16.46 17.01 15.83 15.95 16.09 18.55 15.66 13.58 12.3
Mp6g13680.1 (ALG10)
3.67 4.8 2.54 6.24 4.67 3.39 4.09 3.59 2.09 5.12 5.35 4.01 5.48 2.36 7.04 7.7 6.57 4.79 3.25 4.87 3.58 2.88 4.58 2.92 3.88 3.99 2.69 3.35 4.83 3.57 2.7 1.68
Mp6g18020.1 (COV1)
7.11 8.71 2.44 10.32 7.0 10.37 8.59 7.92 2.6 9.47 9.89 9.42 8.67 3.09 12.37 11.13 10.89 9.86 5.07 10.21 8.97 3.24 10.99 4.11 10.24 9.79 6.19 5.81 7.27 6.44 5.88 3.78
Mp6g18950.1 (VPS9)
0.96 0.97 0.52 2.48 1.92 1.33 1.77 1.19 1.63 0.98 1.53 1.25 1.3 1.38 2.63 3.49 2.62 1.82 0.81 2.06 1.5 0.79 2.55 0.92 1.59 1.58 1.47 0.81 0.89 0.65 0.65 0.97
10.99 12.73 6.73 13.41 9.18 11.67 14.39 10.77 10.81 9.75 14.81 14.0 13.31 6.24 13.84 15.55 13.54 10.14 7.78 11.79 11.51 7.21 11.78 5.58 11.74 12.28 10.59 11.4 12.57 11.82 10.86 7.83
15.63 15.43 15.75 27.81 19.51 18.69 20.92 20.32 20.97 21.64 24.98 20.79 21.19 17.97 28.85 29.98 29.17 24.34 19.53 23.49 21.05 18.12 24.93 18.52 21.93 21.54 14.82 16.4 17.4 13.84 13.56 11.61
9.87 12.47 7.97 17.41 10.61 12.35 12.72 11.56 9.2 9.77 17.66 14.84 16.74 7.48 18.03 19.24 17.35 13.6 11.92 14.33 12.42 10.0 13.54 9.63 13.95 12.42 9.79 10.84 12.78 10.41 10.87 8.72
Mp7g07630.1 (PRX34)
30.86 22.73 6.69 33.7 20.95 35.42 33.25 43.21 11.32 33.22 37.81 34.34 31.19 9.78 48.93 53.97 42.1 45.28 28.66 38.78 36.87 13.21 34.9 13.96 37.9 35.85 26.38 26.34 26.2 17.03 19.25 17.93
Mp7g09420.1 (SUPA)
4.0 5.48 1.98 7.02 4.35 5.41 7.66 6.07 5.34 3.54 11.88 6.18 13.61 2.53 9.55 10.41 9.55 6.03 2.1 6.99 5.9 2.03 7.68 1.61 6.44 6.53 8.17 6.9 6.08 4.11 3.74 3.24
Mp7g18820.1 (BAM2)
2.3 2.16 0.48 2.75 1.21 2.66 2.16 2.78 0.8 0.72 3.19 2.56 3.08 0.56 3.56 2.08 3.4 2.64 2.58 3.5 3.11 1.0 3.29 1.27 3.22 3.46 3.0 2.62 2.78 3.46 3.82 3.4
9.96 13.23 5.15 13.92 9.96 12.99 13.89 13.29 8.04 8.49 17.76 12.31 18.26 9.12 14.9 16.1 15.08 12.1 6.08 12.25 12.92 6.5 12.14 4.84 14.04 13.41 13.35 12.39 12.68 10.84 7.4 5.79
Mp8g11400.1 (SDH1-1)
82.24 113.23 48.6 80.33 137.67 112.41 93.35 90.84 67.29 97.69 118.15 111.61 128.6 54.79 93.47 100.12 77.41 108.28 57.35 121.1 99.02 46.38 110.75 61.5 114.64 91.44 75.6 75.27 95.71 94.55 62.95 51.66
Mp8g14380.1 (PAP28)
7.33 9.21 4.86 10.4 9.76 7.41 9.37 8.27 6.44 7.32 11.02 9.79 11.15 5.38 10.26 12.18 10.59 9.73 4.64 9.4 8.32 4.75 11.45 3.81 8.16 8.88 8.53 6.49 6.02 6.86 6.83 7.52

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)