Heatmap: Cluster_12 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g01630.1 (CSU1)
-0.23 0.24 0.33 -0.72 -0.33 -0.35 -0.29 -0.5 1.02 -0.21 0.49 0.56 0.48 -0.61 -0.56 -0.46 -0.71 -0.47 0.71 -0.21 -0.39 0.49 -0.25 0.87 -0.19 -0.23 -0.58 -0.53 -0.22 0.13 0.13 -0.07
Mp1g07070.1 (ARF10)
0.12 0.31 0.06 -0.55 -0.03 0.1 -0.18 -0.11 0.47 -0.07 0.1 0.42 -0.1 0.41 -0.59 -0.59 -0.61 0.18 0.33 0.15 -0.11 0.4 0.21 0.24 -0.1 0.01 -0.42 0.0 0.22 -0.48 -0.42 -0.59
Mp1g08640.1 (MYB3R1)
-0.09 0.51 0.18 -0.25 -1.3 -0.2 -0.08 -0.3 1.05 -0.36 0.51 0.61 0.39 0.25 -0.22 -0.15 -0.26 -0.84 0.22 -0.56 -0.21 0.17 -0.43 0.01 -0.25 -0.05 -0.42 -0.24 0.11 0.14 0.14 -0.15
Mp1g08920.1 (PUB51)
-0.05 -0.2 0.75 -0.18 -0.96 -0.66 -0.25 -0.64 0.08 -0.92 -0.19 0.35 -0.2 1.36 -0.5 0.12 -0.29 -0.63 0.85 -0.94 -0.85 0.98 -0.39 0.76 -0.93 -0.44 -0.95 -0.06 -0.02 0.28 0.15 0.25
Mp1g09030.1 (DGD2)
-0.35 0.16 0.68 0.25 -0.52 -0.26 -0.5 -0.42 0.78 -0.24 0.59 0.18 0.55 -0.69 0.05 -0.0 0.03 -0.61 0.69 -0.41 -0.32 0.67 -0.48 0.24 -0.17 -0.25 -0.57 -0.54 -0.55 -0.05 -0.04 -0.12
0.14 0.37 0.2 0.01 -0.26 -0.04 0.09 -0.19 0.5 0.01 0.45 0.34 0.32 0.26 -0.1 0.12 -0.25 -0.17 0.01 -0.29 -0.18 0.05 0.06 -0.25 -0.13 -0.04 -0.3 0.0 0.11 -0.47 -0.56 -0.59
Mp1g10220.1 (UBP1B)
0.09 0.39 0.16 -0.06 -0.21 0.03 0.12 -0.17 0.46 -0.23 0.38 0.24 0.31 0.42 -0.22 -0.02 -0.27 -0.24 0.23 -0.23 -0.27 0.19 -0.06 0.03 -0.23 -0.11 -0.21 -0.03 0.09 -0.28 -0.4 -0.65
-0.44 0.54 0.89 -0.31 -0.7 -0.58 -0.31 -0.88 0.46 -0.59 0.74 0.47 0.52 0.67 -0.84 -0.04 -0.46 -0.98 1.1 -1.02 -0.55 0.78 -0.61 1.14 -0.86 -0.61 -1.09 -0.58 -0.51 -0.08 -0.03 -0.4
Mp1g11060.1 (HAM2)
-0.37 0.38 0.48 -0.74 -0.36 -0.44 -0.27 -0.49 1.09 -0.29 0.69 0.44 0.68 0.22 -0.7 -0.77 -0.79 -0.53 0.82 -0.32 -0.45 0.66 -0.21 0.85 -0.49 -0.37 -0.68 -0.39 -0.14 -0.19 -0.36 -0.45
Mp1g11580.1 (FAB1A)
-0.07 0.26 0.34 -0.53 -0.5 -0.14 -0.21 -0.11 0.35 -0.33 0.46 -0.02 0.31 -0.51 -0.35 -0.42 -0.46 -0.41 0.73 -0.16 -0.13 0.44 -0.44 0.52 -0.08 -0.07 -0.21 -0.09 0.1 0.25 0.22 -0.05
0.35 0.08 0.11 -0.52 -0.13 -0.04 -0.34 -0.15 -0.81 -0.93 0.27 -0.16 0.08 0.24 -0.61 -0.4 -0.75 0.11 0.59 0.24 -0.18 0.15 -0.07 0.49 -0.31 -0.12 -0.67 -0.49 -0.23 0.32 0.91 0.76
Mp1g13260.1 (BEH3)
-0.81 0.53 0.77 -1.21 -1.04 -0.47 -0.83 -0.68 1.43 -0.64 0.75 0.35 0.61 -0.63 -0.84 -1.37 -1.02 -0.87 1.65 -0.43 -0.62 1.03 -0.82 1.41 -0.43 -0.71 -0.9 -0.63 -0.52 -0.62 -0.58 -0.66
Mp1g14440.1 (EOL1)
-0.12 0.2 0.41 -0.66 -0.52 -0.31 -0.05 -0.45 0.56 -0.56 0.25 0.47 0.2 0.42 -0.71 -0.43 -0.7 -0.29 0.97 -0.29 -0.24 0.83 -0.04 0.56 -0.33 -0.13 -0.35 -0.23 -0.08 -0.27 -0.12 -0.18
-0.11 0.67 -0.1 -0.12 -0.82 0.15 -0.42 -0.06 0.95 0.13 0.7 0.51 0.41 0.69 -0.58 0.16 -0.51 -0.86 0.58 -0.48 -0.4 0.06 -0.98 -0.01 -0.56 -0.28 -0.09 -0.19 -0.28 -0.32 -0.12 -0.29
Mp1g19010.1 (PAT10)
-0.6 0.08 0.57 -0.08 -0.63 -0.05 -0.43 -0.34 0.69 -0.2 0.42 0.04 0.25 -0.38 -0.0 -0.18 -0.16 -0.28 0.75 0.05 -0.03 0.53 -0.4 0.85 0.12 -0.15 -0.56 -0.51 -0.25 -0.31 -0.3 -0.36
-0.38 -0.07 0.39 -0.32 -0.37 -0.33 -0.53 -0.44 0.6 -0.41 0.31 -0.33 0.19 0.85 -0.36 -0.29 -0.48 -0.21 0.69 -0.22 -0.26 0.45 -0.2 0.6 -0.27 -0.22 -0.45 -0.24 -0.3 0.07 0.43 0.26
Mp1g19660.1 (OEE1)
-0.45 0.16 0.19 -0.49 -0.75 -0.12 0.17 -0.62 0.98 -0.24 0.59 0.55 0.46 -0.47 -0.26 -0.13 -0.43 -0.53 0.86 -0.1 -0.18 0.29 -0.14 0.65 -0.36 -0.0 -0.98 -0.65 -0.4 0.04 -0.04 -0.12
Mp1g20040.1 (ERF8)
-0.42 0.32 0.64 -0.5 -0.5 -0.48 -0.29 -0.25 0.68 0.05 0.27 0.49 0.13 0.91 -0.4 -0.09 -0.65 -0.62 1.02 -0.21 -0.64 0.76 -0.21 0.75 -0.55 -0.51 -0.8 -0.67 -0.53 -0.29 -0.29 -0.41
-0.79 0.44 0.7 -0.09 -1.11 -0.45 -0.58 -0.71 0.79 -0.54 0.78 0.49 0.6 -0.59 -0.22 -0.14 -0.21 -1.01 0.93 -0.31 -0.4 0.52 -0.77 1.01 -0.15 -0.33 -0.72 -0.69 -0.37 -0.23 0.12 0.05
-0.46 -0.19 1.11 -0.36 -0.76 -0.12 -0.41 -0.56 0.54 -0.38 0.43 0.05 0.32 -0.14 -0.08 -0.38 -0.27 -0.59 0.56 -0.25 -0.08 0.83 -0.21 1.07 0.04 -0.12 -0.59 -0.71 -1.06 -0.53 -0.07 0.25
-0.45 0.31 0.44 -0.25 -0.67 -0.49 -0.57 -0.63 0.74 -0.04 0.59 0.29 0.36 0.71 -0.3 -0.15 -0.36 -0.69 0.94 -0.39 -0.56 0.8 -0.4 0.74 -0.54 -0.44 -0.61 -0.48 -0.29 -0.26 -0.09 -0.2
-0.37 -0.02 0.4 0.06 -0.7 -0.16 -0.29 -0.33 0.44 -0.15 0.23 -0.01 0.05 0.26 0.21 0.0 0.02 -0.13 0.23 0.02 0.03 0.38 -0.18 0.3 0.07 -0.05 -0.21 -0.24 -0.16 -0.22 -0.07 -0.09
0.25 0.15 0.56 0.27 -0.36 -0.37 -0.31 -0.1 0.16 -0.57 0.11 0.02 0.44 -0.23 -0.69 -0.17 -0.18 0.04 -0.02 -0.41 -0.48 0.7 -0.11 -0.02 -0.51 -0.04 -0.19 -0.03 0.04 0.27 0.3 0.27
Mp1g26570.1 (Sgpp)
0.04 -0.03 0.03 -0.35 -0.39 -0.73 -0.5 -0.19 -0.04 -0.53 0.21 0.15 -0.02 0.33 0.03 0.13 -0.21 -0.4 0.87 -0.59 -0.43 0.4 0.02 0.93 -0.78 -0.49 -0.91 -1.05 -1.0 0.57 0.85 0.81
Mp1g26750.1 (SCO3)
-0.19 0.06 -0.24 -0.33 -0.34 -0.18 0.02 -0.18 -0.26 -0.4 0.28 0.22 0.16 0.07 -0.19 -0.03 -0.23 0.02 0.63 -0.05 -0.42 0.16 0.17 0.52 -0.37 -0.24 -0.44 -0.43 -0.18 0.38 0.58 0.38
Mp1g27390.1 (LSM4)
0.09 0.2 0.37 -0.73 0.02 -0.02 0.19 -0.08 0.77 0.1 0.14 0.48 0.09 0.7 -0.82 -0.53 -0.9 -0.27 0.24 -0.29 -0.26 0.22 -0.14 0.32 -0.29 -0.14 -0.4 -0.13 -0.05 -0.15 -0.09 -0.23
Mp2g01490.1 (HIR4)
0.55 -0.95 0.88 -0.92 -0.81 -0.77 0.46 -0.38 0.45 0.31 -0.92 -0.11 -0.95 0.72 -1.04 -0.57 -0.88 -0.08 0.58 -1.32 -0.47 1.17 -0.27 0.58 -1.09 -0.16 -1.12 -0.07 0.18 1.05 0.32 0.06
Mp2g01500.1 (HIR4)
1.0 -1.32 0.8 -0.75 -0.51 -0.61 0.15 -0.32 0.36 -0.4 -1.41 -0.34 -1.42 1.08 -0.69 -0.27 -0.85 -0.24 0.68 -1.4 -0.63 1.13 -0.53 0.76 -1.18 -0.43 -1.29 -0.11 0.13 1.2 0.33 0.12
Mp2g07450.1 (PTPMT1)
0.09 0.15 0.36 -0.64 -0.2 -0.08 0.08 -0.09 0.8 0.18 0.14 0.32 0.19 0.41 -0.89 -0.51 -0.79 -0.2 0.41 -0.33 -0.26 0.39 -0.05 0.44 -0.18 -0.05 -0.1 -0.05 0.02 -0.3 -0.33 -0.42
0.39 0.17 0.41 -0.01 0.65 0.07 -0.36 0.37 0.88 -0.09 -0.33 -0.51 -0.18 -0.17 -0.19 -0.7 -0.12 0.05 -0.4 -0.14 -0.11 0.05 -0.3 -0.03 -0.25 -0.17 -0.29 -0.03 0.29 0.21 -0.07 -0.37
Mp2g08410.1 (SAE2)
-0.26 0.0 0.17 -0.55 -0.65 -0.11 -0.17 -0.21 0.62 -0.26 0.26 0.63 0.08 0.07 -0.54 -0.24 -0.62 -0.18 0.7 -0.35 -0.16 0.43 -0.23 0.72 -0.16 0.03 -0.08 -0.1 0.03 -0.14 -0.01 -0.17
-0.35 0.41 0.48 -0.9 -0.68 -0.05 -0.33 -0.4 1.13 -0.26 0.49 0.01 0.56 0.46 -0.93 -0.69 -0.96 -0.61 0.84 -0.31 -0.3 0.54 -0.55 0.74 -0.33 -0.29 -0.06 -0.06 0.03 -0.39 -0.18 -0.34
Mp2g15330.1 (WRKY7)
0.38 -0.03 0.77 -1.83 -0.88 0.1 -1.03 -0.48 1.12 -1.53 0.35 -0.24 0.2 0.11 -2.1 -2.56 -1.88 -0.32 1.36 -0.62 -0.37 1.22 -0.62 1.52 -0.48 -0.04 -0.31 0.07 0.85 -0.95 -1.16 -1.35
0.31 0.07 0.92 -1.94 -0.91 0.04 -1.09 -0.5 1.29 -1.6 0.15 -0.29 0.14 0.12 -2.09 -2.62 -2.1 -0.42 1.48 -0.66 -0.34 1.22 -0.71 1.69 -0.48 0.0 -0.52 -0.21 0.7 -1.09 -1.31 -1.43
Mp2g19920.1 (RAN2)
0.23 0.44 0.13 -0.57 0.01 0.22 0.14 0.06 0.16 0.25 0.35 0.2 0.28 0.21 -0.7 -0.49 -0.75 0.1 0.13 0.03 -0.13 -0.1 -0.21 0.22 -0.04 -0.09 -0.26 0.02 0.19 -0.09 -0.39 -0.52
Mp2g20190.1 (LOS1)
-0.24 0.43 0.58 -0.62 -0.41 -0.16 -0.16 -0.28 0.59 -0.0 0.32 0.46 0.21 -0.6 -0.67 -0.45 -0.74 -0.48 0.63 -0.11 -0.33 0.35 -0.32 0.7 -0.18 -0.21 -0.19 -0.23 -0.12 -0.06 0.22 0.26
Mp2g20200.1 (LOS1)
-0.24 0.43 0.58 -0.62 -0.41 -0.16 -0.16 -0.28 0.59 -0.0 0.32 0.46 0.21 -0.6 -0.67 -0.45 -0.74 -0.48 0.63 -0.11 -0.33 0.35 -0.32 0.7 -0.18 -0.21 -0.19 -0.23 -0.12 -0.06 0.22 0.26
-0.0 -0.46 -0.69 0.12 -0.84 -0.8 -0.23 -0.42 0.83 -0.02 0.58 0.01 0.22 0.48 -0.31 0.12 -0.23 -0.18 0.28 -0.4 -0.15 0.59 -0.06 0.21 -0.28 0.09 -0.08 0.24 0.27 -0.31 -0.1 -0.09
Mp2g26590.1 (COI1)
-0.01 0.21 0.37 -0.18 -0.76 -0.16 -0.26 -0.38 0.56 -0.21 0.44 -0.31 0.13 0.54 -0.5 -0.15 -0.48 -0.67 0.61 -0.54 -0.27 0.35 -0.39 0.47 -0.27 -0.09 -0.19 0.25 0.23 -0.11 0.1 0.12
Mp3g00340.1 (WRKY58)
0.47 0.14 0.8 0.07 0.22 -0.47 -0.41 0.38 0.89 0.08 -0.52 -1.2 -0.11 -1.72 -0.4 -2.3 -0.18 -0.17 0.05 -0.7 -0.36 0.37 -1.21 0.1 -0.75 -0.62 0.27 0.36 0.54 0.49 0.55 0.59
-0.31 0.26 0.41 -0.61 -0.79 -0.32 0.13 -0.38 0.65 -0.16 0.28 0.48 0.36 -0.11 -0.68 -0.26 -0.8 -0.52 0.83 -0.2 -0.13 0.5 -0.18 0.62 -0.17 0.04 -0.63 -0.53 -0.42 0.15 0.23 0.09
0.03 0.1 0.17 -0.3 -0.46 -0.08 -0.2 -0.23 0.63 -0.53 0.46 0.09 0.32 0.6 -0.32 -0.25 -0.38 -0.33 0.32 -0.17 -0.11 0.31 -0.13 0.22 -0.22 -0.1 -0.09 0.11 0.17 -0.19 -0.25 -0.19
Mp3g08710.1 (DDP3)
-0.11 -0.34 -0.02 -0.11 -0.72 -0.15 -0.33 -0.49 0.64 -0.41 0.69 0.14 0.42 0.7 -0.19 -0.21 -0.15 -0.14 0.33 0.06 -0.04 0.52 0.08 0.08 -0.15 0.1 -0.37 0.02 0.03 -0.52 -0.43 -0.38
-0.02 0.1 0.3 -0.35 -0.19 -0.14 -0.21 -0.21 0.49 -0.26 0.42 0.11 0.23 -0.27 -0.5 -0.35 -0.43 -0.16 0.54 -0.13 -0.16 0.29 -0.06 0.29 -0.2 -0.0 -0.3 0.06 0.09 0.13 0.1 0.01
0.71 0.16 1.05 -0.47 -0.57 -0.49 -0.61 -0.31 -0.06 -0.95 -0.11 -0.29 0.15 1.46 -1.29 -1.17 -0.82 -1.04 -0.1 -1.25 -0.98 0.72 -0.76 0.26 -1.1 -0.43 -0.33 0.2 0.14 0.95 0.6 0.7
0.42 0.12 0.79 -0.22 -0.88 -0.61 -0.61 -0.38 0.01 -0.55 0.02 -0.09 0.24 1.4 -0.89 -0.68 -0.53 -0.76 0.56 -0.99 -0.79 0.82 -0.48 0.66 -0.96 -0.33 -0.45 -0.05 -0.15 0.48 0.32 0.37
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Mp3g25160.1 (ACO5)
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Mp4g00550.1 (TUA5)
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Mp4g08970.1 (HAK5)
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Mp4g16380.1 (GSM1)
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Mp4g18200.1 (ORC1A)
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Mp4g22430.1 (NID1)
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Mp5g02780.1 (ATL96)
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Mp5g04840.1 (CCT6-1)
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Mp5g14170.1 (AGD14)
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Mp5g14310.1 (FIP1)
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Mp5g15730.1 (BEST)
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Mp5g18820.1 (HEC3)
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Mp5g21110.1 (PTEN1)
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Mp5g21800.1 (UBC10)
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Mp6g11680.1 (CRD1)
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Mp7g00820.1 (SSP5)
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Mp7g02100.1 (UPL7)
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Mp7g06070.1 (AtHMP23)
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Mp7g06570.1 (QWRF2)
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Mp7g06850.1 (CYCP4;1)
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Mp7g09710.1 (ATML1)
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Mp7g15530.1 (CPK28)
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Mp7g15970.1 (BTL08)
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Mp7g16850.1 (MSH7)
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Mp7g17200.1 (WRKY22)
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Mp8g07340.1 (EXA1)
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Mp8g12620.1 (TUA5)
0.24 0.71 1.16 -0.2 -0.94 -0.17 -0.57 -0.17 1.04 -0.2 0.51 -0.11 0.63 -1.38 -0.89 -0.78 -0.42 -1.33 -0.45 -1.1 -0.7 0.87 -1.28 -0.7 -0.56 -0.48 0.07 0.38 0.27 0.44 0.36 0.48
Mp8g12800.1 (NLP4)
0.09 0.53 0.22 -0.68 -0.28 -0.18 -0.13 -0.33 0.78 -0.04 0.33 0.57 0.2 0.05 -0.95 -0.69 -0.79 -0.4 0.53 -0.59 -0.32 0.48 -0.03 0.59 -0.52 -0.04 0.07 -0.0 -0.05 -0.43 -0.07 0.05
Mp8g14020.1 (NHX1)
-0.02 0.22 0.51 -0.2 -0.31 -0.09 0.12 -0.25 0.31 0.02 0.24 0.29 0.21 -0.15 -0.33 0.05 -0.34 -0.38 0.44 -0.22 -0.15 0.39 -0.12 0.22 -0.11 -0.04 -0.47 -0.21 -0.08 -0.09 -0.02 -0.15
Mp8g17910.1 (JMJ17)
-0.12 0.03 0.17 -0.27 -0.27 -0.26 -0.26 -0.35 0.78 -0.23 0.44 0.05 0.3 0.44 -0.41 -0.28 -0.32 -0.22 0.51 -0.32 -0.33 0.48 0.08 0.32 -0.41 -0.07 -0.21 -0.12 -0.08 -0.22 0.06 -0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.