Heatmap: Cluster_121 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.03 0.04 0.09 0.04 1.0 0.09 0.02 0.05 0.09 0.42 0.15 0.08 0.12 0.05 0.06 0.02 0.04 0.23 0.45 0.92 0.11 0.16 0.36 0.3 0.13 0.04 0.03 0.02 0.02 0.05 0.04 0.05
Mp1g02940.1 (IPP1)
0.01 0.0 0.05 0.17 0.74 0.05 0.02 0.01 0.01 0.07 0.04 0.01 0.01 0.24 0.07 0.2 0.08 0.06 0.51 1.0 0.07 0.15 0.27 0.15 0.08 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01
Mp1g08570.1 (IAR4L)
0.01 0.0 0.01 0.26 0.76 0.02 0.03 0.01 0.01 0.36 0.07 0.03 0.06 0.06 0.12 0.21 0.12 0.09 0.28 1.0 0.02 0.03 0.37 0.06 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.64 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g22080.1 (SPA1)
0.01 0.0 0.0 0.01 1.0 0.06 0.01 0.02 0.0 0.36 0.08 0.01 0.05 0.0 0.01 0.0 0.01 0.12 0.01 0.96 0.06 0.0 0.29 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
Mp2g02030.1 (RSH1)
0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.16 0.04 0.0 0.02 0.0 0.05 0.01 0.03 0.07 0.0 0.94 0.05 0.0 0.43 0.0 0.07 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
Mp2g02330.1 (SESA5)
0.04 0.01 0.15 0.07 0.94 0.06 0.01 0.03 0.2 0.25 0.03 0.01 0.01 0.46 0.04 0.03 0.04 0.09 0.41 1.0 0.04 0.22 0.26 0.36 0.07 0.02 0.05 0.08 0.06 0.12 0.11 0.09
Mp2g02340.1 (ADPG2)
0.29 0.16 0.1 0.26 1.0 0.26 0.16 0.33 0.23 0.42 0.17 0.09 0.18 0.39 0.24 0.14 0.2 0.69 0.28 0.61 0.18 0.13 0.49 0.27 0.3 0.19 0.3 0.3 0.25 0.2 0.26 0.22
0.01 0.01 0.04 0.16 0.59 0.09 0.01 0.06 0.09 0.3 0.22 0.04 0.14 0.19 0.17 0.16 0.15 0.21 0.32 1.0 0.16 0.1 0.46 0.25 0.19 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.09 0.73 0.0 0.0 0.12 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g15740.1 (REM30)
0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.79 0.01 0.0 0.39 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.03 0.25 0.15 1.0 0.3 0.21 0.33 0.13 0.33 0.05 0.03 0.04 0.05 0.2 0.09 0.19 0.5 0.17 0.45 0.17 0.35 0.44 0.24 0.32 0.1 0.16 0.15 0.15 0.15 0.15 0.14
Mp2g26450.1 (PUB46)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.95 0.01 0.0 0.0 0.0 0.2 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 1.0 0.02 0.0 0.48 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.49 0.38 0.26 0.34 1.0 0.57 0.4 0.43 0.47 0.6 0.4 0.41 0.38 0.67 0.37 0.35 0.34 0.56 0.38 0.61 0.47 0.29 0.55 0.34 0.52 0.4 0.43 0.51 0.44 0.31 0.37 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.19 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.14 0.59 0.01 0.01 0.2 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.38 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.51 0.01 0.0 0.25 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.08 0.48 0.47 0.06 0.04 0.37 0.22 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.06 0.64 0.01 0.0 0.3 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g06800.1 (mtHsc70-1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.84 0.03 0.0 0.01 0.0 0.4 0.06 0.02 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.12 0.04 1.0 0.04 0.0 0.33 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.07 0.04 0.05 0.01 0.0 0.72 0.01 0.0 0.27 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Mp3g09260.1 (MPT3)
0.03 0.01 0.04 0.15 1.0 0.05 0.03 0.01 0.03 0.27 0.06 0.02 0.02 0.04 0.13 0.09 0.07 0.04 0.66 0.63 0.05 0.07 0.3 0.16 0.04 0.04 0.03 0.01 0.02 0.05 0.04 0.05
Mp3g09270.1 (CCT6-2)
0.02 0.02 0.03 0.15 1.0 0.02 0.03 0.01 0.05 0.27 0.05 0.04 0.02 0.04 0.11 0.06 0.05 0.04 0.63 0.58 0.06 0.07 0.25 0.14 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.07 0.03 0.04
0.0 0.0 0.03 0.01 1.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.12 0.52 0.98 0.09 0.03 0.38 0.33 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.03 0.05 0.03 1.0 0.11 0.01 0.15 0.04 0.06 0.03 0.0 0.04 0.04 0.08 0.0 0.07 0.2 0.29 0.51 0.04 0.06 0.11 0.22 0.19 0.04 0.15 0.1 0.05 0.09 0.19 0.18
0.02 0.01 0.0 0.05 0.77 0.1 0.01 0.05 0.01 0.41 0.24 0.02 0.13 0.0 0.07 0.03 0.05 0.19 0.09 1.0 0.14 0.01 0.34 0.03 0.23 0.03 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.2 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.73 0.0 0.0 0.16 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.01 0.03 1.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.37 0.08 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02 0.06 0.02 0.82 0.08 0.05 0.27 0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.02 0.78 0.06 0.01 0.01 0.0 0.16 0.14 0.01 0.07 0.0 0.03 0.01 0.02 0.21 0.08 1.0 0.09 0.01 0.39 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.02 0.75 0.02 0.01 0.01 0.0 0.47 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.05 0.03 1.0 0.03 0.0 0.3 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
Mp4g06640.1 (ERF1-1)
0.15 0.1 0.23 0.18 0.41 0.22 0.17 0.18 0.7 0.3 0.13 0.24 0.13 0.14 0.2 0.17 0.16 0.45 0.32 1.0 0.24 0.28 0.37 0.21 0.23 0.21 0.11 0.12 0.15 0.13 0.11 0.12
Mp4g09300.1 (LEA13)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.06 0.0 0.01 0.0 0.33 0.1 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 1.0 0.11 0.0 0.39 0.01 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g10700.1 (DAAR2)
0.03 0.03 0.08 0.12 1.0 0.08 0.05 0.04 0.28 0.51 0.22 0.09 0.16 0.29 0.07 0.08 0.08 0.09 0.2 0.59 0.11 0.09 0.25 0.2 0.09 0.05 0.08 0.05 0.04 0.06 0.05 0.07
Mp4g15050.1 (MCM5)
0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.1 0.0 0.88 0.03 0.0 0.44 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g21700.1 (DNMT2)
0.01 0.0 0.01 0.01 0.66 0.08 0.0 0.03 0.01 0.01 0.05 0.0 0.01 0.0 0.3 0.01 0.1 0.1 0.42 1.0 0.15 0.02 0.13 0.13 0.3 0.03 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.04
0.01 0.0 0.02 0.02 1.0 0.08 0.01 0.03 0.01 0.02 0.06 0.0 0.03 0.01 0.33 0.03 0.13 0.08 0.43 0.98 0.13 0.01 0.15 0.11 0.3 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01
Mp5g01870.1 (WRKY13)
0.08 0.05 0.02 0.08 1.0 0.09 0.14 0.07 0.01 0.3 0.04 0.06 0.07 0.0 0.09 0.11 0.06 0.17 0.02 0.69 0.17 0.04 0.55 0.01 0.09 0.12 0.06 0.07 0.06 0.07 0.06 0.04
Mp5g05270.1 (PXG3)
0.01 0.03 0.01 0.05 0.93 0.04 0.02 0.01 0.01 0.4 0.28 0.17 0.15 0.01 0.08 0.04 0.04 0.08 0.11 1.0 0.07 0.03 0.46 0.04 0.09 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
0.08 0.04 0.17 0.27 0.81 0.18 0.12 0.12 0.14 0.21 0.23 0.14 0.19 0.22 0.26 0.23 0.22 0.24 0.46 1.0 0.17 0.22 0.48 0.56 0.23 0.11 0.05 0.08 0.09 0.11 0.15 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.15 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.02 0.89 0.01 0.0 0.24 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g20610.1 (AZI7)
0.01 0.01 0.01 0.41 1.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.3 0.03 0.17 0.02 0.22 0.29 0.25 0.23 0.01 0.36 0.51 0.02 0.06 0.36 0.17 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.03 0.08 0.08
Mp6g03010.1 (MOT2)
0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.08 0.04 0.9 0.06 0.0 0.28 0.02 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Mp6g03090.1 (MOT2)
0.01 0.0 0.0 0.01 1.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.04 0.6 0.03 0.0 0.21 0.01 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.67 0.04 0.0 0.23 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.79 0.02 0.0 0.19 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Mp6g03120.1 (MOT2)
0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.03 0.99 0.07 0.0 0.28 0.02 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.19 0.02 0.53 0.03 0.01 0.01 0.4 0.25 0.12 0.06 0.07 0.23 0.02 0.02 0.01 0.09 0.57 1.0 0.03 0.31 0.27 0.49 0.04 0.01 0.01 0.09 0.06 0.03 0.02 0.03
Mp6g13370.1 (NTMC2T5.1)
0.0 0.01 0.0 0.02 1.0 0.09 0.02 0.01 0.0 0.33 0.06 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.07 0.02 0.93 0.19 0.0 0.11 0.0 0.15 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0
0.04 0.02 0.02 0.23 0.54 0.03 0.04 0.02 0.02 0.61 0.14 0.06 0.1 0.15 0.17 0.25 0.17 0.07 0.14 1.0 0.05 0.05 0.27 0.07 0.06 0.02 0.03 0.05 0.06 0.04 0.03 0.04
Mp7g16290.1 (MyoB1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.01 0.0 0.0 0.0 0.5 0.21 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 1.0 0.02 0.01 0.32 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.65 0.0 0.0 0.36 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g05130.1 (DUET)
0.02 0.01 0.02 0.2 0.46 0.05 0.03 0.02 0.01 0.46 0.33 0.06 0.14 0.09 0.19 0.17 0.18 0.11 0.09 1.0 0.07 0.03 0.27 0.04 0.09 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02
Mp8g14690.1 (AtPMT2)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.69 0.0 0.0 0.0 0.02 0.48 0.03 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.0 0.05 1.0 0.01 0.04 0.2 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)