Heatmap: Cluster_121 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
2.36 2.85 7.1 3.03 75.97 6.62 1.77 3.69 6.82 32.22 11.29 5.83 8.99 4.03 4.45 1.75 3.08 17.81 34.19 69.8 8.21 12.38 27.51 22.49 9.54 3.4 2.33 1.86 1.64 3.51 2.91 3.45
Mp1g02940.1 (IPP1)
0.32 0.18 2.03 6.5 27.48 1.83 0.77 0.33 0.53 2.75 1.62 0.36 0.51 8.98 2.58 7.6 2.85 2.13 19.15 37.32 2.61 5.58 10.15 5.64 2.96 0.37 0.34 0.24 0.02 0.2 0.42 0.56
Mp1g08570.1 (IAR4L)
0.08 0.07 0.12 4.14 12.12 0.25 0.45 0.16 0.11 5.72 1.12 0.55 0.88 1.03 1.89 3.35 1.87 1.4 4.49 15.94 0.33 0.47 5.97 1.01 0.48 0.05 0.13 0.13 0.09 0.07 0.11 0.07
0.04 0.04 0.01 0.19 73.0 0.23 0.14 0.01 0.0 5.58 0.2 0.54 0.08 0.0 0.48 0.2 0.2 3.17 0.72 46.52 0.34 0.18 25.14 0.24 0.28 0.01 0.05 0.02 0.04 0.01 0.01 0.01
Mp1g22080.1 (SPA1)
4.31 1.72 1.49 4.47 842.45 53.4 4.73 13.98 1.13 305.88 71.59 7.41 42.01 1.47 10.43 2.93 5.26 101.25 5.85 809.09 49.95 1.52 240.56 3.35 60.03 3.65 2.05 1.88 2.49 10.12 9.19 11.72
Mp2g02030.1 (RSH1)
0.38 0.32 0.13 1.52 87.39 2.34 0.26 1.24 0.01 14.01 3.21 0.33 1.33 0.16 4.44 0.59 2.56 5.95 0.28 81.84 4.7 0.19 37.61 0.05 5.8 0.82 1.02 0.3 0.59 0.79 1.24 0.84
Mp2g02330.1 (SESA5)
5.82 0.87 22.18 9.47 135.02 9.32 1.27 4.12 28.8 35.63 3.89 1.23 2.15 66.63 5.54 4.18 5.11 13.25 58.87 143.49 5.7 31.1 37.83 51.83 10.14 2.62 7.77 11.65 8.45 17.6 15.34 12.98
Mp2g02340.1 (ADPG2)
2.53 1.4 0.9 2.24 8.58 2.25 1.37 2.82 1.93 3.63 1.46 0.76 1.57 3.36 2.02 1.18 1.76 5.96 2.42 5.19 1.56 1.08 4.17 2.29 2.58 1.62 2.6 2.55 2.15 1.74 2.21 1.88
0.46 0.52 2.86 11.5 42.46 6.52 0.9 3.99 6.15 21.43 16.03 2.82 10.05 13.79 12.1 11.23 10.83 15.18 22.57 71.61 11.71 6.96 32.75 18.24 13.82 1.66 0.67 0.39 0.36 1.06 0.86 0.74
0.23 0.44 0.37 3.33 170.26 0.94 0.46 0.35 0.16 2.17 0.3 0.17 0.24 1.2 3.6 4.0 3.06 2.1 14.82 123.78 0.62 0.65 19.95 6.2 1.14 0.68 0.16 0.07 0.35 0.1 0.38 0.59
Mp2g15740.1 (REM30)
0.09 0.36 0.06 5.69 506.26 2.1 0.08 0.16 0.05 88.21 11.04 2.71 4.73 0.02 5.79 0.92 2.6 16.82 3.46 402.26 4.27 1.14 198.02 1.11 7.47 0.1 2.27 0.03 0.91 0.07 0.0 0.08
4.43 0.49 4.63 2.84 18.46 5.63 3.85 6.18 2.32 6.1 0.96 0.55 0.67 0.94 3.72 1.71 3.51 9.2 3.17 8.24 3.12 6.44 8.11 4.45 5.9 1.88 3.01 2.82 2.72 2.76 2.75 2.61
Mp2g26450.1 (PUB46)
0.11 0.05 0.0 4.74 359.15 2.98 0.11 0.31 0.0 74.75 2.73 0.56 1.71 0.0 2.47 0.35 1.24 34.14 0.82 377.46 6.24 0.42 182.31 0.21 8.93 0.1 1.18 0.0 0.35 0.0 0.0 0.25
111.99 86.28 60.69 79.16 230.07 131.01 93.06 99.06 108.55 137.89 91.03 95.38 86.35 154.77 85.08 79.4 78.82 128.25 86.46 141.39 107.19 67.34 127.54 77.6 119.31 91.97 99.27 116.61 101.08 70.45 84.25 92.9
0.04 0.21 0.39 0.07 157.16 1.05 0.19 0.1 0.39 29.42 2.45 1.45 0.92 1.71 0.2 0.05 0.12 6.47 21.68 92.4 1.36 1.15 31.3 8.98 1.01 0.04 0.96 0.08 0.0 0.16 0.16 0.64
0.1 0.17 0.16 0.12 95.3 0.64 0.11 0.47 0.21 36.42 1.38 1.38 0.85 0.94 0.06 0.02 0.14 1.15 3.11 48.2 0.73 0.36 23.73 1.34 0.57 0.08 1.01 0.03 0.11 0.24 0.13 0.33
3.16 0.75 10.6 20.1 1629.41 45.0 2.27 4.29 2.33 82.4 24.18 1.95 13.5 69.1 18.9 4.12 12.31 126.86 785.6 770.01 97.94 68.48 607.04 358.47 56.53 4.29 8.61 0.71 4.72 3.35 1.33 2.25
0.0 0.03 0.06 0.42 55.22 0.27 0.02 0.05 0.07 13.2 0.36 0.05 0.15 0.17 0.38 0.21 0.15 2.68 3.5 35.13 0.55 0.2 16.8 1.23 0.6 0.01 0.24 0.01 0.02 0.03 0.02 0.0
Mp3g06800.1 (mtHsc70-1)
0.35 0.8 0.36 7.55 223.1 7.35 1.2 1.46 0.26 107.22 16.32 6.55 7.02 2.2 2.8 5.17 2.2 32.51 10.08 265.32 10.19 1.23 87.87 3.84 13.89 0.5 0.82 0.06 0.46 0.23 0.2 0.36
0.04 0.0 0.04 0.93 17.64 0.18 0.08 0.06 0.0 0.38 0.0 0.11 0.03 0.16 1.21 0.65 0.82 0.22 0.02 12.68 0.21 0.0 4.75 0.13 0.05 0.14 0.09 0.08 0.0 0.09 0.0 0.03
Mp3g09260.1 (MPT3)
0.4 0.15 0.48 1.99 12.87 0.66 0.43 0.16 0.34 3.46 0.77 0.24 0.21 0.51 1.63 1.13 0.92 0.5 8.48 8.17 0.71 0.89 3.81 2.1 0.54 0.46 0.38 0.19 0.27 0.62 0.49 0.6
Mp3g09270.1 (CCT6-2)
1.33 1.7 2.38 12.13 83.45 2.09 2.59 0.63 4.02 22.77 3.9 3.54 1.28 2.92 9.08 4.73 4.52 3.21 52.46 48.48 5.22 5.67 20.56 11.92 2.65 2.71 1.27 0.55 0.99 5.71 2.53 3.21
0.41 0.11 13.9 3.67 472.37 21.38 0.16 5.24 0.22 19.84 0.46 0.18 0.21 2.63 10.34 0.29 3.45 56.14 245.41 463.0 40.28 15.92 179.94 156.72 53.74 0.7 2.03 0.76 1.04 1.44 0.81 1.15
27.83 5.33 9.9 5.55 197.92 21.53 1.76 29.66 8.23 12.77 5.14 0.43 7.65 7.33 15.19 0.95 13.02 40.19 56.66 100.3 7.36 11.23 20.99 44.43 38.49 8.9 30.12 18.87 10.27 17.11 37.78 35.19
2.94 1.75 0.63 8.41 118.97 15.52 2.32 7.56 1.02 62.97 37.08 3.46 19.45 0.46 10.45 4.39 7.42 29.0 13.84 155.13 21.93 1.2 52.04 4.97 36.27 3.92 4.97 1.12 0.69 1.14 2.22 5.98
0.03 0.07 0.0 0.03 26.39 0.25 0.02 0.15 0.0 5.28 0.11 0.05 0.3 0.0 0.05 0.03 0.03 0.72 0.24 19.29 0.06 0.1 4.09 0.25 0.35 0.04 0.08 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0
0.09 0.02 0.05 0.17 5.74 0.26 0.15 0.02 0.03 2.11 0.43 0.1 0.08 0.03 0.17 0.17 0.11 0.33 0.11 4.73 0.43 0.27 1.52 0.06 0.24 0.1 0.05 0.04 0.03 0.04 0.05 0.04
5.87 13.37 9.2 133.64 4383.33 326.08 29.4 80.71 7.32 892.07 803.2 76.83 375.49 10.98 165.96 31.94 92.69 1161.4 440.18 5614.01 507.06 50.08 2174.58 245.06 640.41 23.4 10.81 1.04 9.29 2.85 2.34 2.99
0.18 0.18 0.0 0.51 17.22 0.48 0.21 0.24 0.02 10.81 0.62 0.3 0.33 0.24 0.39 0.18 0.53 1.22 0.65 22.95 0.78 0.02 6.93 0.46 0.61 0.06 0.25 0.06 0.1 0.08 0.16 0.3
Mp4g06640.1 (ERF1-1)
5.88 3.93 9.33 7.12 16.36 8.77 6.73 7.36 28.23 12.13 5.39 9.55 5.43 5.76 7.97 6.8 6.57 17.96 12.71 40.31 9.7 11.33 14.88 8.3 9.15 8.31 4.26 4.94 5.99 5.37 4.53 4.75
Mp4g09300.1 (LEA13)
22.49 16.85 5.29 19.45 4450.46 308.21 24.48 36.48 4.29 1635.32 490.1 61.21 283.65 4.34 10.78 10.37 10.35 389.25 87.17 4907.56 561.8 17.02 1931.51 37.28 441.33 43.2 23.34 8.83 19.97 15.91 10.45 13.52
Mp4g10700.1 (DAAR2)
0.55 0.44 1.36 1.88 16.04 1.24 0.83 0.66 4.45 8.23 3.56 1.38 2.53 4.67 1.13 1.36 1.22 1.52 3.25 9.41 1.74 1.39 3.98 3.22 1.37 0.88 1.3 0.86 0.63 1.04 0.84 1.16
Mp4g15050.1 (MCM5)
0.53 0.66 0.0 5.14 977.81 15.99 0.13 0.85 0.0 64.86 8.47 1.7 3.56 0.0 11.98 0.27 4.87 92.94 1.28 860.65 29.83 0.34 430.0 0.47 37.96 0.35 3.11 0.31 1.22 0.0 0.04 0.32
Mp4g21700.1 (DNMT2)
0.19 0.11 0.17 0.38 17.77 2.07 0.1 0.79 0.29 0.22 1.47 0.08 0.28 0.04 7.94 0.39 2.58 2.59 11.19 26.88 3.92 0.48 3.48 3.44 8.0 0.94 0.3 0.41 0.04 0.55 0.41 1.15
0.17 0.04 0.36 0.41 20.74 1.66 0.13 0.52 0.11 0.37 1.28 0.04 0.71 0.11 6.92 0.64 2.62 1.71 8.84 20.26 2.75 0.22 3.08 2.27 6.13 0.72 0.24 0.15 0.07 0.27 0.68 0.22
Mp5g01870.1 (WRKY13)
0.55 0.32 0.12 0.52 6.88 0.64 0.94 0.48 0.09 2.09 0.27 0.42 0.51 0.03 0.6 0.77 0.43 1.13 0.12 4.73 1.17 0.28 3.78 0.09 0.63 0.83 0.44 0.47 0.42 0.49 0.44 0.31
Mp5g05270.1 (PXG3)
0.56 1.96 0.51 3.55 67.75 2.56 1.58 0.81 0.68 29.0 20.13 12.1 10.95 1.08 6.11 2.71 2.96 6.09 8.17 72.79 5.26 2.36 33.83 3.08 6.64 1.15 1.41 0.36 0.51 0.61 0.72 0.69
5.44 2.56 11.33 17.84 54.55 12.37 8.39 8.26 9.24 13.9 15.76 9.25 12.46 14.71 17.63 15.82 14.58 16.04 31.26 67.33 11.45 14.82 32.57 37.9 15.38 7.68 3.59 5.45 5.94 7.68 10.29 9.47
0.03 0.03 0.0 0.21 71.54 0.5 0.2 0.11 0.0 10.84 0.43 0.6 0.46 0.0 1.19 0.35 0.42 1.62 1.35 63.46 0.62 0.07 17.29 0.07 1.1 0.16 0.1 0.07 0.0 0.03 0.03 0.03
Mp5g20610.1 (AZI7)
0.03 0.03 0.06 2.48 6.0 0.13 0.03 0.0 0.49 1.78 0.18 1.03 0.14 1.3 1.71 1.52 1.38 0.08 2.18 3.04 0.1 0.35 2.18 1.03 0.04 0.04 0.07 0.11 0.22 0.15 0.5 0.46
Mp6g03010.1 (MOT2)
0.12 0.04 0.32 0.47 89.12 3.78 0.3 0.3 0.0 5.3 1.85 0.24 0.76 0.31 1.44 0.44 0.51 7.3 3.33 80.45 5.76 0.26 25.26 1.39 5.73 0.29 1.6 0.03 0.0 0.33 0.64 0.3
Mp6g03090.1 (MOT2)
2.83 1.22 0.65 4.54 334.6 8.49 0.62 6.45 0.38 36.05 3.82 0.45 1.57 0.0 3.46 1.64 3.22 15.82 11.8 199.11 10.93 0.38 70.68 4.91 10.75 1.55 7.32 0.79 1.07 1.31 0.16 0.44
0.13 0.0 0.0 0.87 475.47 10.13 0.19 0.7 0.0 16.85 4.72 0.0 1.62 0.57 1.14 0.21 0.0 25.46 3.0 317.0 17.27 0.0 107.4 1.19 10.94 0.14 4.21 0.0 0.09 0.0 0.28 0.48
0.16 0.0 0.0 0.0 76.94 0.8 0.0 0.49 0.0 2.45 0.92 0.0 0.27 0.0 0.08 0.25 0.07 1.71 0.59 60.5 1.74 0.0 14.26 0.1 2.55 0.0 1.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47
Mp6g03120.1 (MOT2)
0.39 0.53 0.0 1.95 385.18 21.33 0.0 1.38 0.0 20.84 10.93 0.41 3.18 0.0 2.63 0.93 0.98 29.27 11.49 383.05 26.55 0.79 108.22 6.07 24.67 1.02 4.9 0.07 0.26 0.69 0.85 0.69
0.51 0.37 13.16 1.33 37.26 1.78 0.92 0.49 27.79 17.33 8.09 4.45 4.84 16.34 1.24 1.38 0.71 6.2 39.82 70.11 2.38 22.05 18.8 34.5 2.57 0.43 0.47 6.07 4.12 1.92 1.31 1.85
Mp6g13370.1 (NTMC2T5.1)
0.11 0.16 0.0 0.51 25.59 2.2 0.46 0.23 0.0 8.51 1.59 0.09 0.57 0.0 0.45 0.07 0.18 1.69 0.45 23.83 4.84 0.0 2.92 0.08 3.95 0.49 0.54 0.37 0.51 0.25 0.0 0.0
0.56 0.24 0.34 3.59 8.38 0.54 0.63 0.32 0.35 9.43 2.17 0.86 1.6 2.27 2.59 3.89 2.67 1.11 2.23 15.4 0.79 0.82 4.15 1.05 0.98 0.36 0.42 0.78 0.96 0.61 0.4 0.56
Mp7g16290.1 (MyoB1)
0.2 0.29 0.22 0.07 51.9 0.81 0.24 0.05 0.22 34.75 15.05 3.02 7.64 0.09 0.18 0.05 0.06 3.34 2.49 70.2 1.3 0.42 22.77 0.76 0.92 0.22 0.66 0.1 0.27 0.14 0.2 0.14
0.0 0.0 0.14 1.15 347.11 0.35 0.0 0.04 0.02 0.25 0.04 0.08 0.02 0.08 0.62 0.02 0.27 5.49 6.69 226.39 0.36 0.46 123.33 1.55 2.31 0.0 0.66 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0
Mp8g05130.1 (DUET)
0.2 0.18 0.22 2.45 5.74 0.58 0.34 0.23 0.1 5.8 4.11 0.81 1.77 1.12 2.35 2.16 2.25 1.41 1.1 12.52 0.93 0.37 3.41 0.53 1.12 0.54 0.25 0.26 0.21 0.25 0.3 0.27
Mp8g14690.1 (AtPMT2)
0.0 0.0 0.0 0.31 12.95 0.0 0.0 0.0 0.4 8.97 0.53 0.18 0.0 0.19 0.31 0.0 0.81 0.0 0.92 18.86 0.15 0.75 3.82 0.39 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)