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Heatmap: Cluster_42 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.22 0.34 0.01 0.04 -0.0 -0.15 -0.17 -0.08 -0.05 -0.17 -0.26 -0.18 0.0 0.64 0.19 0.16 0.11 0.02 -0.48 -0.48 -0.22 -0.21 0.43 -0.2 -0.31 -0.15 -0.1 0.03 0.18 0.17
0.12 0.15 0.02 0.09 0.11 -0.15 -0.1 0.04 -0.11 0.02 -0.15 -0.2 -0.04 0.42 0.06 -0.03 -0.03 -0.06 -0.18 -0.24 -0.05 -0.13 0.29 -0.11 -0.11 -0.05 0.09 0.18 -0.01 -0.05
0.31 0.31 0.17 0.16 0.16 -0.03 -0.22 -0.09 -0.15 -0.06 -0.33 -0.11 -0.14 0.41 0.11 -0.02 0.01 0.3 -0.32 -0.34 -0.29 -0.21 0.26 -0.12 -0.34 -0.2 -0.18 0.12 0.26 0.05
0.29 0.26 0.13 0.16 0.18 -0.15 -0.17 -0.23 0.02 0.04 -0.24 -0.22 -0.12 0.43 0.14 0.01 0.04 0.18 -0.24 -0.31 -0.19 -0.11 0.4 -0.23 -0.34 -0.16 -0.1 -0.02 0.09 0.01
0.19 0.07 -0.07 -0.07 0.05 -0.18 -0.18 -0.18 -0.1 -0.03 -0.16 -0.09 0.04 0.56 0.04 -0.01 -0.02 0.28 -0.18 -0.27 -0.13 -0.07 0.44 -0.12 -0.17 -0.12 -0.07 0.19 -0.05 0.04
0.23 0.33 0.16 0.24 0.02 -0.06 -0.13 0.12 -0.14 -0.07 -0.17 -0.17 -0.12 0.4 -0.11 -0.03 -0.1 -0.3 -0.42 -0.39 -0.13 -0.09 0.38 -0.17 -0.21 -0.16 -0.07 0.24 0.22 0.22
0.05 0.14 -0.11 -0.16 0.04 0.2 0.0 0.03 -0.28 -0.2 -0.21 -0.18 -0.03 0.63 0.33 0.22 0.17 0.17 -0.4 -0.34 -0.22 -0.24 0.59 -0.08 -0.27 -0.15 -0.18 -0.09 -0.07 -0.01
0.28 0.29 0.11 0.28 0.05 -0.02 -0.19 0.03 -0.15 0.01 -0.16 -0.07 -0.04 0.32 0.03 -0.02 -0.02 -0.12 -0.46 -0.49 -0.2 -0.15 0.4 -0.13 -0.22 -0.16 -0.05 0.12 0.19 0.07
0.2 0.14 -0.06 0.04 0.15 -0.12 -0.15 -0.01 -0.14 -0.0 -0.16 -0.12 -0.05 0.33 -0.12 -0.07 -0.1 -0.11 -0.19 -0.26 -0.06 -0.09 0.4 -0.03 -0.1 0.02 0.07 0.16 0.13 0.07
0.05 0.18 -0.09 0.01 -0.13 -0.1 -0.13 0.11 -0.19 -0.13 -0.33 -0.18 0.04 0.71 0.13 0.18 0.12 0.02 -0.49 -0.48 -0.18 -0.17 0.97 -0.26 -0.25 -0.16 -0.13 -0.14 -0.06 0.08
0.17 0.18 0.07 0.0 0.09 -0.04 -0.05 -0.09 -0.03 -0.01 -0.11 -0.09 -0.27 0.52 0.02 -0.07 -0.09 -0.03 -0.25 -0.29 -0.05 -0.06 0.53 -0.17 -0.18 -0.14 -0.09 0.05 0.09 0.0
0.3 0.3 0.08 0.05 0.21 -0.09 -0.2 0.07 -0.19 -0.09 -0.2 -0.18 -0.08 0.48 0.1 0.05 0.02 -0.18 -0.37 -0.44 -0.12 -0.21 0.37 -0.1 -0.21 -0.11 -0.14 0.19 0.13 0.08
0.37 0.43 0.17 0.18 0.16 -0.12 -0.25 -0.11 -0.32 -0.15 -0.3 -0.19 -0.14 0.31 -0.07 -0.04 -0.01 0.07 -0.57 -0.5 -0.31 -0.21 0.8 -0.19 -0.3 -0.1 -0.09 0.19 0.3 0.09
0.09 0.18 -0.13 -0.02 -0.01 -0.06 -0.11 0.12 -0.15 -0.12 -0.14 -0.22 0.16 0.53 0.15 -0.11 0.02 -0.11 -0.5 -0.35 -0.23 -0.3 0.94 0.01 -0.23 -0.08 -0.11 0.1 -0.01 -0.08
0.25 0.25 0.08 0.12 0.09 -0.01 -0.19 -0.1 -0.26 -0.04 -0.19 -0.1 -0.1 0.64 -0.02 -0.17 -0.12 0.08 -0.36 -0.45 -0.28 -0.15 0.51 -0.01 -0.22 -0.12 -0.04 0.23 0.12 -0.01
0.39 0.58 -0.04 -0.1 0.18 -0.2 -0.3 -0.31 -0.27 -0.15 -0.1 -0.12 -0.25 0.62 -0.27 -0.34 -0.23 0.19 -0.37 -0.47 -0.22 -0.13 0.85 0.14 -0.28 -0.1 -0.0 0.0 0.17 0.08
0.32 0.28 0.17 0.32 0.08 -0.14 -0.16 0.18 -0.24 -0.14 -0.26 -0.26 0.06 0.42 -0.04 -0.15 -0.14 -0.03 -0.36 -0.51 -0.22 -0.19 0.37 -0.13 -0.1 -0.17 -0.06 0.25 0.2 0.09
Spov3_chr1.00623 (PI4KBETA1)
 0.17 0.17 0.15 0.11 0.2 -0.08 -0.18 -0.06 -0.16 -0.1 -0.15 -0.17 0.06 0.57 0.13 0.12 0.06 -0.16 -0.46 -0.42 -0.19 -0.12 0.47 -0.16 -0.19 -0.09 -0.06 0.01 0.0 0.08
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Spov3_chr1.00744 (AUXILIN-LIKE2)
 0.2 0.23 0.09 0.03 0.13 -0.02 -0.21 -0.1 -0.24 -0.18 -0.19 -0.19 0.01 0.81 0.23 0.11 0.14 -0.04 -0.33 -0.41 -0.21 -0.17 0.37 -0.18 -0.28 -0.13 -0.13 0.0 -0.02 0.05
Spov3_chr1.00854 (alpha1-COP)
 0.21 0.22 0.08 0.04 0.09 -0.28 -0.1 0.16 -0.15 -0.06 -0.16 -0.16 0.02 0.34 0.12 -0.02 0.02 -0.04 -0.26 -0.27 -0.11 -0.13 0.38 -0.09 -0.14 -0.11 0.0 0.1 0.04 -0.01
0.28 0.28 0.07 0.21 0.07 -0.19 -0.22 0.03 -0.24 -0.12 -0.12 -0.22 -0.13 0.36 -0.03 -0.1 -0.16 0.1 -0.24 -0.31 -0.19 -0.18 0.53 0.12 -0.04 -0.28 -0.2 0.19 0.31 -0.06
0.36 0.17 -0.17 -0.3 0.14 0.02 0.02 -0.05 -0.25 -0.16 -0.27 -0.15 -0.17 0.83 0.11 0.14 0.01 -0.05 -0.24 -0.37 -0.19 -0.15 0.42 -0.12 -0.34 -0.14 -0.25 0.11 0.18 0.16
0.26 0.25 0.05 0.13 0.06 -0.14 -0.31 -0.02 -0.34 -0.21 -0.23 -0.22 -0.02 0.43 0.1 0.0 -0.04 0.29 -0.24 -0.28 -0.15 -0.12 0.69 -0.11 -0.25 -0.22 -0.15 0.08 0.05 0.05
0.64 0.26 -0.16 -0.43 -0.16 0.11 0.11 0.08 -0.23 -0.19 -0.41 -0.3 -0.03 0.83 0.16 0.07 -0.03 -0.0 -0.39 -0.43 -0.25 -0.18 0.42 0.04 -0.34 -0.16 -0.22 0.25 0.09 -0.14
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0.37 0.37 0.03 -0.11 0.29 -0.18 -0.13 -0.32 -0.14 0.1 -0.22 -0.15 -0.29 0.31 -0.15 -0.18 -0.15 0.09 -0.32 -0.3 -0.17 -0.16 0.8 -0.08 -0.16 -0.07 -0.12 0.13 0.22 0.0
Spov3_chr2.01245 (AtEAF1A)
 0.25 0.31 0.08 0.18 -0.24 -0.09 -0.17 -0.16 -0.05 0.07 -0.18 -0.08 -0.01 0.43 0.06 0.06 -0.04 -0.27 -0.45 -0.4 -0.04 -0.06 0.39 0.05 -0.2 -0.04 -0.06 0.18 0.13 -0.04
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0.13 0.17 0.03 -0.05 -0.01 -0.29 -0.14 0.04 -0.03 -0.04 -0.06 -0.06 0.02 0.37 0.15 -0.03 0.02 -0.25 -0.27 -0.23 -0.1 -0.07 0.72 -0.02 -0.14 -0.12 -0.11 0.09 0.01 -0.16

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Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.